Tugas Bioinformatik Ardiani Samti

Post on 17-Nov-2015

10 views 4 download

description

pengantar

Transcript of Tugas Bioinformatik Ardiani Samti

TUGAS1. Mencari 1 protein (100 protein yang harus berbeda)Jawab:Protein apoptin (VP3) Chicken Anemia Virus Viral Protein 3. Apoptin merupakan protein yang bertugas menginduksi apoptosis dan diperoleh dari Chicken anemia virus (CAV)

2. Buatkan rangkuman terkaita. Gen yang mengkode protein yang bersangkutanJawab: Gen yang mengkode protein apoptin adalah VP3

b. Nama sinonim dari protein yang bersangkutanJawab:Sinonim dari protein apoptin adalah tidak ada. Tetapi memiliki nama lain : Chicken anemia virus (japanese isolate 82-2)dan Chicken anemia virus 82-2/JapanSumber : http://www.uniprot.org/taxonomy/73476

c. Fungsi protein tersebutJawab: Fungsi dari protein apoptin adalah menginduksi apoptosis sel kanker dan diperoleh dari Chicken animea virus

d. Mutasi yang terjadi pada gen pengkodenya dan berkaitan dengan penyakit apa (contoh satu saja)Jawab:

e. Sekuen yang mengkodenyaJawab:

f. Cari struktur 3 dimensi dari protein tersebutJawab:

g. Seandainya poin f belum ada, maka teman-teman harus memodelkan struktur 3 dimensi dari protein tersebut

h. Deskripsikan kira-kira judul dan topic tesis apa yang bisa teman-teman kembangkan dari protein yang teman-teman dapatkanJawab: Penggunaan protein apoptin untuk mengobati kanker pada manusia. Alasannya, karena protein yang berasal dari hewan ini InsyaAllah halal, karena ayam halal untuk dikonsumsi.

i. Docking kan satu protein yang teman-teman dapatkan dengan molekul (protein/DNA/RNA atau smaal molecules) lain