UJI POTENSI ISOLAT RHIZOBAKTERI PADA TANAMAN JERUK …eprints.umm.ac.id/38782/1/PENDAHULUAN.pdf ·...

UJI POTENSI ISOLAT RHIZOBAKTERI PADA TANAMAN JERUK

(Citrus reticulata) DAN TANAMAN JAMBU (Psidium guajava Linn)

SEBAGAI PUPUK HAYATI

SKRIPSI

Diajukan untuk Memenuhi Sebagian Persyaratan

Mencapai Derajat Sarjana Strata Satu (S-1)

Program Studi Agroteknologi

Diajukan Oleh:

Muhammad Putro Nuswantoro

NIM. 201310200311073

PROGRAM STUDI AGROTEKNOLOGI

JURUSAN AGRONOMI

FAKULTAS PERTANIAN PETERNAKAN

UNIVERSITAS MUHAMMADIYAH MALANG

2017

KATA PENGANTAR

Alhamdulillah, puji syukur penulis panjatkan kehadirat Allah SWT yang telah

melimpahkan rahmat dan hidayah-Nya sehingga penulis mampu menyelesaikan penelitian

serta skripsi yang berjudul “Uji Multipotensi Rhizobakteri Pada Areal Rhizosfer Dua Jenis

Tanaman Buah-Buahan (Citrus Reticulata Dan Psidium Guajava) Sebagai Biostimulan

Dan Biofertilizer” tepat pada waktunya tanpa halangan yang berarti.

Pelaksanaan penelitian dan skripsi ini tidak terlepas dari bimbingan, arahan, dukungan,

dan motivasi kuat serta bantuan dari berbagai pihak. Oleh karena itu, dalam kesempatan ini,

penulis ingin mengucapkan terima kasih kepada yang terhormat:

1. Dr. Ir. Ali Ikhwan, M.P. selaku pembimbing I dan Erfan Dani Septia., S.P., M.P. selaku

pembimbing II yang telah banyak meluangkan waktu dan pikiran untuk memberikan

bimbingan serta arahan yang sangat berguna sehingga penulis dapat menyelesaikan skripsi

ini dengan baik.

2. Ir. Hartawati, MP dan Ir. Sufianto, MM selaku dosen Penguji yang telah memberikan

arahan, masukan, kritik dan saran kepada penulis untuk kesempurnaan skripsi ini.

3. Tim IBiKIK ber-anggotakan Redi Roesmana dan Rebecca Kusuma Dewi yang telah bekerja

sama dalam seluruh pelaksaan penelitian berlangsung,

4. Kedua orang tua saya yang selalu memberikan dukungan dan memberikan nasehat serta

semangat sehingga skripsi ini dapat terselesaikan.

5. Seluruh keluarga, teman-teman jurusan Agroteknologi khususnya angkatan 2013 kelas B

yang selalu memberikan semangat dan motivasi kepada penulis dalam penyelesaian skripsi

ini.

Penulis menyadari tiada satu pun karya manusia yang sempurna, sehingga kritik dan

saran demi perbaikan karya ini sangat penulis harapkan. Meski demikian, penulis berharap

karya sederhana ini dapat bermanfaat bagi pembaca sekalian.

Malang, September 2017

Muhammad Putro Nuswantoro

DAFTAR ISI

KATA PENGANTAR .................................................................................... i

DAFTAR ISI ................................................................................................... ii

DAFTAR TABEL .......................................................................................... v

DAFTAR GAMBAR ...................................................................................... vi

DAFTAR LAMPIRAN .................................................................................. vii

RINGKASAN ................................................................................................. viii

I. PENDAHULUAN ................................................................................... 1

1.1 Latar Belakang ........................................................................................ 1

1.2 Rumusan Masalah .................................................................................. 3

1.3 Tujuan Penelitian .................................................................................... 3

1.4 Hipotesis .................................................................................................. 3

1.5 Manfaat Penelitian ................................................................................. 3

II. TINJAUAN PUSTAKA .......................................................................... 4

2.1 Tanaman Perkebunan Buah .................................................................. 4

2.1.1 Jambu .......................................................................................... 4

2.1.2 Jeruk Keprok .............................................................................. 5

2.2 Rhizobakteri ............................................................................................ 6

2.2.1 Rhizobakteri dan Kegunaannya ............................................... 6

2.2.2 Biofertilizer ................................................................................ 7

2.2.3 Cekaman Osmotik ..................................................................... 8

III. METODE PENELITIAN ....................................................................... 9

3.1 Waktu dan Tempat Penelitian ............................................................... 9

3.2 Alat dan Bahan ....................................................................................... 9

3.3 Rancangan Percobaan ............................................................................ 10

3.4 Tahapan Pelaksanaan Penelitian .......................................................... 10

3.4.1 Sterilisasi Alat ............................................................................ 10

3.4.2 Pembuatan Media M63 Standart dan Sterilisasi Media ....... 11

3.4.3 Isolasi Rhizobakteria Tanaman perkebunan buah-buahan

dengan Pengenceran Bertingkat dan Pourplate .................... 11

3.4.4 Pemurnian Bakteri dengan Cara Streak .................................. 12

3.4.5 Pengujian Isolat Bakteri Sebagai Biofertilizer ...................... 12

3.4.6 Pengujian Produksi Hormon Pertumbuhan Menggunakan

Gas Chromatograph Mass Spectrometer (GC-MS) ............. 13

3.4.7 Uji Biofertilizer .......................................................................... 14

3.5 Variabel Pengamatan ............................................................................. 15

3.6 Analisis Data ........................................................................................... 16

IV. HASIL DAN PEMBAHASAN ............................................................... 17

4.1 Hasil .......................................................................................................... 17

4.1.1 Uji Pertumbuhan Rhizobakteri Tanaman Jeruk pada Media

M63 ............................................................................................. 17

4.1.2 Uji Pertumbuhan Rhizobakteria Tanaman Jambu pada

Media M63 Standar ................................................................... 19

4.1.3 Uji Pertumbuhan Rhizobakteri Tanaman Jambu pada

Media M63+100 ppm Triptofan .............................................. 21

4.1.4 Uji Pertumbuhan Rhizobakteri Tanaman Jeruk pada

Media M63+100 ppm Triptofan .............................................. 23

4.1.5 Uji Produksi Hormon Pertumbuhan Menggunakan Gas

Chromatograph Mass Spectrometer (GC-MS) ..................... 24

4.1.6 Uji produksi Senyawa Osmoprotektan Pertumbuhan

Menggunakan Gas Chromatograph Mass Spectrometer

(GC-MS) ..................................................................................... 26

4.1.7 Uji Produksi Senyawa Asam Amino Pertumbuhan


(GC-MS) ..................................................................................... 27

4.1.8 Uji produksi Senyawa Vitamin Pertumbuhan Menggunakan


4.1.9 Uji Produksi Senyawa Karbohidrat Pertumbuhan


(GC-MS) ..................................................................................... 29

4.2 Pembahasan ............................................................................................. 30

4.2.1 Uji Pertumbuhan Rhizobakteri Tanaman Jeruk pada Media

M63 Standar ............................................................................... 30

4.2.2 Uji Pertumbuhan Rhizobakteria Tanaman Jambu pada

Media M63 Standart .................................................................. 32

4.2.3 Uji pertumbuhan Rhizobakteria Tanaman Jambu pada

Media M63 + 100 ppm Triptopan ........................................... 34

4.2.4 Uji pertumbuhan Rhizobakteria Tanaman Jeruk pada

Media M63 + 100 ppm Triptopan ........................................... 35

4.2.5 Uji Produksi Senyawa Hormon Pertumbuhan Menggunakan


4.2.6 Uji produksi Senyawa Osmoprotektan Pertumbuhan


(GC-MS) ..................................................................................... 36

4.2.7 Uji Produksi Senyawa Asam Amino Menggunakan Gas


4.2.8 Uji Produksi Golongan Vitamin Menggunakan Gas


4.2.9 Uji Produksi Golongan Karbohidrat Pertumbuhan


(GC-MS) ..................................................................................... 38

V. KESIMPULAN DAN SARAN ............................................................... 39

5.1 Kesimpulan ............................................................................................. 39

5.2 Saran......................................................................................................... 40

DAFTAR PUSTAKA ..................................................................................... 41

DAFTAR TABEL

Nomor Teks Halaman

1. Data OD awal, OD tertinggi, umur (jam), rerata isolat bakteri tanah

tanaman jeruk pada media M63 ......................................................... 18

2. Data OD awal, OD tertinggi, umur (jam), rerata isolat bakteri tanah

tanaman Jambu pada media M63 ....................................................... 20

3. Jenis dan konsentrasi hormon pertumbuhan Ekstraseluler 3 isolat

bakteri terbaik dari area rhizosfer tanaman Jambu ............................. 24

4. Jenis dan konsentrasi golongan osmoprotektan pada 3 isolat

rhizobakter tanaman jeruk .................................................................. 26

5. Jenis dan konsentrasi asam amino pertumbuhan 3 isolat bakteri ....... 27

6. Jenis dan konsentrasi vitamin pertumbuhan 3 isolat bakteri terbaik

dari area rhizosfer tanaman Jambu ..................................................... 28

7. Jenis dan konsentrasi karbohidrat pertumbuhan Ekstraseluler 3

isolat bakteri terbaik dari area rhizosfer tanaman Jambu. .................. 29

8. Hasil OD rhizobakteri tanaman Jambu pada media M63................... 46

9. Hasil OD rhizobakteri tanaman Jeruk pada media M63 .................... 47

DAFTAR GAMBAR

Nomor Teks Halaman

1. Proses Isolasi Bakteri Tanah dengan cara Pengenceran

Bertingkat sampai 𝟏𝟎−𝟒 ....................................................................... 11

2. Pola Pertumbuhan isolat rhizobakteria tanaman jeruk pada media

M63 standar ........................................................................................... 17

3. Pola pertumbuhan isolat rhizobakteria tanaman jambu pada media

M63 standar ........................................................................................... 19

4. Pola pertumbuhan isolat rhizobakteria tanaman jambu

pada media M63 + triptofan A. isolat I P J2 10-2 COK,

B. isolat I P J2 10-4 ORE, C. isolat I P J5 10-3 COK,

D. isolat I P J4 10-3 P, E. isolat I P J2 10-4 P. ...................................... 22

5. Pola Pertumbuhan Isolat rhizobakteria tanaman jeruk

pada media M63 + 100 ppm triptofan A. isolat I P Jr4 10-4 MER,

B. isolat I P Jr5 10-4 COK, C. isolat I P Jr2 10-3 BIR,

D. isolat I P Jr4 10-2 COK, E. isolat I P Jr4 10-4 BIR. ........................ 23

6. Sampel tanah yang digunakan untuk isolasi Rhizobakteri

tanaman jeruk dan jambu ...................................................................... 48

7. Beberapa hasil pengenceran rhizobakteri

tanaman jeruk dan jambu pada media M63 .......................................... 48

8. A) Proses shaker rhizobakteri selama 24 jam dan B)

proses pengukuran nilai OD menggunakan spektrofotometer .............. 48

9. Proses memasukkan rhizobakteri kedalam venojack 10 ml .................. 49

10. Warna Rhizobakteri Tanaman Jambu ................................................... 50

11. Hasil Chromatograf uji GC-MS rhizobakteri ....................................... 51



14. Setting GC-MS dalam uji kandungan senyawa rhizobakteri ................ 54

DAFTAR LAMPIRAN

Nomor Teks Halaman

1. Komposisi Media Pertumbuhan Rhizobakteri Tanaman

2. Jeruk dan Jambu ................................................................................. 45

3. Tabel Hasil Optical Density (OD) Rhizobakteri Tanaman

4. Jeruk dan Jambu Pada Media M63 ................................................... 46

5. 3. Dokumentasi .................................................................................. 48

6. 4. Karakteristik Rhizobakteri Tanaman Jeruk dan Jambu ................. 50

DAFTAR PUSTAKA

Arrizal S. et.al, 2013, Identifikasi Rhizobakteri pada Semanggi (Marsilea Crenata

Presl.) Yang Terpapar Logam Berat Timbal (Pb), Surabaya, Universitas

Negeri Surabaya.

Astuti S.,2013, Peruraian/Biodegradasi Bahan Pencemar (Polutan) dan

Pemanfaatan Bakteri Nitrobacter Sp Sebagai Upaya Biodegradasi

Pengolahan Air Limbah.

Bargmann, B.O.R., A.M. Laxalt, B. ter Riet, B. van Schooten, E. Merquiol,

C.Testerink, M.A. Haring, D. Bartels, and T. Munnik. 2009. Multiple PLDs

Required for High Salinity and Water Deficit Tolerance in Plants. Plant and

Cell Physiology 50 (1) : 78 - 89.

Dwijoeseputro. 1990. Dasar-Dasar Mikrobiologi. Djambatan. Malang. Hal73, 74.

Ernita, M., Habazar,T., Nasrun dan Jamsari. 2015. Screening of rhizobacteria from

onion rhizosphere can be induce systemic resistance to Bacterial leaf blight

on onion plants. International Jurnal of Agricultural Science. 1 (1).

December. 81 -89.

Fachruddin L., 2008, Membuat aneka selai, Yogyakarta : kanisius. Hal 13-35.

FAO. 2005. Panduan Lapang FAO : 20 Hal Untuk Diketahui Tentang Dampak Air

Laut pada Lahan Pertanian

Fitri, Lenni,. Yekki Yasmin. 2011. Isolation and Observation of Morphology of

Chitinolytic Bacteria Colony. Jurusan Biologi FMIPA Unsyiah, Darussalam

Banda Aceh. Volume 3, Nomor 2, hlm 20-25.

Flowers, T.J. And flowers, S.A. 2005. Why does salinity pose such a difficult

problem for plant breeders? Agric. Water manag. 78 : 15 – 24.

Gnanamanickam S. 2006. Plant-associated bacteria. Springer. The netherlands. Hal

1 - 56.

Hanum C., 2008, Teknik Budidaya Tanaman, Jakarta, Direktorat Pembinaan

Sekolah Menengah Kejuruan, Direktorat Jenderal Manajemen Pendidikan

Dasar dan Menengah, Departemen Pendidikan Nasional.

Harjadi S. 1989. Dasar – dasar hortikultura. Departemen budidaya pertanian.

Fakultas pertanian. Institut pertanian bogor. Bogor.

Ikhwan A dan Susilo E.. 2003. Penerapan Teknologi Inokulasi Rhizobakteri Tahan

Kekeringan pada Tanaman Jagung di Lahan Kering. Kec. Karangploso.

Kab. Malang. Malang. Universitas Muhammadiyah Malang.

Ikhwan A. 2006. Uji Potensi Rhizobakteri Perombak Pestisida Dichloro-Diphenyl-

Trichloroethane Sebagai Pupuk Hayati (biofertilizer). Malang. Universitas

Muhammadiyah Malang.

http://sriastutiturnip.blogspot.com/2013/04/peruraianbiodegradasi-bahan-pencemar.html



Indratin, Wahyuni, S., Ardiwinata, A.N., Harsanti, E.S., Jatmiko, S.Y., Poniman,

dan Sulaeman, E. 2012. Teknologi Arang Aktif Yang Diperkaya dengan

Mikroba Pendegradasi Senyawa POPs di Lahan Padi dan Sayuran. Laporan

Akhir. Pati: Balai Penelitian Lingkungan Pertanian.2012, Isolasi dan

Identifikasi Mikroba Pendegradasi Senyawa Persisten Organic Poluttans

pada Tanah Andosol Magelang, Magelang, Peneliti Badan Litbang

Pertanian Di Balai Penelitian Lingkungan Pertanian, Pati, Laboratorium

Mikrobiologi Lipi Cibinong.

Irawan D.. 2007. Potensi Pengembangan Tanaman Apel (malus sylvestris).

Jay JM. 2000. Modern Food Microbiology. Edisi ke-6. Aspen Publisher, Inc.

Maryland, Jodhpur, Agrobios, India.

Kabir M.E., Karim M.A., and Azad M.A.K.. 2004. Effect of potassium on salinity

tolerance of mungbean (vigna radiata l. Wilczek). J. Of biol. Sci. 4(2):103–

110.

Kristiono A, 2013, Respons Tanaman Kedelai, Kacang Tanah, dan Kacang Hijau

Terhadap Cekaman Salinitas, Buletin Palawija no. 26, 2013.

Kurban, H., Saneoka H., Nehira K., Adilla R. and Fujita K.. 1998. Effect of salinity

on growth and accumulation of organic and inorganic solutes in the

leguminous plants alhagi pseudoalhagi and vigna radiata. Soil sci. Plant

nutr. 44(4):589–597.

McGuinness, 1993. Evaluation and Classification of Water Quality for Irrigation.

in Yaron D. Salinity in Irrigation and Water Resources. Marcel Dekker.

New York. 21–45 pp.

Meryandini, A., Widosari, W., Maranatha, B., Sunarti, T. C., Rachmania, N., dan

Satria, H. 2009. Isolasi bakteri selulolitik dan karakterisasi enzimnya.

Makara Sains. 13: 33338.

Methews D, Rolfe., J. Christopher., Rice., Sacha Lucchini., Carmen Pin., Arthur

Thompson., Andrew D. S. Cameron, Mark Alston, Michael F. Stringer, Roy

P. Betts, Jozsef Baranyi, Michael W. Peck, and Jay C. D. Hintona. 1999.

Lag Phase Is a Distinct Growth Phase That Prepares Bacteria for

Exponential Growth and Involves Transient Metal Accumulation. Journal of

Bacteriology. Vol. 194 No. 3.

Middlebeek, E.J., R.O. Jenkins & J.S. Drijver-de Haas. 1992. Growth in batch

culture. In Vitro Cultivation of Micro-organisms. Biotechnology by Open

Learning. Mikapin. 2012. Tes Jurnal Praktikum Mikrobiolgi Jilid VI (Penghitungan Jumlah

Mikroba Dengan Ruang Hitung). Artikel Teknis Kimia. Mill). Bogor.

Institut Pertanian Bogor.

Neldawati, Ratnawulan dan Gusnedi. 2013. Analisis Nilai Absorbansi dalam

Penentuan Kadar Flavonoid untuk Berbagai Jenis Daun Tanaman Obat.

Padang. UNP Air Tawar Barat Padang.

Ondrasek G., Romic D., Rengel Z., Romic M., Zovko M. (2009). Cadmium

accumulation by muskmelon under salt stress in contaminated organic soil.

Sci Total Environ 407: 2175–2182Parimin, 2005. Jambu Biji. Budi Daya

dan Ragam Pemanfaatannya. Penebar Swadaya, Jakarta.

Patil NB, Gajbhiye M, Ahiwale SS, Gunjal AB, Kapadnis BP. 2011. Optimization

Of Indole 3-Acetic Acid (IAA) Production By Acetobacter diazotrophicus

L1 Isolated From Sugarcane. Intl J Environ Sci 2 (1):307-314.

Prajnanta, F. 2003. Agribisnis Semangka Non-Biji. Jakarta: Penebar Swadaya.Hal.

1 -4.Produksi Dan Gizi. Edisi ke-2. Penerbit ITB. Bandung. 635 hal.

Rahmawati, D. Awalia, M.M.Mustadjab, Fahriyah. 2015. Upaya Peningkatan

Pendapatan Petani Melalui Penggunaan Pupuk Organic. Studi Kasus Pada

Petani Jagung di Desa Surabayan, Kecamatan Sukodadi. Kabupaten

Lamongan. Universitas Brawijaya Malang

Rifai, M.A. 1986. Flora Buah-buahan Indonesia. Bogor : LBN-LIPI.

Rismunandar. 1986. Tanaman Jambu Biji. Bandung : sinar baru. Hal 20-49

Rolfe, J., and Windle, J. 2012. Testing benefit transfer or reef protection values

betweem ocal case studies: The Great Barrier Reef in Australia. Ecological

Econimics, 81, 60-69.

Rubatzky, V. E. dan Yamaguchi, M. 1999. Sayuran Dunia 3. Edisi ke-2.

Institut Teknologi Bandung. Bandung. 320 hal.

Rukmana R., 1994, Budidaya Semangka Hibrida, Yogyakarta: Penerbit Kanisius.

Hal. 11 -18

Semonsma J.S. Dan Piluek K.. 1994. Plant resources of south – east asia.

Prosea. Bogor. Indonesia.

Sharma, A. K. 2002. Organic Farming. Central Arid Zone Research Institute

Jodhpur. Agrobios. India.

Simanungkalit, D. S. 2006. Berbagai Mikroorganisme Rizosfer pada Tanaman

Pepaya (Carica papaya L.) di Pusat Kajian Buah-buahan Tropika (PKBT)

IPBDesa Ciomas, Kecamatan Pasirkuda, Kabupaten Bogor, Jawa Barat.

Skripsi. Bogor: Fakultas Pertanian, Institut Pertanian Bogor.

Soedarsono Y. 1997. The Potency Of Drought-Tolerent Rhizobacteria As Inoculant

For Gogo Rice. Indonesia biotecnology conference. Jakarta.

Sulistyowati, A. 1999. Pertanian Organik dalam Sejarah Peradaban. Wacana, edisi

17 mei-juni 1999, jakarta

Sumarsih, Sri. 2003. Mikrobiologi Dasar. Jurusan Ilmu Tanah Fakultas Pertanian

UPN Veteran Yogyakarta.

Sunarjono H. 1987. Ilmu Produksi Tanaman Buah-Buahan. Bandung : sinar baru.

Hal 209.

Sutanto R. 2002. Pertanian Organik. Yogyakarta. Penerbit Kanisus

Syarifuddin. 2012. Perancangan Peralatan Destilasi Fraksinasi Minyak Nilam Skala

Industri Kecil Menengah (IKM). Hasil Penelitian Industri 66 Volume 25,

No. 2.

Tarabily K, Nassar AH, Sivasithamparam K. 2003. Promotion of Plant Growth By

An Auxin-Producing Isolate Of The Yeast Williopsis Saturnus Endophytic

in Maize Roots. The Sixth UAE Universty Research Conference: 60-69.

Tjahjadi, N. 1987. Bertanam melon. Kanisius. Yogyakarta. 46 hal.

Tjitrosoepomo, G. 2004. Taksonomi Tumbuhan Spermathopytha. Cetakan ke -8.

Gadjah mada university press. Yogyakarta. 477 hal.

Voet, A. 1990. Biochemestry. John Wiley. New York.

Wahyono D, Manohara D, dan Mulya K. 2009. Peranan Bahan Organik pada

Pertumbuhan dan Daya Antagonisme Trichoderma Harzianum dan

Pengaruhnya Terhadap P. Capsici. Pada Tanaman Lada. Jurnal Fitopatologi

Indonesia 7 : 76−82.

Whitaker, t. W. And g. N. Davis. 1962. Cucurbits. Interscience publishers, inc.

New york. 250p.

Widawati, S dan Muharam, A. 2012. Uji Laboratorim Azospirillum sp. yang

Diisolasi dari Beberapa Ekosistem. J. Hort. 22(3) : 258 - 267

Xiong l., schumaker k.s., and zhu j.k. 2002. Cell signaling during cold, drought and

salt stress. The plant cell online. 14(1) : 165–183.

UJI POTENSI ISOLAT RHIZOBAKTERI PADA TANAMAN JERUK …eprints.umm.ac.id/38782/1/PENDAHULUAN.pdf ·...

Documents

Transcript of UJI POTENSI ISOLAT RHIZOBAKTERI PADA TANAMAN JERUK …eprints.umm.ac.id/38782/1/PENDAHULUAN.pdf ·...