Presentation Struktur Kromosom

11
1 Diberi nama kromosom karena kemampuannya dalam menyerap warna tertentu (Yunani : chromos = coloured; soma = body). Kromosom dpt ditemukan pada semua sel berinti dan mengandung DNA yg dihubungkan dengan acidic dan basic protein dalam pengaturan yg masih belum dimengerti dg jelas.

Transcript of Presentation Struktur Kromosom

  • 1 Diberi nama kromosom karena kemampuannya dalam menyerap warna tertentu (Yunani : chromos= coloured; soma = body).

    Kromosom dpt ditemukan pada semua sel berintidan mengandung DNA yg dihubungkan dengan acidic dan basic protein dalam pengaturan yg masih belum dimengerti dg jelas.

  • 2Struktur dasar kromosom :Elementary fibre (D 110 Ao) tdd nukleosome-

    nukleosome. Tiap nukleosome tdd 8 molekulhiston, yg dilingkari oleh molekul DNA (200 bp).Nukleosom dijepit oleh Histone H1

    Elementary fibre yg tdd nukleosome-nukleosometerlihat melalui EM seperti string of beads. Strukturini kmd membentuk coil menjadi chromatin fibre dgD 360Ao.

  • 3Sambungan...........................

    Kromosom metaphase merupakan chromatin fibreyg melekat pada central scafold yg terbentuk dariacidic protein. Chromatin fibre kemudianmembentuk chromatid.

    Dg metode ini memungkinkan double strandedDNA sepanjang + 2m dapat masuk ke dalam inti.

    Kromosom 1 tdd 200 Mb DNA dg panjang 10 msampai kromosom 21 - 40 Mb DNA dg panjang 2m.

  • 4Sambungan...............

    Kromosom tdd dari active euchromatin daninactive heterochromatin (yg berisi sedikit gen2aktif dan ber-replikasi pada akhir fase S)

    Area heterochromatin biasanya berlokasi dekat dgujung telomer dan pada sentromer dan seringmengandung DNA macrosatelit repeat

    Analisa kromosom (karyotyping)

    Untuk mempelajari kromosom, biasanya digunakan limfositdarah tepi, tetapi dapat juga menggunakan sumsum tulang,fibroblas kulit, sel-sel amnion dan jonjot vili (chorionicvilli)

    Darah venoject yg berisi heparin (mencegahpenggumpalan darah).

    Di lab : ditambahkan phytohemaglutinin pada media untukmemicu limfosit bermitosis. Setelah 48-72 jam, mitosis akanberhenti pada metaphase dengan penambahan colchicine,dan ditambahkan larutan hipotonik untuk membengkakkansel dan memisah-misah (separate) kromosom sebelumdifiksasi. Kmd suspensi yg berisi kromosom2 diteteskan keatas slide (object glass)

  • 5Analisa kromosomhttp://anthro.palomar.edu/abnormal/abnormal_1.htm

    Sambungan.................

    Kromosom dpt diwarnai dengan bermacam-macampewarna, ttp utk analisa kromosom rutin G-bandingdigunakan pewarna Giemsa

    hasilnya kromosom tdd 300 - 400 pita2 gelap dan terang ygmencerminkan kondensasi pd kromosom

    G-banding :pita gelap sedikit gen aktif

    kaya A + Tber-replikasi di akhir fase S

    pita terang 80% gen aktif (termasuk housekeeping gene)kaya G + Cber-replikasi di awal fase S

  • 6http://imbs.massey.ac.nz/genetic_damage_humans.htm

    Sambungan.................

    Selain dg G-banding, analisa kromosom dpt dilakukan dg C-banding

    R-bandingQ-banding

    Delesi sebesar 4 000 kb terlihat pada mikroskop

  • 7The normal human karyotype http://arnica.csustan.edu/boty1050/Meiosis/human_karyotype.jpg

    Sambungan...............

    46 kromosom (23 : maternal; 23 : paternal), tdd:22 ps autosom ; 1 ps kromosom seks (X , Y)

    sentromer posisi selalu sama utk tiap kromosom Lengan p , lengan q ; ujung tiap lengan telomer Metasentrik 1, 3, 16, 19, 20 sub metasentrik 2, 4-12, 17-18, X Akrosentrik 13-15 , 21- 22, Y Telosentrik Paris nomenclature (1978) : total number of chromosomes,

    sex chromosome constitution, description of abnormality 46, XX , 46, XY

    47, XX, +2145, X

  • 8Chromosome heteromorphism

    Semua kromosom menunjukkan variasi interindividuildalam content DNA yg diwariskan kromosom Ymemiliki variasi paling banyak dan yg plg sedikit adl. X.

    Setidaknya 30% populasi menunjukkan adanya perbedaankromosom yg dapat dilihat melalui mikroskop

    Perbedaan ini disebut : heteromorphisme

    Ada 4 kelompok utama heteromorphisme pada kromosom :ukuran Yq ; ukuran hetrokromatin pada sentromer ;polimorfisme satelit dan fragile site.

    Ukuran Yq

    Polimorfisme kromosom yg paling umum adalah ukuran lengan panjang kromosom Y.

    10% pria memiliki Y yg lbh panjang atau lebih pendek dibanding umumnya.

    Yq terdiri dari repetitive DNA yg tidak ber-transkripsi berfluororesensi pada Q-banding

  • 9Ukuran heterokromatin pada sentromer

    dijumpai pada kromosom 1, 9 dan 16 pada banyak anggota keluarga yg sehat

    Satellite polymorphisms

    variasi ukuran satelit dapat dilihat pada kromsomakrosentrik 13, 14, 15, 21 dan 22 Kebanyakan variasinya mencakup repetitive DNA,juga variasi jumlah ribosomal gene

    Fragile site Konstriksi selain sentromer dapat dilihat dan

    kontriksi ke dua ini ok patahnya kromatid Setidaknya ada 80 fragile site yg umumnya

    homolog 26 fragile site yg jarang ada ditemukan dan

    diturunkan secara autosomal (contoh 2q13) hanya pada 1 homolog, kebanyakan tidakmenyebabkan kelainan klinis, kecuali fragile sitepada kromosom X (Xq27.3) yg dihubungkandengan keterbelakangan mental (ok repeattrinukleotida yg melebihi batas kritis)

  • 10

    Chromosome in other species

    species Chromosomes number

    Estimated number of structural genes

    ManGorillaMouseDogGoldfishDrosophilaaE. coli

    464840789481

    60 000-70 000-30 000--5 0003 600

    Mitochondrial chromosomes

    mitokondria adalah organel di sitoplasma yg memilikikromosom sendiri yg berupa DNA single circular double helix(10)

    Tdd 16 569 bp, 22 gen utk tRNA pada mitokondria dan 2 tiperibosomal RNA

    Berbeda dg DNA inti : kodon utk bbrp asam amino (UGA tryptophan)

    Tidak ada intron dan kedua pita mengalami transkripsi dantranslasi

    Tiap sel memiliki ratusan mitokondria dan karena hanya ada disitoplasma, maka ditransmisikan melalui sel telur ibu kesemua anak2nya (maternal inheritance)

  • 11

    Sambungan................

    Mutasi pada DNA mitokondria 5-10 kali lebih sering ditemukan d/p DNA inti

    Beberapa kelainan yg disebabkan mutasi pada DNA mitokondria a.l : Lebers hereditary optic neuropathy.

    Pola pedigree pada pewarisan kelainan ini sukar dikenali ok bbrp carrier asymptomatic

    Mutasi pada mitokondria heteroplasmy, tetapi stl bermitosis homoplasmy

    Tgk keparahan peny. proporsi mutant dan wild type

    Connor, Michael. Ferguson-Smith. 1997Essential Medical genetics, 5th ed. BlackwellScience

    Kingston M., Helen.1994. ABC of Clinicalgenetics 2nd ed.