Lampiran 1. Ringkasan

RINGKASAN

ABSTRAK

Penelitian ini dilakukan untuk mengetahui keberadaan bakteri penambat

nitrogen dan bakteri pelarut fosfat pada sampel tanah gambut di provinsi Kalimantan

Timur. Tiga sampel tanah gambut diambil dari lokasi yang berbeda, yakni lokasi

persawahan, pekarangan dan lahan gambut. Bakteri penambat nitrogen diisolasi

menggunakan media semi solid Nitrogen-Fixing Bacteria (NFB) dengan metode stab

sedangkan bakteri pelarut fosfat diisolasi menggunakan media agar pikovskaya

dengan metode pour plate. Kultur diinkubasi selama 24-48 jam pada suhu 28oC.

Hasil menunjukkan adanya keberadaan bakteri penambat nitrogen yang ditunjukkan

dengan perubahan warna pada media NFB-semi solid dan adanya keberadaan bakteri

pelarut fosfat yang ditunjukkan dengan terbentuknya zona jernih (halo) di sekitar

koloni pada media pikovskaya. Didapatkan 3 isolat bakteri penambat nitrogen dan 31

isolat bakteri pelarut fosfat yang telah diidentifikasi hingga tingkat genus. Isolat

bakteri yang teridentifikasi sebagai bakteri penambat nitrogen adalah Azotobacter

sedangkan yang teridentifikasi sebagai bakteri pelarut fosfat adalah Bacillus dan

Pseudomonas.

Kata kunci : bakteri penambat nitrogen, bakteri pelarut fosfat, tanah gambut,

eksplorasi

ABSTRACT

The research was undertaken to investigate the occurance of nitrogen-fixing

bacteria (NFB) and phosphate solubilizing bacteria (PSB) at peat soil in East Borneo

province. Three peat soil sample were collected from different location which were

wet rice field location, yard location and peat area location. NFB was isolated by

Nitrogen-Fixing Bacteria semi solid media with stab method whereas PSB was

ADLN - Perpustakaan Universitas Airlangga

Skripsi Eksplorasi Bakteri Penambat Nitrogen dan Bakteri Pelarut Fosfat pada ... Suwatno, Ario M. W. Y.

isolated by pikovskaya agar media with pour plate method. Culture was incubated 24-

48 hour into temperature of 28oC. The result showed that the existence of NFB was

showed by color transformation at NFB media and existence of PSB was showed by

clear zone (halo) around the colonies at pikovskaya agar media. There were 3 isolates

of NFB and 31 isolates of PSB which have been identified till genus. The isolate

genera bacteria which had been identified as NFB were Azotobacter whereas as PSB

were Bacillus and Pseudomonas.

Keywords : phosphates solubilizing bacteria, nitrogen fixing bacteria, peat soil,

exploration

PENDAHULUAN

Indonesia merupakan negara megabiodiversitas, karena sumber daya alam

yang dimiliki sangat melimpah. Sumber daya alam tersebut meliputi keanekaragaman

fauna dan flora bahkan keanekaragaman jenis tanah, salah satunya adalah tanah

gambut.

Gambut adalaah bahan organik mati yang telah terbentuk di tempat yang

tetap. Gambut terdiri dari 90% air dan 10% tumbuhan. Gambut terbentuk di bawah

kondisi bahan tanaman yang mati kekal selama ribuan tahun karena kombinasi

saturasi air permanen, kadar oksigen rendah dan tingkat keasaman yang tinggi

(Anonim, 2010b).

Tanah gambut terutama yang berada di daerah tropis memiliki sifat fisika,

kimia dan biologi tertentu yang mencerminkan ciri khas dari tanah tersebut. Sifat-

sifat yang menjadi ciri khas tersebut adalah pH relatif rendah antara 3-5 (Agus dan

Subiksa, 2008), terbatasnya ketersediaan nutrien, bahan penyusun yang berasal dari

kayu-kayuan, sifat menyusut, penurunan permukaan gambut (subsidence) (Yuleli,

2009) dan suhu lingkungan berkisar antara 25-32 oC. Disamping itu, sifat lain yang

juga dimiliki adalah kandungan organik yang tinggi karena dalam pembentukannya

terdapat tanaman air dan vegetasi lahan basah yang mati dan melapuk secara bertahap

ADLN - Perpustakaan Universitas Airlangga

Skripsi Eksplorasi Bakteri Penambat Nitrogen dan Bakteri Pelarut Fosfat pada ... Suwatno, Ario M. W. Y.

membentuk lapisan dan terperangkap selama beberapa waktu (Agus dan Subiksa,

2008).

Terdapat tiga golongan mikroba di dalam tanah, yaitu golongan mikroba yang

selalu tetap didapatkan di dalam tanah dan tidak tergantung kepada pengaruh-

pengaruh lingkungan luar yang disebut golongan autochthonous, golongan mikroba

yang kehadirannya di dalam tanah diakibatkan oleh adanya pengaruh-pengaruh luar

yang baru yang disebut golongan zimogenik dan golongan mikroba yang

kehadirannya bersamaan dengan adanya penambahan secara buatan yang disebut

golongan transien. Kelompok mikroba tersebut memiliki peran di tanah terutama

dalam daur unsur organik yang penting untuk kehidupan seperti daur nitrogen dan

daur fosfor. Bakteri yang terlibat dalam daur nitrogen adalah bakteri penambat

nitrogen sedangkan bakteri yang terlibat dalam daur fosfor adalah bakteri pelarut

fosfat.

Bakteri penambat nitrogen merupakan bakteri yang berperan dalam

penyediaan nitrogen pada tanah karena bakteri tipe ini mampu menambat nitrat

dengan mengoksidasi ion ammonium pada tanah sehingga dapat terikat dengan kuat

pada komponen-komponen humus yang menyebabkan nitrat tidak mudah terbilas

keluar tanah (Schlegel, 1994).

Bakteri pelarut fosfat merupakan bakteri yang berperan dalam penyuburan

tanah karena bakteri tipe ini mampu melakukan mekanisme pelarutan fosfat dengan

mengekskresikan sejumlah asam organik berbobot molekul rendah seperti oksalat,

suksinat, fumarat, malat. Asam organik ini akan bereaksi dengan bahan pengikat

fosfat seperti Al3+, Fe3+, Ca2+, atau Mg2+ membentuk khelat organik yang stabil

sehingga mampu membebaskan ion fosfat terikat dan oleh karena itu dapat diserap

oleh tanaman hidupnya (Suriadikarta dan Simanungkalit, 2006).

Data yang ada mengenai genera bakteri penambat nitrogen dan pelarut fosfat

pada tanah gambut terutama di provinsi Kalimantan Timur masih sangat minim. Oleh

karena itu, perlu diadakan eksplorasi lebih lanjut untuk memberikan informasi ilmiah

terkait hal tersebut. Diharapkan dari penelitian ini dapat diperoleh informasi terkait

genera bakteri penambat nitrogen dan pelarut fosfat sehingga dapat dimanfaatkan

ADLN - Perpustakaan Universitas Airlangga

Skripsi Eksplorasi Bakteri Penambat Nitrogen dan Bakteri Pelarut Fosfat pada ... Suwatno, Ario M. W. Y.

sebagai landasan untuk pengembangan teknologi pertanian pada tanah gambut di

provinsi Kalimantan Timur.

METODE PENELITIAN

a. Bahan Penelitian

Bahan yang digunakan untuk diisolasi adalah sampel tanah gambut

permukaan yang diambil di kecamatan Samarinda Utara provinsi Kalimantan

Timur. Bahan-bahan yang digunakan untuk pembuatan media dan uji fisiologis

adalah KOH, K2HPO4, FeSO4, MnSO4, MgSO4, NaCl, CaCl2, N2MoO2, BTB

(Bomothymol Blue), Bacto Agar, glukosa, trikalium fosfat, (NH4)2SO4, KCl,

MgSO4.7H2O, MnSo4, FeSO4, ekstrak khamir, Nutrient Agar (NA), alkohol 70

%, spiritus, dan akuades.

b. Prosedur Penelitian

1. Pengambilan sampel tanah

Lokasi sampel yang akan diambil tanahnya dibersihkan dari seresah,

kemudian rangka besi yang disiapkan disemprot dengan alkohol 95 %.

Selanjutnya rangka ditekan ke dalam tanah, tanah yang berada dalam rangka

diambil menggunakan spatula. Sampel tanah yang diambil dimasukkan ke dalam

plastik dan diberi label, kemudian dimasukkan ke dalam termos es yangberisi es

kering dengan suhu 2-4oC

2. Preparasi sampel

Sampel tanah ditimbang sebanyak 25 g kemudian dicampurkan ke dalam 225

mL akuades steril. Campuran tanah dan akuades steril tersebut di homogenkan

menggunakan vortex untuk kemudian didiamkan sampai terbentuk dua lapisan

yang berbeda, yakni suspensi air tanah dan substrat tanah.

ADLN - Perpustakaan Universitas Airlangga

Skripsi Eksplorasi Bakteri Penambat Nitrogen dan Bakteri Pelarut Fosfat pada ... Suwatno, Ario M. W. Y.

3. Tahap enrichment menggunakan media NFB semi-solid

Suspensi air tanah diambil 10 mL untuk kemudian diencerkan sebanyak

1000x, kemudian dari pengenceran 100x dipindahkan secara aseptik

menggunakan jarum ose lurus ke dalam 3 tabung yang berisi media NFB semi

solid dengan menggunakan metode stab. Setelah dilakukan inkubasi selama 24

jam pada suhu ruang, dilakukan pengamatan untuk mengetahui aktivitas

penambatan nitrogen yang ditandai dengan terbentuknya pelikel dan perubahan

warna media dari krem menjadi biru pada media NFB semi-solid.

4. Isolasi dan identifikasi bakteri penambat nitrogen

Hasil seri pengenceran 10x dari media NFB semi-solid diambil secara aseptik

untuk dipindahkan ke cawan petri dan ditanam pada media NFB solid

menggunakan metode pour plate. Setelah dilakukan inkubasi selama 24 jam pada

suhu ruang, dilakukan pengamatan untuk mengetahui aktivitas penambatan

nitrogen yang ditandai dengan perubahan warna media dari krem menjadi biru di

sekitar koloni yang tumbuh.

Koloni bakteri yang tumbuh pada media NFB solid kemudian diamati karakter

makroskopis koloni terebut berupa warna, bentuk, elevasi, permukaan, tepi,

ukuran dan karakteristik optik; dan karakter mikroskopis koloni tersebut berupa

reaksi Gram dan bentuk sel bakteri.

5. Isolasi dan identifikasi bakteri pelarut fosfat

Hasil seri pengenceran 10x diambil secara aseptik untuk dipindahkan ke

cawan petri dan ditanam pada media pikovskaya menggunakan metode pour

plate. Setelah dilakukan inkubasi selama 24 jam pada suhu ruang, dilakukan

pengamatan untuk mengetahui aktivitas pelarutan fosfat yang ditandai dengan

terbentuknya zona halo di sekitar koloni yang tumbuh.

Koloni bakteri yang tumbuh pada media pikovskaya kemudian diamati

karakter makroskopis koloni terebut berupa warna, bentuk, elevasi, permukaan,

ADLN - Perpustakaan Universitas Airlangga

Skripsi Eksplorasi Bakteri Penambat Nitrogen dan Bakteri Pelarut Fosfat pada ... Suwatno, Ario M. W. Y.

tepi, ukuran dan karakteristik optik; dan karakter mikroskopis koloni tersebut

berupa reaksi Gram dan bentuk sel bakteri.

6. Identifikasi menggunakan uji fisiologi

Uji fisiologis dilakukan untuk mengetahui karakter fisiologis masing-masing

isolat. Uji fisiologis menggunakan media identifikasi yang terdapat pada buku

panduan OXOID. Isolat bakteri yang sudah diketahui karakternya kemudian

dicocokkan dengan buku panduan Bergey’s Manual of Determinative

Bacteriology 9th Edition (Holt, et al., 2000). Uji fisiologis meliputi: Lysine,

Ornithin, H2S, Glucose, Manitol, Xylose, ONPG, Indole, Urease, V-P,

Citrate, TDA, Gelatin, Malonate, Inositol, Sorbitol, Rhamnose, Sucrose,

Lactose, Arabinose, Adonitol, Rafinose, Salicin dan Arginine.

HASIL DAN PEMBAHASAN

a. Pengukuran Parameter Ekologi pada Lingkungan Lahan Gambut

Dari pengukuran yang dilakukan terhadap lingkungan lahan gambut

didapatkan data sebagai berikut

Tabel 1. Data temperatur dan pH sampel tanah gambut

Nomor Sampel Lokasi Sampel Temperatur pH

1 Persawahan 25o C 6

2 Pekarangan 24,8o C 5,5

3 Lahan Gambut 25,6o C 5

Data ini didukung oleh data dari Badan Meteorologi Klimatologi dan

Geofisika (BMKG) kota Samarinda tahun 2011 yang menunjukkan

temperatur lokasi pengambilan sampel pada bulan Maret 2011 berkisar antara

27-32o C.

ADLN - Perpustakaan Universitas Airlangga

Skripsi Eksplorasi Bakteri Penambat Nitrogen dan Bakteri Pelarut Fosfat pada ... Suwatno, Ario M. W. Y.

b. Isolasi bakteri penambat nitrogen

Hasil isolasi dari ketiga lokasi sampling menggunakan media NFB semi-solid

menunjukkan adanya bakteri penambat nitrogen yang ditandai dengan

terbentuknya pelikel berupa selaput atau cincin putih yang terlihat setelah satu

minggu dari masa awal isolasi dan setelah itu terjadi perubahan warna pada

media dari warna krem menjadi biru.

Gambar 1. Visualisasi perubahan warna media NFB semi-semi solid hasil

isolasi bakteri penambat nitrogen dari tanah gambut

c. Identifikasi bakteri penambat nitrogen

Dari isolasi sampel tanah gambut pada media NFB semi-solid yang

menunjukkan hasil positif dilakukan inokulasi ke media NFB agar. Koloni

bakteri yang memiliki karakter dengan tingkat kesamaan yang tinggi

dikelompokkan menjadi satu kelompok. Karakteristik koloni bakteri yang

tumbuh pada media NFB agar berupa karakteristik makroskopis dan

mikroskopisnya secara detail dapat dilihat pada tabel 2 .

ADLN - Perpustakaan Universitas Airlangga

Skripsi Eksplorasi Bakteri Penambat Nitrogen dan Bakteri Pelarut Fosfat pada ... Suwatno, Ario M. W. Y.

Tabel 2. Karakter mikroskopis dan makroskopis isolat bakteri penambat `

nitrogen yang diisolasi dari tanah gambut

KARAKTER KODE ISOLAT

N1.1 N2.1 N3.1

Mik

rosk

opis

Bentuk Kokoid Kokoid Batang

Hasil Pewarnaan

Gram - - -

Mak

rosk

opis

Warna koloni Putih Putih Putih

kekuningan

Bentuk koloni Bulat Bulat Bulat

Elevasi koloni Cembung Cembung Rata

Permukaan

koloni

Halus

mengkilap

Halus

mengkilap

Halus

mengkilap

Tepi koloni Rata Rata Rata

Ukuran koloni Berupa titik Berupa titik Kecil

Karakteristik

optik Buram Buram Buram

d. Uji fisiologi bakteri penambat nitrogen

Isolat bakteri penambat nitrogen yang telah dimurnikan kemudian diuji

kemampuan fisiologi biokimianya menggunakan kit MICROBACT™ GNB

12A/E dan 12 B. Dalam penelitian ini isolat yang diuji adalah isolat N1.1, hal ini

didasarkan pada adanya kesamaan karakter makroskopis dan mikroskopis isolat

bakteri penambat nitrogen yang telah diisolasi sehingga diperoleh hasil isolat

N1.1 mampu memecah gugus asam amino Lysine, Ornithine, dan Arginine; dapat

memfermentasi Glukosa, Manitol, Xylose, Malonate, Inositol, Sorbitol,

Rhamnose, Sucrose, Arabinose, Adonitol, Rafinose, Salicin dan Lactose; dapat

menghidrolisis Urease namun tidak menghidrolisis ONPG dan Gelatin; tidak

ADLN - Perpustakaan Universitas Airlangga

Skripsi Eksplorasi Bakteri Penambat Nitrogen dan Bakteri Pelarut Fosfat pada ... Suwatno, Ario M. W. Y.

menghidrolisis asam amino sistein pada uji H2S; terbentuk Indole; terbentuk

acetoin pada uji Voges-Proskauer; menghasilkan enzim citrase pada uji Citrate;

mendeaminasi Tryptophan pada uji TDA.

e. Isolasi bakteri palarut fosfat

Dalam isolasi bakteri dari ketiga lokasi sampling menggunakan media

pikovskaya diperoleh bakteri pelarut fosfat yang ditandai dengan terbentuknya

zona halo pada inkubasi hari ketiga dari masa awal isolasi, hal ini menunjukkan

bahwa koloni bakteri yang tumbuh pada media pikovskaya dapat melarutkan

fosfat berupa trikalium fosfat yang terdapat dalam media tersebut. Kenampakan

zona halo pada media pikovskaya dapat dilihat pada gambar 2.

Gambar 2. Visualisasi zona halo pada media pikovskaya

f. Identifikasi bakteri pelarut fosfat

Dari isolasi sampel tanah gambut pada media pikovskaya yang menunjukkan

hasil positif dilakukan karakterisasi pada koloni yang tumbuh. Koloni bakteri

yang memiliki karakter dengan tingkat kesamaan yang tinggi dikelompokkan

menjadi satu kelompok. Karakteristik koloni bakteri yang tumbuh pada media

pikovskaya berupa karakteristik makroskopis dan mikroskopisnya secara detail

dapat dilihat pada tabel 3.

Zona halo

ADLN - Perpustakaan Universitas Airlangga

Skripsi Eksplorasi Bakteri Penambat Nitrogen dan Bakteri Pelarut Fosfat pada ... Suwatno, Ario M. W. Y.

Tabel 3. Karakter mikroskopis dan makroskopis isolat bakteri pelarut fosfat

yang diisolasi dari tanah gambut

KARAKTER

KODE ISOLAT

F1.5, F1.6,

F1.16, F1.25

F1.4, F1.10, F1.13,

F1.14, F1.18, F1.19,

F1.20, F1.22, F1.24,

F1.26, F2.2, F2.4,

F2.5

F1.1, F1.2, F1.3,

F1.7, F1.8, F1.9,

F1.11, F1.12,

F1.15, F1.17,

F1.21, F1.23, F2.1,

F2.3

Mik

rosk

opis Bentuk Basil tipe 1 Basil tipe 2 Basil tipe 3

Hasil Pewarnaan

Gram + + -

Mak

rosk

opis

Warna koloni Putih susu Putih Transparan

Bentuk koloni Bulat Bulat Bulat

Elevasi koloni Cembung Cembung Rata

Permukaan

koloni

Halus

mengkilap Halus mengkilap Halus mengkilap

Tepi koloni Rata Rata Rata

Ukuran koloni Sedang Kecil Kecil

Karakteristik

optik Buram Buram Transparan

g. Uji fisiologi bakteri pelarut fosfat

Isolat bakteri penambat nitrogen yang telah dimurnikan kemudian diuji

kemampuan fisiologi biokimianya menggunakan kit MICROBACT™ GNB

12A/E dan 12 B. Dalam penelitian ini isolat yang diuji adalah isolat F1.1 dan

F1.4, hal ini didasarkan pada adanya kesamaan karakter makroskopis dan

ADLN - Perpustakaan Universitas Airlangga

Skripsi Eksplorasi Bakteri Penambat Nitrogen dan Bakteri Pelarut Fosfat pada ... Suwatno, Ario M. W. Y.

mikroskopis isolat bakteri penambat nitrogen yang telah diisolasi sehingga

diperoleh hasil isolat F1.1 mampu memecah gugus asam amino Lysine,

Ornithine, dan Arginine; dapat memfermentasi Glucose, Manitol, Xylose,

Malonate, Inositol, Sorbitol, Rhamnose, Sucrose, Arabinose, Adonitol, Rafinose

dan Salicin namun tidak memfermentasi Lactose; tidak menghidrolisis ONPG,

Gelatin dan Urease; tidak menghidrolisis asam amino sistein pada uji H2S;

terbentuk Indole; terbentuk acetoin pada uji Voges-Proskauer; menghasilkan

enzim citrase pada uji Citrate; tidak mendeaminasi Tryptophan pada uji TDA.

Sedangkan isolat F1.4 mampu memecah gugus asam amino Lysine, Ornithine,

dan Arginine; tidak dapat memfermentasi Glukosa, Manitol, Xylose, Malonate,

Inositol, Sorbitol, Rhamnose, Sucrose, Arabinose, Adonitol, Rafinose, Salicin dan

Lactose; dapat menghidrolisis Gelatin dan Urease namun tidak menghidrolisis

ONPG; tidak menghidrolisis asam amino sistein pada uji H2S; tidak terbentuk

Indole; tidak terbentuk acetoin pada uji Voges-Proskauer; tidak menghasilkan

enzim citrase pada uji Citrate; mendeaminasi Tryptophan pada uji TDA.

h. Hasil identifikasi bakteri penambat nitrogen

Setelah diketahui karakter makroskopis, mikroskopis dan fisiologis dari isolat

N1.1, dilakukan perbandingan antara karakter isolat N1.1 dengan karakter genus

Azotobacter, Azospirillum dan Azomonas yang merupakan bakteri penambat

nitrogen non simbiosis yang terdapat pada lahan gambut (Widiawati, dkk., 2010).

Perbandingan karakter antara genus Azotobacter, Azospirillum dan Azomonas

dengan isolat N1.1 dapat dilihat pada tabel 4.

ADLN - Perpustakaan Universitas Airlangga

Skripsi Eksplorasi Bakteri Penambat Nitrogen dan Bakteri Pelarut Fosfat pada ... Suwatno, Ario M. W. Y.

Tabel 4. Perbandingan karakter genus Azotobacter, Azospirillum dan

Azomonas dengan isolat N1.1

Jenis Karakter

Karakter

genus

Azotobacter

Karakter

genus

Azospirillum

Karakter

genus

Azomonas

Karakter

isolat N1.1

Hasil pewarnaan

Gram -

- - -

Bentuk sel Batang-kokoid Spiral Batang-kokoid Batang

Warna koloni Putih-cokelat Merah muda Merah muda Putih

Tepi koloni Rata Rata Rata Rata

Elevasi Cembung Datar Cembung Cembung

Menambat nitrogen

(NFB semi solid) + + + +

Uji Voges-

Proskauer D

- D +

Membentuk Indole D - D +

Hidrolisis Urease + D + +

pH pertumbuhan 4,8-8,5

(kisaran) 7

4,5-9,0

(kisaran) 6

Habitat asal Tanah dan air Tanah Daerah

perairan

Tanah

gambut

Karakteristik optik Buram Buram Buram Buram

Mikroaerofilik + + + +

Fermentasi Lactose + D + +

Hidrolisis Gelatin - D - -

Sumber: Breed, et al. (1957); Holt, et al. (2000); Wedhastri (2002); Isminami,

dkk. (2007); Becking (2006); Joseph, et al. (2007); Sandeep, et al. (2011)

Keterangan:

ADLN - Perpustakaan Universitas Airlangga

Skripsi Eksplorasi Bakteri Penambat Nitrogen dan Bakteri Pelarut Fosfat pada ... Suwatno, Ario M. W. Y.

- : 90% dari strain yang ada bersifat negatif

+ : 90% dari strain yang ada bersifat positif

D : terdapat reaksi berbeda pada spesies

Hasil perbandingan menunjukkan isolat N1.1 memiliki kesamaan karakter

terbanyak dengan karakter genus Azotobacter yakni sejumlah 13 dari 15 karakter,

sehingga diduga isolat N1.1 merupakan genus Azotobacter.

i. Hasil identifikasi bakteri pelarut fosfat

Setelah diketahui karakter makroskopis, mikroskopis dan fisiologis dari isolat

F1.1 dan F1.4, dilakukan perbandingan antara karakter isolat F1.1 dan F1.4

dengan karakter genus Pseudomonas, Bacillus dan Micrococcus yang merupakan

bakteri pelarut fosfat yang terdapat pada lahan gambut (Widiawati, dkk., 2010).

Perbandingan karakter antara genus Pseudomonas, Bacillus dan Micrococcus

dengan isolat F1.1 dan F1.4 dapat dilihat pada tabel 5 dan tabel 6.

Tabel 5. Perbandingan karakter genus Pseudomonas, Bacillus dan

Micrococcus dengan isolat F1.1

Jenis Karakter

Karakter

genus

Pseudomonas

Karakter

genus

Bacillus

Karakter

genus

Micrococcus

Karakter

isolat F1.1

Hasil pewarnaan

Gram - + + -

Bentuk sel Batang-

kokoid Batang Bundar Batang

Warna koloni Transparan Putih Kuning-

cokelat Transparan

Tepi koloni Rata Rata-

berombak Rata Rata

ADLN - Perpustakaan Universitas Airlangga

Skripsi Eksplorasi Bakteri Penambat Nitrogen dan Bakteri Pelarut Fosfat pada ... Suwatno, Ario M. W. Y.

Elevasi Cembung Meningkat-

cembung Cembung Cembung

Melarutkan fosfat

(media pikovskaya) + + + +

Uji Voges-

Proskauer - D D -

Membentuk Indole D - - +

Hidrolisis Urease - + - -

pH pertumbuhan 4-8 (kisaran) 5-10

(kisaran) 7 6

Habitat asal Tanah dan air Tanah

Kulit

makhluk

hidup, tanah

Tanah

gambut

Karakteristik optik Transparan Buram Translucent Transparan

Mikroaerofilik + + - +

Fermentasi Lactose - + + -

Hidrolisis Gelatin - + + -

Sumber: Breed, et al. (1957); Holt, et al. (2000); Moore, et al. (2006);

Joseph, et al. (2007)

Keterangan:

- : 90% dari strain yang ada bersifat negatif

+ : 90% dari strain yang ada bersifat positif

D : terdapat reaksi berbeda pada spesies

ADLN - Perpustakaan Universitas Airlangga

Skripsi Eksplorasi Bakteri Penambat Nitrogen dan Bakteri Pelarut Fosfat pada ... Suwatno, Ario M. W. Y.

Tabel 6. Perbandingan karakter genus Pseudomonas, Bacillus dan

Micrococcus dengan isolat F1.4

Jenis Karakter

Karakter

genus

Pseudomonas

Karakter

genus

Bacillus

Karakter

genus

Micrococcus

Karakter

isolat F1.4

Hasil pewarnaan

Gram - + + +

Bentuk sel Batang-

kokoid Batang Bundar Batang

Warna koloni Transparan Putih Kuning-

cokelat Putih susu

Tepi koloni Rata Rata-

berombak Rata Rata

Elevasi Cembung Meningkat-

cembung Cembung Cembung

Melarutkan fosfat

(media pikovskaya) + + + +

Uji Voges-

Proskauer - D D -

Membentuk Indole D - - -

Hidrolisis Urease - + - +

pH pertumbuhan 4-8 (kisaran) 5-10

(kisaran) 7 6

Habitat asal Tanah dan air Tanah

Kulit

makhluk

hidup, tanah

Tanah

gambut

Karakteristik optik Transparan Buram Translucent Buram

Mikroaerofilik + + - +

ADLN - Perpustakaan Universitas Airlangga

Skripsi Eksplorasi Bakteri Penambat Nitrogen dan Bakteri Pelarut Fosfat pada ... Suwatno, Ario M. W. Y.

Fermentasi Lactose - + + +

Hidrolisis Gelatin - + + +

Sumber: Breed, et al. (1957); Holt, et al. (2000); Slepecky dan Hemphill

(2006); Joseph, et al. (2007); Bergey dan Boone (2009)

Keterangan:

- : 90% dari strain yang ada bersifat negatif

+ : 90% dari strain yang ada bersifat positif

D : terdapat reaksi berbeda pada spesies

Hasil perbandingan menunjukkan isolat F1.1 memiliki kesamaan karakter

terbanyak dengan karakter genus Pseudomonas yakni sejumlah 14 dari 15

karakter, sehingga diduga isolat F1.1 merupakan genus Pseudomonas.

Sedangkan isolat F1.4 memiliki kesamaan karakter terbanyak dengan karakter

genus Bacillus yakni sejumlah 13 dari 15 karakter, sehingga diduga isolat F1.4

merupakan genus Bacillus.

KESIMPULAN

Berdasarkan hasil dan pembahasan dapat disimpulkan bahwa genus bakteri

penambat nitrogen non simbiotik yang terdapat pada tanah gambut kecamatan

Samarinda Utara provinsi Kalimantan Timur adalah Azotobacter dan genus bakteri

pelarut fosfat yang terdapat pada tanah gambut kecamatan Samarinda Utara provinsi

Kalimantan Timur adalah Bacillus dan Pseudomonas.

DAFTAR PUSTAKA

Agus, F. dan Subiksa, I.G.M. 2008. Lahan Gambut: Potensi untuk Pertanian dan Aspek Lingkungan. Balai Penelitian Tanah dan World Agroforestry Centre (ICRAF). Bogor.

Anonim. 2010b. About Peatlands. www.wetlands.org/Whatwedo/PeatlandsandCO2emissions/Aboutpeatlands/tabid/1362/Default.aspx. Diakses pada 5 Desember 2010.

ADLN - Perpustakaan Universitas Airlangga

Skripsi Eksplorasi Bakteri Penambat Nitrogen dan Bakteri Pelarut Fosfat pada ... Suwatno, Ario M. W. Y.

Bergey, D.H. dan Boone, D.R. 2009. Bergey's Manual of Systematic Bacteriology. Second Edition. Volume Three: The Firmicutes. Springer. United States of America.

Becking, J.H. 2006. The Prokaryotes: A Handbook on The Biology of Bacteria.

The Family Azotobacteraceae. Third Edition. Volume 6: Proteobacteria: Gamma Subclasses. Springer Science. Singapore.

Boone, D.R., G.M. Garrity, R.W. Castenholz, D.J. Brenner, N.R. Krieg, J.T. Staley.

2005. Bergey's Manual of Systematic Bacteriology. Second Edition. Volume Two: The Proteobacteria: Part C: The Alpha-, Beta-, Delta-, and Epsilonproteobacteria. Springer. United States of America.

Breed, R.S., E.G.D Murray dan N.R. Smith. 1957. Bergey’s Manual of

Determinative Bacteriology. Seventh Edition. Williams and Wilkins. Philadhelphia.

Holt, John G., N.R. Krieg, P.H.A. Sneath, J.T. Staley dan S.T. Williams. 2000.

Bergey’s Manual of Determinative Bacteriology. Ninth Edition. Williams & Wilkins. Philadelphia.

Isminarni, F., S. Wedhastari, J. Widada dan B.H. Purwanto. 2007. Penambatan

Nitrogen dan Penghasilan Indol Asam Asetat oleh Isolat-Isolat Azotobacter pada pH Rendah dan Alumunium Tinggi. Jurnal Tanah dan Lingkungan Vol. 7 no. 1. Hal. 23-30.

Joseph, B., R.R. Patra, R. Lawrence. 2007. Characterization of Plant Growth Promoting Rhizobacteria Associated with Chickpea (Cicer arietinum L.). International Journal of Plant Production, 1(2).

Moore, E.R.B., B.J. Tindall, V.A.P.M.D. Santos, D.H. Pieper, J.L. Ramos dan N.J.

Palleroni. 2006. The Prokaryotes: A Handbook on The Biology of Bacteria. Nonmedical-Pseudomonas. Third Edition. Volume 6: Gamma Subclass. Singapore.

Sandeep, C., S.N. Rashmi, V. Sharmila, R. Surekha, R. Tejaswini dan C.K Suresh.

Growth Response of Amaranthus gangeticus to Azotobacter chroococcum Isolated from Different Agroclimatic Zones of Karnataka. Journal of Phytology 2011, 3 (7). Hal 29-34.

Schlegel, H.G. dan Schmidt, K. 1994. Mikrobiologi Umum. Gajah Mada University

Press. Yogyakarta. Slepecky, R.A. dan Hemphill, E. H. 2006. The Prokaryotes: A Handbook on The

Biology of Bacteria. The Genus Bacillus-Nonmedical. Third Edition. Volume 4: Bacteria: Firmicutes, Cyanobacteria. Singapore.

ADLN - Perpustakaan Universitas Airlangga

Skripsi Eksplorasi Bakteri Penambat Nitrogen dan Bakteri Pelarut Fosfat pada ... Suwatno, Ario M. W. Y.

Suriadikarta, R.D.M dan Simanungkalit, D.A. 2006. Pupuk Organik dan Pupuk

Hayati. Balai Besar Litbang Sumberdaya Lahan Pertanian Badan Penelitian dan Pengembangan Pertanian. Bogor.

Wedhastari, S. 2002. Isolasi dan Seleksi Azotobacter spp. Penghasil Faktor

Tumbuh dan Penambat Nitrogen dari Tanah Masam. Jurnal Ilmu Tanah dan Lingkungan Vol. 3 (1). Hal 45-51.

Yuleli. 2009. Penggunaan Beberapa Jenis Fungi untuk Meningkatkan

Pertumbuhan Tanaman Karet (Hevea Brasiliensis) di Tanah Gambut. Tesis. Sekolah Pascasarjana Universitas Sumatera Utara. Medan.

ADLN - Perpustakaan Universitas Airlangga

Skripsi Eksplorasi Bakteri Penambat Nitrogen dan Bakteri Pelarut Fosfat pada ... Suwatno, Ario M. W. Y.

Lampiran 2. Bahan penelitian

Bahan dasar media agar pikovskaya Bahan dasar media NFB

Nutrien agar Alkohol 70% Spiritus

Bahan pewarnaan Gram

ADLN - Perpustakaan Universitas Airlangga

Skripsi Eksplorasi Bakteri Penambat Nitrogen dan Bakteri Pelarut Fosfat pada ... Suwatno, Ario M. W. Y.

Lampiran 3. Alat-alat penelitian

Inkubator

Timbangan analitik

Autoclave Waterbath

Soil tester

Kompor listrik

ADLN - Perpustakaan Universitas Airlangga

Skripsi Eksplorasi Bakteri Penambat Nitrogen dan Bakteri Pelarut Fosfat pada ... Suwatno, Ario M. W. Y.

Vortex Mikroskop binokuler

ADLN - Perpustakaan Universitas Airlangga

Skripsi Eksplorasi Bakteri Penambat Nitrogen dan Bakteri Pelarut Fosfat pada ... Suwatno, Ario M. W. Y.

Lampiran 4. Visualisasi lokasi pengambilan sampel

Lokasi pekarangan

Lokasi persawahan

Lokasi lahan gambut

ADLN - Perpustakaan Universitas Airlangga

Skripsi Eksplorasi Bakteri Penambat Nitrogen dan Bakteri Pelarut Fosfat pada ... Suwatno, Ario M. W. Y.

Lampiran 5. Hasil penelitian

Biakan miring Bacillus Biakan miring Azotobacter

Biakan miring Pseudomonas

ADLN - Perpustakaan Universitas Airlangga

Skripsi Eksplorasi Bakteri Penambat Nitrogen dan Bakteri Pelarut Fosfat pada ... Suwatno, Ario M. W. Y.

Bentuk mikroskopis genus terduga Azotobacter. Bentuk sel kokoid. Gram negatif. Perbesaran 100x.

Bentuk mikroskopis genus terduga Bacillus. Bentuk sel batang. Gram

positif. Perbesaran 100x.

Bentuk mikroskopis genus terduga Pseudomonas. Bentuk sel batang. Gram negatif. Perbesaran 100x.

10 µm

10 µm

10 µm

ADLN - Perpustakaan Universitas Airlangga

Skripsi Eksplorasi Bakteri Penambat Nitrogen dan Bakteri Pelarut Fosfat pada ... Suwatno, Ario M. W. Y.