Presentation Struktur Kromosom

download Presentation Struktur Kromosom

of 22

description

share

Transcript of Presentation Struktur Kromosom

  • Diberi nama kromosom karena kemampuannya dalam menyerap warna tertentu (Yunani : chromos = coloured; soma = body).

    Kromosom dpt ditemukan pada semua sel berinti dan mengandung DNA yg dihubungkan dengan acidic dan basic protein dalam pengaturan yg masih belum dimengerti dg jelas.

  • Struktur dasar kromosom :Elementary fibre (D 110 Ao) tdd nukleosome-nukleosome. Tiap nukleosome tdd 8 molekul histon, yg dilingkari oleh molekul DNA (200 bp). Nukleosom dijepit oleh Histone H1

  • Elementary fibre yg tdd nukleosome-nukleosome terlihat melalui EM seperti string of beads. Struktur ini kmd membentuk coil menjadi chromatin fibre dg D 360Ao.

  • Sambungan...........................Kromosom metaphase merupakan chromatin fibre yg melekat pada central scafold yg terbentuk dari acidic protein. Chromatin fibre kemudian membentuk chromatid.

    Dg metode ini memungkinkan double stranded DNA sepanjang + 2m dapat masuk ke dalam inti.

    Kromosom 1 tdd 200 Mb DNA dg panjang 10 m sampai kromosom 21 - 40 Mb DNA dg panjang 2 m.

  • Sambungan...............Kromosom tdd dari active euchromatin dan inactive heterochromatin (yg berisi sedikit gen2 aktif dan ber-replikasi pada akhir fase S)

    Area heterochromatin biasanya berlokasi dekat dg ujung telomer dan pada sentromer dan sering mengandung DNA macrosatelit repeat

  • Analisa kromosom (karyotyping)Untuk mempelajari kromosom, biasanya digunakan limfosit darah tepi, tetapi dapat juga menggunakan sumsum tulang, fibroblas kulit, sel-sel amnion dan jonjot vili (chorionic villi) Darah venoject yg berisi heparin (mencegah penggumpalan darah).Di lab : ditambahkan phytohemaglutinin pada media untuk memicu limfosit bermitosis. Setelah 48-72 jam, mitosis akan berhenti pada metaphase dengan penambahan colchicine, dan ditambahkan larutan hipotonik untuk membengkakkan sel dan memisah-misah (separate) kromosom sebelum difiksasi. Kmd suspensi yg berisi kromosom2 diteteskan ke atas slide (object glass)

  • Analisa kromosomhttp://anthro.palomar.edu/abnormal/abnormal_1.htm

  • Sambungan.................Kromosom dpt diwarnai dengan bermacam-macam pewarna, ttp utk analisa kromosom rutin G-banding digunakan pewarna Giemsahasilnya kromosom tdd 300 - 400 pita2 gelap dan terang yg mencerminkan kondensasi pd kromosomG-banding : pita gelap sedikit gen aktif kaya A + T ber-replikasi di akhir fase S

    pita terang 80% gen aktif (termasuk housekeeping gene) kaya G + C ber-replikasi di awal fase S

  • http://imbs.massey.ac.nz/genetic_damage_humans.htm

  • Sambungan.................Selain dg G-banding, analisa kromosom dpt dilakukan dg C-banding R-banding Q-banding

    Delesi sebesar 4 000 kb terlihat pada mikroskop

  • The normal human karyotype http://arnica.csustan.edu/boty1050/Meiosis/human_karyotype.jpg

  • Sambungan...............46 kromosom (23 : maternal; 23 : paternal), tdd: 22 ps autosom ; 1 ps kromosom seks (X , Y)sentromer posisi selalu sama utk tiap kromosomLengan p , lengan q ; ujung tiap lengan telomer Metasentrik 1, 3, 16, 19, 20sub metasentrik 2, 4-12, 17-18, XAkrosentrik 13-15 , 21- 22, YTelosentrikParis nomenclature (1978) : total number of chromosomes, sex chromosome constitution, description of abnormality 46, XX , 46, XY 47, XX, +21 45, X

  • Chromosome heteromorphismSemua kromosom menunjukkan variasi interindividuil dalam content DNA yg diwariskan kromosom Y memiliki variasi paling banyak dan yg plg sedikit adl. X.Setidaknya 30% populasi menunjukkan adanya perbedaan kromosom yg dapat dilihat melalui mikroskop

    Perbedaan ini disebut : heteromorphisme

    Ada 4 kelompok utama heteromorphisme pada kromosom : ukuran Yq ; ukuran hetrokromatin pada sentromer ; polimorfisme satelit dan fragile site.

  • Ukuran YqPolimorfisme kromosom yg paling umum adalah ukuran lengan panjang kromosom Y.

    10% pria memiliki Y yg lbh panjang atau lebih pendek dibanding umumnya.

    Yq terdiri dari repetitive DNA yg tidak ber-transkripsi berfluororesensi pada Q-banding

  • Ukuran heterokromatin pada sentromerdijumpai pada kromosom 1, 9 dan 16 pada banyak anggota keluarga yg sehatSatellite polymorphisms variasi ukuran satelit dapat dilihat pada kromsom akrosentrik 13, 14, 15, 21 dan 22 Kebanyakan variasinya mencakup repetitive DNA, juga variasi jumlah ribosomal gene

  • Fragile siteKonstriksi selain sentromer dapat dilihat dan kontriksi ke dua ini ok patahnya kromatidSetidaknya ada 80 fragile site yg umumnya homolog26 fragile site yg jarang ada ditemukan dan diturunkan secara autosomal (contoh 2q13) hanya pada 1 homolog, kebanyakan tidak menyebabkan kelainan klinis, kecuali fragile site pada kromosom X (Xq27.3) yg dihubungkan dengan keterbelakangan mental (ok repeat trinukleotida yg melebihi batas kritis)

  • Chromosome in other species

  • Mitochondrial chromosomesmitokondria adalah organel di sitoplasma yg memiliki kromosom sendiri yg berupa DNA single circular double helix (10)Tdd 16 569 bp, 22 gen utk tRNA pada mitokondria dan 2 tipe ribosomal RNABerbeda dg DNA inti : kodon utk bbrp asam amino (UGA tryptophan)Tidak ada intron dan kedua pita mengalami transkripsi dan translasiTiap sel memiliki ratusan mitokondria dan karena hanya ada di sitoplasma, maka ditransmisikan melalui sel telur ibu ke semua anak2nya (maternal inheritance)

  • Sambungan................Mutasi pada DNA mitokondria 5-10 kali lebih sering ditemukan d/p DNA intiBeberapa kelainan yg disebabkan mutasi pada DNA mitokondria a.l : Lebers hereditary optic neuropathy. Pola pedigree pada pewarisan kelainan ini sukar dikenali ok bbrp carrier asymptomaticMutasi pada mitokondria heteroplasmy, tetapi stl bermitosis homoplasmyTgk keparahan peny. proporsi mutant dan wild type

  • Connor, Michael. Ferguson-Smith. 1997 Essential Medical genetics, 5th ed. Blackwell ScienceKingston M., Helen.1994. ABC of Clinical genetics 2nd ed.