VARIASI MORFOLOGI, POLA PITA PROTEIN, DAN UJI … fileperpustakaan.uns.ac.id digilib.uns.ac.id...
Transcript of VARIASI MORFOLOGI, POLA PITA PROTEIN, DAN UJI … fileperpustakaan.uns.ac.id digilib.uns.ac.id...
perpustakaan.uns.ac.id digilib.uns.ac.id
commit to user
i
VARIASI MORFOLOGI, POLA PITA PROTEIN, DAN UJI KANDUNGAN
PROTEIN BIJI EMPAT VARIETAS Cucurbita moschata Durch DI WILAYAH
PACITAN JAWA TIMUR
Skripsi
Untuk memenuhi sebagian persyaratan
guna memperoleh gelar Sarjana Sains
Disusun oleh:
Rebekca Cindy Yuswita
M0408112
JURUSAN BIOLOGI
FAKULTAS MATEMATIKA DAN ILMU PENGETAHUAN ALAM
UNIVERSITAS SEBELAS MARET
SURAKARTA
2014
perpustakaan.uns.ac.id digilib.uns.ac.id
commit to user
ii
perpustakaan.uns.ac.id digilib.uns.ac.id
commit to user
iii
PERNYATAAN
Dengan ini saya menyatakan bahwa skripsi ini adalah hasil penelitian saya
sendiri dan tidak terdapat karya yang pernah diajukan untuk memperoleh gelar
kesarjanaan di suatu Perguruan Tinggi, serta tidak terdapat karya atau pendapat
yang pernah ditulis atau diterbitkan orang lain, kecuali yang secara tertulis diacu
dalam naskah ini dan disebutkan dalam daftar pustaka.
Apabila dikemudian hari dapat ditemukan adanya unsur penjiplakan maka
gelar kesarjanaan yang telah diperoleh dapat ditinjau kembali dan/atau dicabut.
Surakarta, Januari 2014
Rebekca Cindy Y
NIM. M0408112
perpustakaan.uns.ac.id digilib.uns.ac.id
commit to user
iv
Variasi morfologi, Pola Pita Protein, dan Uji Kandungan Protein Biji Empat
Varietas Cucurbita moschata Durch di Wilayah Pacitan Jawa Timur
Rebekca Cindy Yuswita
Jurusan Biologi, Fakultas Matematika dan Ilmu Pengetahuan Alam,
Universitas Sebelas Maret, Surakarta.
ABSTRAK
Penelitian ini bertujuan mengetahui variasi pola pita protein dan uji
kandungan protein biji labu kuning. Metode yang digunakan untuk isolasi pola
pita protein adalah metode SDS – PAGE(Sodium Dodecyl Sulphate
Polyacrylamide Gel Electrophoresis) dengan tegangan 100 V selama 1 jam,
metode untuk analisis kandungan protein pada biji menggunakan metode Kjeldahl
yang terdiri atas tahap destruksi, destilasi, dan titrasi.
Penelitian ini menggunakan analisis kualitatif untuk melihat keragaman
pola pita protein berdasarkan nilai Rf (nilai relatif) yang diperoleh dari
perbandingan antara jarak migrasi protein terhadap migrasi loading dye. Hasil
penelitian menunjukkan bahwa semua biji labu memiliki perbedaan, komposisi
protein yang ditunjukkan dari tebal tipisnya pola pita protein. Kandungan protein
biji labu juga bervariasi, labu oval memiliki kandungan protein tertinggi yaiutu
(43,82%), kandungan protein yang terkecil (29,31%) ditemukan pada labu botol.
Kata kunci : Cucurbita moschata Durch, pola pita protein, SDS – PAGE,
elektroforesis, analisis kandungan protein, Rf
perpustakaan.uns.ac.id digilib.uns.ac.id
commit to user
v
Variations Morphology, in the Pattern of Protein Bands and the Protein
Content Test of Four Varieties of Seeds Cucurbita moschata Durch in the
Region Pacitan East Java
Rebekca Cindy Yuswita
Biology Department, Faculty of Mathematics and Natural Sciences
Sebelas Maret University, Surakarta.
ABSTRACT
The aims of this study were to determine whether variations in pattern of
the seed protein bands and to examined the content of variation pumpkin seed
protein. Running of protein banding pattern was done by SDS-PAGE (Sodium
Dodecyl Sulphate polyacrylamide gel electrophoresis) with a voltage of 100 volt
for 1 hour. Meanwhile analysis of protein content in the seed, was done by
Kjeldahl method consists of stages destruction, distillation, and titration
respectivety.
The qualitative analysis of this experiment was done by detected the
presence of the protein banding patterns according to the Rf values (Retardation
factor) obtained from the comparison between the migration protein distance and
migration of loading dye. The results showed that all of pumpkin seeds have a
protein content differences which was indicated by thickness of banding patterns.
The protein content as recorded as the highest (43,82%), and this based on
percentage of protein the oval pumpkin, while the smallest percentage (29,31%)
was found at the bottle type.
Keywords: Cucurbita moschata Durch, the pattern of protein bands, SDS -
PAGE, electrophoresis, protein analysis, Rf
perpustakaan.uns.ac.id digilib.uns.ac.id
commit to user
vi
PERSEMBAHAN
Skripsi ini saya dedikasikan untuk :
Yesus Kristus, Juru selamat dan Penebusku
Papa Richard Hutabarat, Mama Rumondang
Hutabarat dan Rowena M D,
Serta keluarga besar, atas cinta dan doanya kepada saya
Teman-teman angkatan 2008,
Atas bantuan dan dukungannya
Almamater, Universitas Sebelas Maret
perpustakaan.uns.ac.id digilib.uns.ac.id
commit to user
vii
MOTTO
“Takut akan Tuhan adalah permulaan pengetahuan, tetapi orang bodoh
menghina hikmat dan didikan”.
(Amsal 1:7)
“Setiap Orang Punya Jatah Gagal, Habiskan Jatah Gagalmu ketika Kamu Masih
Muda”.
(Dahlan Iskan)
perpustakaan.uns.ac.id digilib.uns.ac.id
commit to user
viii
KATA PENGANTAR
1. Puji syukur penulis panjatkan kehadirat Tuhan Yang Maha Esa atas berkat dan
rahmat-Nya yang berlimpah sehingga penulis dapat menyelesaikan penelitian
dan penyusunan skripsi dengan Judul Variasi Pola Pita Protein dan Uji
Kandungan Protein Empat Varietas Biji Cucurbita moschata Durch Di
Wilayah Pacitan Jawa Timur. Penyusunan skripsi ini merupakan salah satu
syarat untuk memperoleh gelar kesarjanaan Strata 1 (S1) di Jurusan Biologi,
Fakultas Matematika dan Ilmu Pengetahuan Alam, Universitas Sebelas Maret,
Surakarta.
2. Penelitian dan penyusunan skripsi ini tidak terlepas dari masukan dan
dukungan berbagai pihak yang sangat membantu dan bermanfaat kepada
penulis. Oleh karena itu, penulis mengucapkan terima kasih kepada :
3. Dr. Agung Budiharjo, M.Si., selaku Ketua Jurusan Biologi, Fakultas
Matematika dan Ilmu Pengetahuan Alam, Universitas Sebelas Maret,
Surakarta yang telah memberikan izin dan dukungan selama penelitian.
4. Prof. Drs.Suranto,M.Sc.Ph.D, selaku Dosen Pembimbing I yang telah
memberikan proyek penelitian, saran, bimbingan penelitian di laboratorium,
hingga terselesaikannya penyusunan skripsi ini.
5. Dr. Ari Susilowati,M.Si., selaku Dosen Pembimbing II yang telah
memberikan saran, dan ilmu yang sangat berharga bagi penulis, serta
bimbingan dari awal penelitian hingga terselesaikannya penyusunan skripsi
ini.
6. Dr. Artini Pangastuti,M.Si., selaku Dosen Penelaah I yang telah memberikan,
saran, kritik, dukungan sehingga penulis mampu memahami materi dengan
baik.
7. Siti Lusi Arum Sari,M.Biotech., selaku Dosen Penelaah II yang telah
memberikan saran dan kritik hingga terselesaikannya penyusunan skripsi ini.
perpustakaan.uns.ac.id digilib.uns.ac.id
commit to user
ix
8. Dr. Dra.Ratna Setyaningsih,M.Si selaku Kepala Laboratorium Jurusan Biologi
FMIPA, Universitas Sebelas Maret, Surakarta yang telah memberikan izin
penelitian beserta sarana dan prasarana selama penelitian.
9. Dosen-dosen di Jurusan Biologi, Fakultas Matematika dan Ilmu Pengetahuan
Alam, Universitas Sebelas Maret, Surakarta yang telah mendidik dan
memberikan dorongan moral sehingga penulis dapat menyelesaikan skripsi
ini. Staf dministrasi Jurusan Biologi, Mas Adenan, Mbak Atik,dan Mbak Nina
yang selalu memberikan doa dan semangat bagi penulis.
10. FajarRidwansyah yang selalu memberi semangat, doa, dan setia mendampingi
penulis sampai skripsi ini selesai. Christian Agung Nugraha, Lia Nandiar,
Syarafina Putri, Bania Aprilla, Larasati Senja, Odise L, dan Maria Ima F atas
dukungan bagi penulis dari awal penelitian hingga penyusunan skripsi.
Teman-teman Biologi khususnya angkatan 2008 yang selalu memberikan
motivasi dan dukungan kepada penulis.
11. Penulis menyadari sepenuhnya bahwa dalam melakukan penelitian hingga
penyusunan skripsi masih jauh dari sempurna. Oleh karena itu, penulis sangat
mengharapkan adanya masukan yang bersifat membangun. Semoga skripsi
ini dapat bermanfaat.
Surakarta, Januari 2014
Penulis
perpustakaan.uns.ac.id digilib.uns.ac.id
commit to user
x
DAFTAR ISI
Halaman
HALAMAN JUDUL ........................................................................................ i
HALAMAN PERSETUJUAN ......................................................................... ii
PERNYATAAN ............................................................................................... iii
ABSTRAK ....................................................................................................... iv
ABSTRACT ..................................................................................................... v
HALAMAN PERSEMBAHAN....................................................................... vi
MOTTO............................................................................................................ vii
KATA PENGANTAR ..................................................................................... viii
DAFTAR ISI .................................................................................................... x
DAFTAR TABEL ............................................................................................ xiii
DAFTAR GAMBAR ....................................................................................... xiv
DAFTAR LAMPIRAN .................................................................................... xv
BAB I. PENDAHULUAN ............................................................................ 1
A. Latar Belakang Masalah ............................................................ 1
B. Perumusan Masalah ................................................................... 3
C. Tujuan Penelitian ....................................................................... 3
D. Manfaat Penelitian ..................................................................... 3
BAB II. LANDASAN TEORI ........................................................................ 4
A. Tinjauan Pustaka........................................................................ 4
1. Klasifikasi labu kuning ........................................................ 4
2. Morfologi labu kuning. ........................................................ 5
3. Kondisi geografis wilayah Pacitan . .................................... 11
4. Protein ............................ ..................................................... 12
5. Pola pita protein dan elektroforesis............................ ......... 13
6. SDS-PAGE............................ .............................................. 14
7. Analisis kandungan protein............................ ..................... 16
B. Kerangka Pemikiran .................................................................. 20
perpustakaan.uns.ac.id digilib.uns.ac.id
commit to user
xi
BAB III. METODE PENELITIAN.................................................................. 22
A. Waktu dan Tempat Penelitian ..................................................... 22
B. Alat dan Bahan Penelitian .......................................................... 23
C. Cara Kerja ................................................................................... 25
D. Analisis kandungan protein ......................................................... 29
E. Analisis Data ............................................................................... 30
BAB IV. HASIL DAN PEMBAHASAN ........................................................ 31
A. Morfologi biji labu kuning ........................................................ 31
B. Pita protein biji labu kuning ...................................................... 36
C. Kandungan protein biji labu kuning .......................................... 52
BAB V. KESIMPULAN DAN SARAN .......................................................... 57
A. Kesimpulan ................................................................................. 59
B. Saran ........................................................................................... 59
DAFTAR PUSTAKA ...................................................................................... 60
LAMPIRAN ..................................................................................................... 64
DAFTAR RIWAYAT HIDUP......................................................................... 69
perpustakaan.uns.ac.id digilib.uns.ac.id
commit to user
xii
DAFTAR TABEL
Halaman
Tabel 1. Morfologi Labu Kuning dan Biji Labu Kuning .............................. ..... 32
Tabel 2. Ukuran dan berat biji dari empat varietas labu kuning .........................35
Tabel 3. Nilai biner Rf berdasarkan banyaknya pola pita
yangmuncul.......................................... ................................................. 41
Tabel 4. Perhitungan Rf dan Log BM markerprotein........... .............................. 43
Tabel 5. Hasil analisis SDS-PAGE berat molekul protein... ............................... 44
Tabel 6. Hasil perhitungan profil pola pita protein biji dari keempat varietas
labu kuning di wilayah Pacitan berdasarkan Tebal pita, Jarak migrasi, Rf,dan
Berat molekul.......................................................................... 49
Tabel 7. Kandungan protein biji dari empat varietas labu kuning ...................... 52
perpustakaan.uns.ac.id digilib.uns.ac.id
commit to user
xiii
DAFTAR GAMBAR
Halaman
Gambar 1. Labu kuning (Cucurbita moschata)………….................. 4
Gambar 2. Labu Kuning Varietas Bokor……………........................ 7
Gambar 3. Labu Kuning Varietas Botol…...…………...................... 8
Gambar 4. Labu Kuning Varietas Oval….…....................................... 8
Gambar 5. Labu Kuning Varietas Ular….............................................. 9
Gambar 6. Bagan Kerangka Pemikiran……………………………….. 21
Gambar 7. Hasil elektroforesis pola pita protein biji labu kuning…….. 37
Gambar 8. Redrawing elektroforesis pola pita protein biji labu kuning.. 38
perpustakaan.uns.ac.id digilib.uns.ac.id
commit to user
xiv
DAFTAR LAMPIRAN
Halaman
Lampiran 1. Kurva standar marker SDS-PAGE………………… 64
Lampiran 2. Bobot molekul pita protein keseluruhan…………… 64
Lampiran 3. Redrawing biji labu kuning varietas bulat………….. 67
Lampiran 4. Redrawing biji labu kuning varietas oval…………… 67
Lampiran 5. Redrawing biji labu kuning varietas ular……………. 68
Lampiran 6. Redrawing biji labu kuning varietas botol…………… 68
perpustakaan.uns.ac.id digilib.uns.ac.id
commit to user
xv
DAFTAR SINGKATAN
Singkatan Kepanjangan
APS
HCl
NaH2PO4
Na2HPO4
Rf
Var.
SDS
TEMED
Ammonium Persulphate
Asam klorida
Natrium dihidrogen-fosfat
Dinatrium hidogren-fosfat
Retardation factor
Varietas
Sodium Dodecyl sulfate
N’N’N’N’ tetramethyl-ethilenediamine