O157, DAN Escherichia coli O157:H7 PADA SAPI BALI DI ... Awal... · Yuli Darmawan Nim. 1009005011...

PERBANDINGAN BAKTERI Coliform, Escherichia coli, Escherichia coli

O157, DAN Escherichia coli O157:H7 PADA SAPI BALI DI KECAMATAN

MENGWI KABUPATEN BADUNG

SKRIPSI

Diajukan untuk Melengkapi Tugas-tugas dan Memenuhi

Persyaratan untuk Mencapai Gelar Sarjana Kedokteran Hewan

Oleh

Yuli Darmawan

Nim. 1009005011

FAKULTAS KEDOKTERAN HEWAN

UNIVERSITAS UDAYANA

DENPASAR

2014

i

RIWAYAT HIDUP

Penulis dilahirkan di Desa Sumberagung, Kecamatan Pesanggaran

Kabupaten Banyuwangi pada tanggal 6 Juli 1992. Penulis merupakan anak Kedua

dari dua bersaudara, dari pasangan Suwarso dan Siti Fatimah.

Penulis menamatkan pendidikan Sekolah Dasar di SD Negeri 1

Sumberagung pada tahun 2004. Kemudian dilanjutkan ke SMP Negeri 1

Siliragung, tamat pada tahun 2007. Dan pada tahun 2010 penulis menyelesaikan

pendidikan Sekolah Menengah Atas di SMA Negeri 1 Pesanggaran.

Penulis diterima di Fakultas Kedokteran Hewan Universitas Udayana pada

bulan Agusutus 2010 melalui jalur PMDK. Sebagai salah satu syarat untuk

memperoleh gelar Sarjana Kedokteran Hewan, penulis melakukan penelitian di

Laboratorium Biosain dan Bioteknologi Universitas Udayana tentang

“Perbandingan bakteri Coliform, Escherichia coli, Escherichia coli O157, dan

Escherichia coli O157:H7 pada sapi bali di Kecamatan Mengwi Kabupaten

Badung”.

ii

RINGKASAN

Foodborne disease adalah penyakit yang ditularkan lewat makanan,

dengan ciri berupa gangguan pada saluran pencernaan dengan gejala umum sakit

perut, diare dan atau muntah. Agen utama penyebab penyakit ini adalah bakteri

yang sebetulnya secara alami terdapat di lingkungan sekitar manusia, dan

ditularkan kepada manusia melalui makanan. Salah satu bakteri tersebut adalah

serotipe patogen dari E. coli yaitu E. coli O157:H7. Penelitian ini bertujuan untuk

mengetahui perbandingan jumlah bakteri Coliform, E. coli, E. coli O157, dan E.

coli O157:H7 pada sapi bali yang berada di Kecamatan Mengwi Kabupaten

Badung. Pada penelitian ini sampel yang digunakan adalah feses yang diambil

secara acak dan proporsional dari ternak sapi bali yang berada di Kecamatan

Mengwi. Sampel yang diambil sebanyak 58 sampel, yang kemudian akan

dilakukan analisis laboratorik di laboratorium Biosain dan Bioteknologi

Universitas Udayana. Tahap isolasi dan identifikasi sampel sampai

teridentifikasinya strain E. coli O157:H7 melalui beberapa tahap, yaitu

penumbuhan pada media EMBA, dilakukan pewarnaan Gram, uji IMVIC,

penumbuhan pada media SMAC, uji serologis dengan E. coli O157 latex

agglutination test dan uji serologis dengan E. coli Anti-serum H7. Dari 58 sampel

feses sapi bali yang diambil dari Kecamatan Mengwi, 100% positif bakteri

Coliform, 55,1% positif E. coli, 6,8% positif E. coli O157, dan 3,4% terdeteksi

positif E. coli O157:H7. Dari keseluruhan sampel yang diperiksa didapatkan

jumlah rata-rata bakteri Coliform adalah 1,2×105 CFU/g, sedangkan E. coli rata-

ratanya sebesar 6,2×104

CFU/g. Hasil analisis Spearman’s rho ini menunjukan

bahwa dengan adanya atau tingginya bakteri Coliform yang ditemukan pada sapi

di Kecamatan Mengwi akan sangat berkorelasi untuk ditemukannya bakteri E.

coli. Begitu juga dengan ditemukannya bakteri E. coli O157 akan sangat

berkorelasi untuk ditemukannya bakteri E. coli O157:H7. Namun dari tingginya

bakteri Coliform dan bakteri E. coli yang ditemukan tidak berpengaruh nyata

terhadap ditemukannya bakteri E. coli O157 maupun E. coli O157:H7.

Kata kunci : Foodborne disease, sapi bali, E. coli O157:H7

iii

ABSTRACT

Foodborne disease is a disease transmitted through food, with

characteristics such as gastrointestinal disorders with common symptoms of

abdominal pain, diarrhea and or vomiting. The main cause of this disease agent is

actually bacteria that are naturally present in the human environment, and is

transmitted to humans through food. One such bacterium is pathogenic serotypes

of E. coli is E. coli O157:H7. Them aim of this study is to compare the presence

of Coliform bacteria, E. coli, E. coli O157, and E. coli O157:H7 in faeces of bali

cattle which is located in sub-district mengwi district badung. Total of 58 samples

were taken randomly and proportionally. Several stages of isolation and

identification of those samples were done in the Laboratory of Bioscience and

Biotechnology at Udayana University, included growth in media EMBA,

performed Gram staining, IMVIC test, growth on SMAC media, serological tests

with E. coli O157 latex agglutination test and serological test with Anti-serum E.

coli H7. The result showed that from 58 samples, 100% were positive contamined

of Coliform bacteria, 55,1% were found positive of E. coli, 6.8% were positive of

E. coli O157, and 3.4% were detected positive of E. coli O157:H7. The average

amount of Coliform bacteria was 1,2×105 CFU/g, while 6,2×10

4 CFU/g for the

average of E. coli. Stastitical analysis result used Spearman's rho showed that the

presence of Coliform bacteria in bali cattle at Mengwi will be highly correlated to

the discovery of E. coli. And also, with the presence of the bacterium E. coli O157

will be highly correlated to the discovery of the E. coli O157:H7. Otherwise, from

the highly presence of Coliform and E. coli were not significantly difference to the

discovery of the E. coli O157 and E. coli O157:H7.

Keyword : Foodborne disease, bali cattle, E. coli O157:H7

iv

UCAPAN TERIMAKASIH

Puji dan syukur penulis panjatkan kehadapan Tuhan Yang Maha Esa,

karena atas segala kasih dan berkatnya yang begitu besar sehingga penulis dapat

menyelesaikan skripsi yang berjudul “Perbandingan Bakteri Coliform,

Escherichia coli, Escherichia coli O157, dan Escherichia coli O157:H7 pada

Sapi Bali Di Kecamatan Mengwi Kabupaten Badung”.

Skripsi ini merupakan salah satu syarat untuk memperoleh gelar Sarjana

Kedokteran Hewan di Fakultas Kedokteran Hewan Universitas Udayana. Penulis

menyadari bahwa keberhasilan penulisan skripsi ini tidak terlepas dari segala

bantuan dan bimbingan yang telah diberikan dari berbagai pihak. Melalui

kesempatan ini, penulis ingin menyampaikan rasa hormat dan terima kasih yang

sedalam-dalamnya kepada :

1. Bapak Dr. drh. Nyoman Adi Suratma, MP, selaku Dekan Fakultas

Kedokteran Hewan Universitas Udayana

2. Bapak Dr. drh. I Wayan Suardana, M.Si selaku Pembimbing 1 dan atas

keikutsertaan saya dalam penelitian kerjasama kemitraan penelitian dan

pengembangan pertanian nasional (KKP3N) yang didanai oleh badan

penelitian pengembangan pertanian Kementrian Pertanian 2014.

3. Bapak drh. Ida Bagus Ngurah Swacita, MP selaku Pembimbing II yang

senantiasa memberikan bimbingan, dukungan, dan pengertiannya sehingga

penulis dapat meyelesaikan skripsi ini.

4. Bapak dan Ibu Tim penguji dr. Made Agus Hendrayana, M.ked, Prof. Dr.

drh. Iwan Harjono Utama, MS, dan Ibu Luh Ade Wilan Krisna, S.Si,

M.Ked atas saran dan masukan yang diberikan.

5. Ibu drh. Tjokorda Sari Nindhia, MP selaku Pembimbing Akedemik atas

segala nasehat dan bantuannya selama penulis menjalani kuliah.

v

6. Ibu Ni Wayan Nursini, S.Tp, MP selaku staf Lab. Biosains dan

Bioteknologi Universitas Udayana atas segala petunjuk dan bimbingannya

selama penelitian berlangsung.

7. Bapak dan Ibu tercinta, Mbak Herlin, Mas Eko, Mas Deni, Agatha dan

seluruh keluarga atas dukungan, kasih sayang, doa, dan pengorbanannya

yang begitu besar sehingga penulisan skripsi ini dapat berjalan dan selesai

dengan tepat waktu.

8. Sahabat tercinta (Adinda Dea Putie C, Oktovina Ta’dung, Kristiana

Yoaltiva J, Fahmi Galuh N , Yusmaniar Galuh A, Moch. Isnan Arkid, Fiki

Agus P) yang telah banyak memberikan semangat.

9. Sahabat seperjuangan penelitian (Khamid Yusuf Baehaqi, Asyauqi Ilham,

Wahyu Hananto, Korbinianus F. Rinca, Iga Prasetyo Adji, Rian KA Praja,

Putu Juniari Ratna, Yunita Sri Hastuti, Andi Isma Lestari, Eva Damayanti,

Oktivia Chandra M, dan Dwi Lestari).

10. Teman-teman angkatan 2010 yang selama ini telah berjuang bersama-

sama saat suka dan duka.

Dalam penyusunan skripsi ini masih banyak kekurangan, dan untuk itu

segala saran dan kritik yang sifatnya membangun sangat penulis harapkan.

Sebagai akhir kata, semoga skripsi ini bermanfaat bagi para pembaca.

Denpasar, 05 Juni 2014

Penulis

vi

DAFTAR ISI

Halaman

RIWAYAT HIDUP ................................................................................................. i

RINGKASAN ........................................................................................................... ii

ABSTRACT ............................................................................................................. iii

KATA PENGANTAR ............................................................................................. iv

DAFTAR ISI ............................................................................................................. vi

DAFTAR TABEL ................................................................................................... viii

DAFTAR GAMBAR ............................................................................................... ix

DAFTAR LAMPIRAN ........................................................................................... x

BAB I. PENDAHULUAN ........................................................................................ 1

1.1 Latar Belakang ........................................................................................ 1

1.2 Rumusan Masalah .................................................................................. 4

1.3 Tujuan Penelitian ................................................................................... 4

1.4 Manfaat Penelitian ................................................................................. 5

1.5 Kerangka Konsep ................................................................................... 5

1.6 Hipotesis Penelitian ............................................................................... 7

BAB II. TINJAUAN PUSTAKA ............................................................................ 8

2.1 Bakteri Coliform ..................................................................................... 8

2.2 Bakteri Escherichia coli ......................................................................... 9

2.3 Escherichia coli O157 ............................................................................ 10

2.4 Sapi Bali ................................................................................................ 12

2.5 Kecamatan Mengwi ............................................................................... 14

BAB III. MATERI DAN METODE ...................................................................... 16

3.1 Bahan-bahan yang Digunakan ............................................................... 16

3.1.1 Sampel .......................................................................................... 16

3.1.2 Bahan-bahan ................................................................................. 16

3.2 Peralatan yang Digunakan...................................................................... 17

3.3 Cara Pengumpulan Data ........................................................................ 17

3.4 Prosedur Penelitian ................................................................................ 17

3.4.1 Pengambilan sampel ..................................................................... 17

3.4.2 Tahap isolasi dan identifikasi sampel .......................................... 17

3.4.2.1 Media EMBA .................................................................. 18

3.4.2.2 Pewarnaan Gram ............................................................. 18

3.4.2.3 IMVIC ............................................................................. 19

3.4.2.4 Penumbuhan pada media SMAC .................................... 20

3.4.2.5 Uji serologis dengan E. coli Latex agglutination Test .... 20

3.4.2.6 Uji serologis dengan E. coli Antiserum H7 .................... 20

3.5 Analisis Data .......................................................................................... 21

3.6 Lokasi dan Waktu penelitian .................................................................. 22

BAB IV. HASIL DAN PEMBAHASAN ............................................................... 23

4.1 Hasil, Isolasi dan Identifikasi Bakteri ................................................... 23

4.2 Perbandingan Jumlah Bakteri Coliform dan Escherichia coli pada

Sapi Bali di Kecamatan Mengwi ......................................................... 33

vii

4.3 Persentase Perbandingan antara bakteri Coliform, Escherichia coli,

Escherichia coli O157, dan Escherichia coli O157:H7 ....................... 35

4.4 Pengujian Hipotesis ............................................................................... 37

BAB V. SIMPULAN DAN SARAN ....................................................................... 40

5.1 Simpulan ............................................................................................... 40

5.2 Saran ...................................................................................................... 40

DAFTAR PUSTAKA ............................................................................................... 42

LAMPIRAN ............................................................................................................. 45

viii

DAFTAR TABEL

Tabel Halaman

1. Hasil data pengamatan perbandingan bakteri Coliform, E. coli, E.

coli O157, dan E. coli O157:H7 pada sapi di Kecamatan Mengwi

Kabupaten Badung .............................................................................................. 30

2. Uji Mc Nemar perbedaan tingkat infeksi antara E. coli dengan E.

coli O157 pada sapi di Kecamatan Mengwi ........................................................ 36

3. Uji Mc Nemar perbedaan tingkat infeksi antara E. coli O157

dengan E. coli O157:H7 pada sapi di Kecamatan Mengwi ................................. 37

ix

DAFTAR GAMBAR

Gambar Halaman

1. Sapi bali ............................................................................................................... 12

2. Hasil positif bakteri Coliform dan E. coli pada Media EMBA ........................... 24

3. Gambar mikroskopik bakteri E. coli .................................................................... 24

4. Hasil positif E.coli pada uji Indol (SIM) ............................................................. 25

5. Hasil positif E. coli pada uji methyl red (MR) .................................................... 26

6. Hasil negatif E. coli pada uji Voges Proskauer (VP) .......................................... 27

7. Hasil negatif E. coli O157 pada uji citrate .......................................................... 27

8. Hasil positif E. coli O157 pada media SMAC .................................................... 28

9. Hasil positif uji E. coli O157 pada latex agglutination test ................................ 29

10. Hasil positif uji Antiserum H7 ........................................................................... 29

11. Perbandingan jumlah antara bakteri Coliform dan E. coli pada

sapi bali di Kecamatan Mengwi Kabupaten Badung .......................................... 34

12.Persentase perbandingan antara bakteri Coliform, E. coli, dan E.

coli O157 dengan E. coli O157:H7 pada sapi bali di Kecamatan

Mengwi Kabupaten Badung ................................................................................ 35

x

DAFTAR LAMPIRAN

Lampiran Halaman

1. Hasil Data Pengamatan Perbandingan Jumlah Bakteri Coliform, E.

coli, E. coli O157, dan E. coli O157:H7 pada sapi bali di

Kecamatan Mengwi Kabupaten Badung ............................................................. 45

2. Hasil Uji Homogenitas data ................................................................................. 47

3. Hasil Uji Normalitas data ..................................................................................... 47

4. Hasil Uji Wilcoxon antara bakteri Coliform dengan E. coli pada

sapi bali di Kecamatan Mengwi Kabupaten Badung .......................................... 48

5. Hasil Uji Korelasi Spearman’s rho antara bakteri Coliform dengan

bakteri E. coli pada sapi bali di Kecamatan Mengwi Kabupaten

Badung ................................................................................................................. 48


bakteri E. coli O157 pada sapi bali di Kecamatan Mengwi



bakteri E. coli O157:H7 pada sapi bali di Kecamatan Mengwi


8. Hasil Uji Korelasi Spearman’s rho antara bakteri E. coli dengan

bakteri E. coli O157 pada sapi bali di Kecamatan Mengwi


9. Hasil Uji Korelasi Spearman’s rho antara bakteri E. coli dengan

bakteri E. coli O157:H7 pada sapi bali di Kecamatan Mengwi


10. Hasil Uji Korelasi Spearman’s rho antara bakteri E. coli O157

dengan bakteri E. coli O157:H7 pada sapi bali di Kecamatan

Mengwi Kabupaten Badung ................................................................................ 51

11. Hasil uji Mc Nemar antara bakteri E. coli dengan bakteri E. coli

O157 pada sapi bali di Kecamatan Mengwi Kabupaten Badung ........................ 51

12. Hasil uji Mc Nemar antara bakteri E. coli O157 dengan bakteri

E. coli O157:H7 pada sapi bali di Kecamatan Mengwi Kabupaten

Badung ................................................................................................................. 52

13. Dokumentasi penelitian ..................................................................................... 52

O157, DAN Escherichia coli O157:H7 PADA SAPI BALI DI ... Awal... · Yuli Darmawan Nim. 1009005011...

Documents

Transcript of O157, DAN Escherichia coli O157:H7 PADA SAPI BALI DI ... Awal... · Yuli Darmawan Nim. 1009005011...