ISOLASI DAN IDENTIFIKASI BAKTERI DARI …repository.ump.ac.id/5589/1/Mega Mareta Ngalih_JUDUL.pdfi...

i

ISOLASI DAN IDENTIFIKASI BAKTERI DARI TANAH DI

SEKITAR PENAMPUNGAN BESI RONGSOK

SKRIPSI

Diajukan Untuk Memenuhi Sebagian Syarat

Mencapai Derajat Sarjana S –1

Oleh :

MEGA MARETA NGALIH

0901070045

PROGRAM STUDI PENDIDIKAN BIOLOGI

FAKULTAS KEGURUAN DAN ILMU PENDIDIKAN

UNIVERSITAS MUHAMMADIYAH PURWOKERTO

2013

ii

Isolasi dan Identifikasi Bakteri…, Mega Mareta Ngalih, FKIP UMP, 2013

iii


iv


v

MOTTO

“Lahaula Wala Quwata Illa Billah Hil Aliyil ‘Azim”

(Tiada Kekuatan dan Daya Melainkan dari Allah yang Maha Tinggi

lagi Maha Mulia)

“Hasbunallah Wa ni’mal wakiil ni’mal maulaa wa ni’mannashiir”

(Bagi kami cukup Allah saja pelindung yang baik, bagi kami tempat

berserah diri yang baik dan penolong yang baik bagi kami)

Selalu berikhtiar, tekun dan sabar dalam mengerjakan

kesulitan, selanjutnya bertawakalah kepada Allah SWT pasti

akan ada kemudahan dan kesuksesan.


vi

PERSEMBAHAN

Sujud syukurku Kehadirat Illahi Robbi atas semua yang telah diberikan

kepada penulis sehingga dapat menyelesaikan skripsi ini tanpa ada halangan, dan

penulis ingin mempersembahkan skripsi ini untuk:

Bapak dan Ibu tercinta peluk cium ananda takkan ada hentinya serta senantiasa

terucapkan tulusnya rasa terimakasih yang mendalam atas Do’a yang tiada

hentinya dan mensuport penulis untuk selalu semangat dalam menyelesaikan

skripsi ini.

Segenap keluarga Rusidi Suhardjo, yang telah membantu secara moril dan

materiil kepada penulis.

Dosen Pembimbing Drs. Heri Maryanto, M.Si dan Dini Siswani Mulia M.Si,

yang telah membantu dalam penyusunan skripsi ini.

Tak lupa juga untuk mas Rozzaq yang selalu memberikan motivasi, perhatian,

Do’a, bantuan, dan segala kasih sayang selama ini.


vii

UCAPAN TERIMAKASIH

Bismillahirrohmaanirrohim

Alhamdulillahirrobbil’alamiin, Puji Syukur penulis panjatkan kehadirat

Allah SWT yang telah melimpahkan rahmat dan inayah-Nya sehingga penulis

dapat menyelesaikan skripsi yang berjudul “Isolasi dan Identifikasi Bakteri dari

Tanah di sekitar Penampungan Besi Rongsok”.

Penulis menyadari bahwa terselesainya penyusunan skripsi ini pastinya

berkat dukungan, bimbingan, serta bantuan dari berbagai pihak yang terlibat

langsung maupun tidak langsung. Dalam kesempatan ini, perkenankanlah penulis

mengucapkan terimakasih yang tulus ikhlas penulis sampaikan kepada bapak Drs.

Heri Maryanto, M.Si dan Ibu Dini Siswani Mulia, S.Pi, M.Si selaku Dosen

Pembimbing skripsi yang dengan segala kesabaran memberikan bimbingan,

arahan serta dorongan sehingga penulis dapat menyelesaikan penelitian dan

penulisan skripsi dengan baik dan lancar.

Selain itu penulis juga mengucapkan terimakasih kepada:

1. Drs. Ahmad, M.Pd selaku Dekan Fakultas Keguruan dan Ilmu Pendidikan

Universitas Muhammadiyah Purwokerto.

2. Drs. Arief Husin, M.Si selaku Ketua Program Studi Pendidikan Biologi

Fakultas Keguruan Ilmu Pendidikan Universitas Muhammadiyah

Purwokerto atas fasilitasi kelancaran skipsi.

3. Segenap Dosen Program Studi Pendidikan Biologi Universitas

Muhammadiyah Purwokerto yang selalu memberikan tambahan ilmu.

4. Staf karyawan Fakultas Keguruan dan Ilmu Pendidikan.

5. Staf laboran yang telah memberi bantuan selama penelitian: Kurniawan, S.Si,

Alhikmah, S.Si, & R. Nindra, S.Si.

6. Bapak dan Ibu yang selalu memberikan Doa dan semangat, beribu-ribu terima

kasih untuk semuanya yang tak akan cukup jika diungkapkan dengan kata-

kata dan yang tak akan mungkin terbalaskan sampai kapanpun.


viii

7. Kakak dan saudara-saudaraku yang selalu memberi nasehat dan motivasi.

8. My special one M. Ridlo Nur Ar Rozzaq terimakasih telah menjadi

penyemangat selama ini, dukungan, Doa, dan bantuannya dalam

penyelesaian skripsi ini.

9. Sahabat-sahabatku Siti Nur Amanah, Neira Wiluyandari, Peni Rahayu, mas

Rudi, terima kasih untuk bantuannya selama ini, motivasi, dan bersedia

menjadi pendengar keluh kesahku serta teman-teman Midi poto kos

terimakasih telah memberikan semangat dan Doa.

10. Teman-teman seperjuangan di Program Studi Pendidikan Biologi angkatan

2009 atas kerjasamanya selama ini.

11. Kepada semua pihak yang tidak bisa penulis sebutkan satu persatu yang telah

membantu dalam penyusunan skripsi ini.

Semoga amal dan kebaikan yang telah diberikan Bapak dan Ibu dosen serta

teman-teman semua kepada penulis mendapat balasan yang setimpal dari Allah

SWT.

Penulis menyadari karya ini masih sangat jauh dari sempurna. Oleh karena

itu, kritik dan saran yang membangun sangat diharapkan. Semoga dapat

bermanfaat bagi pembaca.

Purwokerto, 12 Agustus 2013

Penulis


ix

ISOLASI DAN IDENTIFIKASI BAKTERI DARI TANAH DI SEKITAR

PENAMPUNGAN BESI RONGSOK

Oleh:

MEGA MARETA NGALIH

0901070045

ABSTRAK

Penelitian tentang Isolasi dan Identifikasi Bakteri dari Tanah di sekitar

Penampungan Besi Rongsok telah dilaksanakan di Laboratorium Mikrobiologi

dan Lingkungan Progam Studi Pendidikan Biologi Universitas Muhammadiyah

Purwokerto pada bulan Februari-April 2013. Penelitian ini bertujuan untuk

mengisolasi dan mengidentifikasi jenis-jenis bakteri dari tanah di sekitar tempat

penampungan besi rongsok, di Desa Karangsalam, Kecamatan Kedungbanteng,

Kabupaten Banyumas. Penelitian ini menggunakan metode survey. Sampel tanah

diambil dari tempat penampungan besi rongsok. Pengambilan sampel dilakukan

sebanyak 2 kali dengan interval waktu 1 minggu. Isolasi dilakukan dengan metode

dillution plating (pengenceran) yang dilakukan sampai tingkat 10-3

. Beberapa

kriteria yang digunakan di dalam mengidentifikasi bakteri dapat dilakukan dengan

mengamati karakteristik makroskopis, mikroskopis, dan uji biokimia bakteri.

Pengamatan makroskopis meliputi bentuk koloni, warna koloni, bentuk tepi

koloni, dan ukuran koloni. Pengamatan mikroskopis meliputi pewarnaan Gram,

bentuk sel, dan ukuran sel. Pengujian biokimiawi meliputi uji indole, uji methyl

red, uji voges proskauer, simmon citrate, produksi H2S, urease, fermentasi

karbohidrat, dan uji katalase. Isolat bakteri diidentifikasi menggunakan buku

Bergey’s Manual Deteminative of Bacteriology (Holt et al., 1994). Hasil

identifikasi terhadap isolat bakteri diperoleh 10 genus bakteri yaitu Acinetobacter,

Alcaligenes, Arthrobacter, Azomonas, Enterobacter, Klebsiella, Kluyvera,

Neisseria, Oscillospira, dan Serratia.

Kata Kunci: Bakteri tanah, Besi rongsok, Identifikasi bakteri, Isolasi


x

DAFTAR ISI

Halaman

UCAPAN TERIMAKASIH ........................................................................ vii

ABSTRAK ................................................................................................... ix

DAFTAR ISI ................................................................................................ x

DAFTAR TABEL ......................................................................................... xii

DAFTAR GAMBAR ................................................................................... xiii

DAFTAR LAMPIRAN ................................................................................. xiv

BAB I PENDAHULUAN

1.1 Latar Belakang .................................................................... 1

1.2 Rumusan Masalah ............................................................... 3

1.3 Tujuan Penelitian ................................................................. 3

1.4 Manfaat Penelitian ............................................................... 3

BAB II TINJAUAN PUSTAKA

2.1 Isolasi Bakteri ....................................................................... 4

2.2 Identifikasi Bakteri .............................................................. 5

2.3 Bakteri ............................................................................... .. 7

2.4 Resistensi Bakteri ................................................................ 9

2.5 Besi (Fe) .................... .......................................................... 11

2.6 Tembaga (Cu) .................................................................... .. 12

2.7 Seng (Zn) .............................................................................. 13

BAB III METODE PENELITIAN

3.1 Lokasi dan Penelitian .......................................................... 14

3.2 Alat dan Bahan .................................................................... 14

3.3 Metode Penelitian ................................................................ 15

3.4 Prosedur Penelitian .............................................................. 15

3.5 Identifikasi Bakteri .............................................................. 25

BAB IV HASIL DAN PEMBAHASAN

4.1 Hasil Penelitian ................................................................... 26


xi

4.2 Pembahasan ........................................................................ 47

BAB V SIMPULAN DAN SARAN

5.1 Simpulan ............................................................................. 59

5.2 Saran ................................................................................... 59

DAFTAR PUSTAKA ............................................................................... ... 60

LAMPIRAN ............................................................................................... .. 65


xii

DAFTAR TABEL

Halaman

Tabel 4.1 Isolat bakteri yang berhasil diisolasi dari tanah di sekitar

penampungan besi

rongsok................................................................................

26

Tabel 4.2 Karakteristik genus Serratia .............................................. 34

Tabel 4.3 Karakteristik genus Neisseria ............................................ 36

Tabel 4.4 Karakteristik genus Klebsiella ........................................... 37

Tabel 4.5 Karakteristik genus Alcaligenes ......................................... 38

Tabel 4.6 Karakteristik genus Acinetobacter ..................................... 40

Tabel 4.7 Karakteristik genus Enterobacter ...................................... 41

Tabel 4.8 Karakteristik genus Kluyvera ............................................. 42

Tabel 4.9 Karakteristik genus Azomonas ........................................... 44

Tabel 4.10 Karakteristik genus Arthrobacter ....................................... 45

Tabel 4.11 Karakteristik genus Oscillospira ........................................ 47

Tabel 4.12 Kuantitas isolat bakteri ....................................................... 48


xiii

DAFTAR GAMBAR

Halaman

Gambar 4.1 Isolat MG-4 (A) bentuk koloni bulat, tepi halus, dan

elevasi rata, isolat MG-9 (B) bentuk koloni bulat, tepi

bergerigi, dan elevasi

rata................................................................................

27

Gambar 4.2 Hasil uji indole + ditunjukkan dengan warna merah

pada permukn medium (A) dan uji indole –

ditunjukkan dengan warna kuning pada permukaan

medium

(B)................................................................................

29

Gambar 4.3 Hasil uji MR + pada isolat MG-1 (A) dan hasil uji

MR – pada isolat MG-4

(B)................................................................................

30

Gambar 4.4 Hasil uji VP + pada isolat MG-2 (A) dan uji VP –

pada isolat MG-9

(B)…............................................................................

31

Gambar 4.5 Hasil uji simmon citrate + pada isolat MG-5 (A) dan

uji simmon citrate – pada isolat MG-7

(B)................................................................................

31

Gambar 4.6 Hasil uji katalase +....................................................... 33

Gambar 4.7 Persamaan reaksi hidrolisis glukosa (Cappuccino &

Sherman

1987)............................................................................

53

Gambar 4.8

(a)

Persamaan reaksi fermentasi karbohidrat

(Cappuccino & Sherman

1987)............................................................................

54

Gambar 4.8

(b)

Persamaan reaksi perubahan warna pada medium uji

VP (Cappuccino & Sherman 1987) ............................

54

Gambar 4.9 Reaksi penguraian tryptophan oleh enzim

tryptophanase (Cappuccino & Sherman

1987)............................................................................

55


xiv

Gambar

4.10 (a)

Reaksi (I) Fermentasi asam sitrat (Cappuccino &

Sherman 1987) ............................................................

56

Gambar

4.10 (b)

Reaksi (II) Fermentasi asam sitrat (Cappuccino &

Sherman 1987) ............................................................

57

Gambar

4.11

Persamaan reksi penguraian H2O2 oleh enzim

katalase (Cappuccino & Sherman 1987) .....................

58


xv

DAFTAR LAMPIRAN

Halaman

Lampiran 1 Kode isolat untuk masing-masing genus bakteri................ 64

Lampiran 2 Hasil identifikasi isolat-isolat bakteri................................. 65

Lampiran 3 Gambar hasil pengamatan bentuk sel bakteri..................... 67


ISOLASI DAN IDENTIFIKASI BAKTERI DARI …repository.ump.ac.id/5589/1/Mega Mareta Ngalih_JUDUL.pdfi...

Documents

Transcript of ISOLASI DAN IDENTIFIKASI BAKTERI DARI …repository.ump.ac.id/5589/1/Mega Mareta Ngalih_JUDUL.pdfi...