Post on 06-Mar-2020
1
IDENTIFIKASI DAN RESISTENSI Mycobacterium tuberculosis
DARI SPUTUM PASIEN TUBERKULOSIS TERHADAP
RIFAMPISIN
SKRIPSI
Untuk memenuhi sebagian persyaratan
Mencapai Derajat Sarjana S-1
Diajukan oleh:
Vinie Triana
1008010100
Kepada
Fakultas Farmasi
Universitas Muhammadiyah Purwokerto
Purwokerto
2014
2
ii
Identifikasi dan Resistensi Mycobacterium tuberculosis..., Vinie Triana, Fakultas Farmasi UMP, 2014
3
iii
Identifikasi dan Resistensi Mycobacterium tuberculosis..., Vinie Triana, Fakultas Farmasi UMP, 2014
4
iv
Identifikasi dan Resistensi Mycobacterium tuberculosis..., Vinie Triana, Fakultas Farmasi UMP, 2014
5
RIWAYAT HIDUP
Nama : VINIE TRIANA
Tempat Tanggal Lahir : Jatibarang, 12 september 1992
Nama Ayah : Darmansyah
Nama Ibu : Sunani
Riwayat Pendidikan
SD NEGERI 1 PILANGSARI Tahun 1998-2004
SMP NEGERI 1 JATIBARANG Tahun 2004-2007
SMK FARMASI INDRAMAYU Tahun 2007-2010
UNIVERSITAS MUHAMMADIYAH PURWOKERTO Tahun 2010-2014
Riwayat Kegiatan Ilmiah yang pernah diikuti :
1. Seminar Nasional “Pharmacist For Solving Hypertension With Herbal
Medicine” Program Profesi Apoteker Angkatan XIII Fakultas Farmasi
Universitas Muhammadiyah Purwokerto pada tanggal 22 Januari 2011.
2. Seminar Nasional Kefarmasian “Self Management in Asthma Patients”
Fakultas Farmasi Universitas Muhammadiyah Purwokerto pada tanggal 21
Maret 2013.
Riwayat Kegiatan Pengembangan Diri yang Dilakukan :
1. Anggota BEM Fakultas Farmasi Universitas Muhammadiyah Purwokerto,
masa jabatan 2011-2012.
2. Anggota ISMAFARSI Universitas Muhammadiyah Purwokerto, masa
jabatan 2011-2012.
3. Anggota PIKMA YOUTH CENTER Universitas Muhammadiyah
Purwokerto, masa jabatan 2010-2012 dan 2012-2014.
4. Panitia Seminar Nasional “ Belajar bersama tentang seksualitas untuk
Tanggal 10 Mei 2012.
5. Panitia Talk Show “Pergaulan Bebas sebagai investasi menuju
HIV/AIDS” pada tanggal 2 Desember 2012.
6. Panitia Training Of Trainer “Soft Skills Education, Information And
Comunication” pada tanggal 12 Mei 2013.
v
Identifikasi dan Resistensi Mycobacterium tuberculosis..., Vinie Triana, Fakultas Farmasi UMP, 2014
6
MOTTO
“Sesungguhnya sesudah kesulitan itu ada kemudahan”
( terjemahan Q.S. Al-Insyirah : 6 )
Tak ada sesuatupun
yang dapat membuatmu menyerah!
Kecuali dirimu yang mengizinkannya!
( buku “selalu ada harapan” )
Detik Sekarang bukanlah waktunya untuk menyesali apa yang telah terjadi,tetapi waktunya
mencari solusi untuk kedepannya yang
lebih baik
( vinie Triana )
vi
Identifikasi dan Resistensi Mycobacterium tuberculosis..., Vinie Triana, Fakultas Farmasi UMP, 2014
7
PERSEMBAHAN
Puji syukur penulis panjatkan ke hadirat Allah SWT yang telah memberi
kenikmatan yang sungguh luar biasa. Penulis persembahkan karya ini untuk:
1. Bapak Darmansyah dan Ibu Sunani, terima kasih atas segala doa dan
dukungan yang telah diberikan serta kasih sayang yang tulus kepadaku.
2. Kakakku tersayang (Sugiono, Yuli Darmansyah, Novi Anggraeni) dan
Adikku tersayang (Lintang Risgiyani), serta kedua keponakanku yang cantik
(Ayunda Rahani dan Syahla Aulia F) yang selalu membuatku tersenyum dan
penuh semangat, terimakasih atas doa dan dukungannya.
3. Keluarga besarku yang tidak dapat disebutkan satu per satu, terima kasih atas
doa dan dukungannya.
4. Untuk Supporterku (Om Raya) yang selalu membuatku tersenyum dan
bersemangat kembali disaat ingin menyerah, terimakasih atas doa dan
dukungannya yang yakin bahwa Vinie pasti mampu menyelesaikan tugas
akhir ini.
5. Teman terdekatku (Mba Agustina Olivia Nezar, Mba Siti komerawati, Mba
Rulfita Oka, Ari Ardiansyah, Adi Wibowo, Helmi Al’afghani, Mba Kheriyah,
Ika Arifah D, Diah Nurlaily) terima kasih atas persahabatannya selama ini,
yang tak lupa memberikan semangat dan doanya.
6. Teman- teman di Fajar kozt yang selalu membuatku tersenyum.
7. Teman-teman Farmasi angkatan 2010 terima kasih untuk dukungan dan
semangatnya.
vii
Identifikasi dan Resistensi Mycobacterium tuberculosis..., Vinie Triana, Fakultas Farmasi UMP, 2014
8
KATA PENGANTAR
Syukur alhamdulillah penulis panjatkan kepada Allah SWT, yang telah
melimpahkan rahmat dan karunia-Nya sehingga penulis dapat menyelesaikan
skripsi yang berjudul “IDENTIFIKASI DAN RESISTENSI
Mycobacterium tuberculosis DARI SPUTUM PASIEN
TUBERKULOSIS TERHADAP RIFAMPISIN.
Penulis menyadari bahwa penyusunan skripsi ini masih jauh dari sempurna
karena keterbatasan, kemampuan dan pengetahuan, namun berkat bimbingan,
saran, dorongan dan bantuan dari berbagai pihak, akhirnya penulis dapat
menyelesaikan skripsi ini. Oleh karena itu, pada kesempatan ini penulis
mengucapkan terima kasih yang setulus- tulusnya kepada:
1. Darmansyah dan Sunani, sebagai kedua orang tua yang selalu memberikan
dukungan dan motivasinya hingga selesainya skripsi ini.
2. Drs. H. Syamsuhadi Irsyad, S.H., M.H. Rektor Universitas Muhammadiyah
Purwokerto.
3. Dr. Nunuk Aries Nurulita.,M.Si,Apt. Sebagai Dekan Fakultas Farmasi dan
Dosen pembimbing I, yang telah memberikan bimbingan dan pengarahan
serta motivasi dalam penulisan skripsi ini.
4. Githa Fungie Galistiani.,M.Sc.,Apt. Sebagai pembimbing II yang dengan
sabar membimbing dan mengarahkan serta memotivasi penulis dalam
menyelesaikan skripsi ini.
5. Dosen penguji skripsi Program Studi Farmasi Universitas Muhammadiyah
Purwokerto.
6. Seluruh Dosen Fakultas Farmasi Universitas Muhammadiyah Purwokerto
yang telah memberikan ilmunya sehingga dapat dapat membantu penulis
dalam menyelesaikan penulisan skripsi ini.
viii
Identifikasi dan Resistensi Mycobacterium tuberculosis..., Vinie Triana, Fakultas Farmasi UMP, 2014
9
7. Seluruh laboran dan karyawan TU Fakultas Farmasi Universitas
Muhammadiyah Purwokerto yang telah memberikan arahan dan
bimbingannya.
8. Semua pihak yang telah membantu terselesaikannya skripsi ini.
Peneliti
menyadaribahwaskripsiinimasihjauhdarisempurnakarenafaktorketerbatasan
yang adadalamdiripenulisolehsebabitupenulismohon saran dankritik
yangmembangundansemogaskripsiinidapatbermanfaatbagisemuapihak.Terim
akasih.
Purwokerto, 10 September 2014
VinieTriana
ix
Identifikasi dan Resistensi Mycobacterium tuberculosis..., Vinie Triana, Fakultas Farmasi UMP, 2014
10
DAFTAR ISI
Halaman
HALAMAN JUDUL ................................................................................... i
HALAMAN PERSETUJUAN. ................................................................... ii
HALAMAN PENGESAHAN. .................................................................... iii
SURAT PERNYATAAN............................................................................ iv
RIWAYAT HIDUP ..................................................................................... v
MOTTO.. .................................................................................................... vi
PERSEMBAHAN. ...................................................................................... vii
KATA PENGANTAR ............................................................................... viii
DAFTAR ISI .............................................................................................. x
DAFTAR GAMBAR .................................................................................. xiii
DAFTAR TABEL ....................................................................................... xiv
DAFTAR LAMPIRAN. .............................................................................. xv
INTISARI. ................................................................................................... xvi
ABSTRACT. ............................................................................................... xvii
BAB I PENDAHULUAN
A. Latar Belakang ....................................................................... 1
B. Rumusan Masalah ................................................................. 2
C. Tujuan Penelitian ................................................................... 3
D. Manfaat Penelitian. ................................................................ 3
x
Identifikasi dan Resistensi Mycobacterium tuberculosis..., Vinie Triana, Fakultas Farmasi UMP, 2014
11
BAB II TINJAUAN PUSTAKA
A. Tuberkulosis Paru .................................................................. 4
B. M. tuberculosis ....................................................................... 7
C. Sputum ................................................................................... 8
D. Obat Anti Tuberkulosis .......................................................... 8
E. Resistensi M. tuberculosis ..................................................... 9
F. PCR (Polymerase Chain Reaction) ....................................... 11
G. Identifikasi real time PCR Genexpert MTB/RIF .................. 13
BAB III METODEPENELITIAN
A. Jenis dan Rancangan Penelitian ............................................. 15
B. Definisi Variabel Operasional ............................................... 15
C. Waktu dan tempat penelitian ................................................. 16
D. Alat dan Bahan ....................................................................... 16
E. Populasi dan Sampel .............................................................. 16
F. Cara Penelitian ....................................................................... 18
G. Analisis Data .......................................................................... 20
BAB IV HASIL PENELITIAN DAN PEMBAHASAN
A. Pengambilan sampel .............................................................. 21
B. Identifikasi dan Resistensi dengan GeneXpert MTB/RIF ..... 22
C. Hasil deteksi M.tuberculosis dan Resistensinya .................... 28
D. Keterbatasan penelitian .......................................................... 31
BAB V PENUTUP
A. Kesimpulan ........................................................................... 32
xi
Identifikasi dan Resistensi Mycobacterium tuberculosis..., Vinie Triana, Fakultas Farmasi UMP, 2014
12
B. Saran ..................................................................................... 32
DAFTAR PUSTAKA ................................................................................ xviii
LAMPIRAN ............................................................................................... xxii
xii
Identifikasi dan Resistensi Mycobacterium tuberculosis..., Vinie Triana, Fakultas Farmasi UMP, 2014
13
DAFTAR GAMBAR
Halaman
Gambar 1.Faktor Risiko Kejadian TB dan riwayat alamiah
pasien TB yang tidak diobati ................................................... 6
Gambar 2.Tahapan perkembangan TB resistensi OAT .............................. 10
Gambar 3. Gen rpoB menentukan regio resistensi rifampisin; Mutasi
gen rpoB terjadi pada probe B, probe D,dan probe E .............. 24
Gambar 4a. Hasil Real-time PCR deteksi gen rpoB pada Probe B,
Probe D,dan Probe E pada sputum pasien TB dengan jumlah
MTB sangat rendah, rendah, sedang, dan tinggi, Tidak terjadi
resistensi ................................................................................. 25
Gambar 4b. Hasil Real-time PCR deteksi gen rpoB pada Probe B, Probe D,
dan Probe E pada sputum pasien TB dengan jumlah MTB
rendah, sedang, dan tinggi,terjadi resistensi .......................... . 26
xiii
Identifikasi dan Resistensi Mycobacterium tuberculosis..., Vinie Triana, Fakultas Farmasi UMP, 2014
14
DAFTAR TABEL
Halaman
Tabel 1. Sistem klasifikasi Tuberkulosis dalam U.S.Departement of
Health and human services ........................................................... 7
Tabel 2. Hasil MTB dan jumlah nilai Ct ..................................................... 20
Tabel 3. Karakteristik subjek penelitian ..................................................... 21
Tabel 4. Hasil identifikasi M. tuberculosis pasien Tuberkulosis ................ 28
Tabel 5.Informasi gen ropBmenentukan regio resistensi rifampisin. ......... 29
Tabel 6.Jumlah pasien TB yang resisten terhadap Rifampisin ................... 30
xiv
Identifikasi dan Resistensi Mycobacterium tuberculosis..., Vinie Triana, Fakultas Farmasi UMP, 2014
15
DAFTAR LAMPIRAN
Halaman
Lampiran 1. Alur Penelitian. .................................................................... xxiii
Lampiran 2. Data pasien Tuberkulosis paru RSUD Cilacap ................... xxiv
Lampiran 3. Data Hasil Pemeriksaan Identifikasi dan Resistensi ........... xxv
Lampiran4. Hasil Amplifikasi real-time PCR Genexpert MTB/RIF
mendeteksi M.tuberculosis dan resistensi rifampisin .......... xxvi
Lampiran 5. Gambar Alat dan bahan di laboratorium ............................. lix
Lampiran 6. Lembar informed consent .................................................... lx
Lampiran 7. Surat-surat Perijinan. ........................................................... lxi
xv
Identifikasi dan Resistensi Mycobacterium tuberculosis..., Vinie Triana, Fakultas Farmasi UMP, 2014