Nukleus & ribosom
-
Upload
sandra-welya -
Category
Documents
-
view
121 -
download
7
Transcript of Nukleus & ribosom
Nukleus & Ribosom
Sandra Welya (F05112005)
Wahyuni (F05112025)
Indah Kurnia (F05112034)
Jeni Yanti (F05111021)
Presentasi Oleh: Kelompok 5
Nukleus
Nukleus merupakan organelterbesar dalam sel danmengandung DNA
Gen di dalam nukleusmenyimpan informasi yang penting untuk mensintesisprotein
• Berbentuk bulat
• Ukuran 5 µm
• Terbungkus oleh dualapis membran (luar & dalam)
• Terdapat nuclear pore complex
• Didalamnya terdapatnucleolus
• Mengandung sebagianbesar gen padakromatin.
• Nuclear laminasumber: Campbell (2010)
Nukleus memiliki perananyang sangat penting bagikehidupan sel, karenaberfungsi mengendalikanseluruh kegiatan sel, seperti:
• Mengotrol sintesa protein di dalam sitoplasma
• Sebagai template RNA
• Replikasi DNA
Nukleus terdiri atas:• Membran nukleus• Nukleolus• Nukleoplasma• Kromatin
Sumber : Campbell
Membrannukleus
nukleus tersusun atas membran luar, membran dalam dan komplex pori-pori/lubangAntara membran luar dan dalamterdapat rongga yang disebutperinuclear compartement (40 nm)
•Membran luar berhubunganlangsung dengan Ribosom dan RE
• Kompleks pori terdiri dari lubang/ pori dan annulus
• Diameter pori tersebut 80 - 90 nm
• Diameter kompleks pori 120 - 140 nm
• Annulus terdiri dari 8 membranprotein
20 - 40 nm
Sumber: Campbell
• Nukleolus tidakbermembran
• Bentuk bulat, Ukuran 0,3 mikron
• Fungsi sintesaribosom
• DNA rRNAtranskrip
NUKLEUPLASMA- Berbentuk gel. - Nukleoplasma mengandung
berbagai substansi kimia, seperti ion-ion, protein, enzim, dan nukleotid, kromatin yang tersusun atasuntaian DNA yang terikatpada protein dasar.
Nukleoprotein* Protamin, * Histon* Non histon• Enzim nukleus
DNA polimerase, RNA polimeraseadenosin diaminase, guanase,
nukleofosforilase
• Butir2 atau benang2 halus dalam nukleus ygdapat mengikat zat warna basa = basofil.
• Benang kromatin mengerut (memendek) menyerupai benang terpilinyang disebutkromosom.
• Mitosis : kromatin kromosom
• Kromatin terdiri dari DNA dan Protein Histon, sbg teras.
RIBOSOM
• Berupa organel kecil berdiameter antara 17-20 µm yang tersusun oleh RNA ribosom dan protein.
• Tempat sel membuat atau mensintesisi protein. • Terdapat bebas di sitoplasma atau melekat pada retikulum
endoplasma, yang disebut RE kasar. Tiap ribosom terdiridari 2 sub unit yang berbeda ukuran. Dua sub unit inisaling berhubungan dalam suatu ikatan yang distabilkanoleh ion magnesum.
• Saat sintesis protein ribosom mengelompok menjadipoliribosom (polisom).
Sumber: Campbell
POLIRIBOSOM (POLISOM)Butir-butir ribosom yang tersusun berderet-deret dihubungkan oleh benang-benang halus substansi sel
Jumlah ribosom dalam poliribosom dapat memberikan informasi tentang ukuran molekul protein yang disintesis di tempat tersebut
Dalam eritroblas berkaitan dengan pembentukan hemoglobin
Berdasarkan koefisien sedimentasi dikenal tiga tiperibosom:
Tipe ribosom Koefisien sedimentasi(Svedberg)
Sel prokariot
Sel eukariot (sitosol)
Sel eukariot (organel)
kloroplast
mitokondria
70S
80S
70S
55S – 80S
RIBOSOM PROKARIOT
Monomer (70S)
Subunit kecil (30S)
Subunit besar (50S)
rRNA (16S)
rRNA (23S)
rRNA (5S)
21 protein
32 protein
Ketiga rRNA disintesis oleh gen-gen yang erat berikatan , ditranskripsi oleh RNA polimerase dengan urutan:
16 S 23 S 5 S
Operon rRNA juga mengandung gen untuk beberapa tRNA
Operon : sekelompok gen dan tempat-tempat pengenal padakromosom (DNA) yang berpartisipasi pada pengaturan transkripsi
Protein ribosom ditambahkan / berkombinasi dengan rRNA pada berbagaitahapan perakitan sub unit:
Beberapa protein ditambahkan selama transkripsi
Protein lain ditambahkan setelah transkrip primer lepasdan selama pemrosesan
Protein lain lagi ditambahkan setelah rRNA matang
BENTUK FISIK RIBOSOM PROKARIOT
Subunit 70S
Ribosom lengkap / utuh
Integritasnya tergantung konsentrasi ion Mg2+
> 2 mM
Bila konsentrasi sangat tinggi menjadi partikel 100S
Bila konsentrasi < 2 mM berubah menjadi subunit 30S dan 50S
Keutuhan partikel bergantung padakonsentrasi ion Mg2+
Subunit 50S dan 30S
Bentuk irregular
Subunit 50S berbentuk bola dengan 3 tonjolan
Subunit 30S berbentuk seperti batang, berbelah menjadi dua
Perbedaan ribosomdidasarkan:
Koefisien sedimentasi
Jumlah dan macam RNA
Jumlah protein
Eukariot Prokariot
Monomer
koefisien sedimentasi
RNA
protein
80S
4
70
70S
3
55
Sub Unit Kecil
koefisien sedimentasi
RNA yang ada
protein
40S
18S
30
30S
16S
21
Sub Unit Besar
koefisienRNA protein
60.5S
58S
60S
50S
68S
27S
Ribosom mempunyai 2 tempat berikatan:
1. P-site
(tempat P, tempat berikatan peptil-tRNA), tempat tRNA
berhubungan dengan ujung rantai polipeptida yang sedang
tumbuh
2. A-site
(tempat A, tempat berikatan aminoasil-tRNA), tempat tRNA
yang akan datang (baru) yang membawa satu asam amino
Antara subunit terdapat suatu terusan tempat menembus RNA selama translasi
Isolasi lebih susah daripada ribosom pada prokariotik
Ukuran lebih besar
Suka bergabung dengan sel bakteri
Sedimen monomer 80S
Sedimen subunit 40S dan 60S
Rat liver:
KS small subunit 36,9S
BM small subunit 1,44.106 Dalton
KS large subunit 56,3S
BM large subunit 2,9.106 Dalton
Tanaman BM : 3,9.106 Dalton
Hewan BM : 4,6.106 Dalton
MITOKONDRIAL DAN CHLOROPLAST RIBOSOME
Ribosom pada kloroplast = prokariotik
Ribosom pada mitokondria tidak sama
Sedimen ribosome chloroplast : 70S dan dapat terurai : 30S (29S - 41S) dan 50S (46S – 54S)
Sedimen Ribosom Mitokondria
Monomer Small
subunit
Large
subunit
Animal
Ascomycetes
Ciliate protozoan
Higher plant
55S – 60S
70S – 75S
80S
77S – 80S
30S – 35S
30S – 40S
55S
40S
40S – 45S
50S
55S
60S
Sintesis dan Pemrosesan rRNA Eukariot
Pada eukariot sintesis rRNA (sitosol) berlangsung di nukleolus (anak inti)
Tiga peristiwa yang merupakan ciri nukleolus:
1. Transkripsi gen-gen yang mengkode rRNA (rDNA)
2. Pemrosesan molekul pra rRNA
3. Perakitan subunit-subunit pra ribosom
RNA RIBOSOME
1. RNAs pada ribosom prokariotik
Subunit (large) 50S 5s; 23S
Subunit (small) 30S 16S
2. RNAs pada ribosom eukariotik
Subunit (large) 60S 5s; 5,8S; 28S
Subunit (small) 40S 18S
3. RNAs pada kloroplas
Subunit (large) 4,5s; 5S; 23S
Subunit (small) 16S
4. RNAs pada mitokondria
Subunit (large) 5s (tumb); 16-19S (hwn); 21-26S (lain)
Subunit (small) 12S – 13S (hewan)
14S - 18S (lain)
• Fungsi utama ribosom, mereka memainkanperan perakitan asam amino untukmembentuk protein tertentu, yang padagilirannya sangat penting untukmelaksanakan kegiatan sel. Seperti yang kitaketahui mengenai produksi protein, asamdeoksiribonukleat (DNA) pertamamenghasilkan RNA (messenger RNA ataumRNA) oleh proses transkripsi DNA, setelahitu pesan genetik dari mRNA diterjemahkanmenjadi protein selama terjemahan DNA.
Sintesis protein