Domestik lembu (Bos grunniens) menyediakan daging dan kebutuhan lainnya untuk Tibet yang tinggal di dataran tinggi di Qinghai-Tibet Plateau dan di daerah-daerah yang berdekatan. Perbandingan antara lembu dan sapi dataran rendah yang berkaitan erat (Bos taurus) adalah merupakan sumber informatif dalam mempelajari adaptasi hewan untuk dataran yang tinggi. Di sini, kami menyajikan urutan rancangan genom dari lembu betina yang dihasilkan menggunakan teknologi berbasis Illumina dalam cakupan 65 kali lipat. Perbandingan genom antara lembu dan sapi mengidentifikasi ekspansi dalam gen keluarga lembu yang terkait dengan persepsi sensorik dan metabolisme energi, serta pengayaan domain protein yang terlibat dalam penginderaan lingkungan ekstraseluler dan stres hipoksia. Gen positif yang terpilih dan berkembang pesat dalam garis keturunan lembu juga ditemukan secara signifikan yang diperkaya dalam kategori fungsional dan jalur yang berhubungan dengan hipoksia dan metabolisme nutrisi. Penelitian ini mungkin memiliki maksud penting dalam memahami adaptasi dataran tinggi pada spesies hewan lainnya dan untuk penyakit-hipoksia yang berkaitan pada manusia.