Reproduksi aseksual merupakan cara perbanyakan tanaman tanpa peleburan gamet jantan dan betina. Reproduksi aseksual dapat terjadi baik dengan bagian-bagian veetatif dari tanaman atau dengan embrio vegetatif yang berkembang tanpa peleburan seksual. Reproduksi aseksual terdiri dari dua jenis yaitu reproduksi vegetatif dan apomiksis. Reproduksi vegetatif mengacu pada cara perbanyakan tanaman melalui berbagai bagian vegetatif dari tanaman.reproduksi vegetatif dibagi menjadi reproduksi vegetatif alami dan reproduksi vegetatif buatan.Pada reproduksi vegetatif alami, perbanyakan tanaman tertentu terjadi dengan batang bawah tanah, sub-aerial batang, akar dan bulbils. Modifikasi batang dibawah tanah biasanya berfungsi sebagai organ yang kuat dan menmpunyai banyak tunas. Tunas ini berkembang menjadi tunas dan menghasilkan tanaman setelah perakaran. Misalnya rimpang: Kunyit dan jahe, Umbi batang: kentang, umbi akar: tales, bunda; umbi lapis: bawang putih dan bawang merah. Perbanyakan tanaman pada Sub-aerial batang termasuk perbanyakan dengan modifikasi sulur, stolon, sucker, dll. Sub aerial digunakan pada perkembangbiakan mint, kurma, stroberry, dan pisang.umbi adalah bentuk modifikasi dari bunga yang berkembang menjadi tanaman langsung tanpa pembentukan biji. Pertumbuhan vegetatifnya tidak melibatkan pembuahan dan pembentukan biji. Tanaman bderkembang bila bagian dari tanaman jatuh ke tanah. umbi dapat ditemukan pada tanaman bawang putih, lily, dll. Daun, pekembangbiakan dengan daun sangat jarang ditemukan pada tanaman. Perkembangbiakan dengan daun dapat dilihat pada tanaman Bryophyllum yang memiliki daun berdaging dan tunas adventif yang berada pada pinggiran daun. Tunas tersebut jatuh dan dapat tunbuh menjadi tanaman baru.Perbanyakan tanaman pada bagian vegetatif dengan cara buatan disebut reproduksi vegetatif buatan. Contonya stek batang pada tanaman tebu, anggur, mawar, dll. Stek akar contohnya pada ubi jalar, jeruk, lemon, dll. Merundukan contohnya pada tanaman melati, Okulasi digunakan dalam buah dan tanaman hias.Reproduksi vegetatif mempunyai beberapa keuntungan.1. Kelangsungan genotipe yang sama dengan presisis besar, karena semua keturunan memiliki genotipe dan fenotipe yang sama.2. Berguna unutk mendapatkan individu yang memiliki genetik yang identik.3. Sifat genotipe dapat dipertahankan.Ini menggunakan mutasi tunas yang diinginkan, mutan bisa langsung dirilis sebagai varietas.Apomixis adalah perkembangan biji atau embrio tanpa pembuahan (peleburan seksual). apomixis Obligate merupakan tanaman yang hanya memproduksi dengan reproduksi asksual sedangkan apomixis fakultatif merupakan tanaman yang memiliki potensi untuk berkembang biak baik secara seksual atau aseksual. Partenogenesis adalam perkembangan embrio dari sel telur tanpa pembuahan. Haploid embrionya berkembngan dari sel telur haploid contohnya jagung dan diploid embrionya berkembnag dari sel telur diploid contohnya pada rumput seperti Taraxacum dll. Apogamy adalah perkembangan embrio dari sinergid atau sel antipodal. Haploid embrionya berkembang dari sinergid haploid dan diploid embrionya berkembang dari sinergid diploid atau sel antipodal.Apospory adalah sel diploid yang pertama meletakan ovula ke luar, Kantung embrio berkembang menjadi Kantung embrio lain tanpa pengurangan ., kemudian berkembang langsung dari sel telur diploid tanpa pembuahan . adventative Embryony:adalah embrio yang berkembang langsung dari sel-sel vegetatif ovula , seperti nucleus , embryony adventif terjadi pada mangga , jeruk , dll .Sistem apomictic yang ideal:1. Semua keturunan tanaman harus apomictic sehingga keturunan memiliki genotipe yang sama dengan induk betina.2. Genotipe apomictic lebih baik sepenuhnya laki-laki yang fertil dan self-incomatible , dan bereproduksi melalui pseudogamy .3. Dalam kasus diplospory , kromosom tidak harus memasangkan atau bergabung selama pembelahan meiosis pertama, yang dapat menimbulkan variasi antar keturunan.4. Apomixis harus dominan atas reproduksi seksual, biasanya apomixis ini diatur oleh dua atau lebih gen .5. Ekspresi apomixis dipengaruhi oleh lingkungan .Jalur apomictic dikembangkan menjadi tiga pendekatan yang berbeda seperti berikut :1. Transfer gen dari spesies liar: gen mengendalikan apomixis dapat ditransfer ke spesies tanaman dari spesies liar terkait , misalnya dari Tripacum dactyloides ke jagung , dari Pennisetum orientate ke pearlmillet.2. Mutasi buatan : pendekatan ini bertujuan untuk mengembangkan bentuk-bentuk apomictic, spesies biasanya reproduksi seksual dengan memanfaatkan mutasi induksi atau bahkan mutasi spontan. Upaya ini telah berfokus terutama pada sorgum , di mana dua galur mutan menunjukkan apospory fakultatif yang telah diisolasi .3. Isolasi apomictic rekombinan dari persilangan antarspesies : kadang-kadang apomictic rekombinan dapat pulih dari pemisahan generasi persilangan antara dua spesies yang bereproduksi secara seksual . misalnya , pembentukan biji telah dilaporkan dalam intergeneric hibrida antara T. aestivum dan Avena sativa , H. vulgare dan T. Aestivitm.Peran dalam pemuliaan tanaman1. Reproduksi yang cepet dari galur murniApomixis merupakan salah satu sarana yang efektif untuk memproduksi cepat galur murni.2. Pemeliharaan genotipe unggulApomixis bermanfaat dalam mempertahankan karakteristik tanaman induk dari generasi ke generasi.3. Konservasi heterosisDalam beberapa kasus , hibrida vigour dapat dikeluarkan bagi banyak generasi dengan menggunakan apomixis berulang.Keuntungan apomixis1. apomixis Obligate membolehkan fiksasi heterosisi hibrida. Jadi, petani dapat menanam ulang benih yng dihasilkan oleh benih hibrida yang diproduksi dari generasi ke generasi.2. Berbagai varietas hibrida baru dapat diperbanyak dari beberapa benih hibrida dengan cara galur murni. Ini dapat menyederhanakan produksi benih hibrida.3. Tetua bahkan dapat melakukan persilangan untuk mendapatkan benih hibrida, yang dapat digunakan untuk menghasilkan varietas hibrida baru.4. Benih varietas hibrida dapat dipertahankan sebagai varietas hibrida.Masalah dalam pemanfaatan apomixes.1. Apomiksis adalah fenomena yang sangat rumit . 2. Estimasi tingkat fakultatif apomixis , membosankan dan memakan waktu lama . 3. Dalam kasus fakultatif apomicts , proporsi keturunan seksual ini dipengaruhi oleh faktor lingkungan seperti panjang hari dan suhu . 4. Kekurangan morfologi berhubungan dengan perkembangan , pemeliharaan keturunan apomictic yang menjadi lebih sulit . 5. Dasar genetik apomixis tidak jelas pada kebanyakan kasus.Seleksi klonalKlonal: keturunan dari satu tanaman diperoleh dengan reproduksi aseksualSeleksi klonal : prosedur seleksi klon unggul dari populasi campuran tanaman aseksual diperbanyak seperti tebu , kentang , dll. Fitur utama dari klon1. konstitusi homologKeturunan klon secara genetik identik dan memiliki konstitusi genetik yang sama . Sehingga klon disebut homogogous . Tidak ada variasi genetik dalam klon .2. hetorozigosityAseksual tanaman yang diperbanyak adalah heterozigous sehingga klone juga heterozigot. Keturunan terlihat fenotip yang sama seperti heterozigot .3. adaptasi yang lebih luasKlon lebih mudah beradaptasi dengan variasi lingkungan akibat tingginya tingkat heterozigositas dari garis murni .4. kemampuan tumbuhKlon memiliki kemampuan hibrida yang terpelihara karena adanya reproduksi seksual . Sebagian besar dari varietas tebu dan kentang adalah hibrida .5. sumber keanekaragamanada tiga sumber keanekaragaman dalam klon, yaitu mutasi tunas/pucuk, campuran mekanik, dan kadang-kadang dengan reproduksi seksual.6. Segregasi pada F1Saat hibridisasi dilakukan diantara klon yangbberbeda, segregasi/ pemisahan terjadi pada generasi F1. Setiap tanaman berpotensi menjadi varietas baru, oleh karena itu, seleksi dilakukan di F1.Prosedur seleksi klonal pertama dari campuran klon beratus-ratus tanaman hingga ribuan tanaman unggul dipilih.Kedua, klon tanaman yang dipilih tumbuh terpisah dan klon interior ditolak. Ketiga, percobaan hasil awal dilakukan pemeriksaan standar, seleksi untuk kualitas, ketahanan terhadap penyakit, dll.,didapatkan beberapa klon yang unggul. Ke empat- keenam dilakukan uji multilokasi dari hasil pemeriksaan standar. Klone terbaik diidentifikasi untuk dirilis sebagai varietas baru. Ketujuh. Perbanyakan benih dari klone terbaik dan dilepas sebagai varietas baru. Perbanyakan benih untuk distribus dimulai.

Kelebihan: varietas yang berevolusi dengan metode ini mempertahankan semua karakter dari klon tetua selama beberapa tahun .varietas sangat segaram seperti garis-garis murni . mereka sangat stabil karena tidak ada risiko kerusakan akibat segregasi dan rekombinasi, metode yang efektif untuk perbaikan genetik populasi tanaman secara aseksual, dan skema seleksi berguna untuk menjaga kemurnian klon .Kerugian: metode seleksi ini memanfaatkan variabilitas sudah ada dalam populasi , dan belum dirancang untuk menghasilkan variabilitas, susunan genetik tidak dapat diperbaiki dengan metode ini tanpa hibridisasi, varietas yang dikembangkan oleh seleksi klonal sangat rentan terhadap penyakit baru .Prestasi: di india , metode ini berhasil digunakan untuk mengembangkan varietas baru di kentang , tebu , pisang , jeruk dan anggur . kufri merah dan kufri safed di kentang . ko 11 , ko 12 dan neelam di mangga, Co 541 , CoS 510 di tebu, dan pride monthan dan high gate di pisang.