ASAM AMINO DAN PEPTIDAPERTEMUAN 21Tujuan dan subpokok bahasanTUJUAN:Menjelaskan tentang asam amino dan peptidaSUB POKOK BAHASAN:Asam aminoKlasifikasi asam aminoSifat asam basa amino dan peptidaReaksi2 asam aminoAnalisis asam aminoPenamaan asam amino dan peptida yang terdapat di alam

2Asam aminoAsam amino merupakan penyusun proteinProtein merupakan molekul terbanyak dengan fungsi yang sangat beragam pada suatu sistem yang hidupSetiap asam amino mempunyai:Sebuah gugus karboksilSebuah gugus aminoSebuah gugus-R (rantai samping) yg berbeda yg terikat pd atom karbon

3Klasifikasi asam aminoRantai samping nonpolar (mempunyai elektron yang distribusinya merata)Rantai samping yangbersifat polar (mempunyai elektron yang distribusinya tidak merata)Asam amino dengan rantai samping nonpolarAsam amino jenis ini mempunyai sebuah rantai samping nonpolar yang tidak mengikat atau memberikan proton atau ikut dalam ikatan ion atau ikatan hidrogenRantai samping ini bersifat mirip lipid/minyak interaksi hidrofobik

Letak asam amino nonpolar di dlm protein:Gugus-R nonpolar cenderung berkumpul di bag.dalam protein karena sifat hidrofobiknya.Pada protein yang berada di lingkungan hidrofobik (spt membran), maka gugus-R nonpolar berada pada permukaan luar protein

Prolin:Mengandung sebuah gugus imino, rantai samping dan gugus amino- nya membentuk struktur cincin.Struktur geometrinya berperan dlm pentukan struktur fibrosa kolagen.Asam amino dengan rantai samping polar yang tidak bermuatanAsam amino ini punya: muatan netto = 0 pd pH netral

Ikatan disulfida:Rantai samping sistein punya 1 gugus sulfuhidril (-SH), t4 aktif sbgn besar enzimPada protein, gugus SH dr 2 sistein oksidasi 1 dimer sistin, yg mengandung ikatan disulfida (-S-S-)Rantai samping sbg t4 melekatx komponen lain:Serin, treonin, tirosin gugus hidroksil polar t4 melekatnya gugus fosfatAsparagin (gugus amida), serin & treonin (gugus hidroksil) t4 melekatnya rantai oligosakarida pg glikoproteinAsam amino dgn rantai samping bersifat asamAspartat dan glutamat sbg donor proton.Pd pH netral, rantai samping asam teionisasi & mengandung gugus karboksilat (bermuatan negatif)

Asam amino dengan rantai samping bersifat basaRantai asam amino basa menerima protonPd pH fisiologis, lisin dan arginin rantai sampingnya terionisasi & bermuatan positifHistidin tidak bermuatan, tp bila bergabung dgn protein lain rantai sampingnya bermuatan positif atau netral

Sifat asam basa amino dan peptida

11Sifat-sifat asam dan basa asam aminoJadi, asam amino bebas dan yang berikatan melalui ikatan peptida dapat berfungsi sbg buffer (penyangga)Asam amino dalam larutan berair:Gugus karboksil- bersifat asam lemahGugus amino- bersifat basa lemahAsam amino yang bersifat asam dan basa mengandung gugus yg dpt terionisasi di bagian rantai sampingnya12Persamaan Henderson-HasselbalchHubungan kuantitatif antara konsentrasi asam lemah [HA] dan basa konjugasinya [A-] HA H+ + A-

Ka = [H+][A-]/[HA]Semakin besar Ka:Keasaman makin kuat, krn sbgn besar HA dikonversi menjadi H+ dan A-Semakin kecil Ka:Keasaman makin lemah, karena sedikit asam yang terdisosiasiPenyangga Penyangga adalah larutan yang menahan perubahan pH setelah penambahan asam atau basaPenyangga dpt diperoleh dgn mencampurkan asam lemah [HA] dengan basa konjugatnya [A-].Penyangga mencapai nilai maksimum saat pH-nya = pKa

Penamaan asam amino dan peptida yang terdapat di alamAsam aminoSetiap nama asam amino mempunyai singkatan 3 huruf dan 1 huruf yg berhubungan.Kode 1 huruf ini ditentukan berdasarkan aturan sbb:Huruf pertama yg unik: jika hanya ada 1 asam amino yg dimulai dgn 1 huruf tertentu saja Prioritas diberikan pada asam amino yg paling sering muncul/paling umumNama yang pengucapannya mirip: pengucapan simbol 1 hurufnya mirip dgn asam amino yg menggunakan huruf tsbHuruf yg berdekatan dgn huruf pertamaHuruf pertama yg unikCysteinCysCHistidinHisHIsoleusinIleIMetioninMetMSerinSerSValinValV Prioritas diberikan pada asam amino yg paling umum/sering munculAlaninAlaAGlycineGlyGLeusinLeuLProlinProPThreoninThrTNama yang pengucapannya miripArgininArgR (aRginin)AsparaginAsnN AspartatAspD (asparDik)GlutamatGluE (glutaEmat)GlutaminGlnQ (Qtamin)PhenylalaninePheF (Fenilalanin)TyrosineTyrY (tYrosin)TriptofanTrpW Huruf yg letaknya berdekatan dengan huruf pertamaAspartat atau AsparaginAsxB (dekat A)Glutamat atau glutaminGlxZLysinLysK (dekat L)Asam amino tdk dikenalXPenamaan peptidaMenurut ujung, amino bebas pada rantai peptida (terminal-N) ditulis di sebelah kiri. Ujung karboksil bebas (terminal-C) berada di sebelah kananRangkaian amino dibaca dari ujung akhir terminal-N ke akhir ujung terminal_CContoh: urutan asam amino adalah valin, alanin bukan alanin, valin

Slide Show TipsTo present in true widescreen, youll need a computer and, optionally, a projector or flat panel that can output widescreen resolutions.Common computer widescreen resolutions are 1280 x 800 and 1440 x 900. (These are 16:10 aspect ratio, but will work well with 16:9 projectors and screens.)Standard high definition televisions resolutions are1280 x 720 and 1920 x 1080. Use the Test Pattern on the next slide to verify your slide show settings.

19Widescreen Test Pattern (16:9)Aspect Ratio Test

(Should appear circular)16x94x320