DARMAWAN SAIDDARMAWAN SAIDN11112313N11112313

DNADAN

RNA

ASAM NUKLEATASAM NUKLEAT

Asam nukleatAsam nukleat polimer yang dibentuk oleh mononukleotidapolimer yang dibentuk oleh mononukleotida FungsiFungsi menyimpan, mereplikasi dan mentranskripsi menyimpan, mereplikasi dan mentranskripsi

informasiinformasi genetika genetika

NUKLEOSIDANUKLEOSIDA

Merupakan seny. N-glikosida dr bs purin dan Merupakan seny. N-glikosida dr bs purin dan pirimidin yg dihubungkan oleh ikt glikosida antara pirimidin yg dihubungkan oleh ikt glikosida antara atom karbon-1 dr pentosa dg atom nitrogen 1(N –atom karbon-1 dr pentosa dg atom nitrogen 1(N – 1) dr pirimidin atau nitrogen 9 (N -9) dr purin1) dr pirimidin atau nitrogen 9 (N -9) dr purin

BASA PURIN DAN PIRIMIDINBASA PURIN DAN PIRIMIDIN

NUKLEOTIDANUKLEOTIDA Nukleotida (nukleosida Nukleotida (nukleosida fosfat) adl ester asam fosfat drfosfat) adl ester asam fosfat dr nukleosidanukleosida merupakan nukleosida ygmerupakan nukleosida yg terfosforilasi.terfosforilasi.

Berperan serta dlm sejumlahBerperan serta dlm sejumlah besar proses biokimiawibesar proses biokimiawi peran yg paling dikenal peran yg paling dikenal adl sbg prekursor adl sbg prekursor monomer RNA dan monomer RNA dan DNADNA

NH2

N

N

N

N

OCH2P

O

HO

O

OH OH

O

Basa

(adenin)

1

23

4

5

Subunit Nukleotida dari DNA Subunit Nukleotida dari RNA

H

Timin

H3C H

POLINUKLEOTIDAPOLINUKLEOTIDA

Polimer mononukleotidaPolimer mononukleotida Deoksi asam ribonukleat (DNA)Deoksi asam ribonukleat (DNA) Asam ribonuklaet (RNA)Asam ribonuklaet (RNA)

DNADNA

DNA merupakan struktur yang dibangun oleh KH pentosa

(deoksiribosa), fosfat dan suatu basa dalam bentuk polimer

dan berkombinasi membentuk helix ganda. Blok pembangun DNA adalah “5-carbon sugar

deoxyribose” yang saling dihubungkan oleh ikatan fosfodiester

sehingga terbentuk dua untai ganda dengan tulang punggungnya dibentuk dari ikatan KH-fosfat pada bagian luar helix.

DNADNA

DNA merupakan struktur yang dibangun oleh KH pentosa (deoksiribosa), fosfat dan suatu basa dalam bentuk polime dan berkombinasi membentuk helix ganda.

Blok pembangun DNA adalah “5-carbon sugar deoxyribose” yang saling dihubungkan oleh ikatan fosfodiester sehingga terbentuk dua untai ganda dengan tulang punggungnya dibentuk dari ikatan KH-fosfat pada bagian luar helix.

STRUKTUR DNASTRUKTUR DNA

Kedua strand dari helix saling

merupakan komplemeternya

masing-masing.

Setiap pentosa-nya juga terikat pada salah satu dari keempat basa yang terdiri dari adenine (A), guanine (G), cytosine (C) atau thymine (T).

Gula deoksiribosa dan fosfat Gula deoksiribosa dan fosfat yg menyusun DNA terletak yg menyusun DNA terletak dibgn luar molekul, sdgkan bs dibgn luar molekul, sdgkan bs purin dan pirimidin t’letak di purin dan pirimidin t’letak di sebelah dlm untaian (heliks)sebelah dlm untaian (heliks)

Strand yang berlawanan diikat

oleh suatu ikatan non kovalen diantara dua basa yang selalu berpasangan G dengan C

oleh tiga ikatan hidrogen dan A dipasangkan dengan T oleh dua ikatan hidrogen.

Terdapat dua posisi dari

pentosa yang terikat pada

gugus fosfat yaitu pada ujung

5’-P dan ujung 3’-OH.

Menurut Menurut James WatsonJames Watson & & Francis CrickFrancis Crick

Ukuran jarak antara pasangan Ukuran jarak antara pasangan basa basa

0,34 nm (3,4 0,34 nm (3,4 ooA)A)

Setiap putaran untaian td 10 ps Setiap putaran untaian td 10 ps basa dan jarak satu putar heliks basa dan jarak satu putar heliks 3,4 nm 3,4 nm

Diameter untaian DNA Diameter untaian DNA 2,0 nm 2,0 nm

Bentuk Fisik Struktur DNABentuk Fisik Struktur DNA

B’dsrkan jml ps basa B’dsrkan jml ps basa bbrp tipe (bentuk) bbrp tipe (bentuk)

TipeTipe Pasangan Pasangan bs/putaranbs/putaran

Diameter Diameter heliks (nm)heliks (nm)

AA

BB

CC

DD

EE

ZZ

1111

1010

9,339,33

88

7,57,5

1212

2,3 2,3

1,91,9

1,91,9

--

--

1,81,8

Untaian (strand) DNA td dua Untaian (strand) DNA td dua

lekukan (groove)lekukan (groove)

lekukan besar (major groove)lekukan besar (major groove)

lekukan kecil (minor groove)lekukan kecil (minor groove) lekukan pada tipe B lebih lekukan pada tipe B lebih mudah m’ikat protein drpd mudah m’ikat protein drpd tipe A ( lebih dalam)tipe A ( lebih dalam)

DNA (Gen) terdiri dari tiga struktur penting yaitu : Bagian yang disebut “gene regulatory segment” m’ngdung

srtuktur yang terlibat pada proses inisiasi dan pengaturan proses transkripsi.

Exon bagian yang mengandung codon untuk ditranslasikan oleh mRNA menjadi protein.

Intron bagian struktur yang tidak mengandung codon (intervening sequence).

KROMOSOMKROMOSOM

KROMATINKROMATIN

NUKLEOSOMNUKLEOSOM

RNARNA

Spt pd DNA molekul RNA dibentuk oleh nukleotida yang saling dihubungkan menjadi satu rantai

KH pada DNA deoksiribosa. Sedangkan RNA KH-nya adalah ribosa.

Basa timin diganti oleh urasil pada RNA

STRUKTUR RNASTRUKTUR RNA

DNA terdiri dari dua untai yang saling komplementer membentuk helix ganda, ttp RNA hanya terdiri dari satu untai tunggal, akan tetapi dapat melipat lipat dirinya dalam suatu aturan tertentu.

Basa pada RNA sama spt DNA, kecuali timin diganti oleh urasil.

3 macam RNA penting

mRNA (messenger-RNA) yg melakukan tranfer

informasi mengenai deretan asam amino pada protein yang akan dibangun sesuai dengan urutan kode pada DNA asal.

rRNA (ribosomal-RNA) yang membangun ribosom

bersama dengan protein

tRNA (transfer-RNA) yang mentransfer asam

amino ke ribosom untuk sintesis protein.

mRNAmRNA

rRNArRNA

rRNArRNA

tRNAtRNA

tRNA Td 75 bh nukleotida Td 4 lengan utama lengan

akseptor lengan

antikodon lengan D lengan T C lengan

tambahan Fungsi sbg

penyelaras utk translasi

FAKTOR YANG MEMPENGARUHI FAKTOR YANG MEMPENGARUHI KESTABILAN DNAKESTABILAN DNA

Kestabilan struktur DNAKestabilan struktur DNA

Tumpukan (stacking) basa nukleotida pd satu rantaiTumpukan (stacking) basa nukleotida pd satu rantai interaksi hidrofobik antara basa-basa nukleotidainteraksi hidrofobik antara basa-basa nukleotida hilang krn panas & reagensia hilang krn panas & reagensia struktur tdk teratur : struktur tdk teratur : serapan cahayaserapan cahaya Ikatan hidrogenIkatan hidrogen antara basa-basa yg berpasangan pd rantai gandaantara basa-basa yg berpasangan pd rantai ganda terutama pada ps antara C dan Gterutama pada ps antara C dan G makin >> ps C-G, makin stabil strukturmakin >> ps C-G, makin stabil struktur

Denaturasi DNADenaturasi DNA Pecahnya ikatan hidrogen antara ps basa pada rantai Pecahnya ikatan hidrogen antara ps basa pada rantai

gandaganda

rantai tunggal (single Stranded)rantai tunggal (single Stranded)

Penyebab DenaturasiPenyebab Denaturasi

Panas Panas

ikt hidrogenikt hidrogen

stackingstacking

Asam – basaAsam – basa

asam asam protonasi ggs N dr A,G dan C protonasi ggs N dr A,G dan C

basa basa deprotonasi ggs N dr G dan C deprotonasi ggs N dr G dan C

Tingkat denaturasi DNA t’gantung pd tinggi suhuTingkat denaturasi DNA t’gantung pd tinggi suhu

p’ubahan tk denaturasi DNA p’ubahan tk denaturasi DNA suhu b’tingkat suhu b’tingkat absorban absorban 260260 makin > p’geseran str, mk makin > nilai makin > p’geseran str, mk makin > nilai absorban cahaya absorban cahaya efek hiperkromikefek hiperkromik

denaturasi lengkap DNA denaturasi lengkap DNA suhu > 90 suhu > 90ooCC

Renaturas Renaturas Proses p’bentukan kembali str untai ganda Proses p’bentukan kembali str untai ganda dr keadaan terdenaturasi dr keadaan terdenaturasi