1

BIOLOGI DASARUntuk Mahasiswa Semester I

Jurusan Matematika2013/2014

Agustina Tangapo

Enzim

Kuliah Biologi Dasar I

Jurusan Matematika (2013/2014)

Dasar-dasar Metabolisme Sel

Agustina Monalisa Tangapo

Metabolisme• keseluruhan reaksi kimia yang terjadi di dalam

organisme1. Katabolisme (degradasi): penguraian molekul organik kompleks menjadi

molekul anorganik sederhana (― energi)

2. Anabolisme (biosintesis): pembentukan molekul organik kompleks dari

molekul anorganik sederhana (+ energi)

• Jumlah anabolisme dan katabolisme

Pathway: urutan tahap-tahap reaksi kimia dari prekursor (prazat) s.d. produkmelalui metabolit-metabolit

Metabolit: senyawa kimia antara yang terdapat dalam metabolisme

Jalur metabolisme yang akan bekerja dan kecepatan jalur dikontrol oleh sel dengan bantuan ENZIM (biokatalisator)

• A unique protein

• Mostly in metabolism

• Biological catalysts

Enzyme

Sifat-sifat enzim

• Enzim aktif dalam jumlah yang sangat sedikit, sbg biokatalisator, reaksinyamenjadi sangat cepat dan berulang ulang

• Enzim tidak terpengaruh oleh reaksi yang dikatalisisnya pada kondisi stabil(Enzim merupakan biokatalisator yang mempercepat jalannya reaksitanpa ikut bereaksi)

• Kerja katalis enzim spesifik, karena sisi aktif enzim setangkup denganpermukaan subtrat tertentu

• Enzim sangat peka terhadap faktor-faktor yang menyebabkan denaturasiprotein misalnya suhu, pH dll

• Enzim dapat dipacu maupun dihambat aktivitasnya

• Enzim bermolekul besar

• Logam, memacu aktifitas enzim: Mg, Mn, Co, Fe

• Logam berat, menghambat aktivitas enzim: Pb, Cu, Zn, Cd, Ag

Pengelompokan enzim

Penamaan umum: substrat (proses) + akhiran-ase

• Cofactors– Activator– Coenzymes– Prosthetic groups

Some enzymes require other molecules in order to repeat

Mekanisme reaksiModel lock & key Model induced fit

11

Enzymes have several ways of causing their substrates to enter the transition state:- Enzymes orient substrates- Enzymes induce strain in the substrate- Enzymes temporarily add chemical groups to substrates

Pengaruh pH terhadap reaksi enzimatis

Penghambatan aktifitas enzim ada dua tipe:

1. Kompetitif: zat penghambatmempunyai struktur yang miripdengan substrat sehingga dapatbergabung dengan sisi aktif enzim. Terjadi kompetisi antara substratdengan inhibitor untuk bergabungdengan sisi aktif enzim (misal feed back effect)

2. Non kompetitif: zat penghambatmenyebabkan struktur enzim rusaksehingga sisi aktifnya tidak cocok lagidengan substrat

Questions….????

Dasar-dasar Metabolisme Sel

20

Anabolisme

Katabolisme

Fotosintesis

Overall Reaction• Light reaction – Harvest

light energy

• Convert light energy to chemical energy

• Dark reactions – Expend chemical energy

• Fix Carbon (convert CO2 to organic form)

1. Reaksi terang. Energi sinar matahari

digunakan untuk oksidasi fotokimia

H2O menjadi O2. Elektron yang

dihasilkan dipakai untuk mereduksi

NADP+ menjadi NADPH.

Fotofosforilasi untuk sintesis ATP.

2. Reaksi gelap (reaksi yang tak perlu

energi cahaya). Sintesis karbohidrat

dari CO2 dan H2O dengan memakai

energi hasil reaksi terang (Siklus

Calvin).

Reaksi Terang

Reaksi gelap: 6 CO2 + 12 NADPH + 30 ATP + 12 H2O →C6H12O6 + 12 NADP+ + 30 ADP + 18 Pi + 6 H+

CO2 (sel mesofil) + ATP + H2O →CO2 (sel bundel pelepah) + AMP 2 Pi + H+

Reaksi terang

Reaksi gelap

Reaksi gelap (siklus Calvin)

Respirasi Seluler

33

Respirasi aerob

• Glikolisis

• Konversi asam piruvat menjadi asetil KoA

• Siklus Krebs

• Transfer Elektron

34

35

Respirasi anaerob

MitoKondria

Animasi\ch09_respirasi sel\a01\s01\090101.swf

..\..\Animasi\Citric Acid Cycle.flv

Overview of aerobic respiration

43

Terima Kasih