Aplikom Desain Primer DNA Adit Fiks

8/18/2019 Aplikom Desain Primer DNA Adit Fiks

1/19

LANGKAH KERJA MENYUSUN DNA PRIMER UNIVERSAL DENGAN APLIKASI

NCBI, CLUSTAL OMEGA, PRIMER 3, IDT, DAN IUPAC CODE

Disusun ole !

N"#" ! P$"%i&'" Te(u P$i"#)o%o NIM ! B*J+*3+*

Kel"s ! B

Dosen ! S"e-u%in A.i.

LAPORAN MATA KULIAH APLIKASI KOMPUTER

KEMENTERIAN RISET, TEKNOLOGI, DAN PENDIDIKAN TINGGIUNIVERSITAS JENDERAL SOEDIRMAN

/AKULTAS BIOLOGI

PUR0OKERTO

1+*


2/19

*2 Bu" "4li"si 5NCBI62

12 Ten&u"n s4esies '"n( ""n %i7"$i (en 4en'"n%in'", %"n 4ili s"l" s"&u2


3/19

32 Kli (en '"n( &el" %i4ili, e&i" elu"$ &"#4il"n se4e$&i %i)"8", li

5/ASTA62

92 Co4' 4$o&ein %i no&e4"%2


4/19

:2 M"su"n n"#" (en '"n( &el" %i4ili %i o&" se)el" 5Se"$76, u)"

4en("&u$"n #en;"%i 5Gene6 %"n li 5Se"$76 in((" elu"$ &"#4il"n se4e$&i%i)"8", e#u%i"n 4ili (en se$u4" %i &"#4il"n 5Se"$7 $esul&62

2 Kli (en, se&el" elu"$ &"#4il"n %i)"8", s7$olle)"8" %"n li 5/ASTA62


5/19


6/19

@2 M"su "4li"si 6Clus&"l O#e("6, #"su"n *+ seuen '"n( su%" %i 7o4' %i

no&e4"% %"l"# o&" '"n( &e$se%i" se4e$&i &"#4il"n %i)"8", u)" #en;"%i5DNA6 un&u #e#)"7" seuen DNA2

*+2 Kli 5Su)#i&6, %"n &un((u ;i" elu"$ se4e$&i &"#4il"n %i)"8"2


7/19

**2 Ji" su%" seles"i lo"%in( ""n elu"$ &"#4il"n seuen DNA se4e$&i %i)"8",

%"n 4ili )lo seuen '"n( )e$"%" %i"&"s &"n%" )in&"n( => '"n( )e$"$&i "$e "&"u8il"'" '"n( s"#"2 B"s" '"n( #en(""#i #u&"si %i&"n%"i %en("n &"n%" =>2


8/19

*12 B"n%in("n %en("n seuen '"n( su%" %io4i %i no&e4"%2

*32 Bu" "4li"si 5P$i#e$ 362


9/19

*92 M"su"n seuen DNA %i no&e4"% '"n( su%" %i4ili %i l"n(" no#e$ *:, l"lu

li 5Pi7 P$i#e$s62

*:2 Se&el" elu"$ se4e$&i &"#4il"n %i)"8", 7o4' seuen 5Le-& P$i#e$6 e no&e4"%l"lu )e$i n"#" 5/o$8"$%6 , Co4' seuen 5Ri(& P$i#e$6 un&u %i)e$i n"#"

5$ee$se62


10/19

*2 Pen"#""n seuen DNA )is" %ili"& 4"%" &"#4il"n %i)"8" %en("n #e#)e$i

&"n%" => se)elu# n"#" %"n &"n%" => se&el"n'"2

*


11/19

*?2 Pili 5Oli(o An"l'.e$ 4"%" su) #enu 5Tools6, Co4' seuen 5/o$8"$%6 '"n(

su%" %i#"su"n %i no&e4"%2

*@2 Kli 5An"l'.e6 %"n li"& 4"%" )"(i"n 5Resul&62


12/19

1+2 H"sil 5An"l'.e6, %"4"& %ili"& in-o$#"si &en&"n( seuen DNA '"n( %i#"su"n,

%en("n &e#4e$"&u$ lele se)es"$ ::,1+ C2

1*2 Se&el" %ili"& "sil "n"lis"n'", Kli 5H"i$4in6 Suu &e$&e$" %i &"#4il"n

5H"i$4in6 %en("n &e#4e$"&u$ lele %i &"#4il"n 5An"l'.e6 #e#ilii selisi 1++

#e$u4""n seuen '"n( )"i


13/19

112 Kli 5Sel-%i#e$6, li"& in-o$#"si '"n( %i%"4"&"n2

132 Kli 5He&e$o%i#e$, #"su"n seuen 5Ree$se6 %"n li 5C"l7ul"&e62


14/19

192 Kli 5NCBI Bl"s&6 in((" elu"$ lin )"$u, %"n s7$oll e)"8" l"lu li

5BLAST6 %i su%u& i$i2


15/19

1:2 Se&el" li 5BLAST6 ""n elu"$ G$"4i7 %"n Des7$i4&ion2 Pe$"&i"n %en("n )"i, nil"i E "lue '"n( #en%e"&i +2++ %"n %en("n nil"i Fue$' '"n( *++

#e$u4""n 7i$i %"$i seuen %en("n E V"lue '"n( )"i2


16/19

12 Ke#)"li e e su) #enu -un7&ion 5He&e$o Di#e$6, l"lu #"su"n seuen -o$8"$%

4"%" se7on%"$' seuen, l"lu li 5C$e"&e Co#4le#en&6, %"n "#"&i 4e$u)""nseuen '"n( &e$;"%i2

1


17/19

1?2 M"su e#)"li e A4li"si Clus&"l O#e(", l"lu #"su"n : seuen )e)"s %"$i

no&e4"% '"n( 4e$&"#", &e"n en&e$ %"n #"su"n seuen -o$8"$%, l"lu &e"n en&e$ l"(i %"n #"su"n seuen ine$s, %"n li 5Su)#i&62

1@2 H"sil li 5Su)#i&62


18/19

3+2 Ten&u"n seuen '"n( )"n'" &e$;"%i #u&"si, %en("n ;u#l" )"s" '"( sesu"i

%en("n )"s" 4"%" seuen -o$8"$%2

3*2 Bu" "4li"si 5IUPAC Co%e6, l"lu 7o7o"n %en("n seuen '"n( %i4ili , ;i" "%"'"n( &i%" sesu"i u$u&"nn'" se4e$&i u$u&"n seuen %i"&"sn'" "&"u %i)"8"n'"

#"" )"s" &e$se)u& )is" %i("n&i"n sesu"i o%e '"n( &e$%"4"& %i A4li"si

5IUPAC 7o%e62


19/19

312 H"sil DNA P$i#e$ Unie$s"l2

Aplikom Desain Primer DNA Adit Fiks

Documents

Transcript of Aplikom Desain Primer DNA Adit Fiks