modul1

19
PROGRAM R R adalah bahasa pemrograman dan perangkat lunak untuk analisis statistika dan grafik R. R dibuat oleh Ross Ihaka dan Robert Gentleman di Universitas Auckland, Selandia Baru, dan kini dikembangkan oleh R Development Core Team. Bahasa R kini digunakan statistikawan untuk pengembangan perangkat lunak statistika, serta digunakan secara luas untuk pengembangan perangkat lunak statistika dan analisis data. R menyediakan berbagai teknik statistika (permodelan linier dan nonlinier, uji statistik klasik, analisis deret waktu, klasifikasi, klasterisasi, dan sebagainya) serta grafik. R, sebagaimana S, dirancang sebagai bahasa komputer sebenarnya, dan mengizinkan penggunanya untuk menambah fungsi tambahan dengan mendefinisikan fungsi baru. Kekuatan besar dari R yang lain adalah fasilitas grafiknya, yang menghasilkan grafik dengan kualitas publikasi yang dapat memuat simbol matematika. INSTALASI R 1. Menginstal R dalam sistem operasi Windows Double klik file R-2.3.2-win.exe yang telah di download melalui internet. Kemudian akan keluar tampilan seperti berikut : Pilih bahasa yang akan digunakan, default pada instalasi program ini adalah English, kemudian OK.

description

biostatistika

Transcript of modul1

  • PROGRAM R

    R adalah bahasa pemrograman dan perangkat lunak untuk analisis statistika dan grafik R. R dibuat oleh Ross Ihaka dan Robert Gentleman di Universitas Auckland, Selandia Baru, dan kini dikembangkan oleh R Development Core Team. Bahasa R kini digunakan statistikawan untuk pengembangan perangkat lunak statistika, serta digunakan secara luas untuk pengembangan perangkat lunak statistika dan analisis data.

    R menyediakan berbagai teknik statistika (permodelan linier dan nonlinier, uji statistik klasik, analisis deret waktu, klasifikasi, klasterisasi, dan sebagainya) serta grafik. R, sebagaimana S, dirancang sebagai bahasa komputer sebenarnya, dan mengizinkan penggunanya untuk menambah fungsi tambahan dengan mendefinisikan fungsi baru. Kekuatan besar dari R yang lain adalah fasilitas grafiknya, yang menghasilkan grafik dengan kualitas publikasi yang dapat memuat simbol matematika.

    INSTALASI R

    1. Menginstal R dalam sistem operasi Windows

    Double klik file R-2.3.2-win.exe yang telah di download melalui internet. Kemudian akan keluar tampilan seperti berikut :

    Pilih bahasa yang akan digunakan, default pada instalasi program ini adalah English, kemudian OK.

  • Klik Next pada jendela dialog diatas dan akan muncul seperti berikut :

    Klik Next kemudian muncul jendela dialog seperti berikut :

  • Jendela dialog diatas digunakan untuk menentukan lokasi instalasi dari R. Disini default lokasi instlasinya yakni pada direktori C:\Program Files\R\R-3.0.2. Jika ingin mengubah lokasi instalasinya dapat dengan mengklik browse kemudian pilih lokasi yang diinginkan.

    Default instalasi adalah menggunakan mode 32-bit User instalation. Anda dapat juga memilih mode instalasi lain. Akan tetapi, mode default diatas sudah cukup untuk keperluan praktikum kita. Terlihat instalasi mode ini membutuhkan space 75.1 MB dari hardisk. Selanjutnya klik Next.

  • Pada jendela dialog diatas kita pilih default nya kemudian pilih Next

    jendela dialog diatas untuk menentukan lokasi dari shortcut dari program R pada startmenu program. Disini kita akan menggunakan modus default dari instalasi, yakni shortcut akan diletakkan pada direktori R. Kemudian pilih Next dan sekali lagi pada jendela dialog selanjutnya, maka proses instalasi akan dimulai. Silahkan menunggu sampai proses instalasi selesai.

  • Jika proses telah selesai kemudian akan keluar jendela dialog seperti berikut :

    Klik finish pada jendela dialog diatas. Kemudian pada desktop windows dan start menu dari windows akan terdapat shortcut dari R. Shortcut dari program R pada desktop windows dapat dilihat pada gambar berikut

  • Double klik shortcut R pada desktop atau pada start menu kemudian akan muncul tampilan seperti berikut :

    2. Menginstal R-Commander dalam sistem operasi Windows Untuk menginstal R commander, pilih menu Packages>Install package(s) from local zip files ....kemudian pilih file Rcmdr_2.0-3.zip.Lihat seperti pada jendela dialog berikut

  • Klik open kemudian paket Rcmdr akan terinstal dan lihat tampilan pada R-console

    Pada dialog R console terdapat error dan perlu di instal paket tcltk2. Langkah untuk menginstal paket tcltk2 sama seperti proses mengistal paket Rcmdr diatas. Kemudian jalankan paket R-commander yang dapat dilakukan dengan dua cara,yakni dengan mengetikkan

    perintah berikut pada R-console

    >library(Rcmdr)

    dan menekan Enter satu kali, atau dengan memilih menu Packages>Load package ... dan memilih Rcmdr pada daftar paket library yang terinstal seperti berikut :

    Tekan OK dan akan muncul seperti ini

  • Agar paket Rcmdr dapat berjalan secara sempurna maka perlu diinstal paket paket lainnya yang telah tercantum diatas. Proses penginstalan paket-paket tersebut sama seperti proses penginstalan paket Rcmdr.

    MANAJEMEN DATA DENGAN RCMDR

    Pertama-tama buka paket Rcmdr dengan cara seperti berikut : Packages>load packages

    Pilih paket Rcmdr kemudian OK. Selanjutnya akan muncurl R comander seperti dibawah :

  • 1. Entry Data

    Untuk mengentry data klik Data > New data set

    Kemudian akan muncul jendela dialog seperti berikut :

    Ketik nama data set misal dengan nama uji1 kemudian klik OK. Untuk entry data klik edit data set kemudian akan muncul seperti berikut :

  • Sebagai latihan, entry data berikut ke Rcmdr

    Nama BB Kalori

    Ivan 89 530

    Mely 48 300

    Rosa 56 358

    Setia 72 510

    Mayone 54 302

    Lady 42 300

    Anita 60 387

    Wanto 85 527

    Heri 63 415

    Danu 74 512

    Keterangan :

    BB : Berat Badan Kalori : Kalori yang di konsumsi

    Ketikkan ketiga variabel (nama, BB, dan kalori) pada Data editor, kemudian tampilan Data editor menjadi seperti berikut :

  • Untuk pemberian nama variabel klik pada var1 maka akan muncul :

    Tulis nama variabel nama kemudian close. Langkah yang sama digunakan untuk pemberian nama variabel BB dan kalori. Pada pemberian nama untuk BB maka klik var2 kemudian tulis nama variabelnya dengan BB, dan pemberian nama untuk kalori maka klik var3 kemudian tulis nama variabelnya dengan kalori.

  • Close Data editor untuk mengakhiri proses entry data. Tampak sekarang pada jendela R-Commander terlihat data set bernama uji1 saat ini sedang aktif.

    2. Menampilkan Data Yang Sedang Aktif Untuk menampilkan data yang sedang aktif di memori, klik tombol View data set. Maka jendela data akan dibuka, menampilkan data yang sedang aktif di memori komputer saat ini, yakni data uji1.

    3. Importing Data

    Selain proses entri data, R-commander dapat juga digunakan untuk melakukan import data dari format data yang diberikan pada program lain, yakni data dari Excel atau Open Office.org calc (yang disimpan dalam format file text/dat/csv), SPSS, MINITAB, dan STATA. Pada praktikum kali ini, kita akan menggunakan metode importing data dari file notepad.

  • Entry data nama, BB, dan kalori pada notepad kemudian save dengan nama uji2.txt dengan tampilan seperti berikut :

    Klik pada R commander Data > Import data > from text file, clipboard, or URL...

    Kemudian akan muncul tampilan seperti berikut :

  • Tulis nama data set dengan nama uji2 kemudian OK dan akan mucul seperti berikut :

    Pilih file yang akan di import dari folder yang sesuai kemudian klik open.

    4. Memilih Dataset Yang Aktif

    Untuk memilih data set yang aktif, gunakan menu Data>Active data set>select active set

  • Kemudian pilih data set yang akan dibuka dengan cara klik salah satu data set kemudian klik OK.

    5. Recoding Misalkan kita akan melakukan coding terhadap variabel BB dari dataset uji2

    BB Kode

    < 50 1

    50-79 2

    79 > 3

    Klik Data>manage variable in active data set>recode variable

  • Pilih variabel yang akan dilakuan recoding, tulis nama variable baru dari BB setelah dilakukan recoding dan tulis sintax recode seperti ketentuan diatas kemudian klik OK

    Kemudian untuk cek hasil klik view dataset pada R comander. Diperoleh hasil seperti berikut :

    6. Compute Misalkan saja kita ingin melakukan transformasi terhadap variabel kalori yang dimiliki pada dataset uji2 dengan cara menambahkan nilai kalori dengan 20. Untuk melakukan hal ini, pertama-tama aktifkan dataset uji2. Kemudian buka menu Data>Manage variables in active dataset>Compute variable ....

  • Pilih variabel kalori, tulis nama variabel baru dengan nama kalori_baru, dan tulis pada expression to compute dengan kalori+20

    Kemudian untuk cek hasil klik view dataset pada R comander. Diperoleh hasil seperti berikut :

    7. Menghapus variabel pada dataset Klik Data> Manage variables in active dataset>Delete variable from dataset ....

  • Kemudian akan muncul seperti berikut :

    Pilih variabel yang akan dihapus, misalkan variabel yang akan dihapus adalah variabel BB_kode maka klik pada BB_kode kemudian OK

    8. Menghapus baris pada dataset Klik Data> active dataset>Remove row(s) from active data set ....

  • Kemudian akan muncul seperti berikut :

    Tuliskan baris keberapa saja yang akan dihapus pada jendela dialog diatas, misal baris yang akan dihapus adalah baris ke 2 dan 3 maka tuliskan seperti diatas dan diperoleh hasil seperti berikut :