Metabolit Sekunder

Tim Toksikologi dan Tanaman Obat

FKH UB 2020

Kompetensi

•Memahami dan menjelaskan tentang metabolit sekunder

Terpenoid Fenolik (Asam fenolat Flavonoid tanin kumarin) Senyawa mengandung nitrogen (Alkaloid)

METABOLISME

Metabolisme → modifikasi senyawa kimia secara biokimia di dalam organisme dan sel. Metabolisme mencakup sintesis (anabolisme) dan

penguraian (katabolisme) molekul organik kompleks.

Metabolisme biasanya terdiri atas tahapan-tahapan yang melibatkan enzim, yang dikenal pula sebagai jalur metabolisme.

METABOLISME

Metabolisme total merupakan semua proses biokimia di dalam organisme. Metabolisme sel mencakup semua proses kimia di dalam sel. Tanpa metabolisme, makhluk hidup tidak dapat bertahan hidup.

Produk metabolisme disebut metabolit

Metabolomika : Cabang biologi yang mempelajari komposisi metabolit secara keseluruhan pada suatu tahap perkembangan atau pada suatu bagian tubuh.

4

Produk Metabolisme

Urutan terjadinya

• Metabolit primer

• Metabolit sekunder

• Metabolit intermediet

Efek yang timbul

• Zat aktif Farmasetik

• Zat aktif Farmakologik

Produk Metabolisme

Isolasinya

•Zat aktif

•Zat inert

Status keberadaan

•Genuine

•Artefak

• Diproduksi untuk menunjang

kehidupan namun tidak vital

• Memiliki aktivitas farmakologi

dan biologi

• Contoh : terpenoid, alkaloid,

flavonoid

Metabolit sekunder

• Esensial untuk hidup : pertumbuhan

normal, perkembangan dan reproduksi

• Berupa enzim fisiologis, menghasilkan

energi misal karbohidrat

• Terlibat langsung dalam fungsi fisiologis

normal : protein dan enzim

• Terdapat di dalam organisme atau sel

• Contoh : glukosa, asam organik

sederhana, asam lemak, protein,

hormon dan enzim

Berdasarkan pembentukan

Metabolit primer

Berdasarkan sifat

•Zat Aktif oSuatu senyawa kimiawi yang terdapat di dalam suatu

sumber alami (umumnya tumbuhan) yang memberikan sifat khusus dan karakteristik dari tanaman sumber tersebut.

•Zat Inert oZat yang tidak bereaksi secara kimiawi

8

9

Biosintesis Metabolit Sekunder

•Metabolit sekunder dibentuk melalui jalur sintetis termodifikasi dari metabolit primer, atau dibagi substrat yang berasal dari metabolit primer

• Biosintesis metabolit sekunder sangat beragam tergantung dari goIongan senyawa yang bersangkutan.

• Jalur yang biasanya dilalui dalam pembentukan metabolit sekunder ada tiga jalur, yaitu jalur asam asetat, jalur asam sikimat, dan jalur asam mevalonat.

11

12

(Wink, 2010)

13 (Wink, 2010)

Biosyntethic Pathway

14

Pentosa

• Glikosida, polisakarida

Asam shikimat

• fenol, tanin, alkaloid aromatik

Asetat-malonat

• fenol dan alkaloid

Asam mevalonat

• terpena, steroid dan alkaloid

Biosyntethic Pathway

•Penyadapan metabolit dari proses fotosintesis, glikolisis dan siklus Krebs yang merupakan proses menghasilkan energi, sehingga menyediakan zat intermediet untuk biosintesis metabolit sekunder. •Struktur penting yang digunakan dalam biosintesis

metabolit sekunder berasal dari asetil-KoA (Asetil koenzim A), asam shikimat, asam mevalonat dan 1-deoksilulosa 5-fosfat

15

16

(Wink, 2010)

17

Karakteristik Umum dan Peranan

Karakteristik Umum :

•Metabolit sekunder bekerja sebagai pertahanan tanaman terhadap ancaman dari lingkungan maupun dari spesies lain.

• Tumbuhan telah berevolusi untuk beradaptasi lingkungan dengan pengkodean genetik dan beragam enzim yang bermanfaat untuk biosintesis metabolit sekunder.

• Tidak bersifat esensial untuk pertumbuhan atau metabolisme normal.

• Spesifik untuk genus, spesies bahkan strain tertentu.

Peranan di Tanaman

1. Perlawanan terhadap fungi, amuba, tanaman, serangga, dan hewan

2. Agen transport metal

3. Agen simbiosis

4. Hormon reproduksi

5. Agen komunikasi antar organisme

6. Efektor diferensiasi (sporulasi dan germinasi spora)

20

Peranan untuk Manusia

•Kesehatan (antibiotics, enzyme inhibitors, immunomodulators, agen antitumor, growth promoters of animals and plants)

•Nutrisi (pigments and nutraceuticals)

•Meningkatkan produktivitas pertanian (pesticida, insektisida, effectors of ecological competition and symbiosis and pheromones)

21

Terpenes and Terpenoids

Phenols

Klasifikasi

Alkaloids

TERPENOIDS

Terpenes - class of >20,000 compounds containing carbon atoms in multiples of five

Terpenoids - oxygen-containing terpenes (alcohols, ketones, aldehydes)

(kereviz) (zencefil)

• The name "terpene" is derived from the word "turpentine“ • Terpenes and terpenoids are the primary constituents of

the essential oils of many types of plants and flowers.

rose oil 24

The basic molecular formulae of terpenes are multiples of that, (C5H8)n where n is the number of linked isoprene -Isoprene - 2-methyl-1,3-butadiene- units. This is called the isoprene rule or the C5 rule.

Compounds containing carbon atoms in multiples of 5 suggest a C5 building block - isoprene units linked in a “head-to-tail” fashion

2-methyl-1,3-butadiene

25

Klasifikasi Terpenoid berdasarkan jumlah unit isoprenol C5 pada strukturnya

Finding the isoprene building block - cyclic compounds

Finding the isoprene building block - sesquiterpenes (C15)

27

Finding the isoprene building block - triterpenes (C30) -

Squalene has a natural and vital part in the synthesis of all plant and animal sterols, including cholesterol, steroid hormones, and vitamin D in the human body

Finding the isoprene building block - tetraterpenes (C40)

• Lycopene is responsible for the red color in tomatoes and watermelon

• -carotene is the compound that causes carrots and apricots to be orange

28

• Hemiterpenes consist of a single isoprene unit. Isoprene itself is

considered the only hemiterpene, but oxygen-containing derivatives are

hemiterpenoids such as prenol (found in citrus fruits, cranberry, grapes,

raspberry, blackberry, tomato, white bread) and isovaleric acid (found in

in essential oils).

• Monoterpenes consist of two isoprene units and have the molecular

formula C10H16. Examples of monoterpenes are: geraniol, limonene and

terpineol.

• Sesquiterpenes consist of three isoprene units and have the molecular

formula C15H24. Examples of sesquiterpenes are: humulene, farnesenes,

farnesol.

Prenol

isovaleric acid

limonene a strong smell of oranges

terpineol found in pine oil 29

humulene

taxol used in cancer chemotherapy Taxadiene from enzymes Retinol is one of the forms of vitamin A

• Diterpenes are composed of four isoprene units and have the molecular formula C20H32.

• Examples are cafestol, kahweol, cembrene and taxadiene (precursor of taxol).

• Diterpenes also form the basis for biologically important compounds such as retinol, retinal, and phytol. – They are known to be antimicrobial and antiinflammatory.

30

• Sesterterpenes, terpenes having 25 carbons and five isoprene units, are rare relative to the other sizes. – An example of a sesterterpene is geranylfarnesol.

• Triterpenes consist of six isoprene units and have the molecular

formula C30H48. – Squalene, the major constituent of shark liver oil.

• Tetraterpenes contain eight isoprene units and have the molecular

formula C40H64. – Biologically important tetraterpenes include the acyclic lycopene, the

monocyclic gamma-carotene, and the bicyclic alpha- and beta-carotenes.

• Polyterpenes consist of long chains of many isoprene units.

– Natural rubber consists of polyisoprene in which the double bonds are cis.

Properti Terpenoids dan Aktivitas Farmakologisnya (Kabera et al., 2014)

PHENOLICS

PHENOLICS

• Group of secondary plant products or compounds • Composed of a hydroxyl group attached to an aromatic

ring • A broad range of compounds - found in all components

of plants: leaves, flowers, fruit etc • Function of most compounds is unknown • Comprised of many groups: Flavonoids, Tannins, Lignans

etc. – All very chemically diverse!

Contoh:

• Senyawa fenol sederhana

• Lignan, Neolignan, Lignin

• Stilbena

• Naftokinon

• Antrakinon

• Flavonoid

• Antosianin

• Tanin

• Kumarin

• Kromon & Xanton

• Lignans were identified in plants and later in biological fluids of mammals.

• As a class of compounds they contain a dibenzylbutane skeleton and in plants they aid in the formation of lignin used to construct the plant cell wall

LIGNANS

TANNINS • Tannin a general name for a large group of complex

phenolic substances that are capable of tanning animal hides into leather by binding collagen

• Found in almost every plant part - abundant in unripe fruit

• Deter herbivores due to astringent properties - bind saliva and other digestive proteins

• Antimicrobial - tannins in heart wood prevent decay

TANNINS

Aktivitas Farmakologis Tannin

• Sebagai astringent terhadap diare

• Sebagai diuretik terhadap tumor lambung dan duodenum

• Antiinflamasi

FLAVONOIDS • polyphenolic compounds with 15 Carbon

atoms, 2 benzene rings connected by a 3 carbon chain.

• Flower pigments in angiosperms (yellow, red, blue)

Peranan Flavonoid

• Pada tanaman tongkat tinggi, flavonoid terlibat pada filtrasi UV, fiksasi nitrogen simbiosis, dan pigmen bunga.

• Selain itu juga bertindak sebagai chemical messengers, regulator fisiologis dan cell cycle inhibitor.

1. Epidemiological studies: • reduced risk of cancer, coronary heart disease, and

osteoporosis

2. Biochemical and Pharmacological activities:

• anti-oxidant

• anti-viral • anti-carcinogenic • anti-inflammatory • anti-angiogenic • anti-estrogenic (estrogenic)

Studi Aktivitas Flavonoid

44

Flavonoid Structure O

A

B

C

1

2

3

45

6

7

8 1'

2'

3'

4'

5'

6'

O

OH

A

B

C

1

2

5

6

7

8 1'

2'

3'

4'

5'

6'

O

O

A

B

C

1

2

3

5

6

7

8 1'

2'

3'

4'

5'

6'

O

O

A

B

C

1

2

5

6

7

8 1'

2'

3'

4'

5'

6'

O

O

OH

A

B

C

1

2

5

6

7

8 1'

2'

3'

4'

5'

6'

4

3

Base Structure

Flavanonol

Flavone

Flavanone

Flavonol

A

B

C

1

2

5

6

7

8

1'

2'

3'

4'

5'

6'

O

O

Isoflavone

O

O

OH

OH

OH

OH

OH

O

O

OH

OH

OH

OH

OH

O

O

OH

OH

OH

OH

O

O

OH

OH

OH

OH

OH

OH

Quercetin Taxifolin

Kaempferol Myricetin

O

O

OH

OH

OH

O

O

OH

OH

O

O

OH

OH

OH

OH

OH

O

O

OH

OH

OH

Baicalein Chrysin

Morin Galangin

Flavonoids: source

Fruit and vegetables: (All classes)

Red wine: (Flavanol, Flavonols)

Cocoa: (Flavanols and procyanidins)

Tea: (Flavanols)

Berries: (Anthocyanins)

Citrus: (Flavanone)

O

O

HO

OH

OCH3

BIOCHANIN A

O

O

HO

OH

OH

GENISTEIN

ALKALOIDS

Alkaloids

Definisi:

Alkaloid: “Alkali-like“

•Senyawa (basa) organik yang mengandung atom Nitrogen yang berasal dari asam amino (dan memiliki aktivitas farmakologis dalam kadar rendah)

•Most of them are toxic to other organisms

•Can be extracted by acid-base extraction

Klasifikasi Alkaloids • True-alkaloid:

– Berasal dari asam amino

– Bersifat basa

– Atom N ada pada cincin heterosiklis

– Terdapat dalam bentuk garam dengan asam organik

– Contoh: atropin, morfin

Pseudoalkaloid:

•Memiliki karakteristik seperti alkaloid tetapi tidak berasal dari asam amino

•Misal alkaloid terpen (aconitin: akaloid diterpen) dan alkaloid dari jalur metabolisme asetat (coniin), sifat kebasaan rendah

Klasifikasi Alkaloids

• Protoalkaloid:

Amin sederhana dimana atom nitrogennya bukan merupakan bagian dari cincin heterosiklik, bersifat basa dan berasal dari asam amino, misal meskalin

Klasifikasi Alkaloids

• Tidak semua senyawa yang mengandung atom N adalah alkaloid, contoh:

asam amino, piridin

• Kebasaan alkaloid berbeda-beda bahkan ada yang bersifat amfoterik misal chepalin dan asam, misal: kolkhisin

Fakta tentang Alkaloids

• Umumnya merupakan campuran kompleks dari jalur biogenesis yang sama, yang didominasi salah satu konstituen

• Kandungan alkaloid dapat bervariasi pada tiap tahap pertumbuhan tumbuhan

• Alkaloid yang tidak mengandung oksigen dalam struktur kimianya biasanya pada suhu kamar bersifat cair (nikotin, koniin, spartein)

• Alkaloid yang mengandung oksigen akan berbentuk kristal, umumnya kristal tidak berwarna, pada kasus tertentu berwarna (berberine), beberapa berupa amorph

• Alkaloid yang tidak mengandung oksigen dalam struktur kimianya biasanya pada suhu kamar bersifat cair (nikotin, koniin, spartein)

• Alkaloid yang mengandung oksigen akan berbentuk kristal, umumnya kristal tidak berwarna, pada kasus tertentu berwarna (berberine), beberapa berupa amorph

Stereokimia: Sebagian besar optik aktif (biasanya levorotatori), kecuali yang termasuk gugus purin

Kebasaan Tergantung pada keberadaan lone pair elektron dari atom N, tipe heterosiklis dan substitusinya Electron withdrawing group yang dekat dengan atom N menurunkan kebasaan Elektron donating group menaikkan kebasaan

Kebasaan

•Piridin, kuinolin dan isokuinolin: basa •Pirolidin merupakan basa kuat •Pirol dan indol, bersifat asam

N N

N

NH

NH

NHNH

•Alkaloid basa biasanya terdapat di tanaman dalam bentuk garam dengan asam mineral seperti HCl, H2SO4, HNO3, atau asam organik seperti asam tartrat, sulfamat dan maleat, mekonat, isobutirat dan benzoat, atau dalam kombinasi dengan tanin •Alkaloid yang non basa adalah alkaloid amida, ammonium kuartener, laktam, N-oxid

A. Alkaloid heterosiklis yang berasal dari asam amino:

1. Ornithin

2. Lysine

3. Tirosin

4. Fenilalanin

5. Triptofan

6. Asam antranilat

7. Asam nikotinat

8. Histidin

Klasifikasi Alkaloids berdasarkan Biogenesis

B. Alkaloid heterosiklis yang berasal dari nukleotid purin

C. Alkaloid yang terbentuk melalui transaminasi: terpenoid alkaloid

D. Alkaloid yang terbentuk melalui transaminasi dimana N atom terletak pada eksosiklis

Klasifikasi Alkaloids berdasarkan Biogenesis

Aktivitas Biologis Alkaloids di Tanaman

• Plant growth regulatory activity – Menghambat pertumbuhan tanaman, misal

Tomatine pada tomat

– Aktivitas antimitotik : narciclassine dan narciprimine pada daffodil

• As phytoalexin (senyawa antimikroba) – Lupanine in Lupinus

Aktivitas Farmakologis Alkaloids

You can find me at:

noviatria25@ub.ac.id

Any questions?

Thanks!

Seigler, D.S. 1998. Plant Secondary Metabolism.

Kabera, J.N., Semana, E., Mussa, A.R., He, X. 2014. Plant

Secondary Metabolites : Biosynthesis, Classification,

Function and Pharmacological Properties. Journal of

Pharmacy and Pharmacology; 2 : 377-392

Literature

Wink, M. 2010. Biochemistry of Plant Secondary

Metabolism