Translasi [Repaired]

Click here to load reader

  • date post

    15-Dec-2015
  • Category

    Documents

  • view

    28
  • download

    1

Embed Size (px)

description

translasi

Transcript of Translasi [Repaired]

Slide 1

SINTESIS PROTEINTRANSLASI

11Faktor-faktor yang dibutuhkan dalam sintesis protein:Gen (DNA) yang bertindak sebagai template atau cetakan Suplai RNA nukleotida bebasenzim ATP

22ReviewUntai basa pada molekul DNA disajikan dalam huruf A T C G yang membentuk suatu kode genetik. Kode tersebut menentukan tipe dari asam amino dan memerintahkan di bagian mana harus bergabung untuk membuat suatu protein yang spesifik. Untai dari asam amino pada protein menentukan struktur dan fungsinya. Kode DNA berupa triplet. Tiap triplet, kelompok dari tiga buah basa, mengkode asam amino yang spesifik.

Triplet dari basa pada DNA dan mRNA disebut kodon.Triplet dari basa pada tRNA disebut anti-kodon.33

Proses Translasi44Perangkat Translasi:mRNARibosomtRNAsintetase tRNA-aminoacil55m-RNAPembawa pesan DNA

P r o t e I n

F u n g s iP o l a Cetakan(M e s s e n g e r- R NA)6

7S I t u s S h I n e D a l g a r n o

# D I t e m u k a n o l e h J o h n S h I n e & L y n n D a l g a r n o# S I t u s I n I s I a s i t r a n s l a s i

8P r o k a r I o t = p o l I g e n

VS

E u k a r I o t = m o n o g e n 99tRNA (transfer RNA)tRNA merupakan RNA yang terdapat dalam sitoplasma dengan rantai terpendek yang bertugas menerjemahkan kodon dari mRNA.

1010

1111Fungsi tRNAtRNA berfungsi mengikat asam amino dalam sitoplasma dan memberikan pasangan kodon mRNA di ribosom

1212RIBOSOMSejarah

Pada tahun 1899, G. Garnier melaporkan bahwa sel kelenjar eksokrin mengandung komponen basofil yang banyak. Substansi ini dapat diwarnai dengan pewarna basa dan beliau memberi nama ergastoplasma.Ergastoplasma sebenarnya terdiri atas sejumlah granula yang berdiameter 20--25 nm. Dengan teknik fraksinasi sel memungkinkan pengisolasian granula dan ternyata granula tersebut banyak mengandung RNA. R. Roberts menyebut granula ini dengan RIBOSOM.1313Struktur RIBOSOMRibosom terdiri atas dua sub unit, yaitu sub unit kecil dan sub unit besar. Sub unit kecil mengandung sekitar sepertiga massa ribosom dan sisanya terdapat pada sub unit besar. Dalam keadaan bebas kedua sub unit ribosom terpisah satu dari yang lain dan mereka akan menyatu pada saat proses translasi ukuran ribosom akan dimulai. Ukuran ribosom cukup besar untuk dapat mengikat dua molekul tRNA dan sekitar 40 basa mRNA. 1414

1515Fungsi RIBOSOMInisiasi Inisiasi melibatkan pembentukan kompleks sub unit kecil ribosom dengan tRNA inisiator. Sub unit besar ribosom kemudian menempel pada kompleks tersebut. Proses ini dibantu oleh faktor inisiasi.

TranslokasiTranslokasi melibatkan pergerakan relatif ribosom pada mRNA sehingga kodon yang akan diterjemahkan dapat dibaca oleh tRNA. Proses ini dibantu oleh faktor elongasi

TerminasiPada saat ini mRNA dan polipeptida yang sudah dirangkai dilepaskan dan sub unit ribosom akan terpisah. Tahap ini dibantu oleh faktor terminasi 1616tRNA (transfer RNA)tRNA merupakan RNA yang terdapat dalam sitoplasma dengan rantai terpendek yang bertugas menerjemahkan kodon dari mRNA.

1717Fungsi tRNAtRNA berfungsi mengikat asam amino dalam sitoplasma dan memberikan pasangan kodon mRNA di ribosom

1818Struktur tRNAMolekul tRNA terdiri atas untai tunggal RNA dengan panjang 80 nukleotida. Untai RNA ini melipat ke belakang membentuk molekul dengan struktur tiga dimensi, diperkuat oleh interaksi antara bagian-bagian yang berbeda dari rantai nukleotida.1919Bagian basa N pada tRNA yang menerjemahkan kode yang dibawa mRNA disebut antikodon.Bagian basa N pada mRNA yang memiliki kode untuk menspesifikasikan asam amino disebut kodon.2020Bagian basa N pada tRNA yang menerjemahkan kode yang dibawa mRNA disebut antikodon.Bagian basa N pada mRNA yang memiliki kode untuk menspesifikasikan asam amino disebut kodon.2121

Tiap jenis tRNA memiliki untai dari tiga nukleotida tidak berpasangan (anti-kodon) yang mampu berikatan dengan mengikuti aturan pasangan basa, dan triplet nukleotida komplementer (kodon) pada molekul mRNA.

Karena replikasi DNA dan transkripsi mempengaruhi pasangan basa nukleotida yang berjalan pada arah berlawanan, maka pembacaan kodon pada mRNA (5' -> 3') menyebabkan anti-kodon berikatan pada arah berlawanan. Anti-kodon: 3' CGA 5Kodon: 5' GCU 3' 2222sintetase tRNA-aminoasil Dalam dua langkah reaksi kimia, sintetase tRNA-aminoasil mengkatalisis pembentukan ikatan ester antara gugus karboksil dari asam amino dan gugus 3 hidroksil primer (OH) dari tRNA yang sesuai.

Langkah 1:Asam amino dan sebuah molekul ATP memasuki tempat aktif dari enzim sintetase tRNA-aminoasil.ATP kehilangan pirofosfat dan menghasilkan ikatan AMP yang kovalen terhadap asam amino.Pirofosfat dihidrolisis menjadi dua gugus fosfat.

Langkah 2:tRNA berikatan secara kovalen dengan asam amino untuk menggeser kedudukan AMP dan tRNA-aminoasil (asam amino teraktivasi) kemudian dilepaskan dari enzim.2323

24Langkah-langkah Translasi:InisisasiElongasiTerminasi2525INISIASIInisiasi merupakan tahapan awal dari proses translasi

Inisiasi melibatkan:mRNAtRNA inisiatordua subunit ribosomMembentuk Kompleks Inisiasi2626Sub unit ribosom besar kemudian berikatan dan membentuk initiation complex. tRNA inisiator berada pada tempat yang disebut P site pada sub unit ribosom besar. A site tersedia untuk memuat asam amino berikutnya.Suatu protein yang disebut faktor inisiasi membantu tRNA inisiator, molekul mRNA dan dua subunit ribosom menjadi satu membentuk kompleks inisiasi.MEKANISME INISIASI2727ELONGASIApa? Elongasi (elongate = memanjang) proses pemanjangan rantai polipeptida

Tahap-Tahap Elongasi: a.Pengikatan aminoasil-tRNA pada situs A. b.Pemindahan rantai polipeptida dari situs P ke situs A. c.Translokasi ribosom 2828Tahap 1: Pengikatan aminoasil-tRNA pada situs A

Situs P terdapat fMet-tRNAfMet, situs A kosong.

TAHAP-TAHAP ELONGASI2929Pengikatan aminoasil-tRNA pada situs A EF-Tu GTP Aminoasil-tRNA EF-Tu GTP Kompleks EF-Tu-GTP-aminoasil-tRNA PEF-Ts

PEF-Tu - GDP Aminoasil-tRNA menempati situs A

Syarat: Jikka kodon mRNA dan antikodon tRNA cocok!

3030Tahap 2: Pemindahan Rantai PolipeptidaPembentukan ikatan peptida dikatalis oleh enzim transferase peptidil.Enzim transferase peptidil memutuskan ikatan COO tRNA pada aminoasil-tRNA di situs P.Menghubungkannya kepada gugus amino, membentuk ikatan peptida, terbentuk peptidil-tRNA pada situs A (R. transpeptidasi).EF-Tu GDP lepas dari aminosil-tRNA.EF-Ts mengembalikan EF-Tu GDP EF-Tu GTP.

TAHAP-TAHAP ELONGASI3131

3232Tahap 3: TranslokasiAkhir transpeptidasi: a. Situs P: tRNA bebas asam amino b. Situs A: peptidil-tRNA

Translokasi adalah perpindahan tempat: a. tRNA di situs P situs E (exit). b. Peptidil-tRNA situs A situs P. c. Ribosom bergerak satu kodon ke arah 3.TAHAP-TAHAP ELONGASI3333Translokasi dibantu oleh faktor elongasi G (EF-G).Membutuhkan energi satu GTP.EF-G dan GTP kompleks EF-G GTP.Menempel pada ribosomEF-G dilepaskan dengan menggunakan energi dari hidrolisis GTP.

Proses elongasi akan berlanjut sampai menemukan kodon terminasi3434

3535TERMINASI Tiga basa triplet UAA, UAG, dan UGA tidak mengkode asam amino tetapi menghentikan kodon yang mengakhiri proses translasi (stop codon).

3636TERMINASIProtein yang disebut release factor (faktor pelepas) menghentikan kodon di situs A

3737TERMINASIPolipeptida dibebaskan dari tRNA yang berada di site P dan translasi assembly comes apart

3838TERMINASIpolipeptida melipat, bermodifikasi, atau berkombinasi dengan polipeptida lain untuk membentuk protein fungsional.

3939