UJI PLASMID Bradyrhizobium japonicum TERHADAP LIMA JENIS

PESTISIDA SISTEMIK

SKRIPSI

Diajukan Untuk Memenuhi Sebagian Persyaratan

Mencapai Derajat Sarjana Strata 1 (S-1)

Program Studi Agroteknologi

Disusun Oleh:

Laras Pratami

201010200311054

JURUSAN AGROTEKNOLOGI

FAKULTAS PERTANIAN – PETERNAKAN

UNIVERSITAS MUHAMMADIYAH MALANG

2016

HALAMAN PENGESAHAN

NAMA : Laras Pratami

NIM : 201010200311054

PROGRAM STUDI : AGROTEKNOLOGI

JURUSAN : AGRONOMI

FAKULTAS : PERTANIAN PETERNAKAN

UNIVERSITAS MUHAMMADIYAH MALANG

JUDUL :UJI PLASMID Bradyrhirizobium japonicum

TERHADAP LIMA JENIS PESTISIDA SISTEMIK

Skripsi ini telah diterima sebagai persyaratan untuk memperoleh gelar Sarjana

Pertanian pada Program Studi Agroteknologi Jurusan Agronomi Fakultas

Pertanian Peternakan Universitas Muhammadiyah Malang

Mengesahkan,

HALAMAN PENGESAHAN

NAMA : Laras Pratami

NIM : 201010200311054

PROGRAM STUDI : AGROTEKNOLOGI

JURUSAN : AGRONOMI

FAKULTAS : PERTANIAN PETERNAKAN

Menyatakan bahwa skripsi yang berjudul “Uji Plasmid Bradyrhizobium

japonicum terhadap lima jenis pestisida sistemik” adalah bukan karya orang

lain baik sebagian maupun keseluruhan kecuali dalam bentuk kutipan yang diacu

dalam naskah ini dan telah ada sumbernya. Demikian pernyataan ini sya buat

dengan sebenar-benarnya dan apabila pernyataan ini tidak benar, maka saya

bersedia mendapatkan sanksi akademik.

Mengetahui Malang, 02 November 2016

Pembimbing Utama, Yang menyatakan,

Ir. Hartawati, MS Laras Pratami

SURAT PERNYATAAN

NAMA : Laras Pratami

NIM : 201010200311054

PROGRAM STUDI : AGROTEKNOLOGI

JURUSAN : AGRONOMI

FAKULTAS : PERTANIAN PETERNAKAN

Menyatakan bahwa skripsi yang berjudul “Uji Plasmid Bradyrhizobium

japonicum terhadap lima jenis pestisida sistemik” adalah bukan karya orang

lain baik sebagian maupun keseluruhan kecuali dalam bentuk kutipan yang diacu

dalam naskah ini dan telah ada sumbernya. Demikian pernyataan ini sya buat

dengan sebenar-benarnya dan apabila pernyataan ini tidak benar, maka saya

bersedia mendapatkan sanksi akademik.

Mengetahui Malang, 02 November 2016

Pembimbing Utama, Yang menyatakan,

Ir. Hartawati, MS Laras Pratami

SKRIPSI

Uji Plasmid Bradyrhirizobium japonicum Terhadap Lima Jenis Pestisida

Sistemik

Dipersiapkan dan disusun oleh:

Laras Pratami

(Nim. 201010200311054)

Telah dipertahankan di depan Dewan Penguji

Pada tanggal 02 November 2016

Susunan Dewan Penguji

Ketua Dewan Penguji/ Anggota Dewan Penguji II,

PembimbingUtama,

Ir. Hartawati, MS Dr. Drs. Harun Rasyid, MP

Anggota DewanPenguji I, AnggotaDewanPenguji III,

Pembimbing Pendamping

Dr. Ir. Saidatul Idiyah, MP Ir. Sufianto, MM

Skripsi ini telah diterima sebagai salah satu persyaratan

Untuk memperoleh gelar Sarjana Pertanian

Jurusan Agronomi Fakultas Pertanian Peternakan

Universitas Muhammadiyah Malang

Malang, 02 November 2016

Dekan, Ketua Jurusan,

Dr. Ir.Damat, MP. Dr. Ir. Ali Ikhwan, MP.

NIP. 10640228 199003 1 003 NIP. 19641020 199101 1 001

RIWAYAT HIDUP

Penulis dilahirkan pada tanggal 26 Maret 1992

di Kota Karawang, Jawa Barat sebagai putrid pertama

dari dua bersaudara dari bapak Saprudin dan Ibu

Anismar. Penulis menyeleseikan Pendidikan Sekolah

Dasar SDN Nagasari IX Karawang tahun 2003,

Sekolah Menengah Pertama di Pondok Pesantren Diniyyah Putri Padang Panjang,

Sumatra Barat tahun 2006 dan Sekolah Menengah Atas di Islamic Centre

Muhammadiyah Cipanas, Jawa Barat tahun 2009. Tahun 2010 penulis

melanjutkan pendidikan di Jurusan Agronomi Fakultas Pertanian Peternakan

Universitas Muhammadiyah Malang hingga masa pendidikan selesai. Semasa

Perkuliahan Penulis aktif dalam Organisasi KAMAPA dan Unit Kegiatan

Mahasiswa Tapak Suci dan Kine Club.

i

KATA PENGANTAR

Assalamualaikum Warahmatullahi Wabarakatuh

Syukur Alhamdulilah penulis ucapkan kehadirat Allah SWT atas limpahan

rahmat dan hidayah Nya, sehingga penulis mampu menyelesaikan laporan

penelitian dengan judul “Uji Plasmid Bradyrhizobium Japonicum Terhadap

Lima Jenis Pestisida Sistemik”.

Laporan penelitian ini merupakan salah satu persyaratan untuk

menyelesaikan pendidikan tingkat Sarjana pada Jurusan Agronomi, Fakultas

Pertanian Universitas Muhammadiyah Malang.

Pada kesempatan ini penulis menyampaikan ucapan terima kasih atas

segala bantuan baik berupa tenaga dan pikiran, kepada yang terhormat:

1. Dr. Ir. Damat, MP. Selaku Dekan Fakultas PertanianPeternakan.

2. Dr. Ir. Ali Ikhwan, MP. selaku Ketua Jurusan Agronomi

3. Ir. Hartawati, MS selaku Pembimbing Utama dan Dr. Ir. Saidatul Idiyah, MP,

selaku Pembimbing Pendamping yang telah bersedia mengarahkan dengan

sabar selama penyusunan laporan skripsi ini hingga selesai.

4. Para dosen jurusan Agroteknologi yang telah banyak memberikan

pengetahuan, ilmu dan motivasi selama duduk di bangku perkuliahan.

5. Ayah, ibu tercinta dan teman-teman tersayang, serta semua pihak yang telah

memberikan semangat dalam pelaksanaan penelitian ini hingga selesai.

Akhir kata tak ada gading yang tak retak, penulis menyadari bahwa

laporan penelitian ini masih jauh dari sempurna, kritik dan saran membangun

demi perbaikan akan penulis terima dengan senang hati, selanjutnya harapan

penulis skripsi ini dapat bermanfaat bagi masyarakat.

Wassalamulaikum Warahmatullahi Wabarakatuh

Malang, 17 November 2016

Penulis

ii

DAFTAR ISI

Halaman

KATA PENGANTAR ............................................................................... i

DAFTAR ISI .............................................................................................. ii

DAFTAR TABEL ...................................................................................... iv

DAFTAR GAMBAR ................................................................................. v

DAFTAR LAMPIRAN .............................................................................. vi

RINGKASAN ............................................................................................ vii

I. PENDAHULUAN .................................................................................. 1

1.1. Latar Belakang ................................................................................. 2

1.2. Rumusan Masalah ............................................................................ 3

1.3. Tujuan .............................................................................................. 3

1.4. Hipotesis .......................................................................................... 3

II. TINJAUAN PUSTAKA ........................................................................ 4

2.1. Bradyrhizobium japonicum ............................................................ 4

2.2. Fungsi Rhizobium pada Fiksasi Nitrogen ...................................... 5

2.3. Pestisida Sistemik ........................................................................... 7

2.4. Beberapa Macam Pestisida Sistemik .............................................. 9

2.4.1. Dimetomorf .......................................................................... 9

iii

2.4.2. 2,4 –D Dimetil Amina .......................................................... 10

2.4.3. Isopropil Amina Glifosat ..................................................... 10

2.4.4. Karbofuran ........................................................................... 11

2.4.5. Fipronil ................................................................................. 12

2.5. Plasmid dan Pestisida .............................................................. 12

2.6. Elektroforesis Gel Agarose............................................................. 13

2.7. Interaksi Pestisida dengan Bradyrhizobium Japonicum ................. 15

III. METODE PELAKSANAAN .............................................................. 16

3.1. Waktu dan Tempat ......................................................................... 16

3.2. Alat dan Bahan ............................................................................... 16

3.3. Metode Pelaksanaan ....................................................................... 18

IV. HASIL DAN PEMBAHASAN ........................................................... 24

4.1. Hasil Kegiatan ................................................................................ 24

V. KESIMPULAN DAN SARAN ............................................................. 28

5.1. Kesimpulan ..................................................................................... 28

5.2. Saran ............................................................................................... 28

DAFTAR PUSTAKA ................................................................................ 29

LAMPIRAN ............................................................................................... 32

iv

DAFTAR TABEL

Tabel Teks Halaman

1 Daftar Alat dan Fungsinya…………………………….. 16

2 Daftar Bahan dan Fungsinya…………………………… 17

v

DAFTAR GAMBAR

Gambar Teks Halaman

1 Kromosom dan bentuk Bradyrhizobium japonicum….. 4

2 Isolat bakteri 5 hari setelah inkubasi………………….. 24

3

Profil plasmid B. japonicum setelah pemberian

pestisida sistemik P0 (Kontrol), P1 (Fipronil), P2

(Karbofuran) P3 (Isopropil amina glifosatl), P4 (2,4-D)

dan P5 (Dimetomorf)…………………………………..

23

vi

DAFTAR LAMPIRAN

Lampiran Teks Halaman

1

Dokumentasi Perbanyakan Bakteri Pada Media Pepton

Cair…………………………………………………….

32

2 Dokumentasi Proses Isolasi Plasmid Bradyrhizobium

japonicum…………………...........................................

33

3

Dokumentasi Proses Elektroforesis dan Running DNA

Plasmid. ………………….............................................

34

29

DAFTAR PUSTAKA

Amraini, D. 2001. Pengaruh Zat Pengatur Tumbuh Fipronil Dan Metiram

Terhadap Pertumbuhan, Hasil dan Mutu Hasil Padi Sawah (Oryza

sativa L.). Fakultas Pertanian. Skripsi Institut Pertanian Bogor. Bogor

Ardhana, P. 2012. Unjuk Kerja Aplikasi Sistem Pendinginan Pada Alat

Elektroforesis Termoelektrik. Naskah skripsi s1. Fakultas Teknik

Universitas Indonesia, Jakarta.

Ardiyanto, A. 2013. Hubungan Antara Aktivitas Asetilkolinesterase Darah

Dengan Fungsi Paru Petani. Diponegoro University. Semarang.

Asrofi, K. A. 2014. Pengaruh Lama Penyimpanan Benih Jagung Yang

Diperlakukan Dengan Metalaksil dan Dimetomorf Terhadap Penyakit

Bulai, Skripsi. Universitas Gadjah Mada. Yogyakarta.

Board, E. J. 2013. A Comprehensive Survey Of International Soybean Research -

Genetics, Physiology, Agronomy and Nitrogen Relationships. Book

InTech. DOI: 10.5772/45867.

Corkill, G and Rapley, R. 2008. The Manipulation of Nucleic Acids: Basic Tools

and Techiques In Molecular Biomethods Handbook Second Edition. Ed:

Walker, J.M., Rapley, R. Humana Press, NJ,USA.

Dadang. 2006. Pengenalan Pestisida dan Teknik Aplikasi. Workshop hama dan

penyakit tanaman jarak (Jatropha curcas Unn.) Institut Pertanian Bogor.

Bogor.

Fisher, P. R., Appleton, J. and Pemberton, J. M. 1978. Isolation and

Characterization of The Pesticide-Degrading Plasmid pJP1 from

Alcaligenes paradoxus. Journal of bacteriology, sept. 1978, p. 798-804

vol. 135, no. 3.

Gachande, and Khansole. 2010. Morphological, Culturar and Biochemical

Characteristics of Rhizobium japonicum Syn and Bradyrhizobium

japonicum of Soybean. Journal Bioscience Discovery 02 (1).

Hudayya, A. dan Hadis, J. 2012, Pengelompokan Pestisida Berdasarkan Cara

Kerjanya (Mode of Action). Yasan Bina Tani Sejahtera. Lembang -

Bandung Barat.

30

Jusuf, D. 1987. Plasmid-R dan Kaitannya Dengan Epidemologi Penyakit.

Fakultas Kedokteran Hewan. Skripsi Institut Pertanian Bogor. Bogor

Kesuma, D. S. 2015. Dampak Aplikasi Herbisida Ipa Glifosat Pada Pertanaman

Padi Sawah Sistem Tot Terhadap Tanah dan Tanaman Padi. Sekolah

Pasca Sarjana Institut Pertanian Bogor. Bogor.

Liawati, L. 2001. Seleksi Bakteri Resisten Herbisida Glisofat. Fakultas

Matematika Dan Ilmu Pengetahuan Alam. Skripsi Institut Pertanian

Bogor. Bogor.

Mberu, P. M. 2012. Uji Ketahanan Sembilan Isolat Plasmid Bradyrhzobium

Japonicum dari System Agroforestri dengan Perlakuan Antibiotik

Kloramfenikol dan Tetrasiklin. Skripsi Universitas Muhammadiyah

Malang. Malang.

Nur’aini, F. 2012. Rekayasa Genetika Bakteri Rhizobakterium Sebagai Salah

Satu Upaya Perakitan Tanaman Transgenik Tahan Penyakit. Skripsi

Universitas Muhammadiyah Malang. Malang.

Ohyama, T. 2014. Advances in Biology and Ecology of Nitrogen Fixation. Book

InTech. DOI: 10.5772/56990.

Rolandani, J. 2001. Pengaruh Fiksasi Nitrogen Kacang Tanah dalam Pupuk

Terhadap Kadar Alkaloid dalam Rimpang Jahe. Skripsi Institut

Pertanian Bogor. Bogor.

Sarwani, M. 2014. Pestisda Pertanian dan Kehutanan Terdaftar, Direktorat

Jendral Prasaranadan Sarana Pertanian. Jakarta.

Setiawati, W., Hadis J., Abdi, H. dan Ahsol H. 2015. Pengaruh Insektisida

Karbofuran Terhadap Kerusakan dan Kehilangan Hasil Kentang Akibat

Serangan Gryllotalpa hirsuta burmeister (Ortoptera : Gryllotalpidae)

serta Dampaknya Terhadap Keanekaragaman Artropoda Tanah. Journal

J. Hort. 25(1):54-62

Siqueira, A. F., Ormeño O. E., Souza, R. C., Rodrigues E. P., Almeida, L. G.,

Barcellos, F. G., Batista, J. S., Nakatani, A. S., Martínez, R. E.,

Vasconcelos, A.T. and Hungria, M. 2014. Comparative Genomics of

Bradyrhizobium japonicum CPAC 15 and Bradyrhizobium diazoefficiens

CPAC 7: Elite Model Strains For Understanding Symbiotic

Performance With Soybean. Research Article Bmc Genomics 15:420.

31

Sudjadi, F., 2008. Bioteknologi Kesehatan. Kanisius, Yogyakarta.

Sulistinah, N., S., Antonius dan Maman, R., 2011. Pengaruh Residu Pestisida

Terhadap Pola Populasi Bakteri dan Fungi Tanah Di Rumah Kaca. J.

Tek. Ling Vol. 12 No. 1 Hal. 43 - 53 Jakarta, Januari 2011 ISSN 1441-

318X

Supardan, M. A., 1996. Ilmu, Teknologi dan Etika, Gunung Mulia. Jakarta.

Tobing, L. 2007. Pengaruh Berbagai Konsentrasi Khitosan dan Fipronil

Terhadap Pengendalian Hama Rayap Tanah Macroterms gilvus hagen

(Isoptera; Termitidae) Dilaboratorium. Fakultas Pertanian. Skripsi

Universitas Sumatra Utara. Medan.

Triwibowo. , 2007. Biologi Molekular. Jakarta: Erlangga.

Sumadi. 2014. Prospek Pelapis Benih dalam Meningkatkan Produktivitas

Kedelai. urnal Laboratorium Teknologi Benih, Program Studi

Agroteknologi Faperta Universitas Padjajaran Bandung. Bandung.

Triwibowo. , 2007. Biologi Molekular. Jakarta: Erlangga.