Kontrak perkuliahan:

Mikrobiologi Dasar (BIO212)Koordinator mata ajaran : Dr. Ir. Aris Tri Wahyudi, MSi.

Koordinator Praktikum : Dr. Anja Meryandini, MSi.

1. Perkuliahan 14 minggu

2. Kehadiran kuliah : 80 %> tidak dapat ikut UAS

3. Kehadiran praktikum 100%

4. Jadwal Ujian UTS dan UAS mengikuti jadwal dari AJMP

5. Nilai akhir dari rataan nilai UTS + UAS + Praktikum

6. Nilai Praktikum:

1. Kehadiran 5 %

2. Kuis 15 %

3. Laporan 30 %

4. Ujian Praktikum 50 %

7. Nilai huruf mutu berdasarkan nilai rataan kelas

8. Tidak ada ujian perbaikan

9. Buku bacaan:

1. Madigan MT. 2009. Brock Biology of Microorganisms 12th edition.

San Fransisco. Pearson Bejamin Cummings.

Topik perkuliahan

1 Mikroorganisme dan sejarah mikrobiologi

2 Struktur dan fungsi sel pada bakteri dan archaea

3 Pertumbuhan Mikroba

4 Nutrisi, kultur dan metabolisme mikroba

5 Fermentasi dan Foto sintesis pada Mikroba

6 Genetika Bakteri dan Rekayasa genetik

7 Ekosistem Mikroba

UTS

8 Struktur , pertumbuhan dan keragaman Virus

9 Keragaman Bakteri dan Archaea

10 Keragaman mikroorganisme eukariot

11 Interaksi mikroba dan manusia

12 Mikrobiologi diagnostik dan imunologi

13 Pengendalian Mikroorganisme

14 Bioteknologi Mikrob

UAS

Bagian Mikrobiologi

1. Dr. Anja Meryandini MS : Fisiologi Mikroba: enzim

2. Prof. Dr. Ir. Antonius Suwanto : Genetika Mikroba

3. Dr. Ir. Aris Tri Wahyudi MSi: Genetika Mikroba,

Rhizobium dan Bradyrhizobium

4. Dr. Ir. Iman Rusmana MSi: Ekofisiologi Mikroba; (bakteri

pereduksi nitrat, metanotrof &

metanogen, probiotik di tambak)

5. Dr. Nisa Rachmania MSi: Fisiologi Mikroba: enzim

6. Dr. dr. Sri Budiarti : Patogenisitas bakteri

7. Dr. Ir. Yulin Lestari: Komponen Bioaktif, pelarut fosfat,

Rhizobium dan Bradyrhizobium

Tujuan Instruksional Umum :

Mahasiswa dapat mengetahui bahwa mikrob sebagai

sel mampu melakukan berbagai proses kehidupan dan

menunjukkan pengaruhnya terhadap lingkungan

Tujuan Instruksional Khusus :

Mahasiswa dapat menjelaskan peranan dan kedudukan

mikrob di antara organisme lain melalui perkembangan ilmu

dan teknologi hingga biologi modern

Sub Pokok Bahasan :

1. Mikrobiologi Sebagai Bagian Biologi

2. Mikrobiologi dan Biologi Modern

3. Kedudukan Mikrob di antara Organisme

4. Sejarah Mikrobiologi

Mikrobiologi:

ilmu yang mempelajari mikroorganisme, suatu grup

makhluk hidup yang besar dan sangat beragam, hidup

sebagai sel tunggal atau kluster, termasuk virus yang

berukuran mikroskopik tapi bukan seluler.

Sel mikroba → mampu melakukan semua kegiatan

hidup seperti tumbuh, menghasilkan energi dan

reproduksi dalam 1 sel.

Cakupan Mikroorganisme

Mikrobiologi berkisar pada 2 tema utama yaitu dasar

dan aplikasi.

1. sebagai ilmu dasar → alat penelitian mempelajari

proses hidup (sel mikroba memiliki kesamaan

karakter biokimia dengan multisel).

2. sebagai ilmu aplikasi → berperanan pada bidang

kedokteran, pertanian dan industri.

Mikroba sebagai sel:

Sel tunggal dibatasi dari sel lain melalui membran

Struktur utama nukleus atau nukleoid

Semua sel terbentuk dari 4 komponen: protein, lipid,

karbohidrat, asam nukleat

Terdapat bentuk dan penataan sel

DARIMANA DATANGNYA SEL ?????

Bakteri yg pertama hidup dipermukaan bumi bacteria/Archaea.

Klasifikasi tiga dunia menurut Haeckel (1866)

Klasifikasi tiga domain

menurut Woese (1980)

Klasifikasi lima dunia

menurut Whittaker

(1965)

Pemberian nama ilmiah mikroba ada makna/artinya

Ciri makhluk hidup

1. Metabolisme

Peranan mikroba

dalam kehidupan

manusia

Sejarah Mikrobiologi

Baru dapat diamati setelah adanya mikroskop

Mikrobiologi baru dapat berkembang setelah

terjawabnya 2 pertanyaan dasar:

1. Apakah generatio spontanea benar?

2. Pada penyakit infeksi bagaimana penyebarannya

Menjawab pertanyaan tersebut berhubungan

dengan Louis Pasteur dan Robert Koch

1673-1723, Antoni van

Leeuwenhoek (Dutch)

mengamati mikroorganisme

dari sampel air dan gigi

Bakteri pertama teramati pada tahun 1673

Rudolf Virchow (German)

biogenesis: living cells

can arise only from

preexisting cells.

Percobaan Luis Pasteur

Pasteur menunjukan bahwa bakteri penyebab

pembusukan dapat dimatikan dengan

pemanasan yg tidak terlalu panas (suhu yg

tidak menyebabkan alkohol terevaporasi).

Aplikasi suhu panas dengan waktu singkat

disebut pasteurization.

Luis Pasteur

Pasteur yang menunjukan bahwa yang bertanggung

jawab pada proses fermentasi adalah mikroba

• 1860s: Joseph Lister menggunakan disinfektan untuk

mencegah infeksi dari luka operasi. Setelah melihat kerja

Pasteur bahwa mikroba penyebab busuk makanan dan

penyakit

1876: Robert Koch menunjukan bukti bahwa

bakteri yang menyebabkan penyakit antrax

Postulat Koch : untuk membuktikan bahwa

penyakit tertentu disebabkan oleh mikroba

tertentu

Pengetahuan mengenai cara penyebaran penyakit

memberikan dasar cara pengobatan dan

pencegahan penyakit.

Efek lain dari postulat Koch:

1. Pengenalan kultur murni

2. Penggunaan media padat

3. Mengenalkan pewarnaan tahan asam bagi

Mycobacterium tuberculosis yang kemudian

dikembangkan oleh Ziehls Nielsen

Pemerah susu muda memberi tahu ahli Fisika

Edward Jenner bahwa dia tidak terjangkit

cacar karena sudah pernah sakit dari

cowpox.

1796: Edward Jenner menginokulasi orang

dengan virus cowpox . Orang tersebut

menjadi kebal terhadap cacar (smallpox).

Sehingga disebut vasinasi dari asal kata vacca

yang artinya sapi (cow)

Pertahanan tersebut disebut imunitas

Sejarah vaksinasi

1928: Alexander

Fleming penemu

antibiotik pertama.

Dia mengamati

cendawan Penicillium

menhasilkan

antibiotik, penicillin,

tyang mematikan S.

aureus.

1940s: Penicillin diuji

secara klinis dan

diproduksi masal

Abad 20 adalah era mikrobiologi molekuler. Dua ilmuwan

yang menjembatani masa transisi adalah:

1. Martinus Beijerinck

Teknik kultur spesifik (pengkayaan)

Fiksasi nitrogen aerobik, pereduksi sulfat, bakteri

bintil akar, Lactobacillus dan alga hijau

Memberikan dasar bagi virologi

2. Winogradsky

Siklus nitrogen dan sulfur

Memperkenalkan peranan mikroba sebagai agen

biogeokimia

Kultur murni bakteri nitrifikasi dan Clostridium

pasteurianum

Memperkenalkan konsep kemolitotrof, autotrof,

konsep fiksasi N2 pada bakteri

Pada abad 20 Mikrobiologi berkembang cepat dengan 2

arah yang berlainan: Mikrobiologi dasar dan terapan.

Perkembangan pada Mikrobiologi Dasar:

1. Klasifikasi baru karena ditemukannya mikroba baru

2. Fisiologi Mikroba: enzim-enzim dan reaksi yang

dikatalisnya

3. Hereditas dan variasi pada bakteri : genetika bakteri

4. Virus: bakteriofage

5. Rekayasa genetika

Perkembangan pada Mikrobiologi Terapan:

1. dari Postulat Koch: Mikrobiologi Kedokteran dan

Imunologi

2. dari Beijerinch dan Winogradsky: mikrobiologi pertanian

3. Mikrobiologi industri: ditemukannya mikroba penghasil

antibiotika dan bahan kimiawi lainnya

4. Mikrobiologi akuatik: pengolahan air limbah dan

penyediaan air yang aman

5. Ekologi Mikroba: biodiversitas dan aktivitas mikroba

dalam lingkungannya