PRINSIP DAN APLIKASI OUTBREEDING...Mengurangi resiko penurunan variabilitas genetik Efek genetik out...

24
PRINSIP DAN APLIKASI OUTBREEDING Resume : Efek Genetik Out breeding dan heterosis Jenis dan Manfaat Outbreeding Manfaat OB: 1. adanya gen-gen komplementer antar populasi/breed Contoh Breed Jantan : Sifat A Breed Betina: Sifat B ----------- Breed BARU 2. Efek heterosis 3. Instrumen (tools) peningkatan kualitas genetik Jenis OB: 1. Out Breed: 1 bangsa , beda lokasi asal 2. Outcross/ cross breed: persilangan antar bangsa

Transcript of PRINSIP DAN APLIKASI OUTBREEDING...Mengurangi resiko penurunan variabilitas genetik Efek genetik out...

  • PRINSIP DAN APLIKASI OUTBREEDING

    Resume :

    • Efek Genetik Out breeding dan heterosis

    • Jenis dan Manfaat Outbreeding

    Manfaat OB:1. adanya gen-gen komplementer antar populasi/breed

    Contoh Breed Jantan : Sifat A

    Breed Betina: Sifat B ----------- Breed BARU

    2. Efek heterosis

    3. Instrumen (tools) peningkatan kualitas genetik

    Jenis OB: 1. Out Breed: 1 bangsa , beda lokasi asal

    2. Outcross/ cross breed: persilangan antar bangsa

  • 2

    Outbreeding Systems• Outbreeding (or outcrossing) Is the mating of individuals

    whose relationship is less than the average relationship in the herd or population.

    • The effects of outbreeding are the opposite of those for inbreeding:

    - Increase of genetic variance

    - Possibility to obtain hybrid vigor (heterosis)

    • As a mating strategey, outbreeding more commonly refers to crossbreeding or linecrossing:

    1. Crossbreeding: mating of sires of one breed or a combination of breeds with dams from another breed or combination of breeds

    2. Linecrossing: mating of sires of one line or a combination of lines with dams from another line or combination of lines

  • 3

    Crossbreeding

    • In crossbreeding we look for “breed complementarity”

    each breed is good for traits or characteristics

    different from the other breed

    • Maternal breed: excellent in maternal traits (fertility,

    mothering ability, milk production, etc)

    • Paternal breed: excellent in paternal traits (growth rate,

    meat quality and carcass yield)

    • Breed complementarity is achieved in “terminal sire

    crossbreeding” systems in which maternal breed

    females are mated to paternal-breed males to produce

    progeny desired from market standpoint.

  • 4

    • The main objective of crossbreeding is to obtain

    hybrid vigor or heterosis.

    • Hybrid vigor (HV): an increase in the performance

    of crossbred progeny over purebred progeny in traits

    affected by non-additive factors (dominance,

    overdominance and epistasis). It is an increase in

    gene combination value (GCV) that results from the

    increase in heterozygous genotypes due to

    crossbreeding.

    • Traits which generally show hybrid vigor in

    crossbreeding are the same traits which show

    inbreeding depression like fertility and survival traits.

  • MODAL YANG DIPERLUKAN “BREED MURNI”

    No Kelebihan Kekurangan

    1. Adaptasi kondisi lokal bagus

    (klimat, sosek)

    Rigiditas thd kondisi perubahan

    permintaan pasar (ekonomi(

    2. Homosigositas populasi dan

    kesederhanaan manajemen

    (tingkah laku, morfologi,

    produksi) memeudahkan

    manajemen

    Efektifitas seleksi rendah (untuk

    sifat dg h2 rendah)

    3. Organisasi peternakan lebih

    mudah( identifikasi breed,

    kelompok peternak)

    Kesulitan dalam seleksi simultan

    untk. Bbrp sifat selakigus (untuk

    sifat genetik berlawanan (mis

    repro vs. prod.)

    4. Program genetik “irreversible” Resiko menurunkan variabilitas

    genetik ( krn seleksi atau pd

    populasi kecil)

  • RANGKUMAN : STRATEGI OUT

    BREEDINGBreed eksotik unggul

    Breed silang („F1( ?

    Proporsi

    darah100 % eksotik

    (gradding up)

    < 100 %

    H efek

    (HE) ?

    Tidak ada

    HE

    Pool gens

    Breed sintetis/industri

    Ada HE

    Prod. F1

    Ada HE Seleksi pd F1

    Interkasi G+ E

    Bagus ?

  • MACAM-MACAM OUT BREEDING

    I. Tujuan Genetik:

    a. Menghasilkan Breed Baru

    Breed A X Breed B

    F1 X F1

    F2 X F2

    Fn

    Fn : Disebut breed baru:

    • Ciri spesifik baru

    • Tingkat homoginitas

    tertentu

    b. Perbaikan Genetik

    Introduksi gen unggul pejantan

    pada betina

    Pejantan A X Induk

    Fn

    c. Gradding Up:

    A X B

    AB X B

    ABB X B

    “ + Breed B”

    Waktu: perlu 4 – 5 Generasi: + 93.75-

    96.85 %.

    Sapi : 25 – 30 thn; Kb/Db; 20 thn

    Babi: 10 th.

  • II. Tujuan Komersial

    a. Persilangan Industri / terminal

    A X B

    F1 ------- potong

    Gabungan: A sifar repro/prod

    B sifat daging/susu/pert.

    Kelebihan:

    • Komplementer dr 2 breed

    • Fenomena H efek: repro+ pertbh.

    Kekurangan:

    • Sulit pemilihan breed tetua:adaptasi

    • Teknis pelaksanaan ( dg IB)

    • Pemanfaatan F1 kurang untuk bibit

    • Replecement betina, perlu

    memelihara breed murni

    b. Persilangan dua tingkat

    A X B

    AB X A/B/C/D

    F2 ( dipotong)

    Kelebihan:

    • 2 Kali gen komplementaire (F1, F2)

    • 2 Sumber H efek komulatif

    Kekurangan:

    • Persilangan kpmpleks

    • Perlu breed murni banyak/org. peternak

    c. Persilangan alternatif

    A X B

    AB x A

    AAB X B

    AABB X A dst.

    Kelebihan: Tujuan doubel, kombinasi gen

    Kekurangan : tak bisa untuk bibitpotong

  • Praktek Cross breeding

    1. Back Cross:

    A X B

    F1:AB X A/B

    F2

    2. Criss Cross:

    A X B

    F1 X A

    F2 X B

    F3

    3. Rotasi:

    A X B

    F1 X Breed X

    F2 X Breed Y

    F3 x Breed Z

    Catatan: F1 dengan pejantan breed murni

    scr. bergilirasn

    4.I nterbreeding:

    A X B

    F1 X F1

    F2 X F2

    Fn

    Catatan: disertasi program seleksi ketat

    Catatan Umum Cross Breeding:

    1. Perkawinan dr. bangsa

    berbeda

    2. Menggunakan breed murni

  • 10

    Terminal Sire Crossbreeding

    Sire breed x Dam breed

    A B

    AB

    (Crossbred progeny)

    All progeny including females are

    sold in the market for slaughter

  • 11

    Composite (Synthetic) breeds• A composite or synthetic breed is a breed made

    up of various proportions of two or more breeds

    designed to benefit from hybrid vigor.

    A X B

    AB X C

    ABC X ABC

    Breed of various proportions of A, B, and C

  • 12

    Foreign breed x Local breed

    F L

    F X 1/2F 1/2L

    F X 3/4F 1/4L

    F X 7/8F 1/8L

    15/16F 1/16L

    • Is the mating of males of high genetic merit with females of low genetic merit from the same breed or from a different breed.

    • Mainly used to upgrade local females with males from foreign breeds.

    • The hybrid females resulting from the cross are mated back to purebred males from the foreign breed.

    Grading

    up

  • Unit 4, Lesson 15 - Systems of

    Breeding

    13

    Grading UpTaylo

    r, R

    obert

    E.,

    Scie

    ntific F

    arm

    Anim

    al P

    roduction,

    4th

    ed.

    Why would we want to use grading up?

    In order to make a commercial cow herd a purebred cow herd. Once

    an offspring has 7/8 or 15/16 of the genetic make up of the desired

    breed, it is considered a purebred.

    This would take several generations of breeding up, but may be

    profitable when purebred females of high quality are very expensive.

  • 14

    Crossbreeding

    Why would we want to use

    crossbreeding?

    By crossing breeds the strengths

    and weakness of each breed will

    compliment one another.

    Also increases heterosis, which

    increases the productivity of the

    crossbred offspring above the

    average of breeds that are

    crossed.

    Outcrossing/ Out

    Breed

    Why would we want to

    use outcrossing?

    Unrelated animals of

    the same breed are

    mated.

    In order not to inbreed, but

    have animals maintain

    characteristics of the

    breed.

    Example – Unrelated

    animals of the same

    breed are mated.

  • BAGAIMANA PRAKTEK PERSILANGAN ANTAR SPESIES

    No. Persilangan Fertilitas Keunggulan F1

    Jantan Betina

    1. BantengX Zebu - + Laju pertumbuhan

    2. Keledai Xkuda - + Kerja + ketahanan

    3. Sapi x Yak - - BB/Power/Susu

    4. Bos taurusxB. Indicus + + Daging

    5. Entog X Itik ? ? Daging ?/pertb.

    Catatan:

    •Bukan penghasil bibit

    •Secara teknis memungkinkan, tetapi

    •Tujuan utama bukan genetik .

    Species CrossWhy would we want to do a species

    cross?

    If your desired outcome

    will merit a species cross

    Example – Horse bred to

    a

    donkey to get a mule.

  • EFEK GENETIK OUTBREEDING

    DAN HETEROSIS (Hybrid Vigor)

    Pertimbangan pemilihan sistim perkawinan:1. Tujuan peningkatan kualitas genetik

    2. Karakteristik lingkungan

    3. Potensi dan kemampuan manajemen

    4. ekonomis

    Contoh Implementasi:

    1. Kualitas Genetik-LingkunganSapi-sapi di uji performans di stasiun riset (di Eropa, FH),

    saat diuji sebarluaskan di lapang

    kondisi riil, mis . Di afrika, berubah performans

    Di kenal breed Taurin …. Kecil sekali, genetik sama dengan FH

    2. Ekonomis-Manajemen

    Sapi FH Di Valley Chinois (California) dan di Sharon (Israel), Emirat Arab:

    Produksi sapi perah : 8500 l/laktasi

    Bnadingkan dengan di Indonesia : 4500 l/laktasi

  • Out breeding, untuk mengatasi permasalahan2 seleksi:

    1. Perubahan ekonomi (jenis permintaan produk yang selalu berubah)

    2. Jika h2 rendah efektifitas seleksi rendah

    3. Beberapa sifat sekaligus

    4. Mengurangi resiko penurunan variabilitas genetik

    Efek genetik out breeding

    Efek Genetik Umum:1. Meningkatkan heterosigositas dan menurunkan efek inbreeding

    2. Memanfaatkan heterosigositas

    3. Mengkombinasikan sifat-sifat baik antar breed

    4. Menghasilkan kemajuan genetik secara cepat dalam 1 – 2 generasi

    (tidak mungkin dilakukan dengan seleksi)

  • EFEK Genetik Spesifik:

    1. Out Breed (silang Luar) : 1 bangsa beda lokasi asal

    Kapan dilakukan?:Jika permintaan pasar (preferensi) berubah

    mis ; 2006- 2008: daging dg kadar lemak rendah

    Standart seleksi, tidak realistis lagi

    mis: 1980 ( prod 4500 liter); 2008 (10.000 liter)

    Kondisi ?:Dilakukan, bila dikehendaki perubahan-perubahan drastis

    (digunakan pada kelompok ternak bibit)

    Penekanan pada sifat-sifat produksi yang ekonomis

    Pada sifat dg h2 (sedang-tinggi)

    (h2 tinggi, berkorelasi tinggi dengan fenotip),

    sehingga cukup diseleksi pada fenotip indv.

  • EFEK Genetik Spesifik:

    Out Cross (silang Luar) : antar bangsa

    Tujuan Umum:Meningkatkan produktifitas secara maksimal

    Pada peternakan komersial

    (heterosis efek dan peningkatan frek. Gen yang dikehendaki)

    Aspek Genetik:1. Menyilangkan antar bangsa cenderung untuk menutupi

    gen-gen resesif

    2. Meningkatkan heterosigositas

    3. Produk pada F1,(efek heterosis)

    4.pada sifat2 terkena tekanan silang dalam, pada breed murni)

  • HETEROSIS EFEK (Hybrid vigor)Performans hasil silangan melampui rata-rata tetua

    Tinggi rendahnya EFEK HEHETOSIS diukur dengan Koefisien heterosis

    (P persilangan –P rerata tetua)

    % H = --------------------------------

    P rerata tetua

    Contoh: Persilangan Sapi Madura dengan Limousin

    Misal ADG: Sapi Madura ( 0.4 kg)

    ADG Sapi Limosin ( 0.8 kg)

    ADG hasil silangan (F1) = 0.7 kg

    Maka:

    Rerata ADG tetua = 0.6

    Jadi koefisien heterosis =

    0.7 – 0.6

    % H = -------------- x 100 % = 16 %

    0.6

  • 21

    Measuring Hybrid vigor

    %100% 1 XP

    PPHV

    P

    PF

    Average performance of

    crossbred offspring

    Average performance of parental

    breeds (or lines)

    HV can be expressed in % basis:

    PF PPHV 1

    • Example : Crossbreeding between two dairy breeds:

    • Average milk production per year of breed A is 8000 kg

    • Average milk production per year of breed B is 6000 kg

    • Average of crossbred cows is 7400 kg.

    • Calculate the resulting hybrid vigor on percentage basis.

    %7.5%1007000

    70007400%

    XHV

  • BAGAIMANA PENGARUH LINGKUNGAN

    THD HETEROSIS (hasil persilangan)?????

    Jelek Baik

    Performans lokal

    lokal

    Impor

    Rerata

    tetua

    F1, silang

    HET

    AD

    EF

    HET: Heterosis. ADEF: Additive Effect

    impor

    Lokal

    Rerata

    tetua

    F1, silangHET

    AD

    EF

  • Hubungan antara H dan h2

    Reproduksi Pertumbuhan Karkas

    1. h2 (heritabilitas) Jelek (0.0 –

    0.15)

    Sedang (0,2 –

    0.4)

    Tinggi (0.5 –

    0.70)

    Progres genetik

    (seleksi)

    Rendah Sedang Tinggi

    2. H (efek heterosis) Tinggi ( 10 –

    20 %)

    Sedang ( 5 – 8

    %)

    0 %

    Perbaikan genetik

    (persilangan)

    Tinggi Sedang 0

    Catatan:

    1. Progress genetik =h2 x DS

    2. Pada babi banyak dilakukan persilangan,

    meningkatkan litter size ?, kenapa

  • ESTIMASI PENYEBAB HETEROSIS

    1. Dominansi:

    ternak2 breed murni tidak seleuruhnya homosigot pada seluruh lokus

    dengan persilangan akan terjadi pengurangan proporsi

    lokus gen homosigot resesif

    2. Over dominansi

    Nilai heterosigot melampui nilai pasdangan gen-gen homosigotik

    (pada sifat yg dipengaruhi oleh gen di banyak lokus)

    3. Epistasi:

    Interaksi gen dari kombinasi baru gen-gen dari lokus yang berbeda

    Secara Ringkas:

    % H = Σ dom (P F1 – P rerata tetua) 2,

    Dimana: dom adalah faktor-faktor dominan