jurnal ikm

2
Figur S5 peningkatan MAPT exon 6 terlewati pada pasien DM2. A) Analisis EAA diidentifikasi sebagai kejadian AS pada exon 6 dari transkripsi mRNA ENST00000344290 MAPT. Area AS membesar dan exon 6, jarang pada pasien DM2, hal yang abu-abu. B) Plot box memperlihatkanpenurunan ekspresi dari pemeriksaan Affimetriks tempat 3723723 dikenali exon 6, pada pasien DM2 dibanddingkan CTR (n= 10, **** p,0.0001). Penormalan nilai pada level transkripsi menyeluruh. Splice Index (SI) diindikasikan. Figur S6 Hubungan interaksi langsung gen signifikan LIMMA. Algoritma membentuk jaringan yang terdiri hanya pada gen-gen yang kejadian AS yang signifikan dan tidak ada elemen lain yang ditambahkan oleh jaringan. Gen yang muncul hanya yang memiliki satu koneksi atau lebih. Gen-gen yang up-regulated ditandai dengan lingkaran merah, gen-gen yang down- regulated ditandai dengan lingkaran biru. Intensitas warna berkoresponden terhadap intensitas perubahan lipatan. (PPTX) Figur S7 Jarinagn gen DMPK. Jaringan secara umum oleh algoritma “Auto Expand” sekitar gen DMPK. Algoritma yang ditambahkan gen untuk jaringan memberikan pilihan terhadap yang memiliki konektivitasterhadap gen awal dan berhenti ketika sub-network berpotongan atau mencapai ukuran secara umum sebelum ditetapkan batasan 5 gen. Gen-gen pada kumpulan data, seperti b-catenin, c-src, DNA-PK dan WNK1 ditemukan dalam jaringan. Gen-gen dengan lingkaran berwarna adalah yang signifikan dengan kejadian AS. Gen Up- regulated ditandai dengan lingkaran merah,down-regulated dengan lingkaran biru. Intensitas warna berkoresponden terhadap intensitas perubahan lipatan. (PPTX) Figur S8 Jaringan CDC42BP. Subnetwork diperkaya dengan algoritma “Analyze Network” dari gen LIMMA signifikan terdiri dari gen CDC42BP (DMPK-like). Gen-gen dengan lingkaran berwarna adalah yang kejadian AS signifikan. Gen Up-regulated ditandai dengan lingkaran merah,down-regulated dengan lingkaran biru. Intensitas warna berkoresponden terhadap intensitas perubahan lipatan. (PPTX) Figur S9 Jaringan IDH3. Subnetwork diperkaya dengan algoritma “Analyze Network” dari gen LIMMA signifikan terdiri dari gen IDH3. Gen-gen dengan lingkaran berwarna adalah yang kejadian AS signifikan. Gen Up-regulated ditandai dengan lingkaran merah,down-regulated

description

tentang Dm2 distrophy myotonic

Transcript of jurnal ikm

Figur S5peningkatan MAPT exon 6 terlewati pada pasien DM2. A) Analisis EAA diidentifikasi sebagai kejadian AS pada exon 6 dari transkripsi mRNA ENST00000344290 MAPT. Area AS membesar dan exon 6, jarang pada pasien DM2, hal yang abu-abu. B) Plot box memperlihatkanpenurunan ekspresi dari pemeriksaan Affimetriks tempat 3723723 dikenali exon 6, pada pasien DM2 dibanddingkan CTR (n= 10, **** p,0.0001). Penormalan nilai pada level transkripsi menyeluruh. Splice Index (SI) diindikasikan.

Figur S6Hubungan interaksi langsung gen signifikan LIMMA. Algoritma membentuk jaringan yang terdiri hanya pada gen-gen yang kejadian AS yang signifikan dan tidak ada elemen lain yang ditambahkan oleh jaringan. Gen yang muncul hanya yang memiliki satu koneksi atau lebih. Gen-gen yang up-regulated ditandai dengan lingkaran merah, gen-gen yang down-regulated ditandai dengan lingkaran biru. Intensitas warna berkoresponden terhadap intensitas perubahan lipatan. (PPTX)Figur S7Jarinagn gen DMPK. Jaringan secara umum oleh algoritma Auto Expand sekitar gen DMPK. Algoritma yang ditambahkan gen untuk jaringan memberikan pilihan terhadap yang memiliki konektivitasterhadap gen awal dan berhenti ketika sub-network berpotongan atau mencapai ukuran secara umum sebelum ditetapkan batasan 5 gen. Gen-gen pada kumpulan data, seperti b-catenin, c-src, DNA-PK dan WNK1 ditemukan dalam jaringan. Gen-gen dengan lingkaran berwarna adalah yang signifikan dengan kejadian AS. Gen Up-regulated ditandai dengan lingkaran merah,down-regulated dengan lingkaran biru. Intensitas warna berkoresponden terhadap intensitas perubahan lipatan. (PPTX)

Figur S8 Jaringan CDC42BP. Subnetwork diperkaya dengan algoritma Analyze Network dari gen LIMMA signifikan terdiri dari gen CDC42BP (DMPK-like). Gen-gen dengan lingkaran berwarna adalah yang kejadian AS signifikan. Gen Up-regulated ditandai dengan lingkaran merah,down-regulated dengan lingkaran biru. Intensitas warna berkoresponden terhadap intensitas perubahan lipatan. (PPTX)

Figur S9Jaringan IDH3. Subnetwork diperkaya dengan algoritma Analyze Network dari gen LIMMA signifikan terdiri dari gen IDH3. Gen-gen dengan lingkaran berwarna adalah yang kejadian AS signifikan. Gen Up-regulated ditandai dengan lingkaran merah,down-regulated dengan lingkaran biru. Intensitas warna berkoresponden terhadap intensitas perubahan lipatan. (PPTX)Tabel S1 Sekuen primer (XLSX)Tabel 22 karakteristik klinik dari pasien digunakan untuk susunan riwayatTabel S3 kejadian AS diprediksi dengan analisis EAATabel S4 Pemaparan kejadian DM-AS yang diprediksi dengan analisis EAA sebelumnya Tabel S5 Karakteristik klinik dari pasien untuk Validasi PCR Tabel S6 Laporan analisis komplit