Oleh karena DNA yang dimasukkan ke dalam sel inangbukan hanya DNA rekombinan, maka kita harus melakukan seleksiuntuk memilih sel inang transforman yang membawa DNArekombinan. Selanjutnya, di antara sel-sel transforman yangmembawa DNA rekombinan masih harus dilakukan seleksi untukmendapatkan sel yang DNA rekombinannya membawa fragmensisipan atau gen yang diinginkan.Seleksi sel rekombinan yang membawa fragmen yangdiinginkan dilakukan dengan mencari fragmen tersebut menggunakanfragmen pelacak(probe), yang pembuatannya dilakukan secarainvitromenggunakan teknik reaksi polimerisasi berantai ataupolymerase chainreaction(PCR).