STRUKTUR%20DNA%20DAN%20RNA(1).ppt
-
Upload
darmawan-said -
Category
Documents
-
view
7 -
download
0
description
Transcript of STRUKTUR%20DNA%20DAN%20RNA(1).ppt
DARMAWAN SAIDDARMAWAN SAIDN11112313N11112313
DNADAN
RNA
ASAM NUKLEATASAM NUKLEAT
Asam nukleatAsam nukleat polimer yang dibentuk oleh mononukleotidapolimer yang dibentuk oleh mononukleotida FungsiFungsi menyimpan, mereplikasi dan mentranskripsi menyimpan, mereplikasi dan mentranskripsi
informasiinformasi genetika genetika
NUKLEOSIDANUKLEOSIDA
Merupakan seny. N-glikosida dr bs purin dan Merupakan seny. N-glikosida dr bs purin dan pirimidin yg dihubungkan oleh ikt glikosida antara pirimidin yg dihubungkan oleh ikt glikosida antara atom karbon-1 dr pentosa dg atom nitrogen 1(N –atom karbon-1 dr pentosa dg atom nitrogen 1(N – 1) dr pirimidin atau nitrogen 9 (N -9) dr purin1) dr pirimidin atau nitrogen 9 (N -9) dr purin
BASA PURIN DAN PIRIMIDINBASA PURIN DAN PIRIMIDIN
NUKLEOTIDANUKLEOTIDA Nukleotida (nukleosida Nukleotida (nukleosida fosfat) adl ester asam fosfat drfosfat) adl ester asam fosfat dr nukleosidanukleosida merupakan nukleosida ygmerupakan nukleosida yg terfosforilasi.terfosforilasi.
Berperan serta dlm sejumlahBerperan serta dlm sejumlah besar proses biokimiawibesar proses biokimiawi peran yg paling dikenal peran yg paling dikenal adl sbg prekursor adl sbg prekursor monomer RNA dan monomer RNA dan DNADNA
NH2
N
N
N
N
OCH2P
O
HO
O
OH OH
O
Basa
(adenin)
1
23
4
5
Subunit Nukleotida dari DNA Subunit Nukleotida dari RNA
H
Timin
H3C H
POLINUKLEOTIDAPOLINUKLEOTIDA
Polimer mononukleotidaPolimer mononukleotida Deoksi asam ribonukleat (DNA)Deoksi asam ribonukleat (DNA) Asam ribonuklaet (RNA)Asam ribonuklaet (RNA)
DNADNA
DNA merupakan struktur yang dibangun oleh KH pentosa
(deoksiribosa), fosfat dan suatu basa dalam bentuk polimer
dan berkombinasi membentuk helix ganda. Blok pembangun DNA adalah “5-carbon sugar
deoxyribose” yang saling dihubungkan oleh ikatan fosfodiester
sehingga terbentuk dua untai ganda dengan tulang punggungnya dibentuk dari ikatan KH-fosfat pada bagian luar helix.
DNADNA
DNA merupakan struktur yang dibangun oleh KH pentosa (deoksiribosa), fosfat dan suatu basa dalam bentuk polime dan berkombinasi membentuk helix ganda.
Blok pembangun DNA adalah “5-carbon sugar deoxyribose” yang saling dihubungkan oleh ikatan fosfodiester sehingga terbentuk dua untai ganda dengan tulang punggungnya dibentuk dari ikatan KH-fosfat pada bagian luar helix.
STRUKTUR DNASTRUKTUR DNA
Kedua strand dari helix saling
merupakan komplemeternya
masing-masing.
Setiap pentosa-nya juga terikat pada salah satu dari keempat basa yang terdiri dari adenine (A), guanine (G), cytosine (C) atau thymine (T).
Gula deoksiribosa dan fosfat Gula deoksiribosa dan fosfat yg menyusun DNA terletak yg menyusun DNA terletak dibgn luar molekul, sdgkan bs dibgn luar molekul, sdgkan bs purin dan pirimidin t’letak di purin dan pirimidin t’letak di sebelah dlm untaian (heliks)sebelah dlm untaian (heliks)
Strand yang berlawanan diikat
oleh suatu ikatan non kovalen diantara dua basa yang selalu berpasangan G dengan C
oleh tiga ikatan hidrogen dan A dipasangkan dengan T oleh dua ikatan hidrogen.
Terdapat dua posisi dari
pentosa yang terikat pada
gugus fosfat yaitu pada ujung
5’-P dan ujung 3’-OH.
Menurut Menurut James WatsonJames Watson & & Francis CrickFrancis Crick
Ukuran jarak antara pasangan Ukuran jarak antara pasangan basa basa
0,34 nm (3,4 0,34 nm (3,4 ooA)A)
Setiap putaran untaian td 10 ps Setiap putaran untaian td 10 ps basa dan jarak satu putar heliks basa dan jarak satu putar heliks 3,4 nm 3,4 nm
Diameter untaian DNA Diameter untaian DNA 2,0 nm 2,0 nm
Bentuk Fisik Struktur DNABentuk Fisik Struktur DNA
B’dsrkan jml ps basa B’dsrkan jml ps basa bbrp tipe (bentuk) bbrp tipe (bentuk)
TipeTipe Pasangan Pasangan bs/putaranbs/putaran
Diameter Diameter heliks (nm)heliks (nm)
AA
BB
CC
DD
EE
ZZ
1111
1010
9,339,33
88
7,57,5
1212
2,3 2,3
1,91,9
1,91,9
--
--
1,81,8
Untaian (strand) DNA td dua Untaian (strand) DNA td dua
lekukan (groove)lekukan (groove)
lekukan besar (major groove)lekukan besar (major groove)
lekukan kecil (minor groove)lekukan kecil (minor groove) lekukan pada tipe B lebih lekukan pada tipe B lebih mudah m’ikat protein drpd mudah m’ikat protein drpd tipe A ( lebih dalam)tipe A ( lebih dalam)
DNA (Gen) terdiri dari tiga struktur penting yaitu : Bagian yang disebut “gene regulatory segment” m’ngdung
srtuktur yang terlibat pada proses inisiasi dan pengaturan proses transkripsi.
Exon bagian yang mengandung codon untuk ditranslasikan oleh mRNA menjadi protein.
Intron bagian struktur yang tidak mengandung codon (intervening sequence).
KROMOSOMKROMOSOM
KROMATINKROMATIN
NUKLEOSOMNUKLEOSOM
RNARNA
Spt pd DNA molekul RNA dibentuk oleh nukleotida yang saling dihubungkan menjadi satu rantai
KH pada DNA deoksiribosa. Sedangkan RNA KH-nya adalah ribosa.
Basa timin diganti oleh urasil pada RNA
STRUKTUR RNASTRUKTUR RNA
DNA terdiri dari dua untai yang saling komplementer membentuk helix ganda, ttp RNA hanya terdiri dari satu untai tunggal, akan tetapi dapat melipat lipat dirinya dalam suatu aturan tertentu.
Basa pada RNA sama spt DNA, kecuali timin diganti oleh urasil.
3 macam RNA penting
mRNA (messenger-RNA) yg melakukan tranfer
informasi mengenai deretan asam amino pada protein yang akan dibangun sesuai dengan urutan kode pada DNA asal.
rRNA (ribosomal-RNA) yang membangun ribosom
bersama dengan protein
tRNA (transfer-RNA) yang mentransfer asam
amino ke ribosom untuk sintesis protein.
mRNAmRNA
rRNArRNA
rRNArRNA
tRNAtRNA
tRNA Td 75 bh nukleotida Td 4 lengan utama lengan
akseptor lengan
antikodon lengan D lengan T C lengan
tambahan Fungsi sbg
penyelaras utk translasi
FAKTOR YANG MEMPENGARUHI FAKTOR YANG MEMPENGARUHI KESTABILAN DNAKESTABILAN DNA
Kestabilan struktur DNAKestabilan struktur DNA
Tumpukan (stacking) basa nukleotida pd satu rantaiTumpukan (stacking) basa nukleotida pd satu rantai interaksi hidrofobik antara basa-basa nukleotidainteraksi hidrofobik antara basa-basa nukleotida hilang krn panas & reagensia hilang krn panas & reagensia struktur tdk teratur : struktur tdk teratur : serapan cahayaserapan cahaya Ikatan hidrogenIkatan hidrogen antara basa-basa yg berpasangan pd rantai gandaantara basa-basa yg berpasangan pd rantai ganda terutama pada ps antara C dan Gterutama pada ps antara C dan G makin >> ps C-G, makin stabil strukturmakin >> ps C-G, makin stabil struktur
Denaturasi DNADenaturasi DNA Pecahnya ikatan hidrogen antara ps basa pada rantai Pecahnya ikatan hidrogen antara ps basa pada rantai
gandaganda
rantai tunggal (single Stranded)rantai tunggal (single Stranded)
Penyebab DenaturasiPenyebab Denaturasi
Panas Panas
ikt hidrogenikt hidrogen
stackingstacking
Asam – basaAsam – basa
asam asam protonasi ggs N dr A,G dan C protonasi ggs N dr A,G dan C
basa basa deprotonasi ggs N dr G dan C deprotonasi ggs N dr G dan C
Tingkat denaturasi DNA t’gantung pd tinggi suhuTingkat denaturasi DNA t’gantung pd tinggi suhu
p’ubahan tk denaturasi DNA p’ubahan tk denaturasi DNA suhu b’tingkat suhu b’tingkat absorban absorban 260260 makin > p’geseran str, mk makin > nilai makin > p’geseran str, mk makin > nilai absorban cahaya absorban cahaya efek hiperkromikefek hiperkromik
denaturasi lengkap DNA denaturasi lengkap DNA suhu > 90 suhu > 90ooCC
Renaturas Renaturas Proses p’bentukan kembali str untai ganda Proses p’bentukan kembali str untai ganda dr keadaan terdenaturasi dr keadaan terdenaturasi