Produksi Ekstraseluler Anti
Click here to load reader
-
Upload
putra-setiawan -
Category
Documents
-
view
86 -
download
1
Transcript of Produksi Ekstraseluler Anti
Produksi Ekstraseluler Anti-leukemia Enzim L-asparaginase dari Actinomycetes Laut
oleh solidstate dan Submerged Fermentasi: Pemurnian dan Karakterisasi
abstrak
Tujuan: Tujuan dari penelitian ini adalah untuk mengisolasi actinomycetes kelautan, layar
mereka untuk Lasparaginase aktivitas dan karakterisasi enzim.
Metode: actinomycetes Kelautan diisolasi dari sampel sedimen yang diperoleh dari
Tamilnadu dan Kerala di India. Isolat diidentifikasi sebagai aktinomisetes dengan tes
mikroskopis dan biokimia. Produksi L-asparaginase dilakukan di tiga media yang berbeda,
yaitu, solid-state media, Trypton Glukosa Yeast ekstrak (TGY) kaldu dan Trypton Fruktosa
ekstrak Ragi (TFY) kaldu itu enzim dimurnikan untuk homogenitas dekat dengan
pengendapan amonium sulfat, dialisis, filtrasi gel pada Sephadex G-100 kolom dan SDS-
PAGE.
Hasil: Di antara 10 isolat laut mengalami skrining awal, hanya isolat S3, S4 dan K8
menunjukkan potensi L-asparaginase aktivitas. Semua tanah kelautan tiga isolat disintesis
asparaginase dengan hasil berkisar 24,6-49,2 IU / ml. Tanah mengisolasi S3 menunjukkan
produktivitas tertinggi 49,2 IU / ml dengan kandungan protein 65 ug / ml dan aktivitas
optimum pada pH 7,5 dan 50 º C. Nilai Km jelas untuk substrat adalah 25 pM. Mg2 + ion
sedikit menstimulasi aktivitas sementara Cu2 +, Zn2 + dan EDTA telah dihambat.
Kesimpulan: Hasil penelitian menunjukkan bahwa aktinomisetes laut dapat menjadi sumber
potensi hasil tinggi, substrat yang tinggi spesifisitas L-asparaginase, yang merupakan agen
anti-leukemia.
Kata kunci: L-asparaginase, Solid-state media, TGY kaldu, kaldu TFY, SDS-PAGE, Km
dan Vmax.
PENDAHULUAN
Mikroba laut merupakan sumber potensial untuk bioaktif penting secara komersial
compounds1, 2. Di antara kelautan mikroorganisme, aktinomisetes telah mendapatkan
khusus penting sebagai sumber yang paling ampuh antibiotik dan sekunder bioaktif lainnya
metabolites3. Sementara sebagian besar studi tentang actinomycetes telah berfokus pada
antibiotik produksi, hanya beberapa laporan telah berdiam di mereka enzimatik potential4.
Penemuan L-asparaginase (Lasparaginase aminohydrolase, E.C.3.5.1.1), agen obat untuk
pengobatan tumor ganas, dibuat pada tahun 1922 5. Clementi menunjukkan bahwa marmot
serum berisi aktivitas tinggi dari L-asparaginase5, sementara Mashburn dan Wriston berhasil
dimurnikan Escherichia coli L-asparaginase dan menunjukkan tumor-hambat activity5 nya.
L-asparaginase mengubah L-asparagine untuk Laspartic acid. Sejak beberapa jenis tumor
sel membutuhkan L-asparagine untuk protein sintesis, mereka kehilangan sebuah penting
faktor pertumbuhan di hadapan Lasparaginase. Efektif menipisnya Lasparagine
Hasil di sitotoksisitas untuk leukemia cells5 tapi sejauh ini, tumor aktivitas inhibisi telah
ditunjukkan hanya dengan asparaginases dari E. coli, Erwinia aroideae dan Serratia
marcescens6. Itu administrasi seperti protein enzim untuk durasi yang panjang, secara umum,
menghasilkan sesuai antibodi dalam jaringan, menyebabkan syok anafilaksis atau
netralisasi efek obat. Oleh karena itu, penggunaan Lasparaginase serologis berbeda baru
dengan efek terapi yang sama sangat desirable7. Sampai sekarang, L-asparaginase diproduksi
oleh teknik fermentasi terendam. Namun, solid-state fermentasi (SSF) adalah lebih efektif
teknik sebagai hasil dari produk beberapa kali lebih tinggi dari terendam fermentasi (SF). Ia
juga menawarkan banyak keuntungan lainnya, termasuk resistensi kontaminasi, kemudahan
ekstraksi produk dan sederhana metode untuk mengobati difermentasi residue8.
Tujuan dari penelitian ini adalah untuk mengisolasi Lasparaginase dari aktinomisetes laut
oleh solid-state fermentasi dengan menggunakan bungkil kedelai dan terendam fermentasi
serta parsial pemurnian, dan karakterisasi minyak mentah ekstrak enzim.
EKSPERIMENTAL
Bahan
Sampel sedimen laut dikumpulkan dari situs yang berbeda di Tamilnadu dan Kerala, India
pada kedalaman 10 cm pada Mei 2007 dan ditempatkan dalam kantong polythene yang baru,
dengan menggunakan steril spatula, sebelum analisis laboratorium. Pati, kasein, ekstrak ragi,
pepton, l-asparagin, bungkil kedelai, ekstrak daging sapi, akrilamida, bisacrylamide, bovine
serum albumin dan commassie brilian biru G-250 adalah dibeli dari Hi-media (Mumbai,
India). Sephadex G-100 diperoleh dari Sigma- Aldrich, Jerman, sementara asam
trikloroasetat dibeli dari E. Merck Ltd, Mumbai, India. Semua bahan kimia lainnya yang
analitis kelas dan digunakan tanpa modifikasi lebih lanjut. Pengayaan dan isolasi kelautan
mikroorganisme Satu gram sedimen dipindahkan ke kerucut botol berisi 100 ml steril air laut
broth9 kompleks, pati steril kasein kaldu dan glukosa agar asparagin disusun water10 laut
alami untuk preenrichment yang sampel. Labu adalah diinkubasi pada 30 º C selama 14 hari
dalam shaker inkubator. Sebuah loopful inokulum tersebut dari pra-diperkaya kaldu air laut
yang kompleks, pati kasein kaldu atau glukosa adalah kaldu asparagin melesat pada agar-agar
air laut yang kompleks (SWC), pati kasein agar (SCA) dan glukosa asparagin agar, dan plat
diinkubasi pada 30 º C selama 7 hari. Tunggal diskrit koloni diisolasi dan digunakan untuk
identifikasi. Karakterisasi isolat tanah laut Koloni terisolasi diidentifikasi dengan
menggunakan Standar Internasional Streptomyces Proyek (ISP) procedure10. Morfologi
identifikasi koloni terisolasi dilakukan oleh pewarnaan sederhana, pewarnaan Grams dan
motilitas pengujian dengan menggantung penurunan method11. Karakterisasi biokimia
adalah dengan Produksi melanoid test menggunakan Waksman media pada suhu inkubasi 37
° C selama 4 hari untuk mendeteksi pigmen memproduksi milik isolat; nitrat organik Uji
reduksi dilakukan di organik nitrat kaldu pada suhu inkubasi 37 ° C selama satu minggu
untuk mendeteksi nitrat mengurangi milik isolat; produksi asam Uji dilakukan dalam kaldu
glukosa nutrisi pada suhu inkubasi 20 ° C selama 15 hari untuk mendeteksi fermentasi
glukosa menyebabkan produksi asam; hidrogen sulfida tes produksi dilakukan di SIM Agar
pada suhu inkubasi 37 ° C selama 5 hari, sedangkan uji pencairan gelatin dilakukan di gelatin
nutrisi pada inkubasi suhu 37 ° C selama 24 – 48 jam untuk deteksi gelatin hidrolisis sifat
isolates12. Skrining tanah isolat untuk Lasparaginase produksi dengan cepat-plate assay
Isolat disaring untuk asparaginase Aktivitas menggunakan metode Gulati et al13. Itu media
yang digunakan telah dimodifikasi M-9 Media digabungkan dengan indikator pH (merah
fenol). L-asparaginase aktivitas yang diidentifikasi oleh pembentukan zona merah muda di
sekitar koloni. Dua piring kontrol juga disusun dengan menggunakan dimodifikasi M-9
media - satu adalah tanpa pewarna sementara yang lain adalah tanpa asparagin. Mentah
produksi enzim Enzim kasar disiapkan oleh metode solid-state fermentasi (SSF) dan
terendam fermentasi (SF) Solid-state fermentasi (SSF) metode Media fermentasi terdiri dari 5
g bungkil kedelai dan 10 ml 0,1 M natrium dapar fosfat (pH 7,0) dalam suatu tabung 250 ml.
Para termos yang diautoklaf selama 15 menit pada 121 º C dan tekanan 15 lb, kemudian
didinginkan dan diinokulasi dengan 3 ml dari sebelumnya disiapkan suspensi bakteri. Itu
diinkubasi pada 37 º C selama 4 hari tanpa gemetar dan enzim kasar diendapkan di akhir
fermentasi dengan penambahan 90 ml dari buffer fosfat 0,1 M natrium (pH 7,0) diikuti
dengan sentrifugasi pada 8000 rpm selama 20 min 8. Submerged fermentasi (SF) metode
Sejumlah (100ml) Glukosa Trypton Ekstrak ragi (TGY) kaldu (media produksi, pH 7,0) yang
terdiri dari glukosa, 0.1g, K2HPO4, 0,1 g; ekstrak ragi, 0,5 g; Trypton, 0,5 g; air, sampai 100
ml, dan terkandung dalam 250 ml Erlenmeyer termos, diinokulasikan secara terpisah dengan
isolat tanah dan diinkubasi pada - 28 º C dalam shaker inkubator-berosilasi pada 200 putaran /
menit selama 24 jam. Pada akhir periode fermentasi, enzim mentah disiapkan oleh
sentrifugasi pada 10000 rpm selama 20 menit. Supernatan sel-bebas diambil sebagai
enzyme14 mentah. Demikian pula, 100ml Trypton Fruktosa Ragi ekstrak (TFY) kaldu (media
produksi, pH 7,0) terdiri dari Trypton, 0,5 g; ragi ekstrak, 0,5 g, fruktosa, 0,1 g; kalium
dihidrogen fosfat, 0.1g, dan air, untuk 100 ml juga diinokulasi dengan tanah isolat dan
diinkubasi pada - 28 º C dalam shakerincubator berosilasi pada 200 putaran / menit selama 24
jam. Enzim kasar disiapkan oleh sentrifugasi pada 10000 rpm selama 20 min15. Protein
penentuan Kadar protein ditentukan menurut metode Lowry et al16. Sebuah larutan stok
protein standar, bovine serum albumin (BSA), pada konsentrasi 1000 mg / ml adalah dibuat.
Dari solusi ini, 0,2 sampai 1 ml bekerja larutan standar pada konsentrasi 100 mg / ml diambil
dalam tabung reaksi. Itu Volume dibuat sampai dengan 1 ml dengan suling air untuk
memberikan konsentrasi mulai dari 20 sampai 100 mg / ml. 1 ml reagen cocatteau folins
ditambahkan ke masing-masing tabung reaksi. Setelah 30 menit dari inkubasi, absorbansi
diukur pada 660 nm menggunakan UV berkas ganda – terlihat spektrofotometer (model SL
164, Elico, Hyderabad, India), dan kadar protein ditentukan. Penentuan L-asparaginase
aktivitas Metode yang digunakan adalah dasarnya bahwa Mashburn dan Wriston17. Dalam
pengujian ini, laju hidrolisis L-asparagine adalah ditentukan dengan mengukur amonia dirilis
menggunakan reaksi Nessler itu. Campuran dari 0,1 ml ekstrak enzim, 0,2 ml 0,05 M Tris-
HCl buffer (pH 8,6), dan 1,7 ml 0.01M L-asparagine diinkubasi selama 10 menit pada 37 º C.
Reaksi dihentikan dengan penambahan tersebut dari 0,5 ml 1.5M asam trikloroasetat. Setelah
sentrifugasi pada 10000 rpm, 0,5 ml supernatan terdilusi menjadi 7 ml dengan suling air dan
diobati dengan 1 ml yang Nessler reagen. Reaksi warna diizinkan untuk mengembangkan
selama 10 menit dan absorbansi dibaca pada 480 nm dengan spektrofotometer. Itu amonia
yang dibebaskan ini diekstrapolasikan dari kurva yang diperoleh dengan amonium sulfat.
Satu Unit (IU) dari L-asparaginase didefinisikan sebagai bahwa jumlah enzim yang
membebaskan 1 μ mol amonia per menit di bawah assay conditions18. Pemurnian L-
asparaginase dari kelautan actinomycetes L-asparaginase sebagian dimurnikan dengan
menggunakan prosedur berikut: The enzim kasar dibawa ke saturasi 45% dengan amonium
sulfat pada pH 8,4 dan terus semalam di ruang dingin pada 4 º C. Itu setelah mengalami
sentrifugasi pada 8000 rpm selama 10 menit pada 4 º C. Endapan itu dibuang, sedangkan
supernatan dibawa kejenuhan 85% dengan amonium sulfat dan disentrifugasi pada 8000 rpm
pada 4 º C selama 10 min. Endapan langkah ini adalah dikumpulkan dan disimpan pada 4 º C
6. Dialisis tabung, yang sebelumnya direndam dalam 1M Tris HCl penyangga, digunakan
untuk dialisis dari mengendap. Endapan dilarutkan dalam 1M Tris HCl buffer dan didialisis
terhadap sama penyangga 6. Selanjutnya, didialisis Sampel dimuat ke pra-disetimbangkan
kolom dikemas dengan 0,05 M Tris HCl Sephadex G 100. Itu dielusi dengan 0,05 M Tris
HCl (pH 8,4) buffer yang mengandung 0,1 M KCl. Sebanyak 30 fraksi dikumpulkan di laju
alir dari 5 ml/30 menit. Pecahan menunjukkan aktivitas yang tinggi dikumpulkan dan
digunakan untuk lebih lanjut studies6. Karakterisasi yang dimurnikan secara parsial
Lasparaginase Pengaruh ion pH, suhu dan logam Kegiatan pH profil dimurnikan secara
parsial enzim (pH kisaran 3,5-10,5) telah dipelajari. Buffer asetat (0,1 M, pH berkisar 3,5 -
5,5), 0,1 M dapar fosfat (pH 6,0-8,0 kisaran) dan 0,1 M Tris HCl buffer (pH kisaran 8,5-10,5)
digunakan untuk purpose19 ini. Pengujian itu dilakukan dengan menggunakan 0,1 ml tepat
diencerkan enzim. Aktivitas enzim spesifik adalah dihitung dengan mengukur amonia dirilis,
berdasarkan reaksi Nessler ini, oleh metode Mashburn dan Wriston20 dijelaskan di atas untuk
penentuan Lasparaginase aktivitas. Demikian pula, aktivitas enzim diukur pada berbagai suhu
berkisar antara 30 ° C sampai 100 ° C, dan pada pH optimum dengan menggunakan uji yang
prosedur yang diuraikan above20. Dalam rangka untuk menentukan aktivitas enzim dalam
adanya ion logam yang berbeda (Mg2 +, Cu2 +, Zn2 + dan EDTA), larutan garam yang
berbeda - magnesium sulfat, sulfat tembaga, seng sulfat dan etilena diamina tetraacetic acid
(EDTA) - ditambahkan ke enzim substrat campuran reaksi untuk menghasilkan akhir
konsentrasi 1, 3 dan 10mm, respectively21. Aktivitas spesifik dari masing-masing Sampel
kemudian ditentukan dengan metode dari Mashburn dan Wriston20. Penentuan Km dan
Vmax Ini merupakan salah satu parameter penting untuk mengevaluasi kegunaan potensi
enzim untuk anti-leukemia terapi. Awal kecepatan sampel diperkirakan dalam kisaran L-
asparagine konsentrasi (4 sampai 160 M). Km dan Vmax dihitung dari Lineweaver-Burk
plot18.
HASIL
Pengayaan dan isolasi kelautan actinomycetes di media yang berbeda Dari 20 sampel
sedimen laut diuji, hanya 10 sedimen menunjukkan pertumbuhan pengayaan media. Ini 10
isolat disubkultur dan digunakan untuk studi lebih lanjut. Identifikasi actinomycetes Semua
isolat menghasilkan abu-abu dan putih koloni tanpa pigmentasi dan menunjukkan
pertumbuhan yang cepat dalam waktu dua hari. mereka adalah diidentifikasi sebagai
Streptomyces spp. oleh geser budaya, karakteristik morfologi, fisiologis dan sifat enzimatik,
karbon pemanfaatan dan penggunaan nitrogen. Itu sampel Streptomyces spp yang diisolasi
dari Tamilnadu yang ditunjuk S3, S4 dan S6, sedangkan dari Kerala yang ditunjuk K4 dan
K8. The biokimia karakteristik isolat tanah dirangkum dalam Tabel 1. Screening of L-
asparaginase positif budaya Dari terisolasi Streptomyces spp. Disaring untuk L-asparaginase
aktivitas, hanya S3 dan S4 dari Tamilnadu dan K8 dari Kerala menunjukkan hasil positif
dalam metode uji plate yang cepat. Produksi L-asparaginase Ketiga isolat diperiksa disintesis
asparaginase dengan hasil berkisar antara 24.61 ke 49,23 U / ml. Namun, tanah mengisolasi
S3 adalah dipilih untuk studi lebih lanjut karena sifatnya produktivitas tinggi (49,23 U / ml).
protein konsentrasi Konsentrasi protein yang diperoleh dari S3 organisme terisolasi
ditemukan menjadi 65 pg / ml.
PEMBAHASAN
Meskipun L-asparaginase dari bakteri memiliki secara luas ditandai, yang mirip Perhatian
belum dibayarkan kepada actinomycetes23. Sampai saat ini, antibiotik adalah senyawa
bioaktif utama yang diperoleh dari actinomycetes. Namun, kemampuan untuk menghasilkan
berbagai enzim dapat menarik penelitian bunga dalam prokariota. Tanah isolat S3 dan S4 dari
Tamilnadu dan tanah mengisolasi K8 dari Kerala memiliki Lasparaginase aktivitas. Namun
organisme tidak menghasilkan zona merah muda dalam kontrol baik kelompok - M-9 media
yang digabungkan dengan Lasparagine tanpa merah fenol dan M-9 Media dimasukkan tanpa
L-asparagine. Hal ini menunjukkan bahwa pembentukan zona merah muda karena hanya
untuk L-asparaginase produksi. Di antara tiga media yang digunakan, solid-state Media
memberikan aktivitas enzim tertinggi untuk semua 3 isolat. Mekanisme depresi Efek di TGY
dan TFY kaldu diperkirakan hasil dari kehadiran metabolisme glukosa produk. Studi
menunjukkan bahwa dalam kasus asparaginase biosintesis, depresi yang efek karbohidrat
mungkin merupakan fungsi dari kemampuan mereka untuk menurunkan nilai pH fermentasi
media24. Perbandingan terendam dan solid-state fermentasi menunjukkan perbedaan yang
signifikan dalam enzim aktivitas. Hal ini menunjukkan bahwa mungkin ada peningkatan
akumulasi antara metabolit antara substrat dan produk formasi dalam fermentasi terendam.
Ini adalah juga mungkin karena perbedaan dalam fisiologis keadaan mikroorganisme di
fermentasi solid-state dan terendam. Untuk yang terbaik dari pengetahuan kami, ini adalah
yang pertama melaporkan produksi dan parsial pemurnian L-asparaginase dari laut
actinomycetes terisolasi melalui solid state fermentasi (SSF). Pada langkah pemurnian akhir,
enzim menunjukkan aktivitas spesifik 662,61 IU / mg, yang kira-kira 2 kali lipat kemurnian.
Terbaik pH ditemukan menjadi 7,5, yang dekat dengan pH darah, dibandingkan dengan L-
asparaginases dari lainnya bakteri sumber seperti Serratia marcescens, Mycobacterium spp.
Dan Pseudomonas spp menunjukkan pH optimum kisaran 8,0-8,5 15, 20, 27. Pada 50 ° C,
enzim menunjukkan aktivitas optimal. Itu hasil uji sensitivitas Lasparaginase untuk ion logam
berat mengindikasikan bahwa aktivitas enzim tergantung pada kehadiran fungsional sulfhidril
kelompok. Afinitas L-asparaginase ke substrat berhubungan dengan derajat keefektifan
terhadap tumors25. Afinitas substrat Lasparaginase yang diukur dengan nilai Km adalah
ditemukan 2,4 x 10-5 M untuk L-asparagine. Hal ini lebih baik dibandingkan dengan nilai
Km dilaporkan untuk antineoplastik L-asparaginases dari sumber lain seperti E. coli (1,25 x
10 - 5 M) 26, Proteus vulgaris (2,6 x 10-5 M) 27 dan Erwinia aroideae NRRL Q-138 (3,0 x
10-5 M) 27. Linearitas dari Lineweaver-Burk Plot timbal balik ganda menunjukkan bahwa
terisolasi L-asparaginase mengikuti Michaelis-Menten kinetika.
KESIMPULAN
Penelitian ini hanya menunjukkan laut yang sedimen sampel dari Tamilnadu dan Kerala di
India merupakan sumber potensial dari bioaktif aktinomisetes tetapi juga menunjukkan
bahwa perlakuan awal yang berbeda metode dapat berhasil diterapkan untuk isolasi
actinomycetes. Hyperproductive marine actinomycetes dengan tinggi Lasparaginase
Kegiatan itu berhasil diisolasi dengan menggunakan substrat biaya rendah - kacang kedelai
makan. Selanjutnya, terisolasi Lasparaginase tampaknya menjadi menjanjikan agen dan
memerlukan investigasi lebih lanjut dari perusahaan potensi anti-leukemia aktivitas. Atas
dasar dari data yang diperoleh, kelautan aktinomisetes mungkin menjadi sumber yang belum
tergarap dari berpotensi berharga produk dan mungkin juga lebih baik untuk skrining massal
umum bakteri. Akibatnya, kami sarankan enzim yang mendegradasi asam amino harus
mendapat perhatian yang lebih besar sebagai potensi terapi agen.