Alignment Dengan ClutalX NEW
-
Upload
ki-soewarsono -
Category
Documents
-
view
32 -
download
0
Transcript of Alignment Dengan ClutalX NEW
A. Membuat Fasta File1. Buat fasta file dari program notepad [*.fasta]
2. Copy-paste fasta view sekuens DNA/protein dari NCBI
3. Lakukan pengeditan dengan menghapus beberapa informasi yang tidak diperlukan setelah tanda “>”
4. Simpan fasta file.5. Lakukan penambahan data dalam fasta file yang sama dengan menggunakan langkah 1-4,
sesuai dengan kebutuhan.NB : pemberian/pengaturan nama dalam edit/penambahan data harus berbeda-beda.
B. Melakukan Alignment dengan Clustal X21. Buka Program Clustal X2
2. Buka data melalui File>Load Sequences
3. Atur output file melalui Alignment>Output Format Option [optional]4. Pilih format yang akan digunakan [optional]
5. Lakukan alignment dengan perintah Alignment>Do Complete Alignment
6. Simpan hasil alignment dengan perintah File>Write Alignment as Postscript
NB : salah satu cara membaca File postscript adalah dengan memasang program GhostGum, GhostScript dan GhostWord.