Asam Amino Dan Sintesa Protein
-
Upload
andy-faisal -
Category
Documents
-
view
18 -
download
1
description
Transcript of Asam Amino Dan Sintesa Protein
Setiap sel makhluk hidup mempunyai nucleus (inti sel) dimana didalamnya terdapat nucleoplasma
Nucleus berperan dalam:1. Menyimpan informasi genetik2. Duplikasi DNA3. Transkripsi dalam sintesis protein
Dalam nucleoplasma terdapat chromosomes (chromatin pada saat pembelahan sel) yang strukturnya sebagian besar terdiri dari DNA dan protein
Dalam nucleus juga terdapat nucleoli (anak inti) yang aktif dalam sintesis protein. Nucleoli dalam suatu sel dapat berjumlah satu atau lebih.
Nucleoli berperan dalam sintesis dan penyusunan molekul RNA dan pembentukan sejumlah besar protein ribosom sebelum ditransfer ke sitoplasma.
Dalam tubuh setiap makhluk hidup mengandung asam nukleat.
Merupakan makromolekul. Bentuknya bisa berupa DNA (deoxyribonucleic
acid) dan RNA (ribonucleic acid) Beberapa organisme bersel tunggal seperti
virus tubuhnya hanya terdiri dari DNA atau RNA saja
DNA mempunyai cetakan untuk membangun individu makhluk hidup
Kode genetik bersifat universal
Percobaan pada tahun 1950an menunjukkan bahwa DNA membawa sifat hereditas
Pada 1953 – Watson dan Crick menemukan bahwa sturktur DNA adalah suatru rantai ganda
Watson-Crick ModelWatson-Crick Model
DNA merupakan penyimpan utama dari material genetic (informasi genetik).
DNA merupakan suatu polymer (polynucleotides) dimana 1 unit (monomer) dari DNA adalah nucleotides.
Urutan nukleotida di sepanjang DNA berperan sebagai sandi untuk menyampaikan semua informasi yang diperlukan untuk memerintahkan sel agar membuat segala sesuatu yang diperlukan bagi kehidupan
Setiap nucleotide tdd:- Basa nitrogen purine (adenine, guanine) atau pyrimidine
(cytosine, thymine)- deoxyribose sugar (gula deoksiribosa)- 1,2 or 3 phosphate groups.
Struktur DNA adalah double helix ( rantai ganda), dengan rangkanya yang terdiri dari deoxyribose—phosphate—deoxyribose—phosphate—
Terdapat ikatan hidrogen diatara rantai yang saling berhadapan
Basa Purine dan pyrimide yang terikat kepada gula deoxyribose, dapat berputar bebas. DNA membentuk pasangan basa yang spesifik A-T(2 H-bonds), G-C (3 H-bonds).
Kedua rantai DNA saling berhadapan disebut antiparallel
Struktur DNA
A
T
T
G
C
C
T
A
G
T
A
A
C
G
G
A
T
C
C
T
A
G
G
C
A
A
T
Struktur rantai tunggal, namun cukup kompleks Struktur pembentuk rantai sama seperti DNA
yaitu terdiri dari ribose, phosphatase, basa purin (A,G) dan pyrimidine (C, U)
Types of RNA:-messenger RNA berperan membawa kode genetik
dalam sequencing asam amino-transfer RNA berperan dalam identifikasi dan
transfer asama amino ke ribosom-ribosomal RNA berperan merupakan bagian dari
ribosom yang berfungsi dalam pembentukan protein(polypeptide)
PerbedaanPerbedaan DNA RNALetak Sebagian besar di
nukleus, sedikit di mitochondria dan kloroplast
Dalam sitoplasma, nucleolus dan kromosom
Pyrimidine bases CytosineThymine
CytosineUrasil
Purine bases AdenineGuanine
AdenineGuanine
Pentose deoxyribose riboseHydrolizing enzyme
Deoxyribonuclease (DNase)
Ribonuclease (RNase)
Peranan Genetic information
Synthesis of proteins
Suatu gen merupakan suatu urutan basa yang menempati suatu lokasi spesifik pada molekul DNA
Gen ini mengontrol sifat khusus dengan membuat suatu protein khusus dalam jumlah tertentu
one base pair
in-text, p. 195
or or
Fig. 13.4, p. 202-3
3’5’
growing RNA transcript5’
3’ 5’
3’
direction of transcription
RNA polymerase
sugar-phosphate backbone of one strand of nucleotides in a DNA double helix
sugar-phosphate backbone of the other strand of nucleotides
part of the sequence of base pairs in DNA
transcribed DNA winds up again
DNA to be transcribed unwinds
newly forming RNA transcript
the DNA template at the assembly site
DNA terdiri dari dua rantai nukleotida yang saling berikatan karena adanya ikatan hidrogen
Ikatan hidrogen antara dua rantai tersebut mudah sekali terputus
Setiap rantai tunggal kemudian berperan sebagai cetakan untuk pembentukan rantai baru
newnew old old
enzyme DNA polymerase melepaskan ikatan rantai DNA, menangkap nukleotida bebas, memasangkan dengan nkleotida baru yang sesuai dan membentuk ikatan yang baru
enzymes lain mengoreksi setiap kesalahan untuk memastikan tidak ada kesalahan sedikitpun
Fig. 12.9, p. 196
old
new
old
old
Replikasi DNA berlangsung selama mitosis dan meiosis, untuk membuat sel baru
transcription translation
DNA RNA Protein
Proteins:
Organisms adalah unik karena keunikan protein masing-masing dan …
Bagaimana protein tersebut diorganisasi selama pertumbuhan
Merupakan suatu rantai asam amino yang dibentuk oleh elemen C, H, N, O.
Terdapat 20 jenis Asam amino
Rantai asam amino kemudian bergabung dan berlipat-lipat menjadi bentuk tiga dimensi
DNA membedakan karakteristik suatu organisme karena perbedaan urutan asam amino dalam semua protein yang terdapat pada organisme tersebut
Setiap asam amino (20 amino acids) diwakili oleh tiga basa yang disebut dengan kodon
Setiap kodon mengkodekan satu jenis asam amino
Urutan basa akan menentukan urutan asam amino dalam protein
Pembentukan protein berlangsung dalam suatu tahapan proses yang disebut dengan sintesis protein
Fig. 13.7, p. 204
DNA dipisahkan dengan rantai pasangannya dan messenger RNA mengkopi kode genetik
transcribed DNA winds up again
DNA to be transcribed unwinds
mRNAtranscript
RNA polymerase
RNA dipotong Introns (Non- coding sequences) dibuang
Exons (Expressed sequences) tetap dibiarkan
Fig. 13.5, p. 203
unit of transcription in a DNA strand
exon intron
mature mRNA transcript
poly-A tail
5’
5’ 3’
3’
snipped out snipped out
exon exonintron
cap
transcription into pre-mRNA
3’ 5’
Messenger RNA mengambil kode tersebut dan menuju ke ribosom di sitoplasma
Transfer RNA mengambil asam amino tertentu dan menuju ribosom
Di dalam ribosom, kode tersebut dibaca dan ditranslasikan ke dalam bentuk suatu urutan asam amino
Rantai asam amino akan melipat-lipat dan bergabung menyatu membentuk protein akhir
Fig. 13.10c, p. 206-7
Fig. 13.14, p. 210
TRANSCRIPTION Unwinding of gene regions of a DNA molecule
Pre mRNA Transcript Processing
mRNA rRNA tRNA
TRANSLATION
FINAL PROTEINDestined for use in cell or for transport
Convergence of RNAs
Synthesis of a polypetide chain at binding sites for mRNA and tRNA on the surface of an intact ribosome
Cytoplasmic pools of amino acids, tRNAs, and ribosomal subunits
Mature mRNA transcripts
protein subunits
ribosomal subunits
mature tRNA
Instruksi pada DNA ditranskripsi (dituliskan kembali) dalam bentuk serupa kemudian ditranslasi (diubah) menjadi bahasa protein.
Pertama2 pesan ditranskripsi menjadi jenis molekul lain yang dikenal sebagai RNA kurir (mRNA). Secara kimiawi mRNA sangat serupa dengan DNA, molekul ini juga dapat mengenali basa pada untaian DNA dan melalui proses pengenalan mRNA bekerja menyalin gen yang dibentuk.
Proses mentranslasi instruksi pada mRNA menjadi btk protein kemudian dapat dimulai.
Urutan basa pada molekl mRNA menentukan urutan asam amino pada protein.
Kata-kata pada bahasa mRNA terdiri atas kelompok2 tiga basa berurutan, disebut kodon. Setiap kodon menyampaikan perintah kepada mesin selular yang mensintesis protein bahwa asam amino tertentu hrs digabungkan menjadi protein pada tempat tertentu
Translasi mRNA melibatkan puluhan jenis molekul, diantaranya (rRNA dan tRNA). Keduanya tidak membawa kode genetik, tetapi membantu sel membaca informasi yang terkandung pada mRNA. Sekali mRNA dibuat, molekul ini meninggalkan inti sel dan masuk tubuh utama sel. Disini struktur globular yang dikenal dengan nama Ribosom melekat pada mRNA tersebut. Pada ribosom terdapat rRNA.Sekali Ribosom berikatan dengan mRNA, tRNA menjalankan tugasnya. Terdapat berbagai jenis tRNA dan masing2 mampu mengenali golongan tertentu dari ketiga basa (kodon) pada mRNA. Setiap jenis tRNA membawa hanya satu jenis asam amino tertentu
Replikasi DNA dan
Sintesis Protein
Setelah sel selesai menyusun suatu rantai asam amino, rantai ini mulai melipat dirinya sendiri. Bentuk umum protein adalah rantai berputar dan melekuk membentuk struktur tiga dimensi yang kompleks. Pelipatan ini diatur oleh tenaga kimia.
Bentuk akhir molekul protein ditentukan oleh urutan asam amino yang menyusun protein tersebut.