Abstrak: Lamun habitat memiliki fungsi fisik dan ekologi yang mendukung kualitas perairan yang berdekatan dan organisme tinggal nya. Ada bervariasi dari tekanan pada lingkungan lamun, terutama karena kegiatan orang-orang yang dapat menurunkan fungsi dan kestabilan habitat. Penelitian ini bertujuan untuk mengetahui tentang kestabilan habitat lamun dari komposisi jenis dan / atau kepadatan. Transek-plot dan metode eksplorasi yang digunakan di lima lokasi perairan Manokwari pesisir, yang, Andai, Rendani, Wosi, Briosi, dan Tanjung Manggewa. Ada lima spesies pionir (Cymodocea rotundata, Halodule pinifolia, H. uninervis, Syringodium isoetifolium, Halophila ovalis) dan spesies klimaks 3 (Cymodocea serrulata, Enhalus Enhallus, Thalassia hemprichii). Pelopor hanya ditemukan di Andai dan Wosi, namun kedua perintis dan klimaks ditemui di tiga lokasi lainnya. Dalam kepadatan Rendani dan Tanjung Manggewa lebih tinggi dari spesies klimaks (T. hemprichii) adalah 617,7 dan 828,0 berdiri m-2, masing-masing, meskipun di Briosi pelopor tinggi (C. rotundata) dari 570,7 berdiri m-2. Kondisi ini menunjukkan bahwa lamun habitat di Rendani dan Tanjung Manggewa lebih stabil dibandingkan dengan Briosi, serta Andai dan Wosi. Ini menyimpulkan bahwa spesies pionir yang ditemukan di habitat yang baru terbentuk atau terganggu, di sisi lain, klimaks dalam habitat lebih stabil.