PENGOLAHAN CITRA MIKROSKOPIS UNTUK MENGHITUNG SEL …

25
PENGOLAHAN CITRA MIKROSKOPIS UNTUK MENGHITUNG SEL KURKUMIN PADA CITRA NANOPARTIKEL Skripsi untuk memenuhi sebagian persyaratan mencapai derajat Sarjana S-1 Program Studi Teknik Informatika Diajukan Oleh Nafiatun Sholihah 09651001 PROGRAM STUDI TEKNIK INFORMATIKA FAKULTAS SAINS DAN TEKNOLOGI UIN SUNAN KALIJAGA YOGYAKARTA 2013

Transcript of PENGOLAHAN CITRA MIKROSKOPIS UNTUK MENGHITUNG SEL …

Page 1: PENGOLAHAN CITRA MIKROSKOPIS UNTUK MENGHITUNG SEL …

PENGOLAHAN CITRA MIKROSKOPIS

UNTUK MENGHITUNG SEL KURKUMIN

PADA CITRA NANOPARTIKEL

Skripsi

untuk memenuhi sebagian persyaratan

mencapai derajat Sarjana S-1

Program Studi Teknik Informatika

Diajukan Oleh

Nafiatun Sholihah

09651001

PROGRAM STUDI TEKNIK INFORMATIKA

FAKULTAS SAINS DAN TEKNOLOGI

UIN SUNAN KALIJAGA

YOGYAKARTA

2013

Page 2: PENGOLAHAN CITRA MIKROSKOPIS UNTUK MENGHITUNG SEL …

lJniversilqslslomNegeriSunonKolUogo FM-UINSK-BM-05-O7/RO

PENGESA HAN SKRIPSI/TUGAS AKHIRuIN.02/D.ST/PP.01.1/1701/2013

Pe.golahan Cltra N4ikroskopis Untuk l\4engh tung Sel Kurkumin

Pada C ira Nanopartikel

Nomor

Skripsiffugas Akhir dengan judul

Yang dipersiapkan dan disusun olehNarna

N1T4

Telah dimunaqasyahkan pada

Nilai14unaqasyah

Dan dinyatakan teah dlterima oleh Fakultas

Nafialun Sholihah

09651001

Kamis, 23 Mei2013

Sains dan Teknologi UIN Sunan Ka ijaga

TIM MUNAQASYAH

Ketua Sidang

n0rl=S,{siAt

.n"*JlC ".r."'NIP. 19820511 2A06A4 2 002

Penguji I

Yogyakarta, 23 t4ei 2013UIN Sunan Kalijagallas sarn< n;n lFlno..i

ji, 14.A,

1 002

6Fii{:{"\

t) Utl:'-l: H ph.D

Page 3: PENGOLAHAN CITRA MIKROSKOPIS UNTUK MENGHITUNG SEL …

tri6r untvohor rrton r,r"ged sunqn (ottoso gg Flt-ulltsr-ata-o5-olt/Ro

SURAT ?I.RSETUJUAN SKRIPSVTUGAS AIKSIR

YtL Delan F.,tulss SaiB d@ TehologituN S@ (rliae. Yos/ak n!

,klalaht dldihtuw h

S€rel,! @b€.e, n€neli1i. rcnbailE p.rbju& dar l@gprcksi saraD6erdd@ pdbaikd *pcrlula DrL knni elaku pdbinlilg berpodrpor banm

NIMJuddSkiAti :rmgolalqCitrMil@skopisUnl*MlrghiIulgSeJKwkMin

Paab Citr Ndop€nikel

sud.h dapal diajuloo kmbali t€lada Prosm Studi Teknik Infmgrits F hfirs SaiNde T*roloei LrIN Sll@ Kallag& Yoej*rna €bage sal6t saru symt lirtuIn@p@lel ceLr Sdi@ StlaA Satu .lalM Teknik Infom,rika

Dage ili kMi ndghrn! agr sktipsi4Es al:hn Sau<l@ teebur dj alls dlpgtsg@ diFuraqsya$d, A&s pernrtimtr k ni ucadrn terim k sii,

WBsaltM alai,M v. eh

Yo$/atarta, 13 M€i 2013

Shotuatd Uru [email protected]!. 1982051 I 200604 2 fit

Page 4: PENGOLAHAN CITRA MIKROSKOPIS UNTUK MENGHITUNG SEL …

PERNYATA-AN I<EAIILIAN SKRIPSI

Ydg b.ned! rego di bd rl ini :

Nim 09651001

M6'?!.ke brlu sklpsi dosiE judql PENGOLAIIAN CITRA

MIKROSKOPIS I'NTUK MENGIIITIJNG SEL KTJRKTJMIN PADA

CITRA N]INOPARTII(EL lid* tedrp6t Fds ldya r&e pdlh diqjrh

utk tlM!ftI€h g.br sjrda di Mtu Perg@ Tinggi, d6 s.p€lg.tahuo

$'r ii&t tedlpnt kdrt .tru le{drprt y6!g Fdd &tnb o|.h @rg bn\

t culi r&g 3e@ ldlu[! dilou dd@ Drst ! ili de disbulte dsl@ (m!

Yoglolat , 13 Mei 2013

NlM:09651001

Page 5: PENGOLAHAN CITRA MIKROSKOPIS UNTUK MENGHITUNG SEL …

v

MOTTO

Berusahalah jangan sampai terlengah walau sedetik saja, karena atas

kelengahan kita tak akan bisa dikembalikan seperti semula.

Page 6: PENGOLAHAN CITRA MIKROSKOPIS UNTUK MENGHITUNG SEL …

vi

HALAMAN PERSEMBAHAN

Skripsi / Tugas Akhir ini kupersembahkan kepada :

1. Ibuku Ir. Sundari, M.P. dan Bapakku Drs. H. Geyol Sugiyanta, M.Si. yang

tercinta, yang telah mendidik dan membimbing dengan ketulusan dan

keikhlasan baik secara moril dan materiil.

2. Suamiku Adik S Fajar Irawan yang tercinta, yang selalu memberikan

motivasi dan semangat.

3. Adik-adikku yang tersayang.

4. Teman-teman Prodi Teknik Informatika Mandiri 2009, Ainir, Alvia, Dian,

Sigit, Anas, Wahyu R, Wahyu S, Nugroho, Ficky, Ari, Agung, Izza,

terimakasih atas dukungan kalian semua.

Page 7: PENGOLAHAN CITRA MIKROSKOPIS UNTUK MENGHITUNG SEL …

vii

KATA PENGANTAR

Segala puji bagi Allah SWT, shalawat dan salam semoga tercurah kepada

Nabi Muhammad SAW, keluarganya, para sahabatnya dan pengikutnya hingga

akhir jaman. Syukur Alhamdulillah atas anugerah dan karunia-Nya hingga penulis

diberi kemampuan untuk dapat menyelesaikan skripsi / tugas akhir yang berjudul :

“PENGOLAHAN CITRA MIKROSKOPIS UNTUK MENGHITUNG SEL

KURKUMIN PADA CITRA NANOPARTIKEL”

Pembuatan dan penyusunan proyek akhir ini diajukan sebagai syarat untuk

menyelesaikan studi Strata I di Program Studi Teknik Informatika, UIN Sunan

Kalijaga, Yogyakarta.

Saya menyadari bahwa apa yang saya lakukan dalam penyusunan laporan

proyek akhir ini masih terlalu jauh dari kata sempurna. Oleh karena itu, saya

sangat mengharap kritik dan saran yang berguna dalam penyempurnaan sistem ini

dimasa yang akan datang. Semoga apa yang telah saya lakukan ini dapat

bermanfaat bagi pembaca.

Penulis dalam menyusun laporan Tugas Akhir ini mendapatkan bimbingan,

arahan, dan bantuan dari berbagai pihak. Pada kesempatan ini penulis ingin

mengucapkan terima kasih kepada:

1. Bapak Prof. Drs. H. Akh. Minhaji, M.A., Ph.D., selaku Dekan Fakultas

Sains dan Teknologi UIN Sunan Kalijaga.

2. Bapak Agus Mulyanto, S.Si., M.Kom., selaku Ketua Program Studi Teknik

Informatika.

Page 8: PENGOLAHAN CITRA MIKROSKOPIS UNTUK MENGHITUNG SEL …

viii

3. Ibu Shofwatul Uyun M.Kom., selaku dosen pembimbing akademik serta

dosen pembimbing tugas akhir yang telah banyak memberi dukungan serta

pangarahan demi kelancaran penyusunan laporan tugas akhir ini.

4. Bapak dan Ibu Dosen Program Studi Teknik Informatika yang senantiasa

memberikan bekal ilmu selama perkuliahan.

5. Bapak, Ibu, Suami dan adik-adik yang selalu setia memberikan dukungan

dan doa pada penulis, serta menjadi sumber motivasi dan inspirasi.

6. Teman-teman Prodi Teknik Informatika UIN Sunan Kalijaga, terutama

kepada teman-teman Kelas Mandiri angkatan 2009, Ainir, Alvia, Dian,

Sigit, Anas, Wahyu R, Wahyu S, Nugroho, Ficky, Ari, Agung, Izza yang

telah banyak memberikan bantuan dan semangat dalam penyusunan

laporan tugas akhir ini.

Semoga Allah SWT memberikan pahala yang setimpal atas segala

dorongan, bantuan, dukungan, semangat dan keyakinan yang sudah diberikan

kepada penulis untuk menyelesaikan skripsi ini. Amin.

Yogyakarta, 13 Mei 2013

Penulis

Page 9: PENGOLAHAN CITRA MIKROSKOPIS UNTUK MENGHITUNG SEL …

ix

DAFTAR ISI

HALAMAN JUDUL ......................................................................................... i

HALAMAN PENGESAHAN SKRIPSI / TUGAS AKHIR ............................. ii

SURAT PERSETUJUAN SKRIPSI .................................................................. iii

PERNYATAAN KEASLIAN SKRIPSI ........................................................... iv

MOTTO ............................................................................................................ v

HALAMAN PERSEMBAHAN ....................................................................... vi

KATA PENGANTAR ...................................................................................... vii

DAFTAR ISI ..................................................................................................... ix

DAFTAR GAMBAR ........................................................................................ xii

DAFTAR TABEL ............................................................................................. xiii

ABSTRAK ......................................................................................................... xiv

BAB I PENDAHULUAN

1.1 Latar Belakang .............................................................................................. 1

1.2 Rumusan Masalah .......................................................................................... 2

1.3 Tujuan Penelitian ........................................................................................... 3

1.4 Batasan Masalah............................................................................................. 3

1.5 Keaslian Penelitian ......................................................................................... 4

1.6 Sistematika Penulisan .................................................................................... 4

BAB II TINJAUAN PUSTAKA

2.1 Tinjauan Pustaka ........................................................................................... 6

2.2 Landasan Teori .............................................................................................. 11

2.2.1 Pengantar Pengolahan Citra ................................................................ 11

2.2.2 Pengertian Citra (Image) ..................................................................... 15

2.2.3 Pengolahan Citra Digital ..................................................................... 17

2.2.4 Permasalahan Umum Pada Pengolahan Citra Bioinformatik ............. 18

2.2.5 Pemecahan Masalah Pada Pengolahan Citra Bioinformatik ............... 20

Page 10: PENGOLAHAN CITRA MIKROSKOPIS UNTUK MENGHITUNG SEL …

x

2.2.6 Grayscale ........................................................................................... 22

2.2.7 Kontras ................................................................................................ 24

2.2.8 Segmentasi .......................................................................................... 26

2.2.9 Operasi Ambang batas (Thresholding) ............................................... 27

2.2.10 Operasi Morfologi ............................................................................. 30

2.2.10.1 Structuring Element .............................................................. 32

2.2.10.2 Dilasi ..................................................................................... 33

2.2.10.3 Erosi ...................................................................................... 35

2.2.10.4 Opening ................................................................................ 36

2.2.10.5 Closing .................................................................................. 37

2.2.10.6 Transformasi Top-Hat ......................................................... 37

2.2.11 Connected Component Analisys ....................................................... 38

2.2.12 Matlab 7.1 ......................................................................................... 39

BAB III METODE PENELITIAN

3.1 Alat Yang Dipergunakan............................................................................... 42

3.2 Alur Kerja Penelitian..................................................................................... 42

3.2.1 Pembacaan Citra ................................................................................ 45

3.2.2 Prapengolahan (Preprocessing) ......................................................... 45

3.2.2.1 Skala Abu-abu (Grayscalling) ................................................ 46

3.2.2.2 Kontras I ................................................................................ 46

3.2.2.3 Segmentasi ............................................................................. 47

3.2.2.4 Kontras II ............................................................................... 47

3.2.2.5 Pengambangan (Thresholding) .............................................. 48

3.2.3 Pengolahan (Processing) .................................................................... 49

3.2.4 Analisis (Analizing) ............................................................................ 49

BAB IV HASIL DAN PEMBAHASAN

4.1 Citra Awal .................................................................................................... 51

4.2 Prapengolahan (Preprocessing) .................................................................... 53

Page 11: PENGOLAHAN CITRA MIKROSKOPIS UNTUK MENGHITUNG SEL …

xi

4.2.1 Hasil Grayscalling ............................................................................. 53

4.2.2 Hasil Kontras I ................................................................................... 54

4.2.3 Hasil Segmentasi ................................................................................ 56

4.2.4 Hasil Kontras II .................................................................................. 57

4.2.5 Hasil Thresholding ............................................................................. 58

4.3 Pengolahan (Processing) ............................................................................... 58

4.4 Analisis (Analizing) ....................................................................................... 59

4.4.1 Hasil Labeling dan Counting .............................................................. 59

4.4.2 Testing ................................................................................................ 60

4.5 Pembahasan ................................................................................................... 63

BAB V PENUTUP

5.1 Kesimpulan ................................................................................................... 64

5.2 Saran .............................................................................................................. 64

DAFTAR PUSTAKA ......................................................................................... 66

LAMPIRAN ........................................................................................................ 68

RIWAYAT HIDUP PENULIS

Page 12: PENGOLAHAN CITRA MIKROSKOPIS UNTUK MENGHITUNG SEL …

xii

DAFTAR GAMBAR

Gambar 2.1 Gambar digital yg dihasilkan code tape oleh printer telegraf ...... 12

Gambar 2.2 Gambar digital dgn 15 level keabuan ditransmisikan tahun 1929 13

Gambar 2.3 Citra Analog dan Citra Digital ..................................................... 16

Gambar 2.4 Intensitas grayscale ...................................................................... 22

Gambar 2.5 Citra grayscale yang dirubah menjadi nilai matrik ...................... 23

Gambar 2.6 Hasil konversi citra berwarna menjadi citra grayscale ................ 24

Gambar 2.7 Kontras pada beberapa citra ......................................................... 26

Gambar 2.8 Hasil Penerapan Threshold Tunggal ............................................ 28

Gambar 2.9 Hasil Penerapan Threshold Ganda ............................................... 29

Gambar 2.10 Contoh Citra Hasil Penerapan Mathematical Morfology ............. 31

Gambar 2.11 Contoh-contoh Structuring Element............................................. 33

Gambar 2.12 Teknik analisis piksel tetangga .................................................... 38

Gambar 3.1 Diagram Blok Alur Penelitian ...................................................... 42

Gambar 3.2 Diagram Alir Proses Pengolahan Citra ........................................ 43

Gambar 4.1 Citra Grayscalling ........................................................................ 54

Gambar 4.2 Citra Hasil Kontras dengan nilai high_in = 0.7 ............................ 54

Gambar 4.3 Histogram Citra Kontras dengan nilai high_in = 0.7 ................... 55

Gambar 4.4 Citra Hasil Kontras dengan nilai high_in = 0.9 ............................ 55

Gambar 4.5 Citra Hasil Kontras dengan nilai high_in = 0.5 ............................ 56

Gambar 4.6 Citra Hasil Transformasi Top-Hat................................................ 57

Gambar 4.7 Citra Hasil Kontras Kedua ........................................................... 57

Gambar 4.8 Citra Hasil Threshold ................................................................... 58

Gambar 4.9 Citra Hasil Morfologi ................................................................... 58

Gambar 4.10 Citra Hasil Labeling ..................................................................... 59

Gambar 4.11 Citra Hasil Counting..................................................................... 60

Gambar 4.12 Prototype Pengolahan Citra Mikroskopis .................................... 61

Page 13: PENGOLAHAN CITRA MIKROSKOPIS UNTUK MENGHITUNG SEL …

xiii

DAFTAR TABEL

Tabel 2.1 Ringkasan Referensi Penelitian ........................................................ 9

Tabel 3.1 Spesifikasi Perangkat Uji Coba.......................................................... 42

Tabel 4.1 Gambar dan keterangan dari citra kurkumin ..................................... 51

Tabel 4.2 Data Hasil Pengujian .......................................................................... 60

Page 14: PENGOLAHAN CITRA MIKROSKOPIS UNTUK MENGHITUNG SEL …

xiv

Pengolahan Citra Mikroskopis Untuk Menghitung Sel Kurkumin

Pada Citra Nanopartikel

Nafiatun Sholihah

NIM. 09651001

ABSTRAKSI

Bahan aktif ekstrak kunyit/kurkumin yang telah diformulasikan

menggunakan kitosan cross linked TPP menggunakan teknologi nanoenkapsulasi

diharapkan dapat dipakai sebagai FEED ADDITIVE dalam meningkatkan

kecernaan pakan serta energi metabolis. Namun sebelumnya harus dipilih formula

yang paling baik yaitu yang mempunyai jumlah sel kurkumin paling banyak.

Proses-proses yang terdapat pada tahap preprocessing antara lain

grayscalling, kontras, segmentasi, dan thresholding. Tahap processing dilakukan

dengan operasi morfologi closing diikuti oleh opening. Sedangkan tahap analizing

dilakukan dengan Connected Component Analizing untuk pelabelan dan

penghitungan.

Hasil dari pengujian menunjukkan bahwa metode pengolahan citra

mikroskopis yang tepat dan optimal adalah dengan proses grayscalling, kontras,

segmentasi, thresholding, morfologi opening dan closing, labeling serta counting.

Hasil pengujian terhadap citra kurkumin mencapai nilai keakuratan tertinggi yaitu

95,31% pada citra kurkumin dengan komposisi 121 yang ukurannya 50 nm.

Kata kunci : Pengolahan Citra Mikroskopis, Kurkumin, Operasi Morfologi,

Connected Component Labeling.

Page 15: PENGOLAHAN CITRA MIKROSKOPIS UNTUK MENGHITUNG SEL …

1

BAB I

PENDAHULUAN

1.1 LATAR BELAKANG

Kurkumin merupakan senyawa polifenol yang dapat ditemukan pada

temulawak, temugiring dan kunyit. Bahan aktif ekstrak kunyit/kurkumin yang

telah ditingkatkan bioavailabilitasnya dengan diformulasikan menggunakan

kitosan cross linked TPP menggunakan teknologi nanoenkapsulasi diharapkan

dapat dipakai sebagai FEED ADDITIVE dalam meningkatkan kecernaan pakan

serta energi metabolis. Namun sebelumnya harus dipilih formula yang paling baik

untuk digunakan sebagai FEED ADDITIVE tersebut (Sundari, 2012).

Formulasi kurkumin menggunakan kitosan cross linked TPP yang jumlah

total 12 sampel sudah dipilih 3 sampel yang akan diteliti lebih lanjut. Ketiga

sampel tersebut yang akan digunakan untuk menentukan formula / komposisi

yang paling baik. Cara menentukan formula yang paling baik salah satunya

dengan melihat jumlah sel kurkumin yang tersimpan dalam masing-masing

formula / komposisi. Jumlah sel kurkumin yang paling banyak diasumsikan

sebagai sampel yang paling baik karena formula tersebut dapat mengikat sel

kurkumin lebih banyak daripada formula yang lainnya.

Untuk mengetahui morfologi mikropartikel dapat dilakukan pengukuran

menggunakan mikroskop elektron tranmisi (TEM), dan dengan mikroskop ini sel-

sel kurkumin dapat terlihat. Jumlah sel kurkumin dapat dihitung dengan cara

konvensional. Tetapi bila sel kurkumin yang dihitung cukup banyak akan

Page 16: PENGOLAHAN CITRA MIKROSKOPIS UNTUK MENGHITUNG SEL …

2

memakan banyak waktu. Hal ini menyebabkan pengukuran secara konvensional

tidak efisien. Selain itu, penghitungan secara konvensional terkadang kurang

akurat ketika dilakukan dengan pengamatan langsung. Keakuratan pengamatan

pada sel kurkumin sangat dipengaruhi oleh tingkat ketelitian dan kelelahan mata

atau pun sedikit serta banyaknya sel kurkumin, hal inilah yang mengakibatkan

sering terjadinya kesalahan pada perhitungan manual ini. Dengan semakin

majunya ilmu pengetahuan maka pengukuran akan lebih akurat dengan

melakukan pengukuran dan penghitungan melalui bantuan pengolahan citra

digital. Disisi lain kebutuhan akan kemudahan, kepraktisan serta keakuratan pada

masa sekarang ini sudah menjadi sesuatu yang dianggap sebagai kebutuhan.

Analisa suatu citra untuk menggali informasi yang terkandung di

dalamnya dapat dilakukan menggunakan pengolahan citra digital. Salah satu

contoh analisa pada citra adalah dengan menghitung objek yang ada pada suatu

citra, seperti menghitung jumlah sel kurkumin pada citra nanopartikel. Dengan

mengetahui jumlah sel kurkumin maka formula yang paling baik dapat diketahui.

1.2 RUMUSAN MASALAH

Dari penelitian ini dapat diambil perumusan masalah, antara lain sebagai

berikut :

a. Metode pengolahan citra digital apa sajakah yang tepat dan optimal

untuk menghitung sel kurkumin pada citra nanopartikel.

Page 17: PENGOLAHAN CITRA MIKROSKOPIS UNTUK MENGHITUNG SEL …

3

b. Formula / komposisi kurkumin manakah yang mempunyai tingkat

akurasi tertinggi dari penghitungan jumlah sel kurkumin pada citra

nanopartikel menggunakan pengolahan citra mikroskopis.

1.3 TUJUAN PENELITIAN

Tujuan Penelitian ini adalah :

a. Mencari metode pengolahan citra digital yang tepat dan optimal untuk

menghitung sel kurkumin pada citra nanopartikel.

b. Mencari formula / komposisi kurkumin yang mempunyai tingkat

akurasi tertinggi dari penghitungan jumlah sel kurkumin pada citra

nanopartikel menggunakan pengolahan citra mikroskopis.

1.4 BATASAN PENELITIAN

Hal-hal yang akan dilakukan dalam dalam penelitian ini dibatasi pada

masalah yang akan dibahas, yaitu:

1. Citra yang akan diolah adalah hasil pemotretan sel kurkumin dengan

menggunakan kamera dan mikroskop elektron transmisi (TEM), tanpa

membahas proses pemotretannya.

2. Percobaan pengolahan citra mikroskopis dari kurkumin dengan berbagai

metode pengolahan, namun hanya pada perbesaran tertentu saja.

3. Seluruh percobaan pada penelitian ini menggunakan perangkat lunak Matlab

versi 7.1.

Page 18: PENGOLAHAN CITRA MIKROSKOPIS UNTUK MENGHITUNG SEL …

4

1.5 KEASLIAN PENELITIAN

Penelitian tentang pengolahan citra mikroskopis untuk menghitung sel

kurkumin pada citra nanopartikel sejauh pengetahuan penulis belum pernah

dilakukan sebelumnya. Model penelitian tentang pengolahan citra mikroskopis

seperti ini pernah dilakukan sebelumnya tetapi perbedaannya terdapat pada studi

kasus yang diteliti, proses penghitungan dan data-data lainnya dalam penelitian

ini. Sebagian besar penelitian sebelumnya menggunakan studi kasus untuk

penghitungan sel darah merah. Citra sel darah merah tersebut berasal dari citra

mikroskopis yang diolah menggunakan pengolahan citra digital.

1.6 SISTEMATIKA PENULISAN

Laporan penelitian tugas akhir ini disusun secara sistematis dibagi dalam

beberapa bab. Penyusunan laporan tugas akhir ini memiliki urutan, yang dimulai

dari BAB I sampai BAB V.

BAB I. PENDAHULUAN

Bagian ini menerangkan tentang latar belakang, rumusan masalah,

tujuan penelitian, batasan penelitian, keaslian penelitian dan sistematika

penulisan.

BAB II. TINJUAN PUSTAKA DAN LANDASAN TEORI

Bagian ini berisikan teori-teori penunjang penelitian. Terdiri atas teori

pengolahan citra digital, morfologi citra dan pembahasan singkat

tentang Matlab 7.1. Serta membahas kesulitan-kesulitan pengolahan

citra mikroskopis secara umum dan cara pemecahannya.

Page 19: PENGOLAHAN CITRA MIKROSKOPIS UNTUK MENGHITUNG SEL …

5

BAB III. METODE PENELITIAN

Bagian ini berisi tentang uraian rinci tentang alat dan bahan penelitian.

Selain itu juga memberikan penjelasan mengenai detail langkah-

langkah yang harus dilalui untuk mencapai tujuan dan simpulan akhir

penelitian.

BAB IV. HASIL DAN PEMBAHASAN

Bab ini memuat hasil penelitian dan pembahasan yang sifatnya terpadu

dan tidak dipecah menjadi sub bab tersendiri.

BAB V. PENUTUP

Bagian ini berisi kesimpulan dan saran – saran untuk perbaikan.

Page 20: PENGOLAHAN CITRA MIKROSKOPIS UNTUK MENGHITUNG SEL …

64

BAB V

PENUTUP

5.1 KESIMPULAN

Berdasarkan hasil analisa dan pembahasan, diperoleh kesimpulan sebagai

berikut :

a. Metode pengolahan citra mikroskopis yang tepat dan optimal adalah dengan

proses grayscalling, kontras, segmentasi, thresholding, morfologi opening

dan closing, labeling serta counting.

b. Nilai keakuratan tertinggi yaitu 95,31% pada citra kurkumin dengan

komposisi 121 yang ukuran perbesarannya 50 nm.

5.2 SARAN

Mengingat masih banyaknya perbaikan yang perlu dilakukan pada

penelitian ini, maka penulis mempertimbangkan beberapa saran yang diperlukan

dalam proses perbaikan-perbaikan pada penelitian ini diantaranya adalah:

a. Melakukan pengujian terhadap beberapa nilai untuk parameter Structuring

Element.

b. Melakukan perbandingan antara citra yang dilakukan proses kontras dengan

citra yang tidak dilakukan proses kontras pada preproessingnya.

Page 21: PENGOLAHAN CITRA MIKROSKOPIS UNTUK MENGHITUNG SEL …

65

c. Mencoba metode-metode lain yang memberikan hasil lebih akurat daripada

hasil penelitian ini.

d. Mencoba pengolahan citra mikroskopis dengan objek-objek lainnya.

Page 22: PENGOLAHAN CITRA MIKROSKOPIS UNTUK MENGHITUNG SEL …

66

DAFTAR PUSTAKA

Ahmad, Usman. 2005. Pengolahan Citra Digital dan Teknik

Pemrogramannya.Graha Ilmu. Yogyakarta

Anggreani, Arie dan Darma Putra, 2010, Sistem Pengenalan Kondisi Sel Darah

Merah Pada Citra Mikroskopis, Universitas Udayana Teknologi Elektro

Vol.9 No.2.

Ardisasmita, M.S., 2000, Pengolahan Citra Digital Dan Analisis Kuantitatif

Dalam Karakterisasi Citra Mikroskopik, J: Mikroskopi dan Mikroanalisis

Vol.3 No.1 2000.

Basuki, Achmad, dkk, 2005, Pengolahan Citra Menggunakan Visual Basic, Graha

Ilmu, Yogyakarta.

Dougherty, Geoff. 2009. Digital Image Processing for Medical Applications

Erdiyanto, Ardy, 2012, Rancang Bangun Aplikasi Pencacah Sel Darah Merah

Berbasis PCD, Amikom, Yogyakarta.

Hartadi, D., Sumardi dan R.R. Isnanto, 2004, Simulasi Penghitungan Jumlah Sel

Darah Merah, Transmisi, Vol. 8, No. 2.

Hidayat, Arif, 2007, Matlab Untuk Pengolahan Citra,

http://www.scribd.com/doc/130811874/Matlab-Untuk-Pengolahan-Citra

(diakses tanggal 16 Februari 2013)

Ibrahim, Danny, dkk. 2011. Pengaturan Kecerahan Dan Kontras Citra Secara

Automatis Dengan Teknik Pemodelan Histogram. Undergraduate thesis,

Jurusan Teknik Elektro Fakultas Teknik.

Munir, Rinaldi, Pengolahan Citra Digital dengan Pendekatan Algoritmik,

Bandung: Penerbit Informatika, 2004.

Nugroho. 2005. Implementasi Metode Contrast Stretching untuk Memperbaiki

Kontras Citra.

Nugroho, M. Rifki. 2010. Operasi Morfologi Citra Dengan Matlab. Universitas

Indonesia

Prasetyo, Eko, 2011, Pengolahan Citra Digital dan Aplikasinya Menggunakan

MATLAB, Penerbit Andi, Yogyakarta.

Pujiriyanto, Andry. 2004. Cepat Mahir Matlab. Kuliah Berseri

IlmuKomputer.Com

Page 23: PENGOLAHAN CITRA MIKROSKOPIS UNTUK MENGHITUNG SEL …

67

Putra, Darma. 2003. Pengolahan Citra Digital. Yogyakarta: Andi.

Harris, Revo Almando, 2012, Kurkumin Sebagai Antikanker,

http://pharmassip.blogspot.com/2012/04/kurkumin-sebagai-

antikanker.html (diakses tanggal 16 Februari 2013)

Sundari, 2012, Formulasi Dan Karakterisasi Nanoenkapsulasi Ekstrak Kunyit

Dengan Kitosan Cross-Linked Sodium Tripolifosfat Sebagai Imbuhan

Pakan Ayam Broiler.

Supanji, I K.D., 2012, Pengembangan Aplikasi Perhitungan Jumlah Objek Pada

Citra Digital Dengan Menggunakan Metode Mathematical Morphology

Dan Teknik Connected Component Labeling”, KARMAPATI Vol 1, No.

4.

Sutoyo, T.,dkk., 2009, Teori Pengolahan Citra Digital, Penerbit Andi, Yogyakarta.

Usman, K., 2008, Perhitungan Sel Darah Merah Bertumpuk Berbasis Pengolahan

Citra Digital Dengan Operasi Morfologi, semnasIF UPN ”Veteran”,

Yogyakarta.

Wahyu. 2008. Pengolahan Citra (Image Processing). http://id.shvoong.com/exact-

sciences/physics/1803946-pengolahan-citra-image-processing/.

(diakses tanggal 16 Februari 2013)

Wijaya, M.Ch. dan A. Prijono, 2007, Pengolahan Citra Digital Menggunakan

MATLAB, Informatika Bandung, Bandung.

Zain, M. Ya’qub dan Nasution, Aulia. 2010. Identifikasi Bakteri Tuberculosis

Berdasar Ciri Morfologi Dan Warna. ITS Surabaya.

Page 24: PENGOLAHAN CITRA MIKROSKOPIS UNTUK MENGHITUNG SEL …

SI]RAT XETERANGAI\T

Yeg bdt .dr t6gE di b6*!h id :

NIP : 19550E1219.1032001

IahdeFu$iord :f*torK€rda: F.hrbl Agdhdslli, Uriv. Mat BuM YL

MdEtst!tr brhm Drn6iM :

NIM

: Mfirlb Slolit{h

Phdi/Sddid : T.lnfortrdih /vm: sai$ d& T.holosi tIN [email protected]

B€@bd.r tel.h tukhJo! radilie u!r!L Tls,3 A*.!ir / Ski!3i dogo dd!cia. hltuio il&i Frelitid ey&

It€nild& tudr.t @g{ ili dibud utut dipdguDle s.!6g.i@@dirys,

Yos/.l6dr, 8 Mei 2ol3

Page 25: PENGOLAHAN CITRA MIKROSKOPIS UNTUK MENGHITUNG SEL …

DAFTAR RIWAYAT HIDUP

Identitas Diri

Nama : Nafiatun Sholihah

Tempat/ Tanggal Lahir : Sleman, 6 Desember 1990

Kewarganegaraan : Indonesia

Agama : Islam

Jenis Kelamin : Perempuan

Status Perkawinan : Menikah

Golongan Darah : AB

Alamat : Sorolaten Sidokarto Godean Sleman Yogyakarta 55564

Hobi : Mengaji

Email : [email protected]

[email protected]

Blog : http://asfins-manshurin.blogspot.com/

No. HP : 085743439419 / 02743283304

Pendidikan

Tahun Jenjang Pendidikan

1996-2002 SDN Semarangan IV

2002-2005 SMPN 1 Godean Sleman

2005-2009 SMK N 2 Depok [STM Pembangunan Yogyakarta]

Jurusan T.E.Audio Video

2009-2013 S1 Jurusan T.Informatika

UIN Sunan Kalijaga Yogyakarta

Pengalaman Kerja Praktek/ Magang

Tahun Institusi

2008-2009 IT Comm Panasonic Yogyakarta

2009-2012 Fortran Internet

2012 Admisi UIN Sunan Kalijaga