Apakah Yang Dimaksud Dengan Faktor Lingkungan Abiotik Dan Biotik Pada Mikrobia Industri
-
Upload
hamzaharifinsinambela -
Category
Documents
-
view
221 -
download
0
Transcript of Apakah Yang Dimaksud Dengan Faktor Lingkungan Abiotik Dan Biotik Pada Mikrobia Industri
-
7/24/2019 Apakah Yang Dimaksud Dengan Faktor Lingkungan Abiotik Dan Biotik Pada Mikrobia Industri
1/8
1 Apakah yang dimaksud dengan faktor lingkungan abiotik dan biotik pada
mikrobia industri
Jwb:
Faktor abiotik mengacu pada unsur-unsur hidup fisik dan kimia dalam
ekosistem. Sumber abiotik biasanya diperoleh dari litosfer, atmosfer,
hidrosfer dan. ontoh faktor abiotik pada mikrobiologi industri adalah suhu,
p!, kelembapan " pengeringan, tekanan osmosis, ion-ion logam, iradasi,
dan tekanan. Faktor biotik hidup atau organisme yang pernah hidup dalam
ekosistem. #ni diperoleh dari biosfer dan mampu reproduksi. ontoh faktor
biotik pada mikrobiologi industri adalah interaksi antar mikroba, asosiasi
mikroba dan tumbuhan
$. Jelaskan perbedaan antara pemanfaatan mikrobia secara tradisional dan
modern, berikan contohnya.
Jwb: %ioteknologi tradisional yang tidak secara langsung melibatkan asam
nukleat atau manipulasi molekulerdan asam nukleat %ioteknologi.&erkemban
gan dalam biologi molekuler asam nukleat dalam
proses genetik. !al ini menyebabkan aplikasi biologi manipulasi pada
tingkat molekuler dalam sepert
iteknologi sebagai rekayasa genetika.&emanfaatan mikrobia alami'sifat
dasar'nature dalam proses penghasilan produk ontoh produks: butanol, asam
asetat dan antibiotic. (odern : &emanfaatan mikrobia yang sudah
direkayasa'diubah sifat dasar'nature dalam proses pemanfaatannya,)ekayasagenetika: pengubahan sifat dasar'nature mikrobia, cotohnya dengan metode
pemindahan gen dari satu mikrobia ke mikroba lain ontoh: gen insulin
manusia yang dipindahkan ke bakteriE. coli
*. +ambarkan dan elaskan dogma dalam metode )ekayasa genetika gen
cloning.
Jwb: (etode )ekayasa +enetika
#solasi dan pemurnian gen
/arakterisasi dan identifikasi gen &enyambungan gen ligasi dengan 0ektor plasmidplasmid rekombinan
(emasukkan plasmid rekombinan ke dalam asad penerima transformasi
&emilihan sel penerima gen seleksi rekombinan
&enumbuhan sel rekombinan ekspresi gen
gen cloning igasi 2 3ransformasi - Seleksi transforman - /ulti0asi
transforman -&roduksi insulin
-
7/24/2019 Apakah Yang Dimaksud Dengan Faktor Lingkungan Abiotik Dan Biotik Pada Mikrobia Industri
2/8
4. Apakah yang dimaksud dengan anabolik dan katabolik, elaskan masing
masing keterkaitan antara anabolik dan katabolik
wb :
/atabolisme adalah serangkaianmetabolik yang memecah molekul unit yang lebih
kecil untukmelepaskan energi.516 katabolisme memecah molekulyang besar seperti
polisakarida,lipid, asam nukleat dan protein kedalam unit yang lebihkecil seperti
monosakarida, asam lemak,nukleotida, dan asam amino,masing-masing.
Anabolisme adalah serangkaian metabolik yang membangun molekul
dari unit yang lebih kecil 7$ 8 !$o 9 energi
(eskipun anabolisme dan katabolisme adalah fenomena yang berbeda
beberapa alur memiliki unsur-unsur dari kedua enis
metabolisme intermediat yangberasal dari katabolisme dan yang
uga tersedia untuk anabolisme dikenal sebagai at antara amphibolic.
;.Apakah yang dimaksud dengan primary metabolic dan secondary metabolikA?! dan A3&.
1. +lukosa +lukosa =-fosfat
$. +lukosa =2Fosfat Fruktosa =2fosfat
*. Fruktosa =2Fosfat Fruktosa 1,=2difosfat
4. Fruktosa 1,=2difosfat
?ihidroksiaseton fosfat +liseraldehida *-fosfat
;. +liseraldehida *2Fosfat 1,*2difosfogliserat
=. 1,*2difosfogliserat *2Fosfogliserat
@. *2Fosfogliserat $-Fosfogliserat
. $2Fosfogliserat Fosfoenolpiru0at
B. Fosfoenolpiru0at piru0at
-
7/24/2019 Apakah Yang Dimaksud Dengan Faktor Lingkungan Abiotik Dan Biotik Pada Mikrobia Industri
4/8
@. 3uliskan faktor-faktor berikut harus diperhitungkan dalam menentukan bahan baku
yang akan digunakan dalam menghasilkan produk yang menggunakan
mikroorganisme.
1. 7rganisme : 7rganisme yang akan digunakan harus dapat menghasilkanproduk dalam umlah yang cukup banyak
$. (edium : Substrat yang digunakan oleh organisme untuk membuat produk
baru harus murah dan tersedia dalam jumlah yang banyak.
*. !asil
4. Fermentasi industri dilakukan dalam tangki-tangki yang besar kapasitasnya
dapat mencapai $CC.CCC liter. &roduk metabolisme mikroba biasanya
merupakan campuran heterogen yang terdiri dari sel-sel mikroorganisme
dalam umlah yang sangat banyak, komponen-komponen medium yang tidak
terpakai, dan produk-produk metabolisme yang tidak dikehendaki.Karena
itu, harus dikembangkan metode-metode yang mudah dilaksanakan dalam
skala besar untuk memisahkan dan memurnikan produk akhir yang
diinginkan.
5. Tidak berbahaya bagi manusia, dan secara ekonomik penting bagi hean
dan tumbuhan.
!. "ersi#at non-patogen dan bebas toksin, atau jika menghasilkan toksin harus
cepat di-inakti#kan.
$. %udah dipindahkan dari medium biakan. &i laboratorium, sel
mikroorganisme pertama kali dipindahkan dengan sentri#ugasi, tetapi
sentri#ugasi bersi#at sulit dan mahal untuk industri skala-besar.
. %ikroorganisme lebih disukai jika berukuran besar, karena sel lebih mudah
dipindahkan dari biakan dengan penyaringan 'dengan bahan penyaring
yang relati# murah. Sehingga, fungi, ragi, dan bakteri berfilamen lebih
disukai. %akteri unisel, berukuran kecil sehingga sulit dipisahkan dari biakan
cair.
B. %ikroorganisme industri harus dapat direkayasa secara genetik. (ekayasa
genetika pada mikroba bertujuan untuk meningkatkan e#ekti)itas kerja
mikroba tersebutmisalnya mikroba untuk fermentasi, pengikat nitrogen
udara, meningkatkan kesuburan tanah, mempercepat proses kompos dan
pembuatan makanan ternak, mikroba prebiotik untuk makanan olahan, untukmenghasilkan bahan obat-obatan dan kosmetika, serta &embuatan insulin
manusia dari bakteri Sel pankreas yang mempu mensekresi #nsulin
digunting, potongan ?>A itu disisipkan ke dalam &lasmid bakteri ?>A
rekombinan yang terbentuk menyatu dengan &lasmid diineksikan lagi ke
0ektor, ika hidup segera dikembangbiakkan.
. Jelaskan apa yang dimaksuddengan o0er-produksi mikroorganisme dan beberapa
regulasi terhadap mikroorganisme yang memungkinkan untuk menghindari o0er-
produksi
-
7/24/2019 Apakah Yang Dimaksud Dengan Faktor Lingkungan Abiotik Dan Biotik Pada Mikrobia Industri
5/8
Jwb: o0er produksi mikroorganisme adalh penghasilan mikroorganisme yg
melebihi yg dibutuhkan D produksi mikroorganisme berlebih
Substrat #nduksi
&eraturan umpan balik&eraturan asam amino sintesis )>A
&eraturan (engisi Energi
&ermeabilitas /ontrol
B. Jelaskan pengaruh adanya substrat inducer terhadap aktifitas primari metabolic
terhadap o0er produksi akti0itas mirobia.
Jwb: #nduksi substrat oleh enim memungkinkan organisme untuk merespon dengan
cepat, kadang-kadang dalam hitungan detik, dengan kehadiran substrat yang cocok,
sehingga enim yang tidak diinginkan tidak diproduksi.
1C. /ontrol metabolic untuk o0er-production pada produk antara mengakibatkan
alur yang tergangu seperti gambar di bawah ini. oba elaskan kemungkinan
rekayasa yang dapat mengendalikan kondisi tersebut.
/elebihan perantara di alur bercabang: 3he
akumulasi perantara di alur bercabang adalah yang paling mudah dariberbagai manipulasi yang harus dipertimbangkan. &ertimbangkan produksi produk
akhir E
setelah seri pada +ambar. =.;.
Akhir-produk E menghambat enim 1 dan merepresi Enim $, *, dan 4.
mutan auksotrofik dihasilkan %ab @ yang tidak memiliki enim *. mutan tersebut
7leh karena itu membutuhkan E untuk pertumbuhan. Jika membatasi tingkat
rendah dari E kini dipasok ke
menengah, umlah dalam sel tidak akan cukup untuk menyebabkan penghambatan
enim 1
atau represi enim $ dan karena itu akan berakhir diproduksi, dan dikeluarkan dari
-
7/24/2019 Apakah Yang Dimaksud Dengan Faktor Lingkungan Abiotik Dan Biotik Pada Mikrobia Industri
6/8
sel. &rinsip ini diterapkan dalam produksi ornithine oleh citrulline-kurang
mutan citrulline auotroph dari orynebacterium glutamicum yang tingkat rendah
arginin disediakan +br. =.=.
#i /elebihan dari perantara dari alur bercabangD #nosin -;-
monofosfat fermentasi #(&: #ni adalah sedikit lebih rumit daripada
kasus sebelumnya. >ukleotida penting sebagai agen penyedap dan kelebihan yang
beberapa dapat dilakukan seperti ditunukkan pada +ambar. =.@. ?i alur yang
ditunukkan
pada +ambar. =.@ end-produk adenosin monofosfat ;- A(& dan guanosin -;-
monophsophate +(& baik secara kumulatif umpan balik menghambat dan
menekan
enim utama 516.
Selain itu, A(& menghambat enim 5116 yang bulu #(& untuk anthosine-;-
monofosfat G(&. ?engan makan rendahnya tingkat adenin ke mutan auksotrofikdari orynebacterium glutamicum yang tidak memiliki enim 5116 uga dikenal
sebagai
adenineless karena tidak bisa membuat adenin #(& disebabkan menumpuk. #tu
kon0ersi #(& untuk G(& dihambat oleh +(& pada 51*6. /etika enim 5146 adalah
dihapus oleh mutasi, strain yang membutuhkan baik guanin dan adenin diperoleh.
adalah
dihapus oleh mutasi, strain yang membutuhkan baik guanin dan adenin adalah
obtained.Such ketegangan akan mengeluarkan umlah tinggi G(& saat makan
membatasi konsentrasiguanin dan adenin.
/elebihan-produk akhir alur bercabang: 3he kelebihan akhir
produksi produk akhir yang lebih rumit daripada mendapatkan intermediet.
?iantara produk akhir sendiri produksi produk akhir bercabang
alur lebih mudah daripada di alur bercabang. 70er-produksi produk akhir
alur dari bercabang akan dibahas dalam bagian iniD bercabang
alur akan dibahas nanti.
!al ini diilustrasikan +ambar. =. menggunakan lisin, asam amino yang penting
kurang dalamsereal dan karena itu ditambahkan sebagai suplemen untuk makanan sereal terutama
pada hewan
makanan. !al ini dihasilkan baik menggunakan glutamicum orynebacterium atau
%re0ibacterium
fla0um. isin diproduksi pada bakteri ini dengan alur bercabang yang uga
menghasilkan metionin, isoleusin, dan treonin. Enim awal ini
alur aspartokinase diatur oleh umpan balik penghambatan bersama dari treonindan
lisin. ?engan penghapusan mutasi dari enim yang mengubah semialdehid aspartat
untuk homoserine, yaitu homoserine dehidrogenase, mutan tidak bisa
-
7/24/2019 Apakah Yang Dimaksud Dengan Faktor Lingkungan Abiotik Dan Biotik Pada Mikrobia Industri
7/8
tumbuh kecuali metionin dan treonin ditambahkan ke medium. Selama
treonin tersedia dalam membatasi umlah, konsentrasi intraseluler dari
Asam amino yang rendah dan tidak makan kembali menghambat enim primer,
aspartokinase. #ntermediet metabolisme demikian dipindahkan ke cabang lisin
dan lisin terakumulasi dalam media +ambar. =..
i0 /elebihan dari produk akhir dari alur bercabang: ?ua metode yang digunakan
untuk kelebihan produksi produk akhir dari alur bercabang. Hang pertama adalah
penggunaan analog beracun dari senyawa yang diinginkan dan yang kedua adalah
untuk backmutate
mutan auksotrofik. &enggunaan analog tahan beracun atau umpan balik: ?alam
metode ini organisme bakteri atau
sel-sel ragi, atau spora amur yang pertama kali terkena mutagen. (ereka kemudian
berlapis dalam
medium yang mengandung analog senyawa yang diinginkan, yang bagaimanapunuga beracun
untuk organisme. Sebagian besar sel termutasi akan dibunuh oleh analog. #tu
yang bertahan akan tahan terhadap analog dan beberapa dari mereka akan tahan
terhadap
umpan balik represi dan inhibisi oleh bahan yang berlebih yang diinginkan.
!al ini karena organisme termutasi akan telah ItertipuI dalam hidup pada
substrat yang sama, tapi tidak sama dengan yang ditawarkan setelah mutagenesis.
Akibatnya hal itu mungkin
menunukkan inhibisi umpan balik dalam medium yang mengandung analog tapimungkin resisten terhadap
umpan balik penghambatan dari material yang akan diproduksi, karena perubahan
kecil dalam
konfigurasi enim yang dihasilkan oleh mutan. Efek bersih adalah untuk
memodifikasi
enim yang diproduksi oleh mutan sehingga kurang peka terhadap inhibisi umpan
balik.
Atau enim sistem membentuk mungkin sehingga diubah sehingga tidak sensitif
terhadap
umpan balik represi. 3abel =.$ menunukkan daftar senyawa yang telah digunakan
untuk
menghasilkan mutan analog-tahan.
&enggunaan (utasi sebaliknya: Sebuah mutasi balik dapat disebabkan dalam gen
struktural dari
mutan auksotrofik dalam proses yang dikenal sebagai pengembalian. Enim yang
berbeda dalam struktur
dari enim asli, tapi yang tetap masih aktif, sering mengakibatkan. 3elah
melaporkan bahwa pengembalian mutan auksotrofik kurang enim utama dalam
-
7/24/2019 Apakah Yang Dimaksud Dengan Faktor Lingkungan Abiotik Dan Biotik Pada Mikrobia Industri
8/8
alur metabolisme sering mengakibatkan re0ertants yang mengeluarkan produk akhir
dari
alur. Enim dalam re0ersi aktif tetapi berbeda dari enim asli
menadi sensitif terhadap penghambatan umpan balik.