Apakah Yang Dimaksud Dengan Faktor Lingkungan Abiotik Dan Biotik Pada Mikrobia Industri

download Apakah Yang Dimaksud Dengan Faktor Lingkungan Abiotik Dan Biotik Pada Mikrobia Industri

of 8

Transcript of Apakah Yang Dimaksud Dengan Faktor Lingkungan Abiotik Dan Biotik Pada Mikrobia Industri

  • 7/24/2019 Apakah Yang Dimaksud Dengan Faktor Lingkungan Abiotik Dan Biotik Pada Mikrobia Industri

    1/8

    1 Apakah yang dimaksud dengan faktor lingkungan abiotik dan biotik pada

    mikrobia industri

    Jwb:

    Faktor abiotik mengacu pada unsur-unsur hidup fisik dan kimia dalam

    ekosistem. Sumber abiotik biasanya diperoleh dari litosfer, atmosfer,

    hidrosfer dan. ontoh faktor abiotik pada mikrobiologi industri adalah suhu,

    p!, kelembapan " pengeringan, tekanan osmosis, ion-ion logam, iradasi,

    dan tekanan. Faktor biotik hidup atau organisme yang pernah hidup dalam

    ekosistem. #ni diperoleh dari biosfer dan mampu reproduksi. ontoh faktor

    biotik pada mikrobiologi industri adalah interaksi antar mikroba, asosiasi

    mikroba dan tumbuhan

    $. Jelaskan perbedaan antara pemanfaatan mikrobia secara tradisional dan

    modern, berikan contohnya.

    Jwb: %ioteknologi tradisional yang tidak secara langsung melibatkan asam

    nukleat atau manipulasi molekulerdan asam nukleat %ioteknologi.&erkemban

    gan dalam biologi molekuler asam nukleat dalam

    proses genetik. !al ini menyebabkan aplikasi biologi manipulasi pada

    tingkat molekuler dalam sepert

    iteknologi sebagai rekayasa genetika.&emanfaatan mikrobia alami'sifat

    dasar'nature dalam proses penghasilan produk ontoh produks: butanol, asam

    asetat dan antibiotic. (odern : &emanfaatan mikrobia yang sudah

    direkayasa'diubah sifat dasar'nature dalam proses pemanfaatannya,)ekayasagenetika: pengubahan sifat dasar'nature mikrobia, cotohnya dengan metode

    pemindahan gen dari satu mikrobia ke mikroba lain ontoh: gen insulin

    manusia yang dipindahkan ke bakteriE. coli

    *. +ambarkan dan elaskan dogma dalam metode )ekayasa genetika gen

    cloning.

    Jwb: (etode )ekayasa +enetika

    #solasi dan pemurnian gen

    /arakterisasi dan identifikasi gen &enyambungan gen ligasi dengan 0ektor plasmidplasmid rekombinan

    (emasukkan plasmid rekombinan ke dalam asad penerima transformasi

    &emilihan sel penerima gen seleksi rekombinan

    &enumbuhan sel rekombinan ekspresi gen

    gen cloning igasi 2 3ransformasi - Seleksi transforman - /ulti0asi

    transforman -&roduksi insulin

  • 7/24/2019 Apakah Yang Dimaksud Dengan Faktor Lingkungan Abiotik Dan Biotik Pada Mikrobia Industri

    2/8

    4. Apakah yang dimaksud dengan anabolik dan katabolik, elaskan masing

    masing keterkaitan antara anabolik dan katabolik

    wb :

    /atabolisme adalah serangkaianmetabolik yang memecah molekul unit yang lebih

    kecil untukmelepaskan energi.516 katabolisme memecah molekulyang besar seperti

    polisakarida,lipid, asam nukleat dan protein kedalam unit yang lebihkecil seperti

    monosakarida, asam lemak,nukleotida, dan asam amino,masing-masing.

    Anabolisme adalah serangkaian metabolik yang membangun molekul

    dari unit yang lebih kecil 7$ 8 !$o 9 energi

    (eskipun anabolisme dan katabolisme adalah fenomena yang berbeda

    beberapa alur memiliki unsur-unsur dari kedua enis

    metabolisme intermediat yangberasal dari katabolisme dan yang

    uga tersedia untuk anabolisme dikenal sebagai at antara amphibolic.

    ;.Apakah yang dimaksud dengan primary metabolic dan secondary metabolikA?! dan A3&.

    1. +lukosa +lukosa =-fosfat

    $. +lukosa =2Fosfat Fruktosa =2fosfat

    *. Fruktosa =2Fosfat Fruktosa 1,=2difosfat

    4. Fruktosa 1,=2difosfat

    ?ihidroksiaseton fosfat +liseraldehida *-fosfat

    ;. +liseraldehida *2Fosfat 1,*2difosfogliserat

    =. 1,*2difosfogliserat *2Fosfogliserat

    @. *2Fosfogliserat $-Fosfogliserat

    . $2Fosfogliserat Fosfoenolpiru0at

    B. Fosfoenolpiru0at piru0at

  • 7/24/2019 Apakah Yang Dimaksud Dengan Faktor Lingkungan Abiotik Dan Biotik Pada Mikrobia Industri

    4/8

    @. 3uliskan faktor-faktor berikut harus diperhitungkan dalam menentukan bahan baku

    yang akan digunakan dalam menghasilkan produk yang menggunakan

    mikroorganisme.

    1. 7rganisme : 7rganisme yang akan digunakan harus dapat menghasilkanproduk dalam umlah yang cukup banyak

    $. (edium : Substrat yang digunakan oleh organisme untuk membuat produk

    baru harus murah dan tersedia dalam jumlah yang banyak.

    *. !asil

    4. Fermentasi industri dilakukan dalam tangki-tangki yang besar kapasitasnya

    dapat mencapai $CC.CCC liter. &roduk metabolisme mikroba biasanya

    merupakan campuran heterogen yang terdiri dari sel-sel mikroorganisme

    dalam umlah yang sangat banyak, komponen-komponen medium yang tidak

    terpakai, dan produk-produk metabolisme yang tidak dikehendaki.Karena

    itu, harus dikembangkan metode-metode yang mudah dilaksanakan dalam

    skala besar untuk memisahkan dan memurnikan produk akhir yang

    diinginkan.

    5. Tidak berbahaya bagi manusia, dan secara ekonomik penting bagi hean

    dan tumbuhan.

    !. "ersi#at non-patogen dan bebas toksin, atau jika menghasilkan toksin harus

    cepat di-inakti#kan.

    $. %udah dipindahkan dari medium biakan. &i laboratorium, sel

    mikroorganisme pertama kali dipindahkan dengan sentri#ugasi, tetapi

    sentri#ugasi bersi#at sulit dan mahal untuk industri skala-besar.

    . %ikroorganisme lebih disukai jika berukuran besar, karena sel lebih mudah

    dipindahkan dari biakan dengan penyaringan 'dengan bahan penyaring

    yang relati# murah. Sehingga, fungi, ragi, dan bakteri berfilamen lebih

    disukai. %akteri unisel, berukuran kecil sehingga sulit dipisahkan dari biakan

    cair.

    B. %ikroorganisme industri harus dapat direkayasa secara genetik. (ekayasa

    genetika pada mikroba bertujuan untuk meningkatkan e#ekti)itas kerja

    mikroba tersebutmisalnya mikroba untuk fermentasi, pengikat nitrogen

    udara, meningkatkan kesuburan tanah, mempercepat proses kompos dan

    pembuatan makanan ternak, mikroba prebiotik untuk makanan olahan, untukmenghasilkan bahan obat-obatan dan kosmetika, serta &embuatan insulin

    manusia dari bakteri Sel pankreas yang mempu mensekresi #nsulin

    digunting, potongan ?>A itu disisipkan ke dalam &lasmid bakteri ?>A

    rekombinan yang terbentuk menyatu dengan &lasmid diineksikan lagi ke

    0ektor, ika hidup segera dikembangbiakkan.

    . Jelaskan apa yang dimaksuddengan o0er-produksi mikroorganisme dan beberapa

    regulasi terhadap mikroorganisme yang memungkinkan untuk menghindari o0er-

    produksi

  • 7/24/2019 Apakah Yang Dimaksud Dengan Faktor Lingkungan Abiotik Dan Biotik Pada Mikrobia Industri

    5/8

    Jwb: o0er produksi mikroorganisme adalh penghasilan mikroorganisme yg

    melebihi yg dibutuhkan D produksi mikroorganisme berlebih

    Substrat #nduksi

    &eraturan umpan balik&eraturan asam amino sintesis )>A

    &eraturan (engisi Energi

    &ermeabilitas /ontrol

    B. Jelaskan pengaruh adanya substrat inducer terhadap aktifitas primari metabolic

    terhadap o0er produksi akti0itas mirobia.

    Jwb: #nduksi substrat oleh enim memungkinkan organisme untuk merespon dengan

    cepat, kadang-kadang dalam hitungan detik, dengan kehadiran substrat yang cocok,

    sehingga enim yang tidak diinginkan tidak diproduksi.

    1C. /ontrol metabolic untuk o0er-production pada produk antara mengakibatkan

    alur yang tergangu seperti gambar di bawah ini. oba elaskan kemungkinan

    rekayasa yang dapat mengendalikan kondisi tersebut.

    /elebihan perantara di alur bercabang: 3he

    akumulasi perantara di alur bercabang adalah yang paling mudah dariberbagai manipulasi yang harus dipertimbangkan. &ertimbangkan produksi produk

    akhir E

    setelah seri pada +ambar. =.;.

    Akhir-produk E menghambat enim 1 dan merepresi Enim $, *, dan 4.

    mutan auksotrofik dihasilkan %ab @ yang tidak memiliki enim *. mutan tersebut

    7leh karena itu membutuhkan E untuk pertumbuhan. Jika membatasi tingkat

    rendah dari E kini dipasok ke

    menengah, umlah dalam sel tidak akan cukup untuk menyebabkan penghambatan

    enim 1

    atau represi enim $ dan karena itu akan berakhir diproduksi, dan dikeluarkan dari

  • 7/24/2019 Apakah Yang Dimaksud Dengan Faktor Lingkungan Abiotik Dan Biotik Pada Mikrobia Industri

    6/8

    sel. &rinsip ini diterapkan dalam produksi ornithine oleh citrulline-kurang

    mutan citrulline auotroph dari orynebacterium glutamicum yang tingkat rendah

    arginin disediakan +br. =.=.

    #i /elebihan dari perantara dari alur bercabangD #nosin -;-

    monofosfat fermentasi #(&: #ni adalah sedikit lebih rumit daripada

    kasus sebelumnya. >ukleotida penting sebagai agen penyedap dan kelebihan yang

    beberapa dapat dilakukan seperti ditunukkan pada +ambar. =.@. ?i alur yang

    ditunukkan

    pada +ambar. =.@ end-produk adenosin monofosfat ;- A(& dan guanosin -;-

    monophsophate +(& baik secara kumulatif umpan balik menghambat dan

    menekan

    enim utama 516.

    Selain itu, A(& menghambat enim 5116 yang bulu #(& untuk anthosine-;-

    monofosfat G(&. ?engan makan rendahnya tingkat adenin ke mutan auksotrofikdari orynebacterium glutamicum yang tidak memiliki enim 5116 uga dikenal

    sebagai

    adenineless karena tidak bisa membuat adenin #(& disebabkan menumpuk. #tu

    kon0ersi #(& untuk G(& dihambat oleh +(& pada 51*6. /etika enim 5146 adalah

    dihapus oleh mutasi, strain yang membutuhkan baik guanin dan adenin diperoleh.

    adalah

    dihapus oleh mutasi, strain yang membutuhkan baik guanin dan adenin adalah

    obtained.Such ketegangan akan mengeluarkan umlah tinggi G(& saat makan

    membatasi konsentrasiguanin dan adenin.

    /elebihan-produk akhir alur bercabang: 3he kelebihan akhir

    produksi produk akhir yang lebih rumit daripada mendapatkan intermediet.

    ?iantara produk akhir sendiri produksi produk akhir bercabang

    alur lebih mudah daripada di alur bercabang. 70er-produksi produk akhir

    alur dari bercabang akan dibahas dalam bagian iniD bercabang

    alur akan dibahas nanti.

    !al ini diilustrasikan +ambar. =. menggunakan lisin, asam amino yang penting

    kurang dalamsereal dan karena itu ditambahkan sebagai suplemen untuk makanan sereal terutama

    pada hewan

    makanan. !al ini dihasilkan baik menggunakan glutamicum orynebacterium atau

    %re0ibacterium

    fla0um. isin diproduksi pada bakteri ini dengan alur bercabang yang uga

    menghasilkan metionin, isoleusin, dan treonin. Enim awal ini

    alur aspartokinase diatur oleh umpan balik penghambatan bersama dari treonindan

    lisin. ?engan penghapusan mutasi dari enim yang mengubah semialdehid aspartat

    untuk homoserine, yaitu homoserine dehidrogenase, mutan tidak bisa

  • 7/24/2019 Apakah Yang Dimaksud Dengan Faktor Lingkungan Abiotik Dan Biotik Pada Mikrobia Industri

    7/8

    tumbuh kecuali metionin dan treonin ditambahkan ke medium. Selama

    treonin tersedia dalam membatasi umlah, konsentrasi intraseluler dari

    Asam amino yang rendah dan tidak makan kembali menghambat enim primer,

    aspartokinase. #ntermediet metabolisme demikian dipindahkan ke cabang lisin

    dan lisin terakumulasi dalam media +ambar. =..

    i0 /elebihan dari produk akhir dari alur bercabang: ?ua metode yang digunakan

    untuk kelebihan produksi produk akhir dari alur bercabang. Hang pertama adalah

    penggunaan analog beracun dari senyawa yang diinginkan dan yang kedua adalah

    untuk backmutate

    mutan auksotrofik. &enggunaan analog tahan beracun atau umpan balik: ?alam

    metode ini organisme bakteri atau

    sel-sel ragi, atau spora amur yang pertama kali terkena mutagen. (ereka kemudian

    berlapis dalam

    medium yang mengandung analog senyawa yang diinginkan, yang bagaimanapunuga beracun

    untuk organisme. Sebagian besar sel termutasi akan dibunuh oleh analog. #tu

    yang bertahan akan tahan terhadap analog dan beberapa dari mereka akan tahan

    terhadap

    umpan balik represi dan inhibisi oleh bahan yang berlebih yang diinginkan.

    !al ini karena organisme termutasi akan telah ItertipuI dalam hidup pada

    substrat yang sama, tapi tidak sama dengan yang ditawarkan setelah mutagenesis.

    Akibatnya hal itu mungkin

    menunukkan inhibisi umpan balik dalam medium yang mengandung analog tapimungkin resisten terhadap

    umpan balik penghambatan dari material yang akan diproduksi, karena perubahan

    kecil dalam

    konfigurasi enim yang dihasilkan oleh mutan. Efek bersih adalah untuk

    memodifikasi

    enim yang diproduksi oleh mutan sehingga kurang peka terhadap inhibisi umpan

    balik.

    Atau enim sistem membentuk mungkin sehingga diubah sehingga tidak sensitif

    terhadap

    umpan balik represi. 3abel =.$ menunukkan daftar senyawa yang telah digunakan

    untuk

    menghasilkan mutan analog-tahan.

    &enggunaan (utasi sebaliknya: Sebuah mutasi balik dapat disebabkan dalam gen

    struktural dari

    mutan auksotrofik dalam proses yang dikenal sebagai pengembalian. Enim yang

    berbeda dalam struktur

    dari enim asli, tapi yang tetap masih aktif, sering mengakibatkan. 3elah

    melaporkan bahwa pengembalian mutan auksotrofik kurang enim utama dalam

  • 7/24/2019 Apakah Yang Dimaksud Dengan Faktor Lingkungan Abiotik Dan Biotik Pada Mikrobia Industri

    8/8

    alur metabolisme sering mengakibatkan re0ertants yang mengeluarkan produk akhir

    dari

    alur. Enim dalam re0ersi aktif tetapi berbeda dari enim asli

    menadi sensitif terhadap penghambatan umpan balik.