Mikrobiologi BIO 3051
Ruang lingkup dan Sejarah MikrobiologiProgram S1 –Prodi Studi Biologi
Prof, Dr. A. Endang Sutariningsih Soetarto, MSc.
Kontrak Pembelajaran(Studying tips)
Baca bahan kuliah atau topik pada jadwal sebelum anda datang utk kuliah
Baca catatan anda dg. baik, shg anda minimal memahami konsep yg diberikan
Baca lecture notes dengan baik sehingga- anda dapat mengikuti dan lebih mudah memahami konsep yang diberikan- usahakan untuk mengingat istilah ilmiah dan
mempelajari berdasarkan kamus yang ada
Di dalam kelas: buatlah Catatan tentang informasi dan penjelasan penting yg
diperlukanm serta siapkan pertanyaan utk ditanyakan Setelah selesai kuliah, susunlah kembali catatan kuliah yang
anda tulis selama kuliah Perhatikan pertemuan kuliah hanya berlangsung 150 menit
atau 1 kali dalam 1 minggu selama 12-14 minggu. Oleh karena itu usahakan untuk hadir dalam kuliah dan biasakan belajar sebelum dan sesudah kuliah.
Usahakan melengkapi materi atau catatan anda dan jangan buang waktu belajar anda sehingga anda tidak memahami apa yang anda pelajari
Untuk meyakinkan diri anda telah belajar dg baik: Cobalah mengerjakan latihan atau tugas sebelum anda memulai belajar
Janganlah anda mulai belajar pada saat-saat menjelang ujian
Jangan berhenti dg membuat singkatan kuliah dan mempelajari soal-soal yang diberikan selama kuliah. Hafalkanlah kemudian cari kata kuncinya untuk memudahkan pemahaman
Bacalah berulang-ulang materi kuliah
Siapkan diri anda untuk menghadapi ujian dg belajar lebih sungguh-sungguh dari pada sebelumnya, terutama bagi mahasiswa yang mengulang,
Jagalah kesehatan jangan sampai sakit pada saat menjelang ujian.
Jangan lupa bacalah jadwal kuliah, praktikum dan ujian dengan seksama
Baca acara praktikum yang harus anda siapkan dan kerjakan sesuai jadwal
Praktikum di Lab akan jauh lebih mudah dikerjakan apabila: anda telah menyiapkan dan membekali diri dengan teori
yang telah diperoleh. anda bertanya hal yang anda belum tahu kepada dosen/
asisten yg bertugas. Anda menyiapkan bekal untuk Pre-test yang akan diberikan
sebelum praktikum dimulai (dengan maksud utk mengethi kesiapan mahasiswa dlm mengerjakan praktikum.
EXTENDED SYLLABUS
Nama Mata Kuliah: MIKROBIOLOGIKode : 3051SKS : 3-1Semester : GENAPKoordinator (Kls C) : Prof. Dr.A. Endang S. Soetarto, MSc. Tim Pengampu : Prof. Dr.A. Endang S. Soetarto, MSc.
Abdul Rahman Siregar, S.S.i, M.Biotech.
Tujuan pembelajaran
memberi gambaran tentang dunia mikrobia memperkenalkan teknik penanganan mikrobia yang mudah
ditumbuhkan di laboratorium. Mengenal peran mikrobia dalam kehidupan sehari-hari dan
pada berbagai bidang
Perlu anda catat bahwa mikroorganisme sulit untuk diamati dan ditangani:
Memerlukan kondisi aseptik dan ketelitian tinggi
Oleh karena itu mikrobiologi merupakan subyek praktikal dan sangat menarik untuk dikaji dan dikerjakan di laboratorium.
you should ensure that you attend all the class programs and laboratory sessions.
you should also ensure that you read your lecture notes and laboratory manual prior to a class activity or a lab. session,
these will help you to understand the aims of the lecture and the lab.activities; and what you are expected to do.
Kompetensi
Para mahasiswa mampu a. memahami mikrobiologi secara keseluruhan sbg ilmu dasar
dan ilmu terapanb. memahami arti penting mikrobia yang terkait dengan
disiplin ilmu lainc. menggunakan teknik yang tepat untuk mengenal keaneka-
ragaman mikrobia sebelum mempelajari topik terkait lebih lanjut.
Mikrobiologi sebagai disiplin ilmu dasar dan terapan a. memberikan landasan pengetahuan tentang arti penting dan
pengaruh aktivitas mikrobia di alam terutama dalam kehidupan sehari-hari. b. menguak karakter biokimia dan genetik mikrobia secara
molekular Seiring dg perkembangan biologi molekular dan teknologi,
mikrobia:- mendominasi biologi modern dan - dieksploitasi untuk kesejahteraan manusia dan
kesehatan lingkungan.
Luaran Pembelajaran (Learning Outcomes)
A. Pengetahuan dan pemahaman (knowledge and understanding)
Memahami pengertian atau konsep dasar tentang biologi mikrobia dan perannya dalam proses yang berlangsung di dalam kehidupan sehari-hari dan perubahan alam.
Memahami dasar-dasar untuk mengenal keanekaragaman mikrobia dan dampaknya terhadap lingkungan dan jasad hidup lain.
Memahami dasar teori dan peralatan di laboratorium untuk melaksanakan praktikum atau penelitian mikrobiologi.
Memahami arti penting aspek mikrobiologi molekuler di dalam penggolongan mikrobia dan mengungkap peran mikrobia
B. Kemampuan (ability/intellectual skills) Memiliki kemampuan berfikir untuk:
Menganalisis keanekaragaman mikrobia di alam berdasarkan kebutuhan nutrisi
Menganalisis, dan mencari jawab suatu permasalahan serta mengembangkan pemikiran utk memanfaatkan mikrobia.
Menguasai permasalahan untuk merencanakan dan melaksanakan praktikum atau penelitian di bid mikrobiologi
C. Ketrampilan (practice skills)
Mampu berkarya untuk:
Menerapkan konsep mikrobiologi dalam penelitian pemanfaatan mikrobia pada segala bidang
Menggunakan pustaka ilmiah utk - membuat tugas dan laporan praktikum secara ilmiah
Menggunakan peralatan laboratorium utk - melaksanakan praktikum atau penelitian dg teknik yg tepat
menjaga kondisi aseptis, mengisolasi, menumbuhkan (mengkulturkan), mengidentifikasi mikrobia.
D. Kemampuan manajerial dan alih ilmu (managerial and transferable skills)
Memiliki kemampuan manajerial dan alih ilmu untuk:
Mengatur waktu secara efektif dan efisien untuk menyelesaikan tugas.
Mengkomunikasikan pendapat dan dg menerapkan prinsip kimia, fisika dan matematika di bidang mikrobiologi melalui karya tulis atau seminar
Bekerja sama dalam kelompok. Mengaplikasikan dan mengintegrasikan mikrobiologi ke
dalam cabang lainnya. Menggunakan teknologi komunikasi dan informasi.
E. Sikap (attitude)
Memiliki rasa ingin tahu (curiosity) Menghargai originalitas ide, konsep, dan penemuan
lain Menghargai upaya interdisiplin dalam mengeksplorasi,
memanfaatkan dan melestarikan sumber daya alam Mampu menyesuaikan diri dengan lingkungan yang ada Memperhatikan, menghargai pandangan dan pendapat
orang lain
Tujuan pembelajaran
Memberi bekal pemahaman konsep dasar untuk - mengenal mikrobia dan arti pentingnya di kehidupan sehari-
hari, sehingga setelah mahasiswa menyelesaikan mata kuliah ini mampu:
menjelaskan tentang pengertian dasar Mikrobiologi dan cakupan ilmu terkait serta arti pentingnya dalam perkembangan biologi moderen
membahas karakteristik, keanekaragaman aktivitas dan peran mikrobia di alam,
memberi contoh hubungan antara aktivitas mikrobia atau proses mikrobiologi dengan kehidupan sehari-hari
Memilih atau menunjukkan metoda yang tepat untuk pengamatan sel, isolasi, identifikasi dan mempelajari aktivitas mikrobia
Konsep
Mikrobia 1) sebagai jasad yang sangat kecil dan hanya dapat dilihat dengan
menggunakan alat pembesaran (mikroskop).2). mempunyai pengaruh terhadap kehidupan di alam: merugikan dan
menguntungkan3). memerlukan fasilitas dan metoda yang spesifik utk penanganannya4). dapat dieksploitasi untuk tujuan tertentu dan diaplikasikan dalam
kehidupan sehari-hari (industri, makanan, kesehatan, pertanian dan lingkungan) (kesejahteraan manusia dan kesehatan lingkungan)
5). Mempunyai peran penting dalam perkembangan mikrobiologi yg pesat, mendominasi biologi molekular dan rekayasa genetika serta mempengaruhi teknologi baru di dalam industri.
Untuk menambah pengetahuan dan keterampilan dalam menangani mikrobia, mahasiswa diwajibkan untukmengikuti praktikum dengan bobot 1 sks.
RENCANA KEGIATAN PERKULIAHAN DAN PRAKTIKUM
Mikrobiologi BIO 3052SEMESTER GENAP TAHUN AKADEMIK 2011/2012
No. Dokumen FO-UGM-BI-06-01
Berlaku sejak 03 Maret 2008
Revisi 00
Halaman 1 dari 1
Dosen Pengampu: Prof. Dr. A. Endang Sutariningsih Soetarto, MSc. (ES) (Kelas C)
Abdul Rahman Siregar, S.Si, M.Biotech (AR)* (di bawah Bimbingan)Pengampu Praktikum: Prof. Dr. A. Endang Sutariningsih Soetarto, MSc. (ES)
Endah Retnaningrum, SSi, MEng Abdul Rahman Siregar, S.Si, M.Biotech (AR)*
Minggu Tanggal Topik
1 20-02-12Perkenalan, Ice Breaking dan Kontrak Perkuliahan1. Pengertian dan ruang lingkup Mikrobiologi
2 27-02-122. Sejarah perkembangan Mikrobiologi;a. Penemuan dan perkembangan mikrobiologi b. Perkembangan mikrobiologi masa kini
3 05-03-12
3. Dunia mikrobia dan karakteristik mikrobia a. Keanekaragaman dan kedudukan mikrobia di alam b. Sifat karakteristik mikrobia (Perbedaan antara Prokariotik dan
Eukariotik; Protozoa, Algae, Fungi, Bakteri, Virus)
4 12-03-12c. Morfologi dan struktur sel bakterid. Morfologi dan struktur virus
5 19-03-12
4. Metoda yang digunakan dlm mikrobiologia.Teknik aseptik dan mikroskopi: b.Teknik isolasi dan penumbuhan mikrobia, c.Cara identifikasi mikrobia tak dikenal d. Cara pengamatan aktivitas mikrobia
7 26-03-12
5. Pengertian dasar nutrisi & metabolisme mikrob a. Arti penting Nutrisi dan metabolisme b. Pengelompokan mikrobia berdasar smbr C & tenaga c. Proses metabolik pembentukan tenaga
8-9 2-13/04’12 Ujian Tengah Semester
10 16-04-125. Metabolisme mikrobia c. Proses metabolik pembentukan tenaga d. Penggunaan tenaga oleh sel mikrobia
11 23-04-12
6. Pertumbuhan dan pengendalian pertumbuhan mikrobia a. Pengertian dan Teknik pengukuran pertmbuhan mikrobiab. Kurva normal dan kinetika pertumbhan bakteric. Faktor lingkungan yg mempengaruhi pertmbhn mikrobia:
Minggu Tanggal Topik
Minggu Tanggal Topik
12 30-04-127. Karakteristik bahan genetik, perubahan dan pemindahan
informasi genetik pada mikrobia
13 07-05-128 Peran mikrobia di alam dan di berbagai bidang: a. Kesehatan,medik dan serologi/Immunologi
14 14-05-12 b. Industri Farmasitikal, fermentasi, Makanan, Bioteknologi
15 21-05-12 c. Lingkungan dan peristiwa sehari-hari (penyuburan tanah, biodegradasi), serta. sanitasi lingkungan
16 28-05-07 Review
Black JG, 2008. Microbiology 7e. John Wiley and SonsBrock, T. D., and Madigan, M. T., 2000. Biology of Microorganisms. Prentice Hall. N. Jersey.Prescott L.M, Harley J.P, and Klein D.A., 1999. Microbiology. WCB McGraw HillTalaro, K & Talaro, A (2006), Foundations in Microbiology WCB
Buku tambahan:Atlas, R., 1996. Microbiology. John Wiley & sons. Toronto, London, Singapore.Cano, R.J, and Colome, S.J., 1986. Microbiology. West Publishing company. USA.Ketchum, P. A., 1988. Microbiology Concepts and Applications, John Wiley & sons. LondonSchlegel, H. G., 1992. General Microbiology. Cambridge University Press. Victoria, UK.
Konteks (Fenomena): Mikrobia mempunyai peran dan berinter-aksi dengan lingkungan baik lingkungan biotik maupun non biotik
Konstruksi : 1. Perkuliahan dikemas dengan pengadaan hand out, text books dan sumber lain
yang mudah diakses.2. Metoda penyampaian materi secara interaktif yg dititikberatkan agar
mahasiswa menjadi lebih aktif dalam proses pembelajaran:- dengan pemberian tugas kelompok, - diskusi dan tugas mandiri; - ceramah untuk meperjelas permasalah, dengan penayangan LCD.
3. Mewajibkan mahasiswa untuk menambah pengetahuan dan keterampilan dengan mengikuti praktikum (bobot1 sks)
4. Pembelajaran langsung ke lapangan (industri, instansi terkait ayau alam sekitarnya)
Prasyarat : Biokimia
Mata Kuliah yg diambil Bersamaan : Ekologi, Fisiologi Tumbuhan atau hewan, dan Entomologi.
Mata Kuliah selanjutnya : Fisiologi Mikrobia, Mikrobiologi Lanjut, Mikrobiologi Industri,
Mikrobiologi Tanah, Mikrobiologi Bhn Maknan, Genetika Mikrobia
Lama Perkuliahan : 150 menitTatap Muka : 1 kali per mingguPraktikum per minggu : 2,5 sampai 3 jamBelajar Mandiri : 4 jam per minggu
EvaluasiUjian Tengah Semester (20 %)Ujian Akhir Semester (40 %)Nilai Praktikum (30 %)Kuis dan Tugas (10 %)
PustakaWajibBlack JG, 2008. Microbiology 7e. John Wiley and SonsBrock, T. D., and Madigan, M. T., 2000. Biology of Microorganisms. Prentice
Hall. N. Jersey.Pelczar, M. J., and Chan, E.C.S., 1981. Elements of Microbiology. Mc Graw-Hill
International Book Company. Auckland, London, Paris, Sydney.Prescott L.M, Harley J.P, and Klein D.A., 1999. Microbiology. WCB McGraw Hill
Bagaimana anda mempelajari mikrobiologi
Praktikum (i) Acara (Lihat jadwal dan Petunjuk Praktikum (ii) Pelaksanaan Praktikum (iii) Laporan Praktikum:
1. Tujuan praktikum sesuai dengan acara Praktikum 2. Bahan dan cara kerja tidak perlu ditulis 3. Tulis semua mikrobia yg digunakan dengan nama ilmiah dg benar &
lengkp. Misal: Bacillus subtilis, Escherichia coli, Saccharomyces cerevisieae dsb.
4. Hasil: dipresentasikan dalam bentuk Diagram atau gambar (jelas dan beri keterangan yang jelas). Tabel, histogram, boxed, label, units Grafik, diberi judul, nomor.
5. Diskusi – bahas hasil praktikum anda sesuai dengan teori yg anda peroleh dikaitkan dg tujuan dan dicocokkan dengan teori
6. Daftar Pustaka: Buku acuan dan Jurnal ilmiah 7. Jawablah pertanyaan yang diberikan selengkap mungkin 8. Format laporan seperti pada contoh borang: boleh diketik atau tulis
tangan
What is Microbiology?
What is Microbiology?
Mikrobiologi: ilmu yg mempelajari mikroorganisme atau mikrobia Mikroorganisme (kelompok sel hidup yang beranekaragam
dari berbentuk sel tunggal atau sebagai kluster, termasuk virus (jasad non selular yang mikroskopik)
Mikroorganisme: jasad hidup yg sangat kecil, hanya dapat dilihat dng alat
pembesar ukuran selnya < 0.1 mm= 100 µm masing-masing tdk mudah dibedakan secara filogenetik dr
makroorganisme Mikrobiologi:
teknik koleksi: teknik aseptik, teknik kultur murni, teknik atau pengamatan mikroskopi
What is Microbiology?
Mikrobiologi: Sebagai ilmu dasar
Sebagai ilmu terapan
Mikrobiologist harus mengenal karakter mikrobia dan mampu
membedakannya mampu mengisolasi mikrobia specifik, dari populasi
dan menumbuhkan atau mengkulturkannya, mengenal karakter mikrobia untuk mempelajari
secara in situ tanpa mengkultur
Mikrobiologi Dasar vs. Mikrobiologi Terapan
Mikrobiologi Dasar: Sifat semua sel pada umumnya memiliki karakter yang
sama, Siklus hidup pendek, Membahas sifat biokimia dan genetik.
Mikrobiologi Terapan : Problem praktis yang terkait dengan kedokteran dan kesehatan (penyakit vs. mikrobia
yang hidup berasosiasi dengan tubuh tanpa menimbulkan sesuatu yang membahayakan),
pertanian (kesuburan tanah, dsb.), industri (produksi antibiotika, makanan, dsb.).
Mikrobiologi
Dasar atau fondasi semua ilmu biologi. karena mikroorganisme merupakan model
yang paling excellent untuk memahami fungsi sel organisme tingkat tinggi termasuk manusia.
Ragam cabang Mikrobiologi
Berdasarkan kelompok & peran mikrobia yang terlibat, 1. bakteriologi - bakteri2. mikologi - fungi3. virologi - virus 4. parasitologi - parasit
Berdasarkan peran mikrobia:1. Immunologi – muncul dari mikrobiologi,
- mikrobia yg terkait dg kesehatan manusia.
- merupakan cabang biologi sel2. Mikrobiologi Kedokteran3. Mikrobiologi Tanah 4. Mikrobiologi Industri5. Ekologi Mikrobia
Kombinasi – Virologi Kedokteran.
Ragam cabang Mikrobiologi
WHY STUDY MICROBES?
Mikroorganisme:
Archea, Eubacteria, Eukarya Protista. Fungi, Bakteri sejati: prokaryotic Prokaryota merupakan jasad uniselular yang
sangat berbeda, memiliki dinding sel, membran sel, RNA dan sintesis protein yang spesifik;
Tipe nutrisi penyerapan makanan melalui digesti: protozoa,
beberapa algae, fungi uniseluler dan multiselular;
Penyerapan absorptif: Khamir, kapang; cendawan
WHY STUDY MICROBES? VERY VERRRRRY INTERESTING!!!
Sistem Model : organisme yg sngt kecil tetapi mampu mengerjakan aktivitas seperti:- Gerakan (movement) - Merespon lingkungan - reproduksi- respirasi
Sebagai sistem Model : organisme yg sederhana digunakan untuk mempelajari aktivitas yg kompleks
Misal: bakteri digunakan untuk mempelajari - bagaimana DNA bereplikasi, - bagaimana gen dapat di switch on and off, - bagaimana sel merespon perubahan lingkungan.
WHY STUDY MICROBES?
Mikrobia mampu mengerjakan yg aneh: - fiksasi N2,
- hidup dg gas NH3, H2S;
- menghslkan senyawa beracun dan berbahaya - melakukan fotosintesis khusus.
Mikrobia sbg agensia perubahan geokimia - terlibat di dalam daur unsur di alam
- Daur oksigen, karbon, nitrogen, sulfur.
Scope and relevance of microbes
Arti penting Mikroorganisme
Prekursor untuk organisme tingkat tinggi
Membantu organisme tingkat tinggi tetap bertahan hidup dan mempertahan keseimbangan lingkungan: memproduksi oksigen Mendaur ulang nutrien kunci (C,H,N,O,P) Mendegradasi bahan organik
Ruang lingkup dan relevansi mikrobia
“Jasad yang sangat kecil mempunyai peran sangat besar di alam." (L. Pasteur)
Mikrobia sebagai sel hidup atau organisme hidup yang pertama di alam
Hidup hampir pada semua bentuk lingkungan Jumlah lebih banyak dari pada makroorganisme Merupakan komponen biomasa terpadat Fundamental pada suatu ekosistem Merubah kondisi secara nyata atau melalui cara
yang tidak nampak
Mikrobia merupakan sel hidup yang unik
Sumber Pustaka
Black JG, 2008. Microbiology 7e. John Wiley and Sons
Brock, T. D., and Madigan, M. T., 2000. Biology of Microorganisms. Prentice Hall. N. Jersey.
Pelczar, M. J., and Chan, E.C.S., 1981. Elements of Microbiology. Mc Graw-Hill International Book Company. Auckland, London, Paris, Sydney.
Prescott L.M, Harley J.P, and Klein D.A., 1999. Microbiology. WCB McGraw Hill