Lantai kedua dari Rumah Sakit Gigi dan Mulut Universitas Jember dikengkapi dengan berbagai fasilitas yang menunjang sarana dan prasarana yang dibutuhkan. Untuk sampai pada lantai kedua disediakan dua jalur untuk mempermudah pasien ataupun pelayan kesehatan yang ada di sana. Pada Lantai kedua ini terdapat beberapa laboratorium, ruang untuk keperluan edukasi, kantin dan juga toilet serta ruang tunggu untuk pasien mauoun keluarga pasien. Laboratorium pada Lantai kedua Rumah Sakit Gigi dan Mulut Unversitas Jember terdiri atas Laboratorium Prostodosnsia yang berkaitan dengan rehabilitasi dan pemeliharaan fungsi rongga mulut, kenyamanan, penampilan dan kesehatan pasien dengan pembuatan restorasi gigi asli dan atau penggantian gigi hilang beserta jaringan lunak rongga mulut bahan pengganti buatan, selain itu juga terdapat Laboratorium Orthodonsia yang berkaitan dengan keahlian merapikan gigi dan menserasikan bentuk wajah. Ruang edukasi dilantai 2 digunakan untuk menunjang kegiatan pembelajaran tutorial mahasiswa kedokteran gigi Universitas Jember. Kantin, toilet, dan ruang tunggu pasien merupakan fasilitas tambahan yang membantu memberi kenyamanan pada pasien Rumah Sakit Gigi dan Mulut Unversitas Jember .