7/17/2019 tugas soal biokim.docx

http://slidepdf.com/reader/full/tugas-soal-biokimdocx 1/6

Nama : Vita Fatimah

Nim : 130351603587

S1 Pendidikan IPA/A

Latihan Soal

1. Jelaskan dengan ringkas pengertian dari istilah-istilah berikut:

 Jawab :

a. Enzim

Enzim adalah katalisator pada semua reaksi biokimia (di dalam maupun

diluar sel), sehingga disebut juga biokatalisator.b. KM suatu reaksi enzimatik dan apa ungsin!a

- KM pada reaksi enzimatik merupakan ukuran konsentrasi substrat agar proses

katalitik berlangsung efektif.

- Fungsi KM untuk mengukur konstanta disosiasi suatu enzim.". #idrolase

  Hidrolase merupakan enzim-enzim yang menguraikan suatu zat dengan pertolongan

air. 

d. $igase

$igase adalah sebuah enzim !ang mengkatalisis pembentukan ikatanosodiester dalam %&'.e. isi akti enzim

isi akti enzim adalah daerah !ang terspesialisasi dari protein dimana

enzim berikatan dengan substrat.

. *agaimana "aran!a:

a. Menentukan KM suatu enzim Jawab :

7/17/2019 tugas soal biokim.docx

http://slidepdf.com/reader/full/tugas-soal-biokimdocx 2/6

b. Membedakan enzim dengan apoenzim+proenzim

• Jika dilihat dari karakteristiknya,

- Fungsi dasar dari enzim adalah biokatalis untuk meningkatkan laju reaksi tanpa

terjadinya perubahan struktur secara permanen.

- ebagian besar enzim bertindak secara khusus dengan hanya satu reaktan !disebut

substrat" untuk menghasilkan produk.

- #nzim dapat mengatur dari akti$itas rendah ke akti$itas tinggi dan sebaliknya.%alam tubuh manusia, enzim dapat ditemukan dalam air liur, darah, cairan

lambung dan usus. &ontoh peran enzim adalah pemecahan bahan makanan

sehingga dapat diserap tubuh dan penggumpalan darah.

• 'poenzim yaitu bagian enzim aktif yang tersusun atas protein yang bersifat labil

!mudah berubah" terhadap faktor lingkungan atau proenzim adalah protein bakal

enzim yang harus dimodifikasi(dipotong agar menjadi enzim yang aktif.

- )rotein dalam enzim biasanya berbentuk bulat.

*katan intra dan antarmolekul protein dalam struktur sekunder dan tersier mereka

terganggu oleh perubahan suhu dan pH. *ni mempengaruhi bentuk dan akti$itaskatalistik dari enzim.

- +entuk aktif dari apoenzim dikenal sebagai proenzim atau zimogen. )roenzim

 berisi beberapa asam amino tambahan dan memungkinkan struktur akhir

 berbentuk tersier yang akan dibentuk sebelum diaktifkan sebagai apoenzim.

". Membedakan inhibitor kompetiti dan non kompetiti suatu reaksi

enzimatis Jaab :

• inihibisi kompetitif , inhibitor dan substrat berkompetisi untuk berikatan dengan

enzim. eringkali inhibitor kompetitif memiliki struktur yang sangat mirip dengan

substrat asli enzim. )ada inhibisi kompetitif, kelajuan maksimal reaksi tidak

7/17/2019 tugas soal biokim.docx

http://slidepdf.com/reader/full/tugas-soal-biokimdocx 3/6

 berubah, namun memerlukan konsentrasi substrat yang lebih tinggi untuk mencapai

kelajuan maksimal tersebut, sehingga meningkatkan K m.

 

non kompetitif 

nhibitor non-kompetiti dapat mengikat enzim pada saat !ang sama

substrat berikatan dengan enzim. *aik kompleks E dan E tidak

akti. Karena inhibitor tidak dapat dilaan dengan peningkatankonsentrasi substrat, ma/ reaksi berubah. &amun, karena substrat

masih dapat mengikat enzim, Km tetaplah sama.d. Menentukan akti0itas suatu enzim

a!ab :

'kti$itas enzim disebut juga sebagai kinetik enzim. Kinetik enzim adalah

kemampuan enzim dalam membantu reaksi kimia. Kemampuan enzim ini dapat

dihitung dengan mengukur jumlah produk yang terbentuk, atau dengan menghitung

kurangnya substrat dalam satuan aktu tertentu. elain itu, dapat juga dihitung

dengan peningkatan atau penurunan koenzim. Menghitung jumlah substrat, produk,

atau koenzim di laboratorium tidak mudah karena jumlahnya yang sangat sedikit.

leh karena itu, praktikmenghitung akti$itas enzim adalah dengan mengukur

 perubahan absorbans dalam satuan aktu, pH, dan suhu tertentu seaktu reaksi

 berjalan. 'kti$itas enzim dipengaruhi oleh beberapa faktor, yaitu suhu, pH, kadar

substrat, kadar enzim, inhibitor, dan toksik enzim.e. Menentukan akti0itas spesik suatu enzim

'kti0itas spesik !aitu besarn!a akti0itas enzim per jumlah protein !ang

terkandung dalam "ampuran enzim !ang diuji.. Menentukan baha beberapa enzim merupakan isozim

isoenzim adalah dua atau lebih enzim yang berbeda tetapi memiliki gugus fungsi

yang sama sehingga dapat mengkatalis reaksi atau substrat yang sama.

2. Mungkinkah

a. uatu lipase adalah h!drolase Jawab: mungkin, karena 3riasil 4liserol #idrolase atau lipase merupakan

suatu asil hidrolase !ang bersiat dapat larut dengan baik dalam air.b. uatu papain adalah protease

 Jawab : mungkin, karena Enzim 5apain merupakan enzim protease !ang

terkandung dalam getah papa!a, baik dalam buah, batang maupun

daunn!a.

". uatu larutan ' kadar protein!a han!a 1+16 larutan *, tetapi akti0itas

enzimatikn!a 16/ larutan * Jawab :Mungkin, tegantung ban!akn!a Konsentrasi substrat atau enzim !ang

berada dalam larutan *. elain itu, kondisi lingkungan seperti suhu, p#,

kehadiran inhibitor, dll turut mempengaruhi akti0itas enzim larutan *. 

7. 'pa bedan!a 8eaksi enzimatik dan reaksi non enzimatik

7/17/2019 tugas soal biokim.docx

http://slidepdf.com/reader/full/tugas-soal-biokimdocx 4/6

 Jawab :

"eaksi en#imatik 

Metabolisme disebut juga reaksi enzimatis karena metabolisme terjadi selalu menggunakan

enzim, enzim merupakan biokatalisator metabolisme. #nzim hanya dapat bekerja dengan baik

 pada kisaran suhu dan ph tertentu. #nzim tidak menentukan arah reaksi, tetapi hanyamempercepat laju reaksi, sehingga mencapai keseimbangan.

"eaksi Non$en#im

• ambat

• Membutuhkan suhu yang tinggi

• /ekanan yang tinggi

0. +agaimana langkah-langkah yang harus ditempuh untuk 

a. menentukan akti$itas suatu enzim secara kolorimetri1

 Jawab :5enentuan se"ara kalorimetri pada enzim kitinase5enentuan se"ara kalorimetri didasarkan pada pelepasan produk hasil

degradasi koloidal kitin berupa &-asetil-%-glukosamin ke dalam

supernatant dengan menggunakan metode 8eissig. 5roduk tersebut

dikomplekskan dengan reagen tertentu seperti p-dimetilamino-

benzaldehid atau reagen asam dinitrosalisilat menghasilkan serapan pada

panjang gelombang 976 nm. ubstrat lain !ang bisa digunakan pada

metode ini adalah kitin azure, !aitu kitin !ang direaksikan dengan

sen!aa 8emasol *rillian iolet 98 dan serapam !ang dihasilkan dapat

diukur pada panjang gelombang 76 nm. ntuk menentukan konsentrasi

produk digunakan &-asetil-%-glukosamin sebagai standar.;pektrootometer 'ssa!

Metode ini dapat ditentukan dengan menggunakan sen!aa kromogen

seperti 7-nitroenil-<-%-&-&=-diasetilkitobiosa dan 7-nitroenil-<-%-&-&=-&==-

triasetilkitobiosa !ang disiapkan dalam larutan stok dimetil suloksida

(%M>) dan ditentukan serapan pada panjang gelombang 716 nm.

 b. mendapatkan struktur tiga dimensi suatu protein1

angkah-langkah untuk menentukan struktur 2 dimensi yaitu pada struktur 2 dimensi

terdapat 3 struktur protein antara lain 4

5. struktur primer,

truktur primer adalah rantai polipeptida. truktur primer protein di tentukan oleh

ikatan ko$alen antara residuasam amino yang berurutan yang membentuk ikatan peptida.

6. truktur sekunder 

truktur sekunder ditentukan oleh bentukrantai asam amino 4 lurus, lipatan, atau

gulungan yang mempengaruhi sifat dan kemungkinan

 jumlah protein yang dapat dibentuk. truktur ini terjadi karena ikatan hydrogen an

tara atom dari guguskarbonil ! &7" dengan atom H dari gugus amino ! 8-H "

dalam satu rantai peptida.

2. truktur tersier

truktur tersierditentukan oleh ikatan tambahan antara gugus 9 pada asam-asam

amino yang memberi bentuk tigadimensi sehingga membentuk struktur kompakdan padat suatu protein.

7/17/2019 tugas soal biokim.docx

http://slidepdf.com/reader/full/tugas-soal-biokimdocx 5/6

3. truktur kuartener.

truktur kuartener adalahsusunan kompleks yang terdiri dari dua rantai

 polipeptida atau lebih, yang setiap rantainya bersamadengan struktur primer,

sekunder, tersier membentuk satu molekul protein yang besar dan aktif

secara biologis.

:. %engan penjelasan yang bagaimana( mengapa4

a. Kadangkala enzim tak langsung dibentuk tetapi dalam bentuk proenzim dulu

5roenzim atau zimogen merupakan enzim !ang diproduksi dalam

bentuk inakti. 'da dua tujuan utama pembentukkan proenzim ini

!aitu untuk melindungi tubuh dari proses autodigesti serta mela!ani

kebutuhan enzim tertentu dengan "epat b. )emotongan sebagian pro-enzim( zimogen, justru mengakti$kan enzim ybs

*eberapa protein di sintesis dan di sekresikan dalam bentuk

prekursor tidak akti !ang disebut proprotein. 5roprotein enzim

disebut proenzim + z!mogen. 5roteolisis selekti terhadp suatuproenzim+z!mogen melalui pemotongan bertahap akan membentuk

enzim !ang akti. 5emotongan spesik men!ebabkan perubahan

konormasi !ang men!ingkap sisi akti enzim. Mekanisme

pengaturan ini dapat dilakukan diluar sel karena tidak memerlukan

'35 untuk mengubah z!mogen menjadi sisi akti, karena mekanisme

ini bersiat iire0ersible, maka diperlukan mekanisme lain unt uk

menginaktikan enzim. 5rotease diaktikan dengan protein inhibittor

!ang mengikat se"ara kuat sisi akti.c. #nzim dapat mempercepat perubahan substrat menjadi produk 

Enzim bekerja dengan mengikat reaktan (substrat) !angmen!ebabkan berada pada posisi (orientasi) !ang diinginkandengan energi !ang lebih rendah dari energi akti0asin!a. isi aktienzim (active site) adalah bagian dari molekul enzim tempatberikatann!a substrat, untuk membentuk kompleks enzim substrat,dan selanjutn!a membentuk produk akhir. isi akti suatu enzimberbentuk tiga dimensi, sering berupa lekukan pada permukaanprotein enzim, tempat substrat berikatan se"ara lemah.

ubstrat berikatan dengan sisi akti suatu enzim melalui

beberapa bentuk ikatan kimia !ang lemah (misaln!a interaksi

elektrostatik, ikatan hidrogen, ikatan 0an der ?aals dan interaksihidroobik). etelah berikatan dengan bagian sisi akti enzim,

substrat bersama-sama enzim kemudian membentuk suatu

kompleks enzim-substrat, selanjutn!a terjadi proses katalisis oleh

enzim untuk membentuk produk. Ketika produk sudah terbentuk

enzim menjadi bebas kembali untuk selanjutn!a bereaksi kembali

dengan substrat

;. )ertanyaan 4

a. Jelaskan beberapa penyakit karena defisiensi(kerusakan enzim, dan enzim apa yang

rusak a!ab :

7/17/2019 tugas soal biokim.docx

http://slidepdf.com/reader/full/tugas-soal-biokimdocx 6/6

)enyakit yang disebabkan karena defisiensi(kerusakan enzim adalah 4

5. )orfiria !)orphyrias" adalah sekelompok penyakit yang disebabkan oleh

kekurangan enzim-enzim yang terlibat dalam sintesa heme. Heme adalah

senyaa kimia yang membaa oksigen dan memberi arna merah kepada

darah. Heme merupakan komponen utama dari hemoprotein !suatu jenis

 perotein yang terdapat dalam semua jaringan".6. )orfiria Kutanea /arda !)orphyria &utanea /arda" merupakan bentuk porfiria

yang paling sering ditemukan, yang menyebabkan timbulnya lepuhan-lepuhan

 pada kulit yang terpapar sinar matahari.

 Penyebabnya adalah :

)enyakit ini merupakan suatu porfiria hepatik, terjadi bila uroporfirinogen

dekarboksilase !salah satu enzim di hati yang penting untuk pembentukan

heme", menjadi tidak aktif.

2. )orfiria *ntermiten 'kut !'cute *ntermittent )orphyria" merupakan porfiria

akut yang paling sering ditemukan, yang menyebabkan gejala-gejala

neurologis !gejala-gejala saraf".)enyakit ini disebabkan oleh kekurangan enzim porfobilinogen deaminase,

yang juga dikenal sebagai enzim hidroksimetilbilane sintase.

Kekurangan enzim ini diariskan dari salah satu orangtua, tetapi sebagian

 besar dari mereka yang mearisi kelainan ini tidak pernah menunjukkan

gejala-gejala

 b. jelaskan kegunaan inhibitor enzim dalam pengobatan

a!ab :

inhibitor menghambat fungsi enzim, inhibitor sering digunakan sebagai obat.

&ontohnya adalah inhibitor yang digunakan sebagai obat aspirin. 'spirin

menginhibisi enzim &<-5dan &<-6 yang memproduksi pembaa pesan peradangan prostaglandin, sehingga ia dapat menekan peradangan dan rasa sakit.

 8amun, banyak pula inhibitor enzim lainnya yang beracun. ebagai

contohnya, sianida yang merupakan inhibitor enzim ire$ersibel, akan bergabung

dengan tembaga dan besi pada tapak aktif enzim sitokrom c-oksidase dan

memblok  pernafasan sel

c. jelaskan suatu contoh pengukuran enzim untuk diagnosisa!ab :

Faktor-faktor yang mempengaruhi. uji enzim dalam diagnosis adalah 4

- %istribusi enzim dalam jaringan

- okasi intraseluler 

- )elepasan enzim dari jaringan yang rusak - )erubahan-perubahan permeabilitas membran

- Klearens enzim dari serum

- ama menghilangnya akti$itas ensim dalam serum

- )ola seri enzim serum