KEKAYAAN SPESIES (SPECIES RICHNESS)

KEKAYAAN SPESIES (SPECIES RICHNESS)OLEH KELOMPOK 1PENDAHULUAN

Komunitas: struktur yang membentuk suatu ekosistem?? Baik? Buruk?Diukur/hitungStruktur fisikJumlah jenisnya

memperkirakan kekayaan spesies hal mendasar untuk berbagai bidang dalam ekologi komunitas

kekayaan spesies tidak dapat diukur secara akurat ataupun dihitung secara langsung melalui pengamatan (Gotelli & Colwell, 2001)MASALAHNYA...Perlu pengetahuan dan teknik pendugaan kekayaan spesiesPemanasan....Faktor-faktor apa saja yang mempengaruhi kekayaan spesies??ImigrasiKompetisiPredasi, patogen, parasit, dan herbivoraKemudahanHal-hal apa saja yang dapat dipengaruhi oleh kekayaan spesies?produktivitasstabilitasinvasif

Jenis data yang digunakan??Data kelimpahan (Individual-based)Data insiden (sample-based)Merupakan jumlah spesies yang ditentukan dari keseluruhan individu yang disampelMerupakan jumlah spesies yang ditemukan dalam satu unit sampel atau jumlah dari keseluruhan sampel

Teknik analisis data??Bagaimana kalau dihitung secara sederhana??Under-estimate

Species Accumulation CurveSULIT DILAKUKAN!!!!Jumlah individu yang harus disampling untuk mencapai asymptot sering kali sangat banyak dan penyebarannya luas (Chao et al., 2009)

ahli ekologi hampir tidak pernah memperoleh individu acak dalam satu rangkaian pengamatan. Seringkali individu yang ditemukan bisa saja individu yang sudah pernah ditemukan.

Nicholas J. Gotelli & Anne Chao (2013)Menyebutkan bahwa pendugaan kekayaan spesies biasanya dilakukan dengan 3 metode yaitu:INTERPOLASI KEKAYAAN SPESIES MELALUI RAREFACTIONEKSTRAPOLASI KEKAYAAN SPESIESNONPARAMETRIK ASYMPTOTIK SPECIES RICHNESS ESTIMATORSApa itu rarefaction?interpolasi dari sampel biodiversitas ke dalam jumlah individu yang lebih kecil untuk tujuan perbandingan setiap sampelMenggunakan sampel referensi yang berarti menyamakan ukuran seluruh sampel berdasarkan jumlah spesies terendah yang ditemukan pada satu unit sampelLuas petakN (spc teramati)n (sampel referensi)10x 103320x 2034330x 3045340x 40120350x 501363RAREFACTIONDikembangkan oleh Howard Sanders tahun 1968

Untuk membandingkan kekayaan spesies dalam ukuran sampling yang berbedaStuart Hulbert 1971 menyempurnakan rumus tersebut

Shinosaki (1963)m, R: ukuran individu/sampel referensin, r: ukuran individu yang teramatiXi, Yi: jumlah individu jenis ke-i/ sampel ke-iColeman et al., 1982 membuat persamaan juga untuk kawasan yang sudah diukur

Asumsi rarefactionColwell & Gotelli 2011 menjelaskan beberapa asumsi yang digunakan dalam rarefactionSampling yang cukup/memadaiMetode sampling yang digunakan dibandingkan (sama)Kesamaan taksonomikKomunitas yang tertutup dan individu diskretPenempatan acakKelemahan rarefactionRarefaction hanya dapat berkerja dengan baik ketika tidak terdapat taxa yang sangat mendominasi ataupun sebaliknyaHanya menjelaskan jumlah spesies pada tiap sampel tetapi tidak dapat menjelaskan spesies mana yang paling menonjol pada tiap sampelMetode ini tidak mengenali kelimpahan spesies hanya dapat menerjemahkan kekayaan spesiesRarefaction tidak dapat digunakan untuk menduga asimptot kekayaan spesiesNonparametrik Asymptotic Species Richness EstimatorsMemperkirakan asimptotik kekayaan spesies dengan penduga nonparametrik Menurut Gotelli & Chao (2013) ada tiga cara yang sering digunakan untuk mencoba memperkirakan/menduga asimptot dari SAC yaitu:Parametric Curve Fitting Mengunakan pengitungan frekuensi kelimpahan atau frekuensi insiden yang disesuaikan dengan distribusi kelimpahanPenduga Non parametrik Parametric Curve FittingTidak menggunakan data spesies jarang ataupun dominan dalam menentutkan asimptotHanya meramalkan bentuk puncak kurva SACTidak dapat dibandingkan secara empirisMengunakan pengitungan frekuensi kelimpahan atau frekuensi insiden yang disesuaikan dengan distribusi kelimpahanHasil baik jika distribusi kelimpahan spesies diketahuiSering menyimpang dari nilai harapanTidak ada jaminan dua kelompok spesies memiliki model distribusi yang samaPenduga nonparametrik???Penduga nonparametrikIndividual-basedSample-basedEkstrapolasi kekayaan spesiesIndividual-basedSample-basedIntrapolasi vs ekstrapolasi??

Colwell et al. (2012) menghubungkan pendugaan interpolasi dan pendugaan ekstrapolasi ke dalam sabuah kurva.

Kedua metode tersebut menghasilkan bentuk kurva yang sama

KesimpulanKekayaan spesies merupakan salah satu peubah yang dibutuhkan untuk mendeskripsikan kondisi biodiversitas.

Kekayaan spesies juga merupakan data dasar yang digunakan dalam pengelolaan kawasan ataupun spesies

Terdapat tiga metode pendugaan kekayaan spesies yaitu rarefaction, penduga nonparametrik, dan ekstrapolasi

Contoh SoalNoNama JenisXi1Tectona grandis302Swietenia macrophylla13Pinus merkusii54Altingia excelsa145Callophylum inophyllum26Delonix regia67Paraceriantes falcataria18Cananga odorata19Vitex pubescens210Arthocarpus heterophyllus111Langerstromia speciosa112Pometia pinnata113Alstonia scholaris914Hevea braciliensis915Schima walichii316Gmelina arborea517Khaya antoteca118Eusideroxylon swageri419Persea americana220Durio zibethinus421Pithecelebrum jiringa122Manilkara kauki223Scheilera oleosa124Acacia mangium125Acacia auriculiformis126Macaranga sp227Tetrameles nudiflora128Averrhoa carambola129Dysoxylum gaudichaudianum230Pterygota sp.331Hibiscus tilliaceus232Gluta renghas133Dillenia indicum334Peronema canescens135Ricinus sp.136Syzygium polyanthum137Syzygium jambos238Nephellium junglandifolium139Mangifera indica140Kaliandra sp.241Casuarina equisetifolia4Total136data hipotetik vegetasi Cagar Alam Keling Jawa TengahData tersebut diperoleh dari petak berukuran 50x50 m, jika telah diketahui pada survey lapangan sebelumnya dilakukan juga survey dengan petak berukuran 30x30 m ditemukan 37 individu dengan spesies yang sama, tentukanlah berapa jumlah spesies yang diharapkan dalam pengambilan sampel acak untuk 136 individu?NoNama JenisXi1Rana calconota202Polipedates leucomystax13Bufo melanosticus54Fejervarya limnocharis155Bufo asper2Total43Sekelompok mahasiswa melakukan pengamatan amfibi di Danau LSI IPB menggunakan metode VES+Transek

Jika pada pengamatan serupa sebelumnya ditemukan 20 individu dari spesies yang sama berapakah jumlah spesies yang diharapkan pada pengambilan data ini?

Step1. Cari kombinasi/faktorial dari masing-masing jenisStep 3. Masukan ke dalam rumus dasarGampang kan????Penduga nonparametrik Schao1PenyelesaianPenduga Jackknife DAFTAR PUSTAKAChao , A., Colwell , R., Lin , C.-W., & Gotelli , N. (2009). Sufficient sampling for asymptotic minimum species richness estimators. Ecology, 90, 11251133.Chao, A. (1984). Non-parametric estimation of the number of classes in a population. Scandinavian Journal of Statistics, 11, 265270.Chao, A. (1987). Estimating the population size for capturerecapture data with unequal catchability. Biometrics, 43, 783791.Chao, A. (2005). Species estimation and applications. Dalam S. Kotz, N. Balakrishnan , C. Read , & B. Vidakovic , Encyclopedia of Statistical Sciences (2nd ed., hal. 79077916). New York: Wiley.Coleman, B., Mares , M., Willig , M., & Hsieh, Y.-H. (1982). Randomness, area, and species richness. Ecology, 63, 11211133.Colwell , R., Chao , A., & Gotelli , N. (2012). Models and estimators linking individual-based and sample-based rarefaction, extrapolation, and comparison of assemblages. Journal of Plant Ecology, 5, 321.Colwell, R., & Coddington, J. (1994). Estimating terrestrial biodiversity through extrapolation. Philosophical Transactions of the Royal Society, B345, 101118.Gotelli , N., & Chao , A. (2013). Measuring and Estimating Species Richness, Species Diversity, and Biotic Similarity from Sampling Data. Dalam S. Levin, Encyclopedia of Biodiversity (2nd ed., Vol. 5, hal. 195-211). Waltham: Academic Press.Gotelli , N., & Colwell , R. (2001). Quantifying biodiversity: Procedures and pitfalls in the measurement and comparison of species richness. Ecology Letters, 4, 379391.Gotelli , N., & Colwell , R. (2011). Estimating species richness. Dalam A. Magurran, & B. McGill , Biological Diversity: Frontiers in Measurement and Assessment (hal. 3954). Oxford: Oxford University Press.Magurran, A. (2004). Measuring Biological Diversity. United Kingdom: Blackwell Science Ltd,a Blackwell Publishing company.

Terimakasih-Matur Nuwun-Hatur Nuhun-Terimo Kasih-Amanai-Muliate-Suksma- Tampiaseh-Tarimokasi-Kurusumanga-Sauweghele-Tarima Kasih-Sakalangkong-Makaseh-Makase-Teurimong Gaseh Beh-Thank You-Gracias-Mahalo-Kiitos-Merci beaucop-Gamsa hamnida-Xie Xie-Danke-Arigato-Dank Je-Grazie-Obrigado-Syukron-Toda-Dua Netjer-Shukrya-Takk-Salamot-Khwap khun-Anugurihiitusomi