Terbentuknya spesies baru dapat terjadi karena :1. Isolasi waktu Misalnya adalah kuda. Kuda jaman eosen yaitu Eohippus - Mesohippus - Meryhippus - Pliohippus - Equus. Dari jaman eosin hingga sekarang seorang ahli palaentolog menduga telah terjadi 150 ribu kali mutasi yang menguntungkan untuk setiap gen kuda. Dengan dmikian terdapat cukup banyak perbedaan antara nenek moyang kuda dengan kuda yang kita kenal sekarang. Oleh sebab itu kuda-kuda tersebut dinyatakan berbeda species.2. Isolasi geografis

Burung Fringilidae yang mungkin terbawa badai dari pantai Equador ke kepulauan Galapagos. Karena pulas-pulau itu cukup jauh jaraknya maka perkawinan populasi satu pulau dengan pulau lainnya sangat jarang terjadi. Akibat penumpukan mutasi yang berbeda selama ratusan tahun menyebabkan kumpulan gen yang jauh berbeda pada tiap-tiap pulaunya. Dengan demikian populasi burung di tiap-tiap pulau di kepulauan Galapagos menjadi spesies yang terpisah.3. DomestikasiHewan ternak yang dijinakkan dari hewan liar dan tanaman budi daya dari tumbuhan liar adalah contoh domestikasi. Domestikasi memindahkan makhluk-makhluk tersebut dari habitat aslinya ke dalam lingkungan yang diciptakan manusia. Hal ini mengakibatkan muncul jenis hewan dan tumbuhan yang memiliki sifat menyimpang dari sifat aslinya.4. Mutasi kromosomadalah peristiwa terjadinya species baru secara cepat.MutasiAkhirnya, gen-gen terdapat dalam berbagai bentuk sebagai alel-alel pada lokus didalam suatu populasi dipengaruhi oleh sifat dapat bermutasi dari lokus itu. Mutasi maju (forword mutation) mengurangi frekuensi gen-gen tipe liar; mutasi surut (back mutation) mengingat frekuensi gen-gen tipe liar.Selain itu gen-gen dapat mengalami mutasi maju menjadi banyak bentuk yang berlainan,