Diseño, evaluación y validación de un método Presencia/Ausencia para analizar Clostridium...
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Medio Ambiente
“Diseño, evaluación y validación de un método
Presencia/Ausencia para analizar Clostridium
perfringens”Mariano Gómez - Applus+ Medio Ambiente
Santiago de Compostela
Manuel Araujo – I.I.A.A. Universidad Santiago de Compostela
Medio Ambiente
Antecedentes 1
El R.D. 140/03 establece "0" (cero) en cien ml como valor admisible
para coliformes, E. coli, enterococos y C. perfringens. Si se acepta
esto, no cabe duda de que se está en una situación en la que el
número de esos indicadores en agua es irrelevante, puesto que el
punto de corte, o sea, el valor discriminante, es 1. Esto es obvio, ya
que la mera presencia de UNO de esos microorganismos en
CUALQUIER volumen de agua, es suficiente para cambiar su
calificación. Basándose en esto, es lógico pensar que la metodología
analítica amparada por tal R.D., debiera ser la necesaria para dar una
respuesta de PRESENCIA/AUSENCIA en un volumen de agua
previamente definido
Medio Ambiente
� El R.D. 140/03 sigue propugnando métodos analíticos diseñados para
recuentos bacterianos, más propios de épocas en las que se consideraba
admisible una cierto número de bacterias indicadoras en agua, que de los
tiempos actuales, en los que el propio R.D. establece límites de tolerancia
nulos
� Es más, en el caso de la metodología analítica de referencia para C.
perfringens, no sólo mantiene la filosofía de emplear un método clásico de
recuento (filtración sobre membrana) en una situación en la que la mera
presencia de UN clostridio es determinante, sino que establece el uso del
medio m-CP como guía. Este medio, no sólo no tiene ninguna ventaja
sobre otros de recuento sino que, por si esto fuera poco, su uso introduce
un factor de riesgo innecesario (empleo de vapores de amoniaco) y unos
inconvenientes técnicos, posiblemente asumibles en la década de los
cincuenta, pero totalmente rechazables a las puertas del siglo XXI
Antecedentes 2
Medio AmbienteProyectos desarrollados
� Año 1999: La Xunta de Galicia subvenciona el proyecto : "Diseño de un
medio de cultivo y evaluación de la técnica de detección de Clostridium
perfringens en agua“. Proyecto PGIDTT00IN01E cuya culminación fue la
formulación de un medio P/A para la detección del citado
microorganismo.
� Año 2003: Se obtuvo número de solicitud de patente para la
formulación obtenida: PACp® (nº solicitud de patente P200402323)
�Año 2005 La Xunta de Galicia subvenciona el proyecto: "Evaluación y
validación del medio PACp® para detección de Clostridium perfringens
en agua”. Proyecto PGIDIT04TAL043E cuya culminación ha sido la
validación del medio mediante un ejercicio interlaboratorio
Medio AmbientePor qué de la iniciativa?
Se planteó este trabajo dirigido al desarrollo de una metodología eficaz y
simple para la detección de Clostridium Perfringens en muestras de agua
no sólo porque no se disponía de un procedimiento de presencia-
ausencia para la detección de este parámetro microbiológico, sino
también por su importancia como organismo indicador en aguas
destinadas al consumo humano. Payment ya demostró que las bacterias
esporuladas prácticamente se ven inafectadas por las concentraciones
de cloro residual libre. En este sentido, Clostridium perfringens, es
probablemente la mejor elección como indicador de la inactivación de
ooquistes y virus por cloro, así como un buen indicador de las eficacia del
tratamiento de agua.
Medio AmbienteObjetivos
� Diseñar un medio de cultivo fluorogénico apropiado para la
detección de Clostridium perfringens en aguas por la técnica de
presencia-ausencia.
� Analizar la capacidad del medio diseñado para la detección y
recuento de C. perfringens en aguas, en relación a otros medios
de cultivo, incluido el establecido como guía por el R.D. 140/03.
� Evaluar la capacidad del medio de cultivo y técnica diseñada para
detectar cepas de Clostridium perfringens en presencia y
ausencia de otros microorganismos acompañantes.
� Determinar las propiedades (sensibilidad, especificidad,
selectividad) del medio diseñado para detectar la presencia de
Clostridium perfringens en agua sometida a diferentes tipos de
tratamiento.
Medio AmbienteCómo funciona el PACp®
MUESTRAS DE AGUA
PACp®
AGITACIÓN
PAPA
INCUBACIÓN AEROBIOSIS
44 ± 1ºC/18 ± 2h
UVUV
C. perfringensClostridiumsulfito-reductores
NMPNMP
INCUBACIÓN AEROBIOSIS
44 ± 1ºC/18 ± 2h
UVUV
10
0 m
l
10
ml
Medio Ambiente
Evaluación de selectividad y especifidad
Una vez optimizado el medio PACp® se llevaron a cabo ensayos con
cultivos axénicos de cepas de colección y aisladas del ambiente, con el
objeto de evaluar la capacidad del medio para detectar de forma selectiva
y diferencial Clostridium perfringens. Para ello, se inoculó el medio de
cultivo diseñado con diferentes cepas de Clostridium perfringens, otras
especies del género Clostridium, y otras bacterias reductoras del sulfito y
no reductoras del sulfito pertenecientes a diversas especies y géneros
microbrianos.
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Evaluación de selectividad y especifidad
�Clostridium perfringens: 20 cepas de colección y 50 cepas aisladas en muestras
de agua (muestras con formas vegetativas y muestras con esporas).
�- Otras especies del género Clostridium (C. difficile, C. sordellii).
�- Enterobacterias: 20 cepas de colección (Salmonella spp, Proteus spp,
Escherichia spp, Citrobacter spp, Enterobacter spp, Citrobacter spp).
�- Especies del género Enterococcus: 10 cepas de colección (E. faecium, E.
durans, E. faecalis).
�- Especies del género Staphylococcus: 5 cepas de colección (S. aureus, S.
epidermidis, S. simulans).
�- Especies del género Bacillus: 5 cepas de colección (B. cereus, B. subtilis, B.
coagulans).
�- Especies del género Lactobacillus: 10 cepas de colección (L. brevis, L. casei. L.
acidophilus).
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Metodología analítica
�El análisis de todas las muestras de agua con el medio PACp® se llevó
a cabo bajo dos condiciones de incubación: aerobiosis y anaerobiosis a
37±1°C y 44±1 °C. Se consideraron como un resultado positivo en PACp®
la presencia de crecimiento con precipitado negro y fluorescencia azulada
tras la irradiación con una lámpara de Wood.
�La obtención de resultados idénticos con el medio PACp® incubado en
aerobiosis y anaerobiosis permite confirmar las conclusiones obtenidas
previamente, en el sentido de que la detección de Clostridium perfringens
con el método PACp® puede llevarse a cabo con plena confianza cuando
la incubación se realiza en condiciones de aerobiosis.
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Evaluación de selectividad y especifidad
�Los resultados de estos ensayos permiten concluir que el medio es
especifico y selectivo, por cuanto que las cepas de Clostridium perfringens
dan una respuesta positiva y las cepas no pertenecientes a la citada
especie dan una respuesta negativa.
�Estos resultados se obtuvieron, tanto en ausencia de flora acompañante,
como en su presencia.
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Evaluación de la capacidad del medio de cultivo PACp para detectar Cl. perfringens en muestras de agua.
�Una vez diseñado el medio de cultivo PAcp y la técnica analítica a
emplear para la detección de la presencia-ausencia de Clostridium
Perfringens, la fase final de trabajo consistió en evaluar la capacidad de
esta metodología para detectar estas bacterias en muestras de agua
natural sometidas a diferentes condiciones ambientales.
�Para ello, se analizaron un total de 160 muestras de agua.
Medio AmbienteCuantificación
• El siguiente paso en el desarrollo del método fue estudiar la posible cuantificación de microorganismos utilizando el NMP.
• Para ello se utilizaron dos métodos:
• Un material de referencia fabricado y diseñado en Applus+ Medio ambiente Alicante
• Un ejercicio interlaboratorio para la comparación de metodologías siguiendo la norma ISO 17994:2004 y lasdirectrices de EMAG (European Microbiology Advisory Group).
• Los resultados tanto de muestras naturales como losiniciales del ejercicio se presentan a continuación
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MUESTRAS DE AGUA
FILTRACIÓN
Agar TSC
INCUBACIÓN ANAEROBIOSIS
44 ± 1ºC/21 ± 3h
Agar TSCF
4646ºCºC
1818--24 h24 h
PACp®
10
0 m
l
INCUBACIÓN AEROBIOSIS
45 ± 1ºC/21 ± 3h
UVUV
C. perfringensClostridiumsulfito-reductores
UVUV
C. perfringens
Lactosasulfito
C. perfringensCONFIRMACIÓN
Análisis muestras ambientales
Medio Ambiente
9384-
614213135+
-+-+
TSCFTSC
PACp®
Concordancia entre el número de muestras de agua cl asificadas como positivas y negativas por cada método.
Resultados muestras ambientales
Medio Ambiente
NºType
0012Negatives
93.9139148Positives
%Nº
Cultivos confirmados comoCl. perfringensCultivos a partir del medio PACp ®
Verificacion de cultivos positivos y negativos a partir del medio PACp ®
Resultados verificación de cultivos
Medio Ambiente
Material de referencia
fabricado en Applus+Medio
Ambiente
Disolución de la pastilla en 20 mL de agua
Dilución hasta 1000 mL de agua
Análisis de material de referencia
Medio Ambiente
0
0,5
1
1,5
2
2,5
0 0,5 1 1,5 2 2,5
Log NMP/100 mL (PACp)
Log
UF
C/1
00 m
L (m
CP
, TS
C)
TSC mCP
R2 mCP: 0,71
R2 TSC: 0,75
Resultado con material de referencia
Medio Ambiente
��La La DirectivaDirectiva 98/83/CE98/83/CE establece que los Estados establece que los Estados Miembros pueden emplear métodos alternativos Miembros pueden emplear métodos alternativos siempre que pueda demostrarse que los resultados siempre que pueda demostrarse que los resultados obtenidos sean al menos tan fiables como los obtenidos sean al menos tan fiables como los producidos por lo métodos de referencia o guía.producidos por lo métodos de referencia o guía.
��El Real Decreto 140/2003 establece que los El Real Decreto 140/2003 establece que los laboratorios podrán emplear métodos alternativos, laboratorios podrán emplear métodos alternativos, siempre que estén validados o acreditados o se siempre que estén validados o acreditados o se haya demostrado su equivalencia.haya demostrado su equivalencia.
Ensayos de equivalencia
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Requisitos de la Norma ISO 17994:2004 (Norma española UNE-EN ISO 17994: criterios para establecer la equivalencia entre métodos microbiológicos):
�Definir de los microorganismos diana.
�Participar un grupo de expertos.
�Describir los métodos analíticos y seguir el procedimiento escrito.
�Llevar a cabo una “Training” sesión.
�Participar laboratorios con sistemas de aseguramiento de la calidad.
�Emplear muestras representativas de amplia área geográfica.
�Emplear muestras incluidas en el campo de aplicación de ambos métodos:
�Las muestras naturales son las idóneas. No obstante, no tiene sentido analizar muestras reales de redes de distribución (el doble cero no se puede emplear en el análisis de comparación).
�Pueden prepararse muestras adecuadas por dilución, enriquecimiento o mezclado de diferentes tipos de agua.
�Puede resultar apropiado estresar las poblaciones microbiológicas de algunas muestras mediante la aplicación controlada de desinfectantes o por almacenamiento en condiciones de refrigeración.
Equivalencia entre métodos
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�Emplear muestras que contengan suficiente nº microorganismos diana (10 – 30).
�Las submuestras analizadas por los dos procedimientos deben proceder del mismo envase.
�Participar un mínimo de 6 laboratorios.
�Anotar los resultados presuntivos y confirmados.
�Excluir las muestras con doble cero y las que den resultados incontables.
�Evaluar los datos:
�Examen crítico de los datos (identificación de valores rechazables y otras irregularidades).
�Análisis de datos agrupados por laboratorio, tipo de muestra,…
�Cálculo de las diferencias relativas básicas, medias, desviaciones estándar, incertidumbres expandidas.
�Decisión sobre la idoneidad de los datos.
�Evaluación de la equivalencia de los métodos.
Requerimientos Norma ISO 17994:2004
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AGUA SUPERFICIALAGUA SUPERFICIAL
1 -
2 L FILTRACIÓNFILTRACIÓN
100 mL
10 mL
1 mL
4444ºCºC/18/18--24 h24 hanaerobiosisanaerobiosis
REFRIGERACIÓNREFRIGERACIÓN(24 h)(24 h)
40
0 m
LDILUCIÓNDILUCIÓN100 mL
FILTRACIÓNFILTRACIÓNAGAR mAGAR m --CPCP
NMPNMPPACpPACp
AGAR TSCAGAR TSC
100 mL
100 mL
Preparación de muestras de agua superficial
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4,5 L
AGUA SUPERFICIALAGUA SUPERFICIALAGUA EFLUENTE 2ºAGUA EFLUENTE 2º
500 500 mLmL
AGUA TRATADAAGUA TRATADA24 h a 24 h a TªTª ambienteambiente
5 L
AGITACIÓNAGITACIÓN5
00
m
L
50
0
mL
50
0
mL
50
0
mL
FIL
TR
AC
IÓN
FIL
TR
AC
IÓN
100
100
mL
mL
4444 º
CºC/1
8/1
8 --24
h24
han
aero
bios
isan
aero
bios
is
AGAR TSCAGAR TSC
60 UFC60 UFC 30 UFC30 UFC 8 UFC8 UFC 2 UFC2 UFC
REFRIGERACIÓN (24 h)REFRIGERACIÓN (24 h)
1/
3
1/
5
1/
2
1/
3
DILUCIÓNDILUCIÓN
FILTRACIÓNFILTRACIÓNAGAR mAGAR m --CPCP
NMPNMPPACpPACp
100 mL100 mL
5 L
AGITACIÓNAGITACIÓN
SEDIMENTACIÓNSEDIMENTACIÓN44ºCºC/1 h/1 h
10 ml
6 6 –– 12.5 12.5 mg Clmg Cl 22
CADA 1 CADA 1 minminTRAS 3TRAS 3--5 5 minmin
agitación agitación
Preparación de muestras de agua sometidas a tratamiento de desinfección
Medio Ambiente
Inicio
Finalm-CP
5 COLONIAS5 COLONIAS
SELECCIÓN DE 1 SELECCIÓN DE 1 COLONIA CADACOLONIA CADA
n/5n/5
PACp
TODOS: si nº de tubos positivos TODOS: si nº de tubos positivos es es << 55SELECCIÓN DE 5 TUBOS AL SELECCIÓN DE 5 TUBOS AL AZAR: si el nº de tubos AZAR: si el nº de tubos positivos es > 5positivos es > 5
Nº de tubos o colonias para confirmar
Medio Ambiente
m-CP
PACp
TSC-Yema huevo
TSC-Yema huevo
Incubación Incubación anaerobiosisanaerobiosis3535--3737ºCºC/24 h/24 h
Caldo Tioglicolato
Incubación Incubación anaerobiosisanaerobiosis3535--3737ºCºC/24 h/24 h
Caldo Tioglicolato
Caldo Tioglicolato
Tinción Gram
Lactosa-sulfito
Leche-hierro
Movilidad-nitratos
Lactosa-gelatina
4646ºCºC/18/18--24 h24 h
4646ºCºC/2 /2 -- 5 h5 h
3535ºCºC/24 h/24 h
4646ºCºC/24 h/24 h 44ºCºC/1 h/1 h
sólidosólido
3535ºCºC/24 h/24 h
líquidolíquido
Confirmación de colonias o tubos positivos
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+Liquefacción de la gelatina
+Reducción de Nitratos
-Movilidad
+Fermentación tumultuosa de la leche
+Fermentación de lactosa
+Reducción del sulfito
+Tinción Gram
Reacción típica deC. perfringens
Prueba
Reacciones típicas de C. perfringens
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Equivalencia: se fundamenta en la diferencia relativa media y la incertidumbre expandida (U)
Diferencia relativa, x = ln(ai)-ln(bi)
ai = valor confirmado por el método alternativo en la muestra i
bi = valor confirmado por el método alternativo en la muestra i
Incertidumbre expandida, U = ksx =
Intervalo de confianza,Límite inferior: xL = x – ULímite superior: xH = x + U
2s
√ √ √ √ n
Análisis estadístico: UNE-EN ISO 17994
Medio Ambiente
0,476
0,1644
1,152
X - U
- 0,0873
- 0,431
0,169
X + U
No concluyente0,28161,16150,1943Total
No concluyente0,29750,9408- 0,1331Agua sin
tratamiento
Diferencia positiva
0,49031,29750,6620Agua con
tratamiento
Interpretación(D = 0,1)
USXMuestras
Métodos “no diferentes” (Equivalentes): -D < xL < 0 y 0 <xH < +D
Métodos “diferentes”: xL > 0 ó xH < 0
No concluyente: xL < -D y xH > 0 ó bien xL < 0 y xH > +D
Indiferente: xL > -D y xH < 0 ó bien xL > 0 y xH < +D
Resultados preliminares equivalencia