biokimia TRANSLASI

download biokimia TRANSLASI

of 18

description

mata kuliah biokimia translasi

Transcript of biokimia TRANSLASI

  • 7/16/2019 biokimia TRANSLASI

    1/18

  • 7/16/2019 biokimia TRANSLASI

    2/18

    Pengertian????

    Merupakan reaksi kimia kompleks yangterjadi di dalam sel, dan melibatkanbeberapa senyawa penting, terutama DNA

    dan RNA Molekul DNA berperan sebagai cetakan bagiterbentuknya RNA, sedangkan RNAberperan mengarahkan urutan asam aminodalam pembentukan molekul protein didalam ribosom

  • 7/16/2019 biokimia TRANSLASI

    3/18

    3

    Peran RNA dan ribosom dalam sintesis

    protein

    Ribosom sintesis protein

    mRNA cetakanrRNA dalam ribosom

    tRNA mengambil asam

    amino sitoplasma

  • 7/16/2019 biokimia TRANSLASI

    4/18

    TAHAPAN terdiri atas:

    Transkripsi

    Translasi

  • 7/16/2019 biokimia TRANSLASI

    5/18

    Proses sintesis molekul RNA, yang merupakan

    proses pembentukan rantai poliribonukletidadari berbagai monoribonukleotida, dengan

    melibatkan utasan DNA sebagai modelcetakannya dan enzim polimerase RNA sebagaikatalisatornya

  • 7/16/2019 biokimia TRANSLASI

    6/18

    Apa yang dibutuhkan???

    1.Utas DNA cetakan dalam sintesis

    RNA

    2. Polimerase RNA (transkriptase)

  • 7/16/2019 biokimia TRANSLASI

    7/18

    RNA Polimerase :

    Sering disebut dengan RNA Transkriptase untukmembedakannya dengan RNA yang bertugas dalamproses Replikasi.Enzim ini sering dijadikan model suatuorganisme. Enzim ini tersusun atas struktur yangkompleks ( tersusun atas + 15 subunit - subunit ) aktif

    yang disebut Holoenzim.

    Holoenzim terdiri dari enzim inti & faktor (sigma )

    Enzim inti : Mengkatalisis sintesis RNA

    Faktor (sigma ) : Mengenali tanda awal transkripsi yangterdapat pada utas DNA cetakan.

    Sub unit sub unit ini tidak disatukan dengan ikatankovalen tetapi dengan ikatan sekunder

  • 7/16/2019 biokimia TRANSLASI

    8/18

    RNA hasil transkripsi salah satunya adalah m RNA yang akanberperan sebagai cetakan protein.

    Basa mRNA akan membetuk rangkaian kodon

    ( adalah rangkaian 3 basa yang berdampingan pada m RNAyang menyandikan satu asam amino )

    Pesan genetik mRNA diterjemahkan menjadi rangkaian asamamino berdasarkan sandi genetik.

    Hal yang perlu diketahui pada proses transkripsi :

    Promotor site

    Enzim RNA Polimerase

    Antisense ( - ) strand

    Terminator

    Terminologi / Tahap transkripsi

    Inisiasi

    Elongasi Terminasi

  • 7/16/2019 biokimia TRANSLASI

    9/18

    Titik permulaan transkripsi : Merupakannukleotida DNA pertama yangditranskripsikan kedalam nukleotida RNA.Pada titik pelekatan ini transkripstase akanberasosiasi erat dengan DNA dan

    Ribonuleotide akan masuk untukberpasangan dengan utas cetakan. Titikpermulaan biasanya ( 90 %) merupakan

    suatu basa Purin

  • 7/16/2019 biokimia TRANSLASI

    10/18

    Inisiasi :Proses penempelan kompleks RNA polimerase pada promotor site.

    Elongasi : Setelah terjadi proses inisiasisubunit ( faktor sigma )akan

    melepaskan diri dan sintesis RNA dilanjutkan oleh Core enzim( enzim yang tidak mengandung faktor sigma ) menggunakanutas cetakan arah 51 - 31 dan membutuhkan 4 macamnukleosida ( ribonukleosida 51trifosfat )

    yaitu : r-ATP, r-CTP, r-GTP, r-UTP

    Terminasi Transkripsi berlangsung sampai ditemukannya tanda untuk

    berhenti (kodon stop)

    Tanda terminasi yang sederhana adalah bagian DNA yangdengan urutan basa GC disebut palidrome dan diikuti olehbagian DNA yang kaya akan basa AT.

    Bila genom tidak mengandung palidrome maka terminasimenggunakan protein Rho

  • 7/16/2019 biokimia TRANSLASI

    11/18

    11

  • 7/16/2019 biokimia TRANSLASI

    12/18

  • 7/16/2019 biokimia TRANSLASI

    13/18

    .Translasi

    Proses sintesis / pembentukan protein

    dengan menggunakan mRNA sebagaicetakan.

    Proses ini membutuhkan :

    m RNA terdiri dari 3 urutan basa yang akandibaca/ diterjemahkan dalam bentuk triplet yangdisebut kodon, tiap kodon menterjemah kan /menyandikan satu asam amino.

    misalnya ;

    AUU : Isoleusin ( Ile)

    CUA : Leusin ( Leu)

    GUA : Valin ( Val)

  • 7/16/2019 biokimia TRANSLASI

    14/18

    Ribosom

    Merupakan kompleks Ribosom RNA denganprotein yang terdiri dari sub unit besar dansub unit kecil ( P site dan A site )

    P site : Adalah tempat terikatnya t RNAdengan rantai polipeptida yang sedangtumbuh ( peptidyl t RNA )

    A site : Tempat terikatnya aminoasil t RNA

    Tahap Translasi

    Inisiasi

    Elongasi

    Terminasi

  • 7/16/2019 biokimia TRANSLASI

    15/18

    Inisiasi : Diawali dengan proses aktivasi terhadap t RNA. P- site yang berisi f Met dan t RNA

    A

    site kosong nantinya akan diisi oleh amino asil- t RNAsesuai dengan kodon berikutnya Selanjutnya pembentukan ikatan peptida antara asam

    amino baru dengan f Met. Elongasi : Perpanjangan sintesis protein dengan pembacaan

    kodon( sandi genetik). tRNA akan dilepaskan dari P- site, A- site kembali

    kosong,dan akan diisi oleh aminoasil- tRNA yangbaru sesuai dengan kodon baru ( step 1 ).

    Amino asil yang baru akan membentuk ikatan

    peptida dengan rantai polepeptida sebelumnya (step 2) Kompleks kembali bergerak tRNA kembali

    dilepaskan dan A site kembali kosong , proses iniberlangsung terus sampai ditemukan stop kodon (UAG,UGA,UAA )

  • 7/16/2019 biokimia TRANSLASI

    16/18

    Terminasi : Elongasi berhenti bila stop kodonyang ditemui terisi dengan proteinRelease Factor(RF)

    Proses ini berlangsung diikutidengan dihidrolisisnya rantai

    peptida yang terbentuk dari tRNA. Kompleks ribosom dibebaskan darimRNA.

    Protein yang dihasilkan akan

    mengalami perubahan agar dapatberfungsi secara fisiologis

  • 7/16/2019 biokimia TRANSLASI

    17/18

  • 7/16/2019 biokimia TRANSLASI

    18/18

    Protein yang dihasilkan belum

    merupakan protein yang aktif

    karena belum dapat berfungsisecara fisiologi