KODE GENETIK

Teguh Sarry HartonoPPDS Mikrobiologi Klinik22 Oktober 2009

Kode genetik• Informasi dari DNA dikodekan ke dalam suatu

urutan tiga nukleotida (triplet nukleotida) pada

mRNA, yang masing-masing merupakan “kata

sandi” untuk satu asam amino yang spesifik.

• Tiap triplet pengkode itu disebut kodon.

• Ada 4 macam basa nukleotida pada mRNA

Adenine (A), Uracil (U), Guanine (G) and

Cytosine (C)

• Ada 20 asam amino di alam

jika tidak dikombinasi 4 basa nukleotida 4

AA

Jika dikombinasi menggunakan 2 nukleotida

42 = 16 AA

Jika dikombinasi menggunakan 3 basa

nukleotida (triplet) 43 = 64

cukup untuk dikode menjadi 20 AA

• Masing-masing asam

amino mempunyai

kodon yang spesifik.

• Dengan demikian

jumlah kode genetik

ini lebih banyak dari

jumlah asam amino

yang ada.

• Ternyata diketahui ada beberapa kodon yang mengkode

asam amino yang sama (genetic code redudancy atau

degeneracy).

• 61 kodon merupakan kodon sense yang mengkodekan

asam-asam amino. Satu diantaranya merupakan start

kodon yaitu kodon AUG (metionin) yang akan

menempatkan diri pada permulaan (ujung asam amino)

pada semua rantai polipeptida.

• 3 kodon tidak mengkode asam amino apapun karena

ketiganya merupakan kodon untuk mengakhiri proses

translasi, yaitu :

TAA (UAA pada mRNA) , TAG (UAG pada mRNA),

TGA (UGA pada mRNA). Disebut kodon nonsense atau

stop kodon.

• Dalam proses translasi dibutuhkan sekuen

triplet tRNA yang mencocokan mRNA untuk

sintesis .

• Satu-satunya cara untuk mencocokan

nukleotida tersebut adalah melalui base pair

yang akan saling melengkapi, triplet tRNA yang

mengkode dan melekat pada asam amino

spesifik disebut antikodon

• Berpasangannya kodon dan antikodon terjadi

di ribosom dimana asam amino yang

berlekatan dengan tRNA dapat digabungkan

oleh ikatan peptida membentuk polipeptida

X

Changes 3 amino acids

X

Changes 1 amino acid

Changes all following amino acids

following amino acids are unchanged

Codon-anticodon interactions• codon-anticodon base-pairing is antiparallel• the third position in the codon is frequently degenerate• one tRNA can interact with more than one codon (therefore 50 tRNAs)• wobble rules

• C with G or I (inosine)• A with U or I• G with C or U• U with A, G, or I• I with C, U, or A

5’ 3’

U U CA A G

3’ 5’ tRNAPhe

mRNA

5’ 3’

U U U

A A G

3’ 5’ tRNAPheu

mRNA

wobble base

• one tRNAPhe can read two of the phenilalanin codons

I

usual base

Terima kasih

Referensi

1. Yuwono.Biologi Molekuler.20052. Stannfield. Scahum’s easy outline. Biologi Molekuler dan Sel.

(terjemahan).2003 3. Genetic Code, RNA and Protein Synthesis http://s3.amazonaws.com/cramster-resource/3652_n_15352.pdf4. The Genetic Code. http://www.cramster.com/genetic-code-lecture-note-r30-8027.aspx

Because codon-anticodon interactions can allow "wobble" pairing at the third position of a codon (the first position of an anticodon), it is possible for a single tRNA to recognize two or three codons. The allowable base pairing interactions are shown in the next slide and are listed above. This is accomplished because G can pair not only with C but also with U, and because of the modified base inosine. Inosine is derived from adenosine by deamination.

"Wobble" during reading of the mRNA allows some tRNAs to read multiple codons that differ only in the 3rd base.

What is the nature of the Code Is the code overlapping or non-overlapping? Is the code punctuated or non-punctuated? These details were worked out by CrickCrick used mutagens to introduce changes into

a coding sequenceUsed mutagens that either induced point

mutations in the DNA or insertions.After generating mutants he checked the

proteins coded by the mutant sequences