GEN - dharmawangsa.ac.iddharmawangsa.ac.id/public/upload/Ekspresi Gen.pdf · Ekspresi Gen Informasi...
Transcript of GEN - dharmawangsa.ac.iddharmawangsa.ac.id/public/upload/Ekspresi Gen.pdf · Ekspresi Gen Informasi...
![Page 1: GEN - dharmawangsa.ac.iddharmawangsa.ac.id/public/upload/Ekspresi Gen.pdf · Ekspresi Gen Informasi genetik yang terdapat pada struktur DNA diturunkan kepada sel anak melalui proses](https://reader031.fdokumen.com/reader031/viewer/2022013121/5c92d4d709d3f206488b9189/html5/thumbnails/1.jpg)
![Page 2: GEN - dharmawangsa.ac.iddharmawangsa.ac.id/public/upload/Ekspresi Gen.pdf · Ekspresi Gen Informasi genetik yang terdapat pada struktur DNA diturunkan kepada sel anak melalui proses](https://reader031.fdokumen.com/reader031/viewer/2022013121/5c92d4d709d3f206488b9189/html5/thumbnails/2.jpg)
GEN
FenotipKualitatif
FenotipKuantitatif
•Warna tubuh•Bentuk sirip•Bentuk sisik•dll
• Fekunditas• Panjang/berat tubuh• Kandungan lemak• Persentase daging• dll
Ekspresi Gen
![Page 3: GEN - dharmawangsa.ac.iddharmawangsa.ac.id/public/upload/Ekspresi Gen.pdf · Ekspresi Gen Informasi genetik yang terdapat pada struktur DNA diturunkan kepada sel anak melalui proses](https://reader031.fdokumen.com/reader031/viewer/2022013121/5c92d4d709d3f206488b9189/html5/thumbnails/3.jpg)
Informasi genetik yang terdapat pada struktur DNAditurunkan kepada sel anak melalui proses replikasiDNA, dan diekspresikan oleh proses transkripsi DNAmenjadi RNA, yang kemudian dilanjutkan denganproses translasi dimana RNA dikonversi menjadiprotein
Definisi
![Page 4: GEN - dharmawangsa.ac.iddharmawangsa.ac.id/public/upload/Ekspresi Gen.pdf · Ekspresi Gen Informasi genetik yang terdapat pada struktur DNA diturunkan kepada sel anak melalui proses](https://reader031.fdokumen.com/reader031/viewer/2022013121/5c92d4d709d3f206488b9189/html5/thumbnails/4.jpg)
![Page 5: GEN - dharmawangsa.ac.iddharmawangsa.ac.id/public/upload/Ekspresi Gen.pdf · Ekspresi Gen Informasi genetik yang terdapat pada struktur DNA diturunkan kepada sel anak melalui proses](https://reader031.fdokumen.com/reader031/viewer/2022013121/5c92d4d709d3f206488b9189/html5/thumbnails/5.jpg)
Lokasi
![Page 6: GEN - dharmawangsa.ac.iddharmawangsa.ac.id/public/upload/Ekspresi Gen.pdf · Ekspresi Gen Informasi genetik yang terdapat pada struktur DNA diturunkan kepada sel anak melalui proses](https://reader031.fdokumen.com/reader031/viewer/2022013121/5c92d4d709d3f206488b9189/html5/thumbnails/6.jpg)
![Page 7: GEN - dharmawangsa.ac.iddharmawangsa.ac.id/public/upload/Ekspresi Gen.pdf · Ekspresi Gen Informasi genetik yang terdapat pada struktur DNA diturunkan kepada sel anak melalui proses](https://reader031.fdokumen.com/reader031/viewer/2022013121/5c92d4d709d3f206488b9189/html5/thumbnails/7.jpg)
DNA harus dapat menggandakan diri (Replikasi) sebelum
diwariskan Harus sama/tetap antar generasi (basa-basa DNA harus selalu
komplementer; A = T dan G = C) Replikasi berjalan secara antiparalel (ujung 5’ ke ujung 3’) Enzim yang dibutuhkan selama proses replikasi :
(1) Enzim topoisomerase; melonggarkan pilinan danmemperbaiki rotasi DNA heliks ganda(2) Enzim helikase; mengkatalisis untuk membuka DNA heliksganda(3) DNA polimerase; menjalin penambahan basa-basanukleotida dan pemanjangan untai DNA yang komplementerterhadap cetakan DNA
REPLIKASI DNA
![Page 8: GEN - dharmawangsa.ac.iddharmawangsa.ac.id/public/upload/Ekspresi Gen.pdf · Ekspresi Gen Informasi genetik yang terdapat pada struktur DNA diturunkan kepada sel anak melalui proses](https://reader031.fdokumen.com/reader031/viewer/2022013121/5c92d4d709d3f206488b9189/html5/thumbnails/8.jpg)
Pola replikasi DNA terjadi secara semikonservatifyaitu masing-masing untai DNA parental bertindaksebagai cetakan (template)
DNA Parental
![Page 9: GEN - dharmawangsa.ac.iddharmawangsa.ac.id/public/upload/Ekspresi Gen.pdf · Ekspresi Gen Informasi genetik yang terdapat pada struktur DNA diturunkan kepada sel anak melalui proses](https://reader031.fdokumen.com/reader031/viewer/2022013121/5c92d4d709d3f206488b9189/html5/thumbnails/9.jpg)
Primase adalah RNA polimerase yang mensintesis primer RNA pendekyang diperlukan untuk memulai proses replikasi untai.
![Page 10: GEN - dharmawangsa.ac.iddharmawangsa.ac.id/public/upload/Ekspresi Gen.pdf · Ekspresi Gen Informasi genetik yang terdapat pada struktur DNA diturunkan kepada sel anak melalui proses](https://reader031.fdokumen.com/reader031/viewer/2022013121/5c92d4d709d3f206488b9189/html5/thumbnails/10.jpg)
Pola replikasi : Replikasi Semikonservatif = masing-masinguntai DNA pada DNA heliks ganda bertindak sebagaicetakan
![Page 11: GEN - dharmawangsa.ac.iddharmawangsa.ac.id/public/upload/Ekspresi Gen.pdf · Ekspresi Gen Informasi genetik yang terdapat pada struktur DNA diturunkan kepada sel anak melalui proses](https://reader031.fdokumen.com/reader031/viewer/2022013121/5c92d4d709d3f206488b9189/html5/thumbnails/11.jpg)
TRANSKRIPSI DNA
Informasi genetik yang terdapat pada untai DNA baruperlu disintesis dan diterjemahkan menjadi protein yang lebih spesifik untuk proses metabolismeselanjutnya
Transkripsi yaitu proses dimana gen DNA disalinmenjadi kode RNA yang komplementer oleh enzimRNA polimerase
Terjadi di dalam nukleus
![Page 12: GEN - dharmawangsa.ac.iddharmawangsa.ac.id/public/upload/Ekspresi Gen.pdf · Ekspresi Gen Informasi genetik yang terdapat pada struktur DNA diturunkan kepada sel anak melalui proses](https://reader031.fdokumen.com/reader031/viewer/2022013121/5c92d4d709d3f206488b9189/html5/thumbnails/12.jpg)
Inisiasi Transkripsi Pada Promoter Eukariot
1. Titik mulai transkripsi disebut promotor. Promotorlah yang menentukan dimana transkripsi dimulai dan untai mana yang digunakan sebagai cetakan. Selain itu promotor juga berperan sebagai pengikatan RNA Polimerase.
2. Promotor pada Eukariot yaitu sebuah kotak TATA atau TATA BOX, yaitu nukleotida yang mengandung sekuens TATA.
3. Setelah itu barulah RNA Polimerase melekat pada promotor dan memulai inisiasi dengan membuka kedua untai DNA, dan enzim ini mulai mentranskip untai cetakan
Terminasi Transkripsi Saat polimerase sedang melakukan penambahan nukleotida, RNA polimerase mentranskrip sinyal poliadenilasi (AAUAAA) pada pre-mRNA. Menyebabkan RNA polimerase memotong bagian itu dan pre- mRNA terlepas.
![Page 13: GEN - dharmawangsa.ac.iddharmawangsa.ac.id/public/upload/Ekspresi Gen.pdf · Ekspresi Gen Informasi genetik yang terdapat pada struktur DNA diturunkan kepada sel anak melalui proses](https://reader031.fdokumen.com/reader031/viewer/2022013121/5c92d4d709d3f206488b9189/html5/thumbnails/13.jpg)
Only 1 strand of DNA in a gene gets transcribed:
RNA polymerase: enzymethat initiates transcriptionby binding to promoter at the 3' end of DNA, unwindsand unzips it.
RNA activated nucleotides pair with the complementary bases of the DNA strand
RNA polymerase, bindsthe RNA nucleotidestogether to form themRNA poynucleotide.
Elongasi
![Page 14: GEN - dharmawangsa.ac.iddharmawangsa.ac.id/public/upload/Ekspresi Gen.pdf · Ekspresi Gen Informasi genetik yang terdapat pada struktur DNA diturunkan kepada sel anak melalui proses](https://reader031.fdokumen.com/reader031/viewer/2022013121/5c92d4d709d3f206488b9189/html5/thumbnails/14.jpg)
Tahap penerjemahan kode mRNA (kodon) oleh tRNA ke
dalam urutan asam amino
Pada tahap ini urutan kodon (urutan tiga basa nitrogen pada mRNA) diterjemahkan menjadi asam amino
Asam amino kemudian membentuk rantai polipeptida
Molekul yang ada dalam proses translasi adalahmessenger RNA (mRNA), ribosom, transfer RNA (tRNA), dan asam amino
Terjadi di ribosom
TRANSLASI
![Page 15: GEN - dharmawangsa.ac.iddharmawangsa.ac.id/public/upload/Ekspresi Gen.pdf · Ekspresi Gen Informasi genetik yang terdapat pada struktur DNA diturunkan kepada sel anak melalui proses](https://reader031.fdokumen.com/reader031/viewer/2022013121/5c92d4d709d3f206488b9189/html5/thumbnails/15.jpg)
Ribosomes
• Made of rRNA and protein
• 2 subunits (large and small) form a 3D groove
• 2 major sites: P site---holds the growing polypeptide
A site---new amino acids enter here
![Page 16: GEN - dharmawangsa.ac.iddharmawangsa.ac.id/public/upload/Ekspresi Gen.pdf · Ekspresi Gen Informasi genetik yang terdapat pada struktur DNA diturunkan kepada sel anak melalui proses](https://reader031.fdokumen.com/reader031/viewer/2022013121/5c92d4d709d3f206488b9189/html5/thumbnails/16.jpg)
INFORMATION IN THE mRNA
Codon: sequence of 3 nucleotides on
m-RNA that codes for one amino acid.
The GENETIC CODE states which codon stands for which aminoacid.
1 aminoacid
1 aminoacid
![Page 17: GEN - dharmawangsa.ac.iddharmawangsa.ac.id/public/upload/Ekspresi Gen.pdf · Ekspresi Gen Informasi genetik yang terdapat pada struktur DNA diturunkan kepada sel anak melalui proses](https://reader031.fdokumen.com/reader031/viewer/2022013121/5c92d4d709d3f206488b9189/html5/thumbnails/17.jpg)
GENETIC CODE
Even though there are only 20 amino acids
that exist, there are actually 64 possible
tRNA molecules:
4 X 4 X 4 = 64 possible combinations
CODONCODON CODON G C U
1º NUCLEOTIDE
2º NUCLEOTIDE
3º NUCLEOTIDE
=Ala
![Page 18: GEN - dharmawangsa.ac.iddharmawangsa.ac.id/public/upload/Ekspresi Gen.pdf · Ekspresi Gen Informasi genetik yang terdapat pada struktur DNA diturunkan kepada sel anak melalui proses](https://reader031.fdokumen.com/reader031/viewer/2022013121/5c92d4d709d3f206488b9189/html5/thumbnails/18.jpg)
Transfer RNA (tRNA)
Carries amino acids to the ribosome
3 base anitcodon pairs with the mRNA codon
During tRNA charging each tRNA picks up an amino acid from the cytoplasm
![Page 19: GEN - dharmawangsa.ac.iddharmawangsa.ac.id/public/upload/Ekspresi Gen.pdf · Ekspresi Gen Informasi genetik yang terdapat pada struktur DNA diturunkan kepada sel anak melalui proses](https://reader031.fdokumen.com/reader031/viewer/2022013121/5c92d4d709d3f206488b9189/html5/thumbnails/19.jpg)
Step 1: Initiation
• 5’ G-cap of mRNA binds to ribosome
• Start codon AUG and anticodon with Methionine bind a P site
• A site is open and ready to receive new tRNAs
![Page 20: GEN - dharmawangsa.ac.iddharmawangsa.ac.id/public/upload/Ekspresi Gen.pdf · Ekspresi Gen Informasi genetik yang terdapat pada struktur DNA diturunkan kepada sel anak melalui proses](https://reader031.fdokumen.com/reader031/viewer/2022013121/5c92d4d709d3f206488b9189/html5/thumbnails/20.jpg)
Step 2: Elongation (Adding New Amino Acids)
Codon recognition
Peptide bond formation
Translocation: ribosome moves along mRNA, aminoacyl tRNA shifts from A site to P site
![Page 21: GEN - dharmawangsa.ac.iddharmawangsa.ac.id/public/upload/Ekspresi Gen.pdf · Ekspresi Gen Informasi genetik yang terdapat pada struktur DNA diturunkan kepada sel anak melalui proses](https://reader031.fdokumen.com/reader031/viewer/2022013121/5c92d4d709d3f206488b9189/html5/thumbnails/21.jpg)
Step 3: Termination
A stop codon is reached
UAA UAG UGA
All parts release
![Page 22: GEN - dharmawangsa.ac.iddharmawangsa.ac.id/public/upload/Ekspresi Gen.pdf · Ekspresi Gen Informasi genetik yang terdapat pada struktur DNA diturunkan kepada sel anak melalui proses](https://reader031.fdokumen.com/reader031/viewer/2022013121/5c92d4d709d3f206488b9189/html5/thumbnails/22.jpg)