ASAM AMINO,PROTEIN

&ASAM NUKLEAT

Kuliah Biomedik 1

Fakultas Kedokteran

Universitas Tarumanagara

MAKANAN NORMAL

campuran kompleks bahan-bahan tumbuhan dan

binatang

PROTEIN, LEMAK, KARBOHIDRAT

DEFINISI

PROTEIN PROTEIOS

Il

Pertama

POLIAMIDA

Asam-asam amino = 20 macam

STRUKTUR UMUM

H2N CH C

R

OH

O

H2N CH C

R OH

O+H3N CH C

R O -

O

ION DIPOLAR

ZWITTER ION

RANTAI SAMPING

• R = alifatik gly, ala, val, leu, ile, pro

• R = hidrosiklik ser, thr

• R = aromatik phe, tyr, trp

• R = asam asp, glu

• R = amida asn, gln

• R = basa lys, arg, his

• R = mengand. S cys, met

KONFIGURASI

CHO

HO

CH 2

OH

L-Gliseraldehid

H C

H N C H

COOH

R

asam L-amino

..

2

ALANIN = ALA

CH3 C

NH3 +

COO -

H pKa =

pKb =

2,3

9,7

HCOOH C

NH3 +

CH3OH

-

H +

HCOO

-C

NH3 +

CH3OH

-

H+

HCOO

-C

NH2

CH3

2,3 9,7 + 1 0 -1

pI = ½ ( 2,3 + 9,7) = 6

ASAM AMINO PROTEIN

- ALANIN m/ Co – Enzym A (asetilasa)

d/ as, pantotenat vitaminC – C – CO2

-

NH3

+

• TAURIN t.d/ sel, terikat pd as. Empedu

C – C – SO3- diturunkan dari sistein

TAURO CHOLAT

NH3+

ASAM AMINO PROTEIN• As. - AMINO BUTIRAT (GABA)

C – C – C – CO2- m/ decarboksilasi A.

GLUTAMAT

NH3+ d/ jar. Otak, ragi, bakteri

• As. - AMINO ISO BUTIRAT m/ hasil

H3N+ – C – C – CO2- katabolisme pirimidin d/ otot tnt

CH3

Penentuan a.a.

• kromatografi daya partisi a.a terhadap

fasa diam dan fasa gerak

• mikrobiologi mikroorganisme

• kolorimetri perband. warna p. suatu Rx.

REAKSI WARNA

Rx warna asam amino

NAMA PEREAKSI a.a. WARNA

NIN-HIDRIN Nin-hidrin Ungu Ruheman

NITRO PRUSID

Na-nitroprusid/NH4OH encer

SISTEIN Merah

HOPKINS-COLE

As. glioksilat/ H2SO4

TRIPTOFAN Ungu

MILLON HgNO3 / HNO3 TIROSIN Merah

KSANTO PROTEIN

HONO2 pekat Tir, trp, phe(inti benzen)

Kuning

SAKAGUCHI Alfa-naftol + Na-hipoklorit

ARGININ Merah

SULLIVAN Na-naftokuinon-1,2-sulfonat-4

SISTEIN Merah

Rx warna asam amino

NAMA PEREAKSI a.a. WARNA

SULLIVAN Na-naftokuinon-1,2-sulfonat-4

SISTEIN Merah

PAULY Na-hipoklorit, As.Sulfanilat yang didiazokan d. basa

TIROSINHISTIDIN

Merah

EHRLICH p-dime-amino-benzaldehid/ HCl 12N

TRIPTOFAN Biru

FOLIN-CASCALTEU

As. fosfomolibdo-tungstat

TIROSIN Merah

PEPTIDAPEPTIDA

H2N CH C

R1

OH

O

H2N CH C

R2

OH

O

+

a.a. 1 a.a 2

H2N CH C

R1

O

H N

CH C

R2

OH

O

Residu NIkatanpeptida

Residu C

TATA NAMA

• INA IL

• Dari ujung kiri kanan, atau ujung C ujung C

Glutation = γ - glutamil – sisteil – glisin

Glu - cys - gly

• TRF = piroglutamil-histidil-prolinamida

NH

CH C

CH2 OH2C

CO HN CH C

CH2

O

N

NH

NC

NH2

O

PENENTUAN STRUKTUR PEPTIDA

• JENIS DAN BANYAK ASAM AMINO

(AMINO ACID ANALYZER).

• URUTAN ASAM AMINO

▨ ANALISIS RESIDU UJUNG N

1. PEREAKSI SANGER 2,4-DINITROFLUOROBENZEN (DNP) FLUORO BEREAKSI DENGAN GUGUS NH2 PADA RANTAI

▨ 2. PEREAKSI EDMAN FENIL ISOTIOSIANAT

PENANDAAN DAN PEMBEBASAN AA UJUNG N HETEROSIKLIK FENILTIOHIDANTOIN + A A BERIKUT

• PEMUTUS POLIPEPTIDA SPESIFIK

ENZIM PROTEOLITIK

ENZIM PROTEOLITIK

No.

PEREAKSI SISI PEMUTUS

1. KIMOTRIPSIN Phe, Tyr, Trp

2. PEPSIN Tyr, Phe, Trp

3. TERMOLISIN Ile, Leu, Val

4. TRIPSIN Lys, Arg

5. SIANOGEN BROMIDA (CNBr) Met

6. KARBOKSI PEPTIDASE ASAM AMINO UJUNG C

PROTEIN POLIAMIDA PEPTIDA

PROTEIN POLIAMIDA PEPTIDA > 100 a.a. < 100 a.a.

H2O

a. a.a. Prot. Sederhana a.a. + bukan a.a. Prot. Majemuk

hem, k.h., l, as. nukleat

SIFAT-SIFAT PROTEIN

1. LARUT DENATURASI» BER (-) KELARUTAN

» HILANGNYA KEAKTIFAN ENZIM, HORMON

» # DIHABLURKAN KEMBALI

PERUB. STR.

PEMECAHAN IKATAN

KOAGULASI DENATURASI PERMANEN

SIFAT-SIFAT PROTEIN

2. KOLOID HIDROFIL

( -NH2, -COOH, -OH )

3. AMFOTER

4. PROTEIN (-) mengikat KATION

PROTEIN (+) mengikat ANION

5. BERDIALISIS

6. Rx. PRESIPITASI:– As. Mineral <<< mengendap, >>> larut– Basa H2O mengendap– Pereaksi alkaloid mengendap. Bila pH = pI– (trikloro asetat, as. tanat, dll) – garam dr. logam berat, mengendap tgt. PH, suhu,

e-lit– alkohol, mengendap, >>> efektif pada pI– pemanasan koagulasi # larut– suhu eff. 38 oC - 75 oC

KLASIFIKASI PROTEIN TUGAS

a. PROTEIN SERAT pembentuk otot, kulit, rambut, (Fibrous protein) dinding pembuluh darah,

tdd. Molekul yang panjang, erat dan larut

– Contoh:• Kolagen jar. Penyambung kaya OH-prolin• Elastin urat & pembuluh darah• Keratin rambut, kuku, bulu burung kaya

sistein & sistin

KLASIFIKASI PROTEIN TUGAS

b. PROTEIN GLOBULAR melakukan berbagai fungsi

(tipe fungsional) larut d. air

– Contoh:• Hb pembawa oksigen ke sel• Insulin berperan dalam metabolisme karbohidrat• Antibodi membentuk protein asing menjadi tidak aktif• Fibrinogen memb. serat2 tdk larut yg menggump.

darah• Hormon membawa pesan keseluruh tubuh

KLASIFIKASI PROTEIN TUGAS

• ENZIM KATALIS BIOLOGIK

• HORMON PEMBAWA BERITA KIMIA

• PROT. TRANSPOR PEMBAWA MOLEKUL KECIL

• PROT. CADANGAN , Seperti : Kasein susu

Ovalbumin putih telur

KLASIFIKASI PROTEIN TUGAS

• PROTEIN KONYUGASI bersenyawa dengan non (conyugate protein) protein

– Contoh: - as nukleat nukleo protein• - > 4% karbohidrat muko protein• - < 4% karbohidrat gliko protein• - lipid lipoprotein pospolipid kolesterol

• - zat warna kromo protein• - asam pospat fosfo protein• - ion logam metalo protein

STRUKTUR PROTEIN

• STRUKTUR PRIMER– m/ rentetan a.a. molekul protein, akibat ik. PEPTIDA– PENENTU IDENTITAS PROTEIN

• STRUKTUR SEKUNDER– Ik. HIDROGEN– Ik. DISULFIDA MELILITNYA RANTAI POLIPEPTIDA

• STRUKTUR TERSIER

– Ik. HIDROGEN– GAYA VAN DER WALLS PELIPATAN LAPISAN

• STRUKTUR KUARTERNER SEP. BOLA-BOLA

ASAM NUKLEAT ASAM NUKLEAT

(DNA , RNA)polimer

NUKLEOTIDA

BASA NITROGEN NUKLEOSIDA1 UNIT GULA NUKLEOTIDA1 GUGUS FOSFAT

ik. Kovalen

hetero atom pada P & P dari C 1’ pada Gula

• Misal nukleosida:

ADENIN + β D.2 DEOKSI RIBOSA

9

1'

5'

N

NN

N

NH2

O

HOH

HH

HH

HO

Misal Nukleotida pirimidin:URIDIN TRIPOSPAT(UTP)

O

NH

O

ON

O

OHOH

HH

HH

OP

O-

O

P

O

O

O-

P

O

HO

O-

1'

2'3'

4'

5'

NUKLEOTIDA MONOPOSPAT UTAMA

NUKLEOTIDA NAMABASA UNSUR NUKLEOSIDA

RIBO NUKLEOTIDA- AMP- GMP- CMP- UMP

ADENINGUANINSITOSINURASIL

ADENOSINGUANOSINSITIDINURIDIN

DEOKSI RIBO NUKLEOTIDA- d AMP- d GMP- d CMP- d TMP

ADENINGUANINSITOSIN

TIMIN

deoksi ADENOSIN deoksi GUANOSIN deoksi SITIDINdeoksi TIMIDIN