Merintis Kolaborasi Global dengan HPC@LIPI

24
Merintis Kolaborasi Global dengan HPC@LIPI Taufiq Wirahman P2 Informatika, LIPI 10 Juni 2015 Jakarta Taufiq Wirahman (P2 Informatika, LIPI) Merintis Kolaborasi Global dengan HPC@LIPI 10 Juni 2015 Jakarta 1 / 24

Transcript of Merintis Kolaborasi Global dengan HPC@LIPI

Page 1: Merintis Kolaborasi Global dengan HPC@LIPI

Merintis Kolaborasi Global dengan HPC@LIPI

Taufiq Wirahman

P2 Informatika, LIPI

10 Juni 2015Jakarta

Taufiq Wirahman (P2 Informatika, LIPI) Merintis Kolaborasi Global dengan HPC@LIPI 10 Juni 2015 Jakarta 1 / 24

Page 2: Merintis Kolaborasi Global dengan HPC@LIPI

Outline

1 PendahuluanScientific ComputingHPC

2 KolaborasiSasaranDetil Kolaborasi

Koneksi Grid-LIPI pada Grid-ALICEImplementasi GPGPU untuk Space Charge Calculation

3 FasilitasHardwareSoftwarePendaftaran User

4 Profil PenggunaanPenggunaJobs

5 PenutupKontak

Taufiq Wirahman (P2 Informatika, LIPI) Merintis Kolaborasi Global dengan HPC@LIPI 10 Juni 2015 Jakarta 2 / 24

Page 3: Merintis Kolaborasi Global dengan HPC@LIPI

Komputasi

Komputasi sains

Penyusunan model matematika dan teknik penyelesaian numerik sertapenggunaan komputer untuk menganalisis dan memecahkanmasalah-masalah sains

Biasanya berupa penerapan simulasi komputer atau berbagai bentukkomputasi lainnya untuk menyelesaikan masalah-masalah dalamberbagai bidang keilmuan

Dalam perkembangannya digunakan juga untuk menemukanprinsip-prinsip baru yang mendasar dalam sains

Taufiq Wirahman (P2 Informatika, LIPI) Merintis Kolaborasi Global dengan HPC@LIPI 10 Juni 2015 Jakarta 3 / 24

Page 4: Merintis Kolaborasi Global dengan HPC@LIPI

Apakah HPC itu?

”HPC is when I care how fast I get an answer” (Kohlmeyer, ICTP)

High Performance Computing dapat dikerjakan di:

Workstation, desktop, laptop, smartphoneSupercomputerLinux/MacOS/Windows ClusterGrid atau CloudCyberinfrastructure = kombinasi dari beberapa perangkat di atas

HPC dapat juga dikatakan sebagai High Productivity Computing

Taufiq Wirahman (P2 Informatika, LIPI) Merintis Kolaborasi Global dengan HPC@LIPI 10 Juni 2015 Jakarta 4 / 24

Page 5: Merintis Kolaborasi Global dengan HPC@LIPI

Mengapa HPC?

Scientific computing menjadi bagian terpenting dalam berbagaidisiplin ilmu

Permasalahan yang ada semakin kompleks, diperlukan tim penelitidengan keahlian yang beragam, termasuk ahli dalam pemrogramanparalel dan operasional klaster

Tuntutan peningkatan performansi kerja suatu sistem dalam waktucepat dengan hasil optimal

Taufiq Wirahman (P2 Informatika, LIPI) Merintis Kolaborasi Global dengan HPC@LIPI 10 Juni 2015 Jakarta 5 / 24

Page 6: Merintis Kolaborasi Global dengan HPC@LIPI

Kolaborasi LIPI-ALICE CERN

Milestones

October 2013: MoU ALICE-LIPI, sebagai associate member

August - October 2014: Kunjungan ke CERN, LIPI tergabung keALICE Grid

November 2014: LIPI diterima sebagai Full member

February - April 2015: Kunjungan ke Universitas Heidelberg sebagaisalah satu kolaborator

Taufiq Wirahman (P2 Informatika, LIPI) Merintis Kolaborasi Global dengan HPC@LIPI 10 Juni 2015 Jakarta 6 / 24

Page 7: Merintis Kolaborasi Global dengan HPC@LIPI

Sasaran KolaborasiPenguasaan Iptek

Keterlibatan LIPI dalam riset fundamental (fisika) dan terapan(informatika) pada tingkat di garis terdepan.

CERN merupakan pusat penelitian terdepan di riset sainsfundamental.

Penemuan Boson Higgs tahun 2012: 4000 lebih sitasi dalam 3 tahun,hadiah Nobel untuk Peter Higgs tahun 2013.

CERN merupakan salah satu pusat pengembangan, pengkajian, danpenerapan teknologi komputasi kinerja tinggi.

Laju penerimaan data rata-rata 6 GiB/detik, puncak 10 GiB/detik.Kapasitas penyimpanan data keseluruhan 140 PiB.Kapasitas CPU keseluruhan 250 000 lebih.Fasilitas komputasi terdistribusi di lebih dari 50 negara, termasukIndonesia.

Taufiq Wirahman (P2 Informatika, LIPI) Merintis Kolaborasi Global dengan HPC@LIPI 10 Juni 2015 Jakarta 7 / 24

Page 8: Merintis Kolaborasi Global dengan HPC@LIPI

Sasaran KolaborasiPeningkatan kelembagaan dan pelaksanaan penelitian iptek

Membawa LIPI ke gelanggang kerjasama multidisiplin, multilembaga,multinasional (3M).

Semakin banyak topik-topik dalam iptek memerlukan kerjasama 3M:Analisis genetika keanekaragaman hayati, kajian perubahan iklim,mitigasi bencana alam, perilaku sosial budaya masyarakat.

Memperkenalkan masyarakat iptek Indonesia pada budaya danmanajemen pelaksanaan penelitian iptek 3M.

Membuka ruang dan kesempatan untuk membangun jejaring iptekdengan memanfaatkan jejaring 3M yang telah ada di kolaborasi.

LIPI telah aktif menjalin kerjasama dengan beberapa universitas danlembaga penelitian lain sesama anggota kolaborasi, dan mendapatpeluang untuK S3 maupun kunjungan penelitian.

Taufiq Wirahman (P2 Informatika, LIPI) Merintis Kolaborasi Global dengan HPC@LIPI 10 Juni 2015 Jakarta 8 / 24

Page 9: Merintis Kolaborasi Global dengan HPC@LIPI

Kolaborasi LIPI - ALICE CERN (Sisi Komputasi)

Proyek O2

ALICE-GridNetwork SimulationCollaborative Software Engineering

Pengembangan Software untuk Detektor TPC

Koreksi Waktu Nyata Distorsi Space-ChargePengenalan Jejak Heliks pada TPC untuk Kompresi Data

Taufiq Wirahman (P2 Informatika, LIPI) Merintis Kolaborasi Global dengan HPC@LIPI 10 Juni 2015 Jakarta 9 / 24

Page 10: Merintis Kolaborasi Global dengan HPC@LIPI

ALICE Grid

Produksi Data ALICE dalam Order Petabyte (1015).

Sumber daya komputasi besar untuk analisis fisika.

Beban komputasi terbagi.

Taufiq Wirahman (P2 Informatika, LIPI) Merintis Kolaborasi Global dengan HPC@LIPI 10 Juni 2015 Jakarta 10 / 24

Page 11: Merintis Kolaborasi Global dengan HPC@LIPI

Koreksi Distorsi Space Charge

Implementasi GPGPU untuk Space Charge Calculation

Kolabolator

Pusat Penelitian Informatika - LIPI & Universitas Heidelberg, Jermandalam kolaborasi ALICE-CERN

Pendekatan

Eksplotasi Multigrid untuk Perhitungan Space Charge

Development and Testing Site

LIPI memiliki Cluster GPU digunakan untuk Pengembangan

Aplikasi akan dijalankan di Cluster GPU yang dimiliki sistemO2-ALICE CERN

Taufiq Wirahman (P2 Informatika, LIPI) Merintis Kolaborasi Global dengan HPC@LIPI 10 Juni 2015 Jakarta 11 / 24

Page 12: Merintis Kolaborasi Global dengan HPC@LIPI

Spesifikasi

Master Node

Prosesor: 2x8 core E5 Family

Memori : 128 GB

Storage : 24 TB raw

General Node

Prosesor: 2x4 core E5 Family

Memori : 8 GB

Storage : 500 GB

GPGPU Node

Seperti general node

GPGPU card: Tesla M2075 (448 core)

Taufiq Wirahman (P2 Informatika, LIPI) Merintis Kolaborasi Global dengan HPC@LIPI 10 Juni 2015 Jakarta 12 / 24

Page 13: Merintis Kolaborasi Global dengan HPC@LIPI

Lokasi

Node Bandung Cibinong Total

Master Node 2 2 4General computing node 34 80 114GPGPU Computing node 4 16 20High Memory Node - 8 8Storage - 30 TB 90 TB (+80 TB raw)

60 TB

Taufiq Wirahman (P2 Informatika, LIPI) Merintis Kolaborasi Global dengan HPC@LIPI 10 Juni 2015 Jakarta 13 / 24

Page 14: Merintis Kolaborasi Global dengan HPC@LIPI

Upgrade

Computing node (8)

High memory node2x8 core, 256 GB memory

Storage (2)

30 TB (usable) untuk public cluster60 TB (usable) untuk T2 ALICE

Network

Dedicated Network untuk HPC100 Mbps

Taufiq Wirahman (P2 Informatika, LIPI) Merintis Kolaborasi Global dengan HPC@LIPI 10 Juni 2015 Jakarta 14 / 24

Page 15: Merintis Kolaborasi Global dengan HPC@LIPI

Software

General

Linux based cluster (CentOS, Scientific Linux)

Open source software

Job management: PBS/TorqueScheduler: MauiMonitoring: Ganglia, NagiosAplikasi: Free/Open Source

Khusus

Software berbayar: disediakan pengguna

Kebutuhan khusus lainnya

Taufiq Wirahman (P2 Informatika, LIPI) Merintis Kolaborasi Global dengan HPC@LIPI 10 Juni 2015 Jakarta 15 / 24

Page 16: Merintis Kolaborasi Global dengan HPC@LIPI

SOP Pemakaian

Taufiq Wirahman (P2 Informatika, LIPI) Merintis Kolaborasi Global dengan HPC@LIPI 10 Juni 2015 Jakarta 16 / 24

Page 17: Merintis Kolaborasi Global dengan HPC@LIPI

Profil Pengguna

Pengguna berdasar institusi Pengguna berdasar keilmuan

Taufiq Wirahman (P2 Informatika, LIPI) Merintis Kolaborasi Global dengan HPC@LIPI 10 Juni 2015 Jakarta 17 / 24

Page 18: Merintis Kolaborasi Global dengan HPC@LIPI

Statistik

Taufiq Wirahman (P2 Informatika, LIPI) Merintis Kolaborasi Global dengan HPC@LIPI 10 Juni 2015 Jakarta 18 / 24

Page 19: Merintis Kolaborasi Global dengan HPC@LIPI

Statistik

Taufiq Wirahman (P2 Informatika, LIPI) Merintis Kolaborasi Global dengan HPC@LIPI 10 Juni 2015 Jakarta 19 / 24

Page 20: Merintis Kolaborasi Global dengan HPC@LIPI

Statistik - ALICE CERN

Taufiq Wirahman (P2 Informatika, LIPI) Merintis Kolaborasi Global dengan HPC@LIPI 10 Juni 2015 Jakarta 20 / 24

Page 21: Merintis Kolaborasi Global dengan HPC@LIPI

Statistik - ALICE CERN

Taufiq Wirahman (P2 Informatika, LIPI) Merintis Kolaborasi Global dengan HPC@LIPI 10 Juni 2015 Jakarta 21 / 24

Page 22: Merintis Kolaborasi Global dengan HPC@LIPI

Statistik - ALICE CERN

Taufiq Wirahman (P2 Informatika, LIPI) Merintis Kolaborasi Global dengan HPC@LIPI 10 Juni 2015 Jakarta 22 / 24

Page 23: Merintis Kolaborasi Global dengan HPC@LIPI

Kontak

http://grid.lipi.go.id

[email protected]@mail.lipi.go.id

Taufiq Wirahman (P2 Informatika, LIPI) Merintis Kolaborasi Global dengan HPC@LIPI 10 Juni 2015 Jakarta 23 / 24

Page 24: Merintis Kolaborasi Global dengan HPC@LIPI

Terima Kasih

Taufiq Wirahman (P2 Informatika, LIPI) Merintis Kolaborasi Global dengan HPC@LIPI 10 Juni 2015 Jakarta 24 / 24