PENUNTUN PRAKTIKUMBIOKIMIA

PROGRAM STUDI S1 FARMASIFAKULTAS KEDOKTERAN

UNIVERSITAS MALAHAYATI BANDAR LAMPUNG2016

PRAKTIKUM 1ASAM NUKLEAT

1. PENDAHULUAN

Unit terkecil dari suatu kehidupan adalah sel yang merupakan pabrik kecil dimana bahan-bahan dasar seperti asam amino, lipin dan elemen-elemen dasar lain-nya diterima, dan senyawa-senyawa baru yang lebih kompleks (protein, lipida kompleks, karbohidrat dan asam nukleat) diproduksi. Ribuan enzim yang berbeda diperlukan untuk kelangsungan proses-proses biokimia dalam sel. Setiap sel mem-punyai kemampuan mengandakan diri dengan kode DNA sebagai cetak biru, bahan-bahan dasar sebagai komponen penyusun dan dengan bantuan katalis enzim (Kirby, 1990).

Menurut model Watson-Crick, makro molekul DNA merupakan utas ganda dimana pita-pita komponen dihubungkan oleh ikatan hydrogen. Ikatan-ikatan ini sangat stabil, namun akan terlepas pada pemanasan 95 oC sampai 100 oC dan akan menempel lagi bila temperatur diturunkan pada 65 oC. Unit dasar dari DNA adalah nukleotida yang terdiri dari basa (Adenin, Guanin, Timin dan Sitosin), gula dioksiribosa dan grup fosfat. Nukleotida-nukleotida itu saling dirangkaikan dengan ikatan-ikatan fosfodiester kovalen yang menghubungkan karbon 5’ pada sebuah gugus dioksiribosa dengan karbon 3’ pada gugus berikutnya. Keempat macam basa tersebut tersambung ke rantai gula fosfat .

Gambar.6 Struktur DNA (The National Health Museum, 1999)

Masing-masing basa purin (Adenin an Guanin) selalu berpasangan dengan basa pirimidin (Timin dan Sitosin). Adenin selalu berpasangan denganTimin sedang-kan Guanin selalu berpasangan dengan Sitosin sehinga menghasilkan suatu model pilih ganda simetris. Semua basa dari molekul DNA selalu berada di sebelah dalam pilin ganda dengan gula-fosfat di sebelah luar. Dengan demikian basa-basa pada untaian yangsatu berada dekat sekali dengan basa-basa pada

untaian yang lain. Pasangan-pasangan basa ini ditautkan oleh ikatan-ikatan hydrogen yang relatif lemah, Adenin dengan Timin diikat oleh dua atom hydrogen, Guanin dan Sitosin diikat oleh tiga atom hydrogen (Stansfield, 1983)

Sel tumbuhan terbungkus dalam membran sitoplasma yang dikelilingi sel yang kuat. Untuk mengeluarkan DNA dari dalam sel terlebih dahulu harus meng-hancurkan membran dan dinding sel tersebut. Cara yang paling sering dilakukan pada bakteri adalah dengan menggunakan bahan kimia. Selain itu, seperti yang sering dilakukan pada tanaman, dapat pula dilakukan dengan cara fisik yaitu meng-hancurkan sel menggunakan mortar dan pestle pada kondisi beku dengan bantuan nitrogen cair. Tepung sel yang diperoleh melalui cara fisik ini kemudian dilarutkan dengan beberapa bahan kimia, kemudian disentrifugasi untuk memisahkan supernatan yang mengandung DNA, RNA dan protein dari sel.

2. TUJUANPraktikum ini bertujuan untuk mengetahui penampakan asam nukleat dari

bagian tanaman.

3. BAHAN DAN METODE 3.1 Bahan3.1.1 Sayuran misalnya broccoli/bunga kol3.1.2 Detergent bubuk sebanyak 0,7-0,8 sendok teh3.1.3 Garam meja sebanyak 2,5 sendok teh3.1.4 Ethanol 70%

3.2 Alat3.2.1 Beaker glass ukuran 200 ml dan 500 ml3.2.2 Sendok teh3.2.3 Mortar dan pestle3.2.4 Saringan teh3.2.5 Chop stick (pengaduk/sumpit)

3.3. Metode3.3.1 Timbang bunga kol/brokoli sebanyak 5 gram3.3.2 Tumbuk sampai halus menggunakan mortar dan pestle3.3.3 Tambahkan 5 mL akuades3.3.4 Tambahkan garam : deterjen dengan perbandingan = ½ : 1, 1 : 1 dan 1 :

½ 3.3.5 Diamkan selama 15 menit3.3.6 Saring menggunakan saringan teh ke dalam beaker glass3.3.7 Sebanyak 2,5 mL filtrat dimasukkan ke dalam tabung reaksi3.3.8 Tambahkan ethanol 70% dua kali lipat volume cairan hasil penyaringan

menggunakan chop stick/pengaduk secara perlahan-lahan.3.3.9 Tunggu beberapa saat dan perhatikan dua lapisan yang terbentuk dalam

beaker glass.3.3.10Amati dan catat perubahan yang terbentuk.

4. Pertanyaan Pendahuluan1. Apa yang dimaksud dengan asam nukleat?

2. Apa yang dimaksud dengan DNA dan RNA?3. Sebutkan unit dasar penyusun nukleotida!4. Tuliskan rumus umum dari asam amino.