2 - Asam Amino, Peptida & Protein
-
Upload
jajangpermanasubhan -
Category
Documents
-
view
252 -
download
6
Transcript of 2 - Asam Amino, Peptida & Protein
![Page 1: 2 - Asam Amino, Peptida & Protein](https://reader033.fdokumen.com/reader033/viewer/2022061603/55cf9dd6550346d033af71f7/html5/thumbnails/1.jpg)
ASAM AMINO,PEPTIDA DAN PROTEIN
![Page 2: 2 - Asam Amino, Peptida & Protein](https://reader033.fdokumen.com/reader033/viewer/2022061603/55cf9dd6550346d033af71f7/html5/thumbnails/2.jpg)
ASAM AMINO
Merupakan unit terkecil/monomer penyusun peptida dan protein
Strukturnya terdiri atas :- atom C asimetris- gugus alkil ( R )- gugus NH2- gugus karboksil COOH
![Page 3: 2 - Asam Amino, Peptida & Protein](https://reader033.fdokumen.com/reader033/viewer/2022061603/55cf9dd6550346d033af71f7/html5/thumbnails/3.jpg)
ASAM AMINO STANDAR DAN NON STANDAR
Merupakan 20 asam amino L – α yang menyusun protein dalam komposisi yang beragam
Jenis asam amino , urutan, serta struktur tiga dimensi yang terbentuk dalam pembentukan protein akan mempengaruhi sifat dan fungsi protein tsb.
Ditemukan juga asam amino ke 21 ( jarang) yaitu selenosistein yang terdapat dalam beberapa enzim seperti glutation peroksidase
Asam amino non standar : asam amino diuar asam amino standar yang membentuk protein , ada lebih 300 jenis.Merupakan odifikasi asam amino standar, contoh: α-phosposerin, merupakan serin yang mengalami posporilasi oleh bantuan enzim pospokinase
![Page 4: 2 - Asam Amino, Peptida & Protein](https://reader033.fdokumen.com/reader033/viewer/2022061603/55cf9dd6550346d033af71f7/html5/thumbnails/4.jpg)
ASAM AMINO ESENSIAL
Merupakan 8 asam amino yang dibutuhkan tubuh, namun tidak bisa diproduksi sendiri oleh tubuh ( disuplai dari luar tubuh ) yaitu : leusin,isoleusin, lisin, metionin,fenil alanin,threonin, triptofan, dan valin
Asam amino ½ esensial : bisa diparoduksi tubuh orang dewasa yaitu : histidin,arginin, sistein,glisin,serin dan tirosin.
Asam amino non esensial : alanin,aspargin,asamaspartat,asam glutamat,glutamin,dan prolin.
![Page 5: 2 - Asam Amino, Peptida & Protein](https://reader033.fdokumen.com/reader033/viewer/2022061603/55cf9dd6550346d033af71f7/html5/thumbnails/5.jpg)
KLASIFIKASI ASAM AMINO
Diklasifikasikan berdasar gugus R (rantai samping)
Biasanya berdasar sifat-sifat seperti: hidrofobik/hidrofilik, polar/non polar, ada/tidaknya gugus terionisasi
Berikut gambar asam amino standar penyusun protein berdasar klasifikasinya :
![Page 7: 2 - Asam Amino, Peptida & Protein](https://reader033.fdokumen.com/reader033/viewer/2022061603/55cf9dd6550346d033af71f7/html5/thumbnails/7.jpg)
Klasifikasi asam amino berdasar kepolaran , gugus spesifik, dan gugus yang bersifat hidrofobik :
1. Asam amino yang bersifat polar Asam amino dengan muatan positif ( bersifat basa )
yaitu : arginin, histidin dan lisin Asam amino yang bermuatan negatif ( bersifat asam )
yaitu : asam glutamat, dan asam aspartat 2. Asam amino bersifat non polar yaitu : serin, threonin, aspargin, glutamin 3. Asam amino dengan gugus khas yaitu : sistein dan selenosistein( mengandung gugus sulfur) , glisin ( asam amino paling sederhana),prolin( mengandung gugus imidazol ) 4. Asam amino dengan gugus hidrofobik yaitu : alanin, isoleusin, leusin, metionin, phenil alanin, triptofan, tirosin, dan valin.
![Page 8: 2 - Asam Amino, Peptida & Protein](https://reader033.fdokumen.com/reader033/viewer/2022061603/55cf9dd6550346d033af71f7/html5/thumbnails/8.jpg)
SIFAT UTAMA ASAM AMINO :
1. Sifat amfoter , yang membentuk Zwitter ion, dimana pada pH titik isoelektriknya bermuatan netto = 0
![Page 9: 2 - Asam Amino, Peptida & Protein](https://reader033.fdokumen.com/reader033/viewer/2022061603/55cf9dd6550346d033af71f7/html5/thumbnails/9.jpg)
2. Sifat isomerisasinya, untuk protein asam amino yang terlibat adalah asam amino L- α.
Gambar isomerisasi asam amino alanin
![Page 10: 2 - Asam Amino, Peptida & Protein](https://reader033.fdokumen.com/reader033/viewer/2022061603/55cf9dd6550346d033af71f7/html5/thumbnails/10.jpg)
PEPTIDA
Merupakan polimerasi asam amino , dan jika berpolimerasi membentuk polipeptida yang merupakan protein, terdiri dari beberapa unit asam amino yang dihubungkan oleh ikatan peptida.Mempunyai fungsi biologis yang beragam spt : sebagai hormon, sebagai neurotransmiter, sebagai antibiotik ( spt : gramisidin A ) , untuk pembuatan vaksin, dsb
![Page 11: 2 - Asam Amino, Peptida & Protein](https://reader033.fdokumen.com/reader033/viewer/2022061603/55cf9dd6550346d033af71f7/html5/thumbnails/11.jpg)
STRUKTUR
Merupakan gabungan beberapa unit sam amino yang dihubungkan oleh ikatan peptida
Contoh :
![Page 12: 2 - Asam Amino, Peptida & Protein](https://reader033.fdokumen.com/reader033/viewer/2022061603/55cf9dd6550346d033af71f7/html5/thumbnails/12.jpg)
PROTEIN STRUKTUR DAN FUNGSI
Merupakan polipetida yang dibangun dari 4 tingkatan struktur pembentuknya
Perubahan pada masing-masing tingkatan struktur mempngaruhi sifat dan fungsi protein
Pengklasifikasiannya dilakukan berdasar banyak cara, spt berdasar kelarutan, bentuk, fungsi biologis, atau struktur3 dimensinya.
![Page 13: 2 - Asam Amino, Peptida & Protein](https://reader033.fdokumen.com/reader033/viewer/2022061603/55cf9dd6550346d033af71f7/html5/thumbnails/13.jpg)
STRUKTUR PROTEIN :
Ada 4 tingkatan struktur yang membentuk protein :
1. Struktur primer , merupakan urutan asam amino yang menyusun protein yang disebutkan dari kiri ke kanan ( dari N terminal ke C terminal )
Ikatan yang menstabilkan struktur ini adalah ikatan peptida
![Page 14: 2 - Asam Amino, Peptida & Protein](https://reader033.fdokumen.com/reader033/viewer/2022061603/55cf9dd6550346d033af71f7/html5/thumbnails/14.jpg)
GAMBAR STRUKTUR PRIMER
![Page 15: 2 - Asam Amino, Peptida & Protein](https://reader033.fdokumen.com/reader033/viewer/2022061603/55cf9dd6550346d033af71f7/html5/thumbnails/15.jpg)
2. STRUKTUR SEKUNDER PROTEIN
Struktur ini biasanya terjadi akibat terbentuknya ikatan hidrogen antara asam amino dengan asam amino lainnya,sehingga membentuk konformasi α helix dan β sheet
Pada konformasi α helix juga terjadi gaya Van der Walls
![Page 16: 2 - Asam Amino, Peptida & Protein](https://reader033.fdokumen.com/reader033/viewer/2022061603/55cf9dd6550346d033af71f7/html5/thumbnails/16.jpg)
GAMBAR STRUKTUR SEKUNDER
![Page 17: 2 - Asam Amino, Peptida & Protein](https://reader033.fdokumen.com/reader033/viewer/2022061603/55cf9dd6550346d033af71f7/html5/thumbnails/17.jpg)
3. STRUKTUR TERSIER
![Page 18: 2 - Asam Amino, Peptida & Protein](https://reader033.fdokumen.com/reader033/viewer/2022061603/55cf9dd6550346d033af71f7/html5/thumbnails/18.jpg)
Struktur Tersier Protein Dihydrofolatreductase (Image from uic.edu)
Struktur tersier adalah menjelaskan bagaimana seluruh rantai polipeptida melipat sendiri sehingga membentuk struktur 3 dimensi. Pelipatan ini dipengaruhi oleh interaksi antar gugus samping (R) satu sama lain. Ada beberapa interaksi yang terlibat
![Page 19: 2 - Asam Amino, Peptida & Protein](https://reader033.fdokumen.com/reader033/viewer/2022061603/55cf9dd6550346d033af71f7/html5/thumbnails/19.jpg)
INTERAKSI IONIK
Terjadi antara gugus samping yang bermuatan positif (memiliki gugus –NH2 tambahan) dan gugus negatif (–COOH tambahan).
![Page 20: 2 - Asam Amino, Peptida & Protein](https://reader033.fdokumen.com/reader033/viewer/2022061603/55cf9dd6550346d033af71f7/html5/thumbnails/20.jpg)
IKATAN HIDROGEN
Jika pada struktur sekunder ikatan hidrogen terjadi pada ‘backbone‘, maka ikatan hidrogen yang terjadi antar gugus samping akan membentuk struktur tersier. Karena pada gugus samping bisa banyak terdapat gugus seperti –OH, –COOH, –CONH2 atau –NH2 yang bisa membentuk ikatan hidrogen.
![Page 21: 2 - Asam Amino, Peptida & Protein](https://reader033.fdokumen.com/reader033/viewer/2022061603/55cf9dd6550346d033af71f7/html5/thumbnails/21.jpg)
GAMBAR IKATAN HIDROGEN PADA STRUKTUR TERSIER
![Page 22: 2 - Asam Amino, Peptida & Protein](https://reader033.fdokumen.com/reader033/viewer/2022061603/55cf9dd6550346d033af71f7/html5/thumbnails/22.jpg)
GAYA DISPERSI VAN DER WAALS
Beberapa asam amino memiliki gugus samping (R) dengan rantai karbon yang cukup panjang. Nilai dipol yang berfluktuatif dari satu gugus samping dapat membentuk ikatan dengan dipol berlawanan pada gugus samping lain.
![Page 24: 2 - Asam Amino, Peptida & Protein](https://reader033.fdokumen.com/reader033/viewer/2022061603/55cf9dd6550346d033af71f7/html5/thumbnails/24.jpg)
JEMBATAN SULFIDA
Cysteine memiliki gugus samping –SH dimana dapat membentuk ikatan sulfida dengan –SH pada cystein lainnya, ikatan ini berupa ikatan kovalen sehingga lebih kuat dibanding ikatan-ikatan lain yang sudah disebutkan di atas.
![Page 25: 2 - Asam Amino, Peptida & Protein](https://reader033.fdokumen.com/reader033/viewer/2022061603/55cf9dd6550346d033af71f7/html5/thumbnails/25.jpg)
GAMBAR JEMBATAN SULFIDA
![Page 26: 2 - Asam Amino, Peptida & Protein](https://reader033.fdokumen.com/reader033/viewer/2022061603/55cf9dd6550346d033af71f7/html5/thumbnails/26.jpg)
4.STRUKTUR QUARTENER
Protein atau polipeptida yang sudah memiliki struktur tersier dapat saling berinteraksi dan bergabung menjadi suatu multimer. Protein pembentuk multimer dinamakan subunit. Suatu multimer dinamakan dimer jika terdiri atas 2 subunit, trimer jika 3 subunit dan tetramer untuk 4 subunit. Multimer yang terbentuk dari subunit-subunit identik disebut dengan awalan homo–, sedangkan jika subunitnya berbeda-beda dinamakan hetero–. Misalnya hemoglobin yang terdiri atas 2 subunit alfa dan 2 subunit beta dinamakan heterotetramer.
![Page 27: 2 - Asam Amino, Peptida & Protein](https://reader033.fdokumen.com/reader033/viewer/2022061603/55cf9dd6550346d033af71f7/html5/thumbnails/27.jpg)
GAMBAR STRUKTUR QUARTENER HAEMOGLOBIN
![Page 28: 2 - Asam Amino, Peptida & Protein](https://reader033.fdokumen.com/reader033/viewer/2022061603/55cf9dd6550346d033af71f7/html5/thumbnails/28.jpg)
KLASIFIKASI PROTEIN
Klasifikasi protein ada berbagai macam, berdasar bentuk,fungsi, kelarutan dsb;
Klasifikasi berdasar kelarutan : albumin, larut dalam air dan garam globulin, sedikit larut dalam air dan larut
dalam garam protamin, larut dalam 70-80% etanol,tidak
larut dalam air dan etanol absolut - histon , larut dalam larutan garam, dsb
![Page 29: 2 - Asam Amino, Peptida & Protein](https://reader033.fdokumen.com/reader033/viewer/2022061603/55cf9dd6550346d033af71f7/html5/thumbnails/29.jpg)
KLASIFIKASI BERDASAR FUNGSI:
1. Protein katalitik, berupa enzim 2. Protein traranspor,spt haemoglobin,
lipoprotein 3. Protein struktur, spt : kolagen 4. Protein pengatur , spt : hormon peptida 5. Protein pelindung,spt : imunoglobulin 6. Protein kontraktil , spt : aktin 7. Protein penyimpanan , spt feritin,
mioglobin
![Page 30: 2 - Asam Amino, Peptida & Protein](https://reader033.fdokumen.com/reader033/viewer/2022061603/55cf9dd6550346d033af71f7/html5/thumbnails/30.jpg)
KLASIFIKASI BERDASAR BENTUK:
1. Protein globular, mempunyai rantai polipeptida yg berpilin serta terlipat secara padat dengan rasio aksial( rasio panjang terhadap lebar) kurang dari 10 , umumnya antar 3-4, contoh : enzim
2. Protein fibrosa : memiliki rasio aksial lebih dari 10 , spt , banyak berfungsi dalam jaringan ikat,kulit dsb
![Page 31: 2 - Asam Amino, Peptida & Protein](https://reader033.fdokumen.com/reader033/viewer/2022061603/55cf9dd6550346d033af71f7/html5/thumbnails/31.jpg)
DENATURASI PROTEIN :
Denaturasi adalah rusaknya struktur sekunder, tersier,dan quartener dari protein akabat pengaruh zat kimia, panas, sehingga merusak aktivitas biologisnya. Denaturasi ada yang bersifat reversibel ( spt : protein disulfida isomerase ) dan ireversibel ( spt : enzim)
Asam , basa urea, sodium dodesil sulfat dapat memutuskan ikatan hidrogen, ikatan hidrofobik, dan ikatan ionik, sehingga merusak struktur protein kecuali struktur primer
![Page 32: 2 - Asam Amino, Peptida & Protein](https://reader033.fdokumen.com/reader033/viewer/2022061603/55cf9dd6550346d033af71f7/html5/thumbnails/32.jpg)
KERUSAKAN PADA TRUKTUR SEKUNDER DAN EFEK MEDISNYA:
Devisiensi vitamin C berat, enzim prolil serta lisil hidroksilase menjadi inaktif, disamping itu juga mengakibatkan tropokolagen tidak dapat membentuk ikatan silang kovalen, akan terjadi skorbut yg ditandai pendaahan gusi, penyembuhan luka yg laa, buruk dan bisa juga sampai menyebabkan kematian.
- dsb