Thu nhận. Xử lý. Trực quan hóa. Phân tích. Kết nối. Lưu trữ.

zeiss.com/zen

Phần mềm kính hiển vi ZENGiải pháp toàn diện dành cho bạn: Từ Mẫu vật đến Kiến thức

Thu nhận. Xử lý. Trực quan hóa.Phân tích. Kết nối. Lưu trữ.

http://www.zeiss.com/zen

2

ZEISS Efficient Navigation (viết tắt là ZEN) là giao diện phần mềm mà bạn sẽ thấy trên tất cả hệ thống chụp ảnh hiển vi của ZEISS. Dù thực hiện tác vụ với kính hiển vi nào bạn đều sẽ tìm thấy các công cụ và mô-đun trực quan hữu ích để:

• Thu nhận hình ảnh bằng quy trình tự động hóa thông minh• Xử lý hình ảnh bằng các thuật toán đã được khoa học chứng minh• Trực quan hóa dữ liệu lớn (big data) bằng công cụ 3D được hỗ trợ bởi GPU• Phân tích hình ảnh thông qua các công cụ dựa trên công nghệ máy học• Kết nối hình ảnh giữa kính hiển vi quang học-quang học hoặc quang

học-điện tử• Lưu trữ dữ liệu sơ cấp ở định dạng an toàn cục bộ hoặc trên đám mây

Thiết kế cân bằng giữa tính đơn giản và tính linh hoạt cho người sử dụng kính hiển vi

Đối với các công việc thường quy và đơn giản, ZEN cung cấp ngay kết quả cho bạn một cách nhanh chóng và dễ dàng. Bạn sẽ luôn biết được phương án nào là khả thi và bước nào là thích hợp nhất để thực hiện kế tiếp. Giao diện người dùng chung cho phép bạn sử dụng trên tất cả các dòng kính hiển vi ZEISS với cùng giao diện đồ họa và quy trình làm việc tương tự nhau. Nhờ thế, bạn sẽ tiết kiệm được thời gian, giảm chi phí cho hoạt động đào tạo và hỗ trợ.

Đối với các thí nghiệm nghiên cứu phức tạp, ZEN sẽ mang đến tính linh hoạt tối đa giúp thiết kế quy trình làm việc đa chiều theo ý bạn. Các tùy chọn trong chế độ chuyên gia mở ra khả năng vô tận. Bạn muốn tùy chỉnh nhiều hơn nữa? Hãy trải nghiệm lập trình ngôn ngữ Python với giao diện dành cho phần mềm tương thích của bên thứ ba. Bạn thấy choáng ngợp trước các tùy chọn cài đặt? Các nút "Tối ưu" cho phép bạn nhanh chóng bắt đầu với các thông số mặc định. Khi thiết kế thí nghiệm, bạn sẽ không bao giờ hết ý tưởng.

Trải nghiệm Phần mềm kính hiển vi toàn diện

› Tổng quan

› Ưu điểm

› Ứng dụng

› Hệ thống

› Công nghệ và thông tin chi tiết

› Dịch vụ

3

Thu nhận. Xử lý. Trực quan hóa.

Thu nhận thông minhGiúp bạn thành công với các thí nghiệm phức tạp nhất.ZEN điều khiển tất cả các hệ thống hiển vi chụp ảnh của ZEISS, giúp bạn vận hành tất cả thiết bị của mình trên cùng một giao diện tiện dụng. Là một nhà nghiên cứu, bạn có thể không quen thuộc với tất cả các bộ phận của kính hiển vi, nhưng chắc chắn bạn biết rõ mẫu vật và thuốc nhuộm mà mình sử dụng. Với "Thiết lập thông minh" (Smart Setup), trung tâm điều khiển thông minh, bạn chỉ việc tìm chọn thuốc nhuộm và ZEN sẽ tự động tạo các tùy chọn cài đặt giúp bạn, dù bạn dùng loại kính hiển vi nào. Bạn hướng đến các thí nghiệm có khả năng tái lập? Chỉ cần một hình ảnh chưa qua xử lý được thu nhận từ trước và một cú nhấp chuột đơn giản, bạn sẽ có thể sao chép chính xác thí nghiệm đó. Và đó mới chỉ là bước khởi đầu cho quá trình thu nhận thông minh của ZEN. Bạn sẽ tìm thấy nhiều tính năng tự động hóa thông minh khác, một số sẽ hướng dẫn bạn phát hiện các sự kiện hiếm gặp và một số khác sẽ hỗ trợ bạn hiệu chỉnh phần cứng.

Khả năng trực quan hóa mạnh mẽTự tin tương tác với dữ liệu lớn của bạn.Những tiến bộ trong tiến trình tự động hóa kính hiển vi, công nghệ camera và hiển vi phiến ánh sáng (light-sheet) đã thúc đẩy sự phát triển về kích thước dữ liệu và thách thức về trực quan hóa dữ liệu lớn theo cấp số nhân. Khi sử dụng máy quét tiêu bản ZEISS Axioscan 7, bạn có thể nhanh chóng tạo ra một bản quét 2D dạng ô xếp khổng lồ đa kênh với độ phóng đại cao. Cấu trúc dữ liệu hình tháp ZEN mạnh mẽ cho phép bạn phóng to và thu nhỏ dữ liệu 2D đó một cách trơn tru chỉ với một thao tác cuộn chuột đơn giản, tương tự như sử dụng ứng dụng bản đồ trên điện thoại thông minh. Bạn có 200 GB dữ liệu về não chuột đã được xử lý trong suốt từ ZEISS Lightsheet 7? Chỉ cần tải dữ liệu lên ZEN - bạn sẽ phải ngạc nhiên trước tốc độ và độ rõ nét của nhiều phương pháp kết xuất 3D khác nhau. Được hỗ trợ bởi công nghệ arivis ImageCore và sử dụng hiệu quả tài nguyên hệ thống, bạn có thể xem hình ảnh 3D cỡ lớn của mình ngay cả trên phần cứng dành cho người dùng thông thường.

Xử lý định lượngThu được những kết quả đáng tin cậy và có thể tái lập.Thu nhận những hình ảnh hiển vi tuyệt đẹp chỉ là bước khởi đầu của hành trình thí nghiệm. Hơn 180 công cụ xử lý hình ảnh, sử dụng các thuật toán dễ hiểu và đã được khoa học chứng minh, sẽ giúp bạn chuyển đổi và quản lý dữ liệu của mình. Chỉ việc tìm kiếm từ khóa của phương pháp bạn dự định thực hiện, ví dụ như kymograph hoặc deconvolution, ZEN sẽ đưa bạn đến đúng chỗ. Bạn chưa quen với những tùy chọn cài đặt xử lý đó? ZEN sẽ đọc siêu dữ liệu của hình ảnh đầu vào, sau đó chỉ hiển thị các bước xử lý logic và tự động tối ưu hóa các thông số mặc định. Bạn thậm chí còn có thể xử lý hình ảnh từ các nền tảng khác bằng cách sử dụng công cụ nhập từ bên thứ ba của ZEN. Với không gian làm việc chuyên dụng, bạn cũng có thể dễ dàng xử lý hàng loạt hình ảnh để có được kết quả định lượng và không thiên lệch. Với nhiều công cụ xử lý trong phiên bản miễn phí ZEN lite của chúng tôi, bạn có thể thoải mái thực hiện công việc ngay tại nhà, qua máy tính xách tay của mình.

› Tổng quan

› Ưu điểm

› Ứng dụng

› Hệ thống


› Dịch vụ

4

Phân tích. Kết nối. Lưu trữ.

Phân tích dễ dàngHiểu tường tận về nghiên cứu của bạn.Phân tích hình ảnh là bước cần thiết để trích xuất những thông tin có ý nghĩa từ hình ảnh hiển vi của bạn, thông qua các công cụ phân đoạn và định màu kỹ thuật số. Tuy nhiên, việc xây dựng một quy trình phân tích hình ảnh cụ thể thích hợp với một ứng dụng không phải là nhiệm vụ dễ dàng. Việc này đòi hỏi phải có kiến thức về xử lý hình ảnh và khả năng kết hợp một loạt các tác vụ. ZEN giải quyết yếu tố mất cân bằng này bằng các mô-đun BioApps đơn giản và có tính lắp ghép. Mỗi mô-đun được tối ưu hóa cho một loại ứng dụng, ví dụ như cài đặt phân đoạn phù hợp và trình bày dữ liệu đơn giản hóa cho ứng dụng đếm tế bào hoặc đo độ hội lưu. Bạn cần xây dựng một quy trình làm việc đặc biệt? Mô-đun Phân tích hình ảnh (ZEN Image Analysis) dựa trên trình hướng dẫn sẽ hướng dẫn bạn từng bước để tạo các phép đo của riêng mình. Bạn cũng có thể tích hợp công cụ phân đoạn Intellesis dựa trên công nghệ máy học của chúng tôi vào quy trình làm việc để phân tích hình ảnh nhiễu một cách dễ dàng và chính xác.

Lưu trữ an toànLuôn tự tin khi xử lý dữ liệu phức tạp.Bảo mật dữ liệu được ưu tiên hàng đầu vì ZEN lưu trữ tất cả dữ liệu đáng giá của từng thí nghiệm bằng hình thức siêu dữ liệu (476 đầu mục và đang tiếp tục tăng). Định dạng tệp .czi độc quyền mang tính toàn diện, dễ thao tác, hỗ trợ dữ liệu lớn nhưng vẫn có tính mở. Định dạng này tương thích với Bio-Formats và có thể đọc trực tiếp bằng ImageJ và nhiều phần mềm thứ ba khác. Với một cú nhấp chuột, bạn cũng có thể xuất các tệp sang định dạng OME-TIFF, định dạng ảnh đặc tả của Open Microscopy Environment, để giúp việc trao đổi dữ liệu hình ảnh đa nền tảng trở nên thuận lợi hơn. Bạn đang quản lý một lượng lớn dữ liệu trong cơ sở của mình? Mô-đun ZEN Data Storage cung cấp một nền tảng trung tâm dựa trên máy chủ để lưu trữ và sắp xếp dữ liệu sơ cấp của bạn đồng thời quản lý quyền truy cập của người dùng; trong khi mô-đun ZEN Data Explorer cấp quyền truy cập cho người dùng trình duyệt từ bất cứ nơi đâu.

Tương quan hiển vi độc đáoKết hợp các góc nhìn từ mọi tỷ lệ và phương thức quan sát.Sự đa dạng thú vị của các công nghệ hình ảnh hiển vi cho phép quan sát cùng một mẫu vật nhanh hơn, sâu hơn, lâu hơn và ở mức độ chi tiết cao hơn từ nhiều góc nhìn khác nhau. Hãy hình dung về khả năng giải đáp các vấn đề khoa học của bạn khi kết hợp những hình ảnh này từ nhiều công cụ từ ZEISS hoặc bên thứ ba. ZEN Connect là giải pháp hiển vi tương quan độc đáo giúp bạn phủ chồng, điều hướng và tổ chức dữ liệu đa phương thức của mình. Bạn phải dành nhiều thời gian để xác định vị trí khớp liên hợp giữa hai tế bào thần kinh đặc biệt tìm kiếm thông tin siêu cấu trúc? Bạn có thể cải thiện đáng kể hiệu quả công việc bằng cách kết hợp tính năng tại ảnh trường rộng của kính hiển vi huỳnh quang trường rộng và khả năng tạo ảnh phân giải cao của kính hiển vi điện tử phát xạ trường. ZEN Connect cho phép bạn nhanh chóng có được cái nhìn tổng quan về toàn bộ mẫu lát cắt não bằng các dấu ấn huỳnh quang, xác định và định vị vùng ROI cho hình ảnh EM.

› Tổng quan

› Ưu điểm

› Ứng dụng

› Hệ thống


› Dịch vụ

5

Hình ảnh thực tế với ZEN

Chụp ảnh time-lapse

Tế bào sống với ti thể màu xanh lục và đầu tip vi ống màu đỏ (EB3). ZEN cho chúng ta cái nhìn sâu sắc hơn về các quá trình tế bào nhanh và sống động đồng thời cung cấp các công cụ để xử lý dữ liệu trong cùng một giao diện người dùng quen thuộc.

Sự di chuyển của cơ quan sơ cấp và sự bám kết của các đối thần kinh chưa trưởng thành trong phôi Cá ngựa vằn (Cá sọc ngựa). Hình chiếu cường độ tối đa của 155 mặt phẳng z, thu được bằng Airyscan 2. Màng màu xanh lục, sợi actin màu tím.

ZEN cho phép bạn quan sát mẫu vật của mình lâu hơn và trong các điều kiện tự nhiên hơn bao giờ hết, vì nó kiểm soát chính xác việc thu nhận hình ảnh ở chế độ quan sát trường rộng hoặc LSM. Không có photon nào bị lãng phí và hình ảnh được xử lý và khôi phục để mang lại tỷ lệ tín hiệu trên nhiễu cao nhất.

Mẫu J. Hartmann và D. Gilmour, EMBL, Heidelberg, Đức cung cấp

Nhấp vào đây để xem video này Nhấp vào đây để xem video này

20 µm

› Tổng quan

› Ưu điểm

› Ứng dụng

› Hệ thống


› Dịch vụ

https://zeiss.wistia.com/medias/ppymzl6weq

https://zeiss.wistia.com/medias/i2bwypuu0t

1000 µm

6


Tạo ảnh diện tích lớn

Hình ảnh dạng ô xếp của phần thận chuột với bốn nhãn màu. ZEN mang lại chiến lược tối ưu hóa lấy nét mẫu vật tốt nhất trên diện tích lớn ở độ phân giải cao. Bạn thu được hình ảnh chất lượng tốt hơn trong thời gian ngắn hơn.

Hình ảnh trường sáng của một mô, thu được bằng chế độ Ảnh toàn cảnh trực tiếp (Live Panorama). ZEN tự động chụp ảnh và ghép chúng lại, trong khi bạn điều hướng theo cách thủ công tới vị trí mong muốn trên mẫu vật.

› Tổng quan

› Ưu điểm

› Ứng dụng

› Hệ thống


› Dịch vụ

7

Hình ảnh kết xuất 3D của phôi Cá ngựa vằn. Ảnh Z stack Apotome đã xử lý với deconvolution.Với các tùy chọn xem và xử lý ảnh mạnh mẽ, ZEN cung cấp cho bạn thông tin chi tiết về mẫu vật của mình để bạn đưa ra kết luận và lập kế hoạch cho các thí nghiệm tiếp theo.

Tạo ảnh 3D

Hình ảnh hướng trực diện của mẫu lát cắt não chuột, thu được với hệ LSM 900.Ảnh Z stack của vùng hồi hải mã của một tiêu bản não chuột với các tế bào thần kinh (màu xanh lục) và các nhân tế bào (màu đỏ).ZEN hỗ trợ bạn tìm ra vị trí hoàn hảo trên mẫu vật và dễ dàng xử lý các tệp lớn để bạn luôn có thể tập trung vào việc kiểm tra dữ liệu của mình.


› Tổng quan

› Ưu điểm

› Ứng dụng

› Hệ thống


› Dịch vụ

8

Đếm số tế bào dương tính với DAB (màu nâu với đường viền xanh lục) trong các phần mô và tính tỷ lệ phần trăm của tổng số tế bào (màu xanh lam và màu nâu): 36%.

Phân tích hình ảnh

Ảnh Z stack 129 lát cắt của nhân tế bào, được phân đoạn và định lượng đầy đủ, sử dụng APEER on-site trong ZEN.


› Tổng quan

› Ưu điểm

› Ứng dụng

› Hệ thống


› Dịch vụ

9

Phân tích, xử lý và trực quan hóa ngoại tuyến.Gói phần mềm cho tất cả các hệ thống tạo ảnh, bao gồm cả hệ thống tạo ảnh 3D dùng nguồn laser.

Phiên bản cơ bản miễn phí của ZEN với bộ điều khiển Axiocam có thể được mở rộng thêm với các mô-đun cụ thể.

Gói phần mềm cho tất cả các hệ thống trường rộng độc lập không dùng laser.

Phần mềm cơ bản cho các mô-đun tương quan cho phép thu nhận hình ảnh SEM.

Được thiết kế riêng cho các hệ thống ZEISS Lattice Lightsheet 7.

Được thiết kế riêng cho các hệ thống ZEISS Celldiscoverer 7.

Được thiết kế riêng cho các hệ thống ZEISS Axioscan 7.

Các gói phần mềm ZEN

ZEN system ZEN lite ZEN deskZEN pro

ZEN SEMZEN Lattice LightsheetZEN CelldiscovererZEN Slidescan

› Tổng quan

› Ưu điểm

› Ứng dụng

› Hệ thống


› Dịch vụ

10

Tùy ý lựa chọn mô-đun

Các tính năng chung của ZEN

Có thể chuyển đổi giữa chế độ sáng và tối của giao diện người dùng đồ họa để thích ứng với độ sáng môi trường xung quanh.

Giao diện người dùng cung cấp khả năng phóng to và thu nhỏ theo từng bước để điều chỉnh tối ưu kích thước màn hình.

Tất cả các yếu tố chức năng có thể được hiển thị ở chế độ thu nhỏ hoặc toàn màn hình.

Tích hợp đầy đủ với kính hiển vi ZEISS có thể được thiết lập cấu hình trong MicroToolbox, camera Axiocam và các bộ phận bổ sung

Cơ chế điều khiển tương tác và tự động của các bộ phận kính hiển vi tự động riêng lẻ

Hoạt động truyền thông tin từ bộ phận được mã hóa vào phần mềm

Có thể định cấu hình, lưu và tải lại các thí nghiệm thu nhận phức tạp.

Bộ ghi phim cho phép thu được phim một cách rất đơn giản bằng nút Bắt đầu và Dừng (không thể cài đặt khoảng thời gian và cài đặt thời lượng).

Có thể chọn chuỗi chiều thu nhận hình ảnh (tùy thuộc vào chiều đang hoạt động).

Có thể tạo tùy chọn cài đặt phần cứng với sự trợ giúp của đồ họa đường dẫn ánh sáng.

Có thể dễ dàng kết hợp các chuỗi lệnh để tạo cài đặt phần cứng:• Chứa chức năng Thiết lập thông minh giúp tạo ra các thí nghiệm hoàn toàn tự động nhằm thu được hình ảnh huỳnh quang đa kênh và truyền qua bằng cách sử dụng các hệ thống tự động.• Thu nhận hình ảnh với camera đen trắng, màu, độ phân giải cao và độ nhạy cao, hình ảnh đen trắng lên đến 16 bit, hình ảnh màu lên đến 3 × 16 bit.

Có thể điều chỉnh các thông số hiển thị mà không cần thay đổi giá trị pixel.

Khi thu được hình ảnh, hoạt động chỉ định tỷ lệ hình học là hoàn toàn tự động (tùy thuộc vào cấu hình kính hiển vi).

Lịch sử thu nhận được ghi lại và lưu dưới dạng siêu dữ liệu ở định dạng hình ảnh CZI. Định dạng này đã được phát triển dựa trên các tiêu chuẩn định dạng OME-TIFF và OME-XML của Open Microscopy Environment. Điều này cho phép khả năng tương thích sâu rộng với Đầu đọc định dạng Bio-Formats của Open Microscopy Environment.

Hình ảnh thu được sẽ được tự động lưu ở định dạng CZI hoặc các định dạng hình ảnh khác (bao gồm siêu dữ liệu). Cũng có thể lưu ở định dạng CZI ở dạng nén.

Tích hợp đầy đủ vào chức năng đa người dùng của Windows (tách dữ liệu người dùng và cài đặt chương trình, cấu hình dành riêng cho người dùng, v.v.)

Các tùy chọn cấu hình cho giao diện người dùng đồ họa cho phép tạo các thanh menu, lưu cấu hình nơi làm việc và xác định thuộc tính các phần tử đồ họa tiêu chuẩn.

Xuất sang định dạng OME-TIFF (định dạng đặc tả hình ảnh của Open Microscopy Environment cho phép trao đổi dữ liệu hình ảnh hiển vi).

Xuất thành các định dạng ảnh ZVI, BMP, GIF, JPG, PNG, TIFF, HDP và xuất thành các định dạng video AVI và Windows Media. Xuất hàng loạt hình ảnh và video.

Nhập hình ảnh (LSM, ZVI, BMP, TIFF, JPG, GIF, PNG) và chức năng chuyển đổi hình ảnh (TIFF, JPG, BMP) sang định dạng CZI

Cửa sổ điều hướng

Phép đo tương tác: chiều dài, dữ liệu đo dựa trên biên dạng (diện tích, hộp, chu vi, các giá trị thang xám), góc

Không gian làm việc của ZEN Connect có kiến trúc tệp theo dự án: Phóng to từ chế độ xem mẫu kiểu macro đầy đủ cho đến chi tiết kích thước nano. Kết hợp dữ liệu từ mọi nguồn hình ảnh và xem nhiều lớp ảnh có thể điều chỉnh độ trong suốt. Căn chỉnh hình ảnh theo cách thủ công cho phép hiệu chỉnh trục xy, xoay, thay đổi tỷ lệ, cắt và phản chiếu.

› Tổng quan

› Ưu điểm

› Ứng dụng

› Hệ thống


› Dịch vụ

11


Đi kèm Tùy chọn

Tùy chọn/Mô-đun ZEN lite ZEN desk ZEN pro ZEN systemCơ bản ZEN

Điều khiển thiết bị Điều khiển Axiocam

Điều khiển các camera khác

Điều khiển kính hiển vi tự động

Điều khiển Apotome

Điều khiển phụ kiện của nhà cung cấp bên thứ ba

Điều khiển PMT

Điều khiển mô-đun laser

Thu nhận Bộ ghi phim (Movie recorder)

Mở rộng lấy nét chỉnh tay (Manual extended focus)

Ảnh toàn cảnh (Panorama)

Thu nhận nhanh (Fast acquisition)

Camera đôi (Dual camera)

Đa kênh (Multi channel)

Tua nhanh thời gian (Time-lapse)

Chụp cắt lớp (Z stack)

Tự động lấy nét phần mềm (Software autofocus)

Định vị trí và lấy ảnh vùng rộng (Tile & Positions)

Công cụ thiết kế thí nghiệm (Experiment designer)

Thu nhận có hướng dẫn (Guided acquisition)

Chụp cắt lớp tương quan mảng (Correlative Array Tomography)

Đếm photon (Photon counting)

FCS

Airyscan

HDR đồng tiêu (Confocal HDR)

Kết nối Kết nối cơ bản

Kết nối

Kết nối Tiện ích bổ sung 2D


› Tổng quan

› Ưu điểm

› Ứng dụng

› Hệ thống


› Dịch vụ

12

Đi kèm Tùy chọn *chỉ khả dụng trong chế độ xử lý hình ảnh

Tùy chọn/Mô-đun ZEN lite ZEN desk ZEN pro ZEN systemXử lý Đảo ngược hiệu ứng mờ cơ bản (Deconvolution basic)

Phân lớp quang phổ (Spectral unmixing)

Đảo ngược hiệu ứng mờ (Deconvolution)

Colocalization

Mở rộng lấy nét (Extended focus)

Xử lý trực tiếp (Direct processing)

Xử lý & phân tích nâng cao (Advanced processing & analysis)

Môi trường Macro (Macro environment)

Hộp công cụ xử lý EM (EM processing toolbox)

Nhập từ bên thứ ba (Third Party Import)

Xử lý hình ảnh từ Airyscan

Xử lý ảnh Lightsheet

Trực quan hóa Kết xuất 3D cơ bản

3Dxl, hỗ trợ bởi arivis

3Dxl plus, hỗ trợ bởi arivis

Phân tích Phép đo (Measurement)

BioApps (4×)

Phân tích hình ảnh (Image analysis)

Intellesis

Phân loại đối tượng Intellesis (Intellesis object classification)

Phân tích hình ảnh + Intellesis (Image analysis + Intellesis)

Sinh lý học (Physiology)

FRAP

FRET *

APEER on-site cơ bản

APEER on-site nâng cao

Lưu trữ ZEN Máy khách lưu trữ dữ liệu (ZEN Data Storage Client)


› Tổng quan

› Ưu điểm

› Ứng dụng

› Hệ thống


› Dịch vụ

13



Tùy chọn/Mô-đun ZEN Slidescan ZEN Celldiscoverer ZEN Lattice Lightsheet ZEN SEMCơ bản ZEN

Điều khiển thiết bị Điều khiển Axiocam

Điều khiển các camera khác

Điều khiển kính hiển vi tự động

Điều khiển phụ kiện của nhà cung cấp bên thứ ba

Điều khiển PMT

Điều khiển mô-đun laser

Thu nhận Thu nhận nhanh (Fast acquisition)

Đa kênh (Multi channel)

Tua nhanh thời gian (Time-lapse)

Chụp cắt lớp (Z stack)

Tự động lấy nét phần mềm (Software autofocus)

Định vị trí và lấy ảnh vùng rộng (Tile & Positions)

Công cụ thiết kế thí nghiệm (Experiment designer)

Thu nhận có hướng dẫn (Guided acquisition)

Chụp cắt lớp tương quan mảng (Correlative Array Tomography)

Chỉnh sửa đồ họa ảnh tự động (Automated photomanipulation)

Airyscan

Kết nối Kết nối cơ bản

Kết nối



› Tổng quan

› Ưu điểm

› Ứng dụng

› Hệ thống


› Dịch vụ

14



Tùy chọn/Mô-đun ZEN Slidescan ZEN Celldiscoverer ZEN Lattice Lightsheet ZEN SEMXử lý Đảo ngược hiệu ứng mờ cơ bản (Deconvolution basic)

Phân lớp quang phổ (Spectral unmixing)

Đảo ngược hiệu ứng mờ (Deconvolution)

Colocalization

Mở rộng lấy nét (Extended focus)

Xử lý trực tiếp (Direct processing)

Xử lý & phân tích nâng cao (Advanced processing & analysis)

Môi trường Macro (Macro environment)

Hộp công cụ xử lý EM (EM processing toolbox)

Nhập từ bên thứ ba (Third Party Import)

Xử lý hình ảnh từ Airyscan

Trực quan hóa Kết xuất 3D cơ bản

3Dxl, hỗ trợ bởi arivis

3Dxl plus, hỗ trợ bởi arivis

Phân tích Phép đo (Measurement)

BioApps (4×)

Phân tích hình ảnh (Image analysis)

Intellesis

Phân loại đối tượng Intellesis (Intellesis object classification)

Phân tích hình ảnh + Intellesis (Image analysis + Intellesis)

Sinh lý học (Physiology)

FRAP

FRET

APEER on-site cơ bản

APEER on-site nâng cao

Lưu trữ ZEN Máy khách lưu trữ dữ liệu (ZEN Data Storage Client)

› Tổng quan

› Ưu điểm

› Ứng dụng

› Hệ thống


› Dịch vụ

15

THU NHẬN:Đa kênh (Multi-Channel)Thu nhận hình ảnh huỳnh quang và ảnh truyền qua trong các kênh độc lập:• Không giới hạn số kênh độc lập cho kỹ thuật

chiếu sáng phản xạ và truyền qua. • Hoàn toàn tự động tạo cài đặt kính hiển vi cần

thiết cho một kênh với khả năng thay đổi cài đặt.• Thời gian phơi sáng độc lập và hiệu chỉnh bóng

mờ cho từng kênh.• Hỗ trợ thu nhận đồng thời hai kênh bằng cách

sử dụng hai camera đồng bộ.

THU NHẬN:Tua nhanh thời gian (Time-lapse)Thu nhận các hình xuyên suốt một khoảng thời gian:• Thu nhận hình ảnh ở tốc độ cao nhất có thể.• Xác định khoảng thời gian trống giữa các hình

ảnh, tổng thời gian thu nhận và số lượng thời điểm.

• Có thể ngừng giữa chừng quá trình thu nhận để phân tích hình ảnh đã có hoặc thay đổi các thông số thí nghiệm.

• Quy mô thí nghiệm chỉ bị giới hạn bởi dung lượng còn trống trong ổ cứng.

• Có thể chỉnh chuỗi thời gian theo cách thủ công để bắt đầu và dừng lại, vào những thời điểm cố định, sau một khoảng thời gian chờ hoặc bằng tín hiệu nhập vào (kích hoạt).

THU NHẬN:Chụp cắt lớp (Z stack)Thu nhận ảnh chụp cắt lớp với sự trợ giúp của bộ truyền động lấy nét tự động:• Xác định Z stack ở chế độ đầu tiên và cuối cùng

hoặc chế độ trung tâm.• Khả năng chụp cắt lớp Z stack chỉ giới hạn bởi

phạm vi di chuyển của hệ thống và bước chỉnh tối thiểu.

• Nút Khoảng cách tối ưu đặt bước chính xác để đáp ứng tiêu chuẩn Nyquist.

• Tích hợp bộ truyền động trục Z bù trừ sai lệch để có độ chính xác tối đa.

• Có thể thu nhận ảnh Z stack ở các vị trí lấy nét tương đối hoặc tuyệt đối trong thí nghiệm.


Nhấp vào đây để xem video này

› Tổng quan

› Ưu điểm

› Ứng dụng

› Hệ thống


› Dịch vụ

https://zeiss.wistia.com/medias/mx7hm0sgi7

16

THU NHẬN:Mở rộng lấy nét chỉnh tay (Manual Extended Focus)Tạo hình ảnh theo cách thủ công không giới hạn độ sâu trường ảnh:• Trích xuất các chi tiết sắc nét từ các hình ảnh

riêng lẻ ở các vị trí lấy nét khác nhau và kết hợp chúng thành một hình ảnh có độ sâu trường ảnh mở rộng.

• Hoạt động với hình ảnh được thu nhận theo cách tương tác. Có thể thêm hình ảnh vào kết quả trung gian qua chức năng khoảng thời gian hoặc chức năng chính.

• Thuật toán Wavelet cho phép sử dụng trong ánh sáng truyền qua, ánh sáng phản xạ và huỳnh quang.

THU NHẬN:Tự động lấy nét (Software Autofocus)Xác định vị trí lấy nét tối ưu của mẫu vật:• Hoạt động trong ánh sáng truyền qua, ánh

sáng phản xạ và huỳnh quang.• Hoạt động không cần hiệu chuẩn cho tất cả

các vật kính và bộ lọc.• Các tùy chọn để điều chỉnh chất lượng, vùng

tìm kiếm và tỷ lệ lấy mẫu của chức năng lấy nét tự động cho ứng dụng.

• Chức năng tự động lấy nét có thể được kích hoạt tự động trong quá trình thí nghiệm tại các khoảng thời gian và kênh xác định cũng như tại các vị trí ô hoặc vị trí riêng lẻ đã được xác định trước.


THU NHẬN:Định vị trí và lấy ảnh vùng rộng (Tile & Positions)Tạo hình ảnh chính xác, độ phân giải cao thông qua thao tác quét tự động các vùng và vị trí được xác định trước của mẫu:• Các vùng của hình ảnh dạng ô xếp và các vị trí

riêng lẻ có thể được kết hợp tự do.• Bàn sa trượt gắn động cơ cho phép quét mẫu

tự động.• Việc xếp chồng các hình ảnh riêng lẻ có thể

được kết hợp thành một hình ảnh tổng quan bằng cách sử dụng thuật toán "ghép nối".

• Chọn từ các loại đĩa đa giếng được xác lập trước hoặc tạo mới cho riêng bạn các lựa chọn đĩa đa giếng, tiêu bản nhiều ngăn, tiêu bản và đĩa khác.

• Trình hướng dẫn chiến lược lấy nét trực quan sẽ giúp bạn xác định tiêu điểm tốt nhất.

› Tổng quan

› Ưu điểm

› Ứng dụng

› Hệ thống


› Dịch vụ

17

THU NHẬN:Chụp toàn cảnh (Panorama)Tạo hình ảnh tổng quan chính xác, độ phân giải cao từ các hình ảnh 2D riêng lẻ được thu nhận theo cách thủ công:• Thu nhận các hình ảnh đa kênh riêng lẻ chồng

lấp lên nhau theo kiểu tương tác và kết hợp chúng để tạo thành hình ảnh toàn cảnh trên kính hiển vi có bàn sa trượt được mã hóa hoặc tự động.

• Hình ảnh toàn cảnh 3D có thể được thu nhận trên giá bằng bộ truyền động trục Z tự động.

• Ảnh toàn cảnh trực tiếp: ZEN tự động chụp ảnh và ghép nối ảnh trong quá trình điều hướng mẫu.

THU NHẬN:Công cụ thiết kế thí nghiệm (Experiment Designer)Thiết lập cấu hình các thí nghiệm không đồng nhất:• Hỗ trợ cho tất cả các chiều thí nghiệm: chuỗi

thời gian, chụp cắt lớp Z stack, hình ảnh dạng ô xếp và số kênh.

• Hoạt động thông qua giao diện đồ họa đơn giản bằng cách sử dụng bốn loại khối thí nghiệm khác nhau dọc theo dòng thời gian: Thu nhận, Thực thi, Tạm dừng và Tương tác.

• Kiểm soát đồng bộ hoặc không đồng bộ các hoạt động phần cứng trong quá trình thí nghiệm.

• Xác định số vòng lặp thí nghiệm.• Tập hợp các chức năng xử lý mạnh mẽ để trích

xuất hoặc kết hợp các hình ảnh đa khối.


THU NHẬN:Thu nhận có hướng dẫn (Guided Acquisition)*Thực hiện việc thu nhận có mục tiêu hoàn toàn tự động với các đối tượng mà bạn muốn:• Tiết kiệm thời gian và không gian lưu trữ bằng

cách chỉ tập trung thu nhận hình ảnh vào các đối tượng mà bạn muốn (ví dụ: các sự kiện hiếm gặp).

• Tự động hóa quy trình làm việc của bạn, bao gồm quét tổng quan, dò đối tượng thông qua phân tích hình ảnh tự động và thu nhận hình ảnh đa chiều, độ phân giải cao cho từng đối tượng dò được.

• Tùy chỉnh các chiến lược lấy nét cho cả quét tổng quan và thu nhận một cách chi tiết.

• Tự động lưu tất cả hình ảnh, bảng và cài đặt trong một thư mục giúp dễ dàng truy cập và sử dụng lại.

* cần có mô-đun ZEN Image Analysis

› Tổng quan

› Ưu điểm

› Ứng dụng

› Hệ thống


› Dịch vụ

18


THU NHẬN:Chụp cắt lớp tương quan mảng (CAT)Thu nhận hình ảnh nối tiếp siêu mỏng tự động trong kính hiển vi điện tử quét và trường rộng:• Các vùng trọng tâm được xác định thủ công

trong một phần sẽ được tự động truyền đến tất cả các phần sau.

• Có thể chụp ảnh các vùng trọng tâm đã chọn trong kính hiển vi quang học và điện tử.

• Các chuỗi hình ảnh 2D được căn chỉnh thành một khối ảnh lớp cắt 3D, đưa đến một bộ dữ liệu tương quan kết hợp thông tin từ kính hiển vi quang học và điện tử thành một khối hình ảnh.

XỬ LÝ:Nhập từ bên thứ ba (Third Party Import)Nhập hình ảnh hiển vi của bên thứ ba vào ZEN:• Các hoạt động nhập hình ảnh của bên thứ ba

ở định dạng gốc bao gồm trích xuất siêu dữ liệu có liên quan.

• Hỗ trợ trích xuất siêu dữ liệu tùy thuộc vào định dạng gốc (hỗ trợ bởi Bio-Formats).

XỬ LÝ:Xử lý trực tiếp (Direct Processing)Thực hiện đồng thời các tác vụ xử lý hình ảnh tốn nhiều thời gian ngay trong quá trình thu nhận hình ảnh:• Làm mờ để xóa nền 2D nhanh chóng và dễ

dàng với kết quả định lượng chân thực.• Hỗ trợ lựa chọn các phương pháp xử lý, như

deconvolution, xử lý ảnh chụp Airyscan, chuyển đổi sơ cấp, xóa nhiễu hoặc làm sắc nét với mặt nạ unsharp.

• Sử dụng luồng dữ liệu để thiết lập một chuỗi các chức năng xử lý hình ảnh.

• Xử lý từ xa giúp tối đa hóa tài nguyên máy tính trong quá trình thu nhận ảnh.

• So sánh tức thời song song dữ liệu sơ cấp và dữ liệu đã xử lý.

Nhấp vào đây để xem video này

› Tổng quan

› Ưu điểm

› Ứng dụng

› Hệ thống


› Dịch vụ

https://zeiss.wistia.com/medias/rrka04ge9g

19

XỬ LÝ:Đảo ngược hiệu ứng mờ (Deconvolution)Sử dụng thuật toán đảo ngược 3D để cải thiện hình ảnh lớp cắt 3D của bạn:• Xử lý hiệu quả trên nhiều CPU• Tăng cường tốc độ thông qua tăng tốc GPU

bằng card đồ họa chuyên dụng tương thích CUDA.

• Khả năng cải thiện độ phân giải tới 120 nm (tùy thuộc vào hệ tạo ảnh).

• Tương thích với kính hiển vi trường rộng thông thường, Apotome, Lightsheet 7, kính hiển vi đồng tiêu hoặc đa photon.

• Bằng cách thay đổi các tham số, có thể lựa chọn sử dụng bốn phương pháp chính, cộng với hơn 15 phương pháp đã được công bố (ví dụ: Richardson-Lucy).


XỬ LÝ:Mở rộng lấy nét (Extended Focus)Tạo hình ảnh không giới hạn độ sâu trường ảnh• Trích xuất chi tiết sắc nét từ các hình ảnh riêng

lẻ ở các vị trí lấy nét khác nhau và kết hợp thành một hình ảnh có độ sâu trường ảnh cao.

• Xử lý ảnh Z stacks đã được thu nhận.• Thuật toán Wavelet cho phép sử dụng trong

ánh sáng truyền qua, ánh sáng phản xạ và huỳnh quang

XỬ LÝ:Hộp công cụ xử lý EM (EM Processing Toolbox)Chọn từ danh sách các công cụ xử lý để cải thiện bộ dữ liệu EM của bạn:• Dễ dàng nhập thêm hình ảnh EM thu nhận với

SmartSEM vào mô-đun ZEN Nhập từ bên thứ ba.• Loại bỏ các tín hiệu lạ như nhiễu và sọc• Dựng lại bộ dữ liệu 3D từ các hình ảnh 2D tiếp

nối: Cân bằng và căn chỉnh các bộ dữ liệu của bạn bằng công cụ căn chỉnh z-alignment tự động.

• Thay thế các ảnh lát cắt riêng lẻ có chất lượng kém trong ảnh chụp cắt lớp Z stack 3D.

• Cắt các vùng 3D dạng tự do theo ý muốn nhằm loại bỏ các vùng không cần thiết khỏi bộ dữ liệu EM để quan sát được ảnh 3D tùy chỉnh hơn.

› Tổng quan

› Ưu điểm

› Ứng dụng

› Hệ thống


› Dịch vụ

ImageJ

MATLAB Python

FIJI

20

XỬ LÝ:Xử lý & phân tích nâng cao (Advanced Processing & Analysis)*Mở rộng các chức năng xử lý và thực hiện các phản hồi thí nghiệm• Thêm nhiều tập hợp chức năng xử lý ảnh:

Cạnh, Số học, Hình thái học, Phân đoạn và Nhị phân.

• Phản hồi thí nghiệm cho phép điều chỉnh và sửa đổi các thí nghiệm đang chạy bằng cách sử dụng các tập lệnh Python.

• Truy cập kết quả từ phân tích hình ảnh trực tuyến trong thời gian chạy thí nghiệm cũng như trạng thái hệ thống hiện tại.

• Ghi dữ liệu hoặc khởi động các ứng dụng ngoài như Python, Fiji hoặc MATLAB trực tiếp trong khi chụp ảnh thí nghiệm.


* cần có mô-đun ZEN Image Analysis

XỬ LÝ:APEER On-siteSử dụng các mô-đun APEER được tích hợp đầy đủ trong ZEN• Sử dụng các mô-đun APEER chung và cá nhân

để kích hoạt các tính năng xử lý và phân tích bổ sung và quy trình làm việc trong ZEN bao gồm cả viết lệnh Python.

• Tập hợp các công cụ của riêng bạn vào một mô-đun APEER và sử dụng chúng trong ZEN.

• Hỗ trợ thực hiện từ xa trong cơ sở hạ tầng CNTT cục bộ của người dùng.

• Thực hiện các chức năng phân tích hình ảnh mã nguồn mở và tùy chỉnh trong ZEN (tại chỗ), được cung cấp qua APEER, nền tảng xử lý dữ liệu và hình ảnh dựa trên đám mây.**

Liên hệ: [email protected]

** Nếu bạn cần hỗ trợ phát triển các giải pháp tùy chỉnh, chúng tôi có một đội ngũ các nhà khoa học dữ liệu giúp nhanh chóng phát triển các ứng dụng bằng cách sử dụng các công cụ học máy và truyền thống.

XỬ LÝ:Môi trường Macro (Macro Environment)Tùy chỉnh và tự động hóa ZEN bằng cách sử dụng các tập lệnh Python mạnh mẽ:• Trình chỉnh sửa tập lệnh tích hợp với các tính

năng gỡ lỗi, ghi và hoàn thành mã.• Có thể dễ dàng tích hợp các mô-đun APEER và

các gói phần mềm ngoài như Python, MATLAB hoặc Fiji trong một quy trình làm việc tự động.

• Sử dụng IronPython để tích hợp các chức năng dựa trên .NET.

› Tổng quan

› Ưu điểm

› Ứng dụng

› Hệ thống


› Dịch vụ

21

PHÂN TÍCH:Phép đo (Measurements)Thực hiện các phép đo tương tác• Đo các thông số hình thái của các biên dạng đã

được xác định tương tác: diện tích, góc định hướng, chu vi, đường kính, trọng tâm, bán kính của hình tròn có diện tích bằng nhau, hệ số hình dạng, hộp giới hạn, hình chiếu, v.v.

• Đo các giá trị mật độ cho hình chữ nhật và biên dạng.

• Tự do định cấu hình tất cả các công cụ đo lường tương tác hiển thị các thông số mong muốn trong bảng, danh sách hoặc đồ thị.

• Tùy chọn dành cho việc đo lường tương tác trong hình ảnh trực tuyến.

TRỰC QUAN HÓA:3Dxl*Trực quan hóa ảnh cắt lớp 3D/4D:• Hiển thị các mô hình khối 3D bằng cách sử

dụng công nghệ dò tia hiệu quả, ngay cả đối với dữ liệu lớn.

• Hiển thị tối đa 6 kênh và chuỗi thời gian.• Chọn từ năm phương pháp kết xuất: Độ trong

suốt, Khối, Phép chiếu cường độ tối đa, Bề mặt, kết hợp các phương pháp với tối đa ba mặt phẳng cắt.

• Chế độ trong suốt được cải thiện giúp trực quan hóa các cấu trúc đặc tốt hơn, chẳng hạn như EM, XRM và dữ liệu huỳnh quang đặc.

• Chức năng cầu nối: Gửi hình ảnh tới arivis vision4D với các cài đặt đã lưu và các luồng dữ liệu mẫu để phân tích 3D nhanh chóng và dễ dàng.

• Tạo hình ảnh động.

TRỰC QUAN HÓA:3Dxl Plus*Mô-đun này sử dụng trình xem Tomo3D:• Kết xuất tối đa ba khung giao diện xem 2D và

một khung giao diện xem 3D cùng lúc.• Chế độ xem 3D có tính năng kết xuất khối

dựa trên kỹ thuật chiếu tia sáng với các chế độ trong suốt, khối và cường độ tối đa.

• Điều chỉnh chế độ xem 3D, màu nền và ánh sáng theo kênh thông minh linh hoạt.

• Vị trí của ba khung giao diện xem 2D trực giao được đồng bộ hóa với chế độ xem 3D.

• Điều hướng qua các mẫu và hình chiếu bằng các đường cắt màu.

* hỗ trợ bởi arivis


› Tổng quan

› Ưu điểm

› Ứng dụng

› Hệ thống


› Dịch vụ

22

PHÂN TÍCH:Dò điểm tự động (Automated Spot Detection)Từ ứng dụng BioApps, chúng tôi cung cấp phân tích hình ảnh mang tính đột phá, trình bày kết quả phù hợp với các bảng đo lường có tính tương tác, biểu đồ nhiệt và các sơ đồ.• Tự động định lượng các điểm trong nhân tế

bào.• Áp dụng cho các ứng dụng FISH, phân tích

telomere / centromere hoặc đếm tiêu điểm.• Đo tổng số điểm, số điểm trung bình trên mỗi

tế bào hoặc mật độ điểm trung bình.• Được tối ưu hóa cho các phép đo trong các

ứng dụng sàng lọc với thiết lập trên đĩa đa giếng.

PHÂN TÍCH:Phân tích hình ảnh (Image Analysis)Tạo một chương trình đo tự động do một trình hướng dẫn phần mềm trực quan hướng dẫn:• Linh hoạt thiết lập các lớp và lớp phụ• Phân đoạn đối tượng bằng cách chọn một vài

đối tượng tham chiếu, hoặc bằng cách tự động lập ngưỡng hoặc dựa trên máy học.

• Tinh chỉnh kết quả bằng bộ lọc và khả năng tách đối tượng bổ sung.

• Đo các đặc điểm hình học và mật độ của các đối tượng riêng rẽ hoặc trong toàn bộ hình ảnh.

• Kiểm tra kết quả nhanh chóng bằng cách sử dụng sơ đồ tương tác (sơ đồ đường thẳng, biểu đồ tần suất, biểu đồ phân tán, biểu đồ nhiệt), với liên kết trực tiếp giữa các hình ảnh và bảng biểu.

• Xuất kết quả dưới dạng bảng hoặc danh sách để phân tích thêm.

PHÂN TÍCH:Đếm tế bào (Cell Counting)Từ ứng dụng BioApps, chúng tôi cung cấp phân tích hình ảnh mang tính đột phá, trình bày kết quả phù hợp với các bảng đo lường có tính tương tác, biểu đồ nhiệt và các sơ đồ.• Tự động phát hiện nhân tế bào được đánh dấu

huỳnh quang trong các mẫu sinh học.• Thích hợp để đo lường khả năng sinh sôi hoặc

khả năng sống.• Đo số lượng tế bào, cường độ hạt nhân tế bào,

cường độ trung bình và diện tích trung bình.• Được tối ưu hóa cho các phép đo trong các

ứng dụng sàng lọc với thiết lập đĩa giếng chứa mẫu.


› Tổng quan

› Ưu điểm

› Ứng dụng

› Hệ thống


› Dịch vụ

23

PHÂN TÍCH:IntellesisKích hoạt các thuật toán máy học để phân đoạn hình ảnh:• Huấn luyện một mô hình phân đoạn hình ảnh

đơn giản thực hiện gắn nhãn dữ liệu của bạn hoặc nhập các mạng thần kinh nhân tạo sâu được huấn luyện trước.

• Hỗ trợ toàn diện bất kỳ bộ dữ liệu đa chiều nào bao gồm các ô, chụp Z stack hoặc hình ảnh đa kênh.

• Tương thích với hầu hết các định dạng hình ảnh phổ biến như CZI, OME-TIFF và các định dạng bên thứ ba nhập từ các nhà cung cấp khác.

• Tích hợp hoàn toàn với luồng dữ liệu phân tích hình ảnh ZEN và giao diện viết lệnh.

• Gói PyPi mã nguồn mở để cho phép sử dụng các mạng được huấn luyện bên ngoài ở trong ZEN.

PHÂN TÍCH:Hội lưu (Confluency)Từ ứng dụng BioApps, chúng tôi cung cấp phân tích hình ảnh mang tính đột phá, trình bày kết quả phù hợp với các bảng đo lường có tính tương tác, biểu đồ nhiệt và các sơ đồ.• Tự động định lượng sự hội lưu của tế bào trực

tiếp từ ánh sáng truyền qua hoặc hình ảnh huỳnh quang.

• Có thể áp dụng để kiểm soát chất lượng trong các xét nghiệm tế bào và số liệu đưa ra trong các xét nghiệm chữa thương.

• Đo diện tích được tế bào bao phủ hoặc phần trăm diện tích.

• Được tối ưu hóa cho các phép đo trong các ứng dụng sàng lọc với thiết lập trên đĩa đa giếng.

PHÂN TÍCH:Biểu hiện gen và protein (Gene and Protein Expression)Từ ứng dụng BioApps, chúng tôi cung cấp phân tích hình ảnh mang tính đột phá, trình bày kết quả phù hợp với các bảng đo lường có tính tương tác, biểu đồ nhiệt và các sơ đồ.• Tự động định lượng hiệu quả chuyển nạp trong

nuôi cấy tế bào 2D.• Có thể áp dụng cho các giao thức chuyển nạp

hoặc chọn các clone dương tính.• Đo mức độ phân bố của các phân tử được

đánh dấu trong một quần thể tế bào.• Định lượng khả năng lây nhiễm vi-rút hoặc vi

khuẩn.• Đo tổng số và phần trăm tế bào dương tính

cũng như cường độ tín hiệu trung bình.• Được tối ưu hóa cho các phép đo trong các

ứng dụng sàng lọc với thiết lập đĩa trên đĩa đa giếng.


› Tổng quan

› Ưu điểm

› Ứng dụng

› Hệ thống


› Dịch vụ

24

PHÂN TÍCH:Phân tích hiệu quả FRAP (FRAP Efficiency Analysis)Phân tích FRAP / FLIP hoặc các thu nhận chuỗi thời gian tương tự:• Phân tích các thu nhận chuỗi thời gian với các

sự kiện tẩy màu để xác định nửa thời gian khôi phục / giảm tín hiệu huỳnh quang.

• Hỗ trợ các thuật toán phù hợp theo cấp số đơn hay cấp số nhân bao gồm các tùy chọn để chỉnh sửa nền và sửa lỗi tẩy màu huỳnh quang do tạo ảnh gây ra.

• Khả năng đánh giá ROI theo nhóm.

PHÂN TÍCH:FRETPhân tích bộ dữ liệu FRET:• Hỗ trợ hiện tượng phát xạ nhạy sáng và tẩy

màu huỳnh quang thụ thể.• Bao gồm chế độ xem FRET đặc biệt với tính

toán các thông số điều khiển và hiển thị mã màu của các hình ảnh thu được cũng như sự thay đổi cường độ của các vùng hình ảnh đã chọn.

• Hỗ trợ các phương pháp phổ biến nhất: Gordon, Xia, Youvan.


PHÂN TÍCH:Phân loại đối tượng Intellesis (Intellesis Object Classification)Kích hoạt các thuật toán máy học để phân loại các đối tượng được phân đoạn.• Môi trường huấn luyện với phân công lớp trực

quan• Tương thích với các đối tượng thu được bằng

phân đoạn thông thường hoặc phân đoạn Intellesis

• Hỗ trợ toàn diện bất kỳ bộ dữ liệu đa chiều nào bao gồm các ảnh vùng ô, ảnh chụp Z stack hoặc hình ảnh đa kênh

• Tương thích với hầu hết các định dạng hình ảnh phổ biến như CZI, OME-TIFF và các định dạng bên thứ ba nhập từ các nhà cung cấp khác

• Các thuật toán máy học mã nguồn mở được thiết lập tốt, được hỗ trợ bởi Python, TensorFlow, ONNX, Scikit-Learn và Dask

› Tổng quan

› Ưu điểm

› Ứng dụng

› Hệ thống


› Dịch vụ

25


PHÂN TÍCH:Sinh lý học (Động lực học) Physiology (Dynamics)Sử dụng một phương thức mang tính tương tác và linh hoạt để đo sự dao động của ion tốc độ cao như canxi nội bào trong mẫu vật sống:• Hỗ trợ tạo ảnh với bước sóng đơn (ví dụ như

Fluo-4) và thuốc nhuộm bước sóng kép (ví dụ: Fura-2).

• Cho phép tính toán tỷ lệ và hiển thị hình ảnh tỷ lệ trực tuyến.

• Lập biểu đồ linh hoạt và hiển thị hình ảnh. Hiển thị bảng dữ liệu trực tuyến và ngoại tuyến nhờ chức năng xuất dữ liệu.

• Sử dụng các lệnh chuyển có thể xác định cho các chú thích trực tuyến và thay đổi tốc độ thu nhận. Có thể tạm dừng và lấy nét lại thông qua chế độ xem camera trực tiếp.

• Bộ kích hoạt TTL có thể định cấu hình tự do.

PHÂN TÍCH:ColocalizationĐịnh lượng colocalization trên hai kênh:• Phân phối pixel giá trị thang xám được hiển

thị trong hai kênh với sự trợ giúp của biểu đồ phân tán chia bốn góc. Liên kết biểu đồ phân tán, hình ảnh và bảng dữ liệu.

• Vẽ nhiều vùng vào hình ảnh. Bảng dữ liệu hiển thị các giá trị đo được một cách sống động cho cả toàn bộ hình ảnh và các vùng riêng lẻ.

• Hiển thị và xuất 17 giá trị đo được ra một bảng dữ liệu có thể được xuất để phân tích thêm.

› Tổng quan

› Ưu điểm

› Ứng dụng

› Hệ thống


› Dịch vụ

26

Ảnh do G. Eichele, Khoa Di truyền và Hành vi, Viện Hóa lý Sinh Max Planck, Göttingen, Đức cung cấp

KẾT NỐI:Kết nối (Connect)*Mở rộng chức năng cơ bản của ZEN Connect bằng quy trình làm việc tập trung vào mẫu vật để thu nhận và tương quan hình ảnh từ các công cụ khác nhau như kính hiển vi quang học hoặc điện tử:• Kiểm soát tương tác chuyển động của bàn sa

trượt từ không gian làm việc ZEN Connect.• Nhập hình ảnh vào dự án.• Nhập hình ảnh hiển vi của bên thứ ba được hỗ

trợ định dạng Bio-Formats.• Xuất chế độ xem dự án đã hợp nhất dưới dạng

hình ảnh hoặc video lướt qua.• Xuất ra SerialEM.

LƯU TRỮ:Máy khách lưu trữ dữ liệu (Data Storage Client)Mô-đun này cung cấp quyền truy cập vào giải pháp phòng thí nghiệm kết nối ZEN Data Storage.• Lưu trữ tập trung và truy cập đồng thời linh

hoạt đối với các hình ảnh và dữ liệu của bạn.• Quản lý dữ liệu tập trung, thông minh bao gồm

quản lý truy cập và chia sẻ dữ liệu.• Quản lý người dùng tập trung với phân quyền

dựa trên nhiệm vụ.• Tách biệt giữa thu nhận và phân tích hình ảnh.• Truy cập dựa trên web vào dữ liệu từ mọi nơi

thông qua ZEN Data Explorer đi kèm.• Các ứng dụng của ZEN Data Explorer có sẵn

cho điện thoại thông minh và máy tính bảng trên cả hệ điều hành của Apple và Android.

* Có sẵn các tiện ích bổ sung để mở rộng chức năng của ZEN Connect. Để biết thêm thông tin, vui lòng xem thông tin riêng của sản phẩm.


› Tổng quan

› Ưu điểm

› Ứng dụng

› Hệ thống


› Dịch vụ

Dịch vụ ZEISS - Luôn đồng hành cùng bạnHệ thống kính hiển vi của ZEISS là một trong những công cụ quan trọng nhất của bạn. Hơn 170 năm qua, thương hiệu ZEISS và kinh nghiệm của chúng tôi đã đại diện cho sự tin cậy và tuổi thọ lâu dài của thiết bị trong lĩnh vực kính hiển vi. Bạn có thể tin tưởng vào dịch vụ và hỗ trợ khách hàng vượt trội của chúng tôi - cả trước và sau lắp đặt. Đội ngũ dịch vụ ZEISS lành nghề của chúng tôi đảm bảo rằng kính hiển vi của bạn luôn sẵn sàng để sử dụng.

Cung ứng• Quy hoạch phòng thí nghiệm & Quản lý công

trường• Kiểm tra công trường & phân tích môi trường• IQ / OQ tiêu chuẩn GMP• Lắp đặt & Bàn giao• Hỗ trợ tích hợp CNTT• Đào tạo khởi động

Đầu tư mới• Ngừng sử dụng• Thu cũ đổi mới

Vận hành• Dịch vụ dự đoán giám sát từ xa• Kiểm tra & Bảo trì phòng ngừa

• Hợp đồng bảo trì phần mềm• Đào tạo vận hành và ứng dụng

• Hỗ trợ của chuyên gia qua điện thoại & từ xa• Bảo vệ các hợp đồng dịch vụ

• Hiệu chuẩn đo lường• Di chuyển thiết bị

• Vật tư tiêu hao• Sửa chữa

Nâng cấp• Kỹ thuật tùy chỉnh

• Nâng cấp & Hiện đại hóa• Quy trình làm việc tùy chỉnh qua APEER

Xin lưu ý: Khả năng cung cấp dịch vụ tùy thuộc vào dòng sản phẩm và từng khu vực >> www.zeiss.com/microservice

27

› Tổng quan

› Ưu điểm

› Ứng dụng

› Hệ thống


› Dịch vụ

https://www.zeiss.com/microscopy/int/service-support.html

Sản

phẩm

này

khô

ng c

ó tá

c dụ

ng c

hữa

bệnh

, điề

u tr

ị hoặ

c dù

ng là

m c

ơ sở

chẩ

n đo

án y

tế. S

ản p

hẩm

chỉ

đượ

c bá

n tạ

i một

số

quốc

gia

. Liê

n hệ

với

đại

diệ

n củ

a ZE

ISS

tạ

i địa

phư

ơng

để b

iết t

hêm

thôn

g tin

.VN

_41_

011_

038

| Phi

ên b

ản 3

.4 |

CZ 0

6-20

21 |

Thiế

t kế,

phạ

m v

i gia

o hà

ng v

à tiế

n bộ

kỹ

thuậ

t có

thể

thay

đổi

mà

khôn

g cầ

n bá

o tr

ước.

| ©

Car

l Zei

ss M

icro

scop

y G

mbH

Carl Zeiss Microscopy GmbH07745 Jena, Đứ[email protected]

http://facebook.com/zeissmicroscopy

http://flickr.com/zeissmicro

http://www.twitter.com/zeiss_micro

http://www.youtube.com/zeissmicroscopy

mailto:microscopy%40zeiss.com?subject=

Thu nhận. Xử lý. Trực quan hóa. Phân tích. Kết nối. Lưu trữ.

Documents

Transcript of Thu nhận. Xử lý. Trực quan hóa. Phân tích. Kết nối. Lưu trữ.