Tugas Evidance Based Medicine

7/30/2019 Tugas Evidance Based Medicine

http://slidepdf.com/reader/full/tugas-evidance-based-medicine 1/19

TUGAS EVIDANCE BASED

MEDICINEDIAGNOSTIC

DETECTION OF SALMONELLA TYPHI BY

NESTED POLYMERASE CHAIN REACTION IN

BLOOD, URINE, AND STOOL SAMPLES



Skenario

• Pasien berusia 21 tahun datang ke RS dengan

keluhan demam selama hampir 2 minggu dengan

frekuensi demam meningkat perlahan terutama

pada waktu sore hari hingga malam hari. Dokter mendiagnosis demam tifoid dan dokter

melakukan pemeriksaan kultur. Dokter

menyarankan untuk melakukan pemeriksaan

dengan PCR.



Foreground Question

• Apakah pemeriksaan PCR sama baiknya dengan

pemeriksaan kultur dalam menegakan diagnosis

demam tifoid?



PICO

• P : Pasien 21 tahun dengan demam tifoid

• I : Pemeriksaan PCR

• C : Pemeriksaan Kultur • O : Pemeriksaan yang cepat untuk

mendiagnosis demam tifoid



• Type of Question: Diagnosis

• Keyword: typhoid AND culture AND PCR

• Type of study: (-)

• Artikel yang dipilih: DETECTION OF

SALMONELLA TYPHI BY NESTED

POLYMERASE CHAIN REACTION IN BLOOD,URINE, AND STOOL SAMPLES

•

Hasil pencarian: www.highwire.standford.edu



RESUME JURNAL

Demam tifoid merupakan masalah kesehatan yang banyak

terjadi di negara berkembang. Sebagian besar terjadi di negara-

negara berpenghasilan rendahDemam tifoid disebabkan oleh Salmonella enterica serovar

Typhi dan ditularkan melalui rute fekal-oral dengan

mengkonsumsi air yang tercemar dan didalam makanan. Pasien

dalam masa penyembuhan dapat meningkatan risiko infeksi.Faktor risiko lainnya adalah kemiskinan, tingkat pendidikan

yang rendah, kondisi higienis dan pasokan air yang buruk



• Secara khusus rantai polimerase reaksi (PCR) yang mampu

mendeteksi dalam jumlah menit DNA patogen tertentu melalui

amplifikasi segmen DNA.

• Song dan teman-teman, menggambarkan PCR nested untuk

mendeteksi DNA S. typhi dalam darah. Dalam studi ini, kami

menilai sensitivitas PCR nested pada sampel darah danmenyelidiki apakah metode tersebut dapat digunakan untuk

deteksi dari S. typhi DNA dalam urin dan sampel tinja. Untuk

sampel darah ini berakhir, urin dan tinja dari pasien dengan

demam tifoid dicurigai diuji dan hasilnya dibandingkandengan kultur darah dan tes Widal.



BAHAN DAN METODE

Sampel : 131 pasien 68 positif demam tifoid dengan pemeriksaan kultur

51 dengan gejala dan tanda seperti demam tifoid

12 non tifoidLokasi : Makassar, Sulawesi Selatan (di dua rumah sakit yang berbeda dan satu pusat kesehatan)

Kriteria :

Range : 6-54 tahun, median : 20 tahun

Demam tinggi secara terus menerus (suhu rata-rata = 38 ° C, rangen = 37,2-40 ° C)

Splenomegali

Gejala konstitusional

Durasi penyakit rata-rata 7 hari (kisaran 4-15 hari)

Sampel darah untuk kultur dan PCR, dan sampel serumuntuk analisis serologi dikumpulkan dari semua

pasien. Sampel urin dikumpulkan dari 105 pasien (60 laki-laki dan 45 perempuan), dan sampel tinja dikumpulkandari 50 pasien (38 laki-laki dan 12 perempuan). Spesimendikumpulkan pada hari yang sama atau dalam waktu 1-2

hari setelah konsultasi pertama.



PENGAMBILAN SAMPLE

• Kultur darah. Darah segar yang dikumpulkan ditempatkan

dalam kaldu Ox empedu dan diinkubasi selama 24 jam padasuhu 37 ° C. Salah satu ml kemudian letakkan pada sediaan

agar Salmonella Shigella (SS) dan diinkubasi selama 24 jam

pada suhu 37 ° C, dan diperiksa pertumbuhan. Jika ada

pertumbuhan, koloni kuman diperiksa dengan pewarnaan

Gram

• Analisis serologis. Tes widal dengan antigen O

menunjukkan dan menginterventasikan telah sesuai dengan

prosedur laboratorium rutin. Titer A = 1:320 dianggap positif.

• Persiapan DNA dari darah, feses, dan urin. DNA diekstraksidari darah segar yang dikumpulkan, urin, dan sampel tinja

menurut diatom-guanidinium isotiosianat metode (GuSCN)

dijelaskan oleh Boom dan teman-teman



HASIL

Berdasarkan hasil gabungan dari kultur darah, tiga PCR (PCR

pada darah, PCR pada urine, PCR pada feses) dan uji Widal,

sensitifitasnya adalah 61,8%, 84,5%, 46,9%, 69,3%, dan39 %. Sensitivitas dari PCR nested pada darah (P <0,001) dan

urin (P = 0,01) secara signifikan lebih tinggi, dan sensitivitas

PCR nested pada feses (P> 0,05) adalah mirip dengan sensitivitas

kultur darah.



PEMBAHASAN

• Pasien dengan demam selama 3-30 hari diuji dan menunjukkan

bahwa sensitivitas yang lebih tinggi didapatkan pada PCR

dibandingkan dengan kultur darah. Hal ini diakibatkan dari penggunaan antibiotik sebelumnya dan riwayat penyakit yang

relatif lama. Dalam penelitian kami, kebanyakan pasien tifus

didiagnosis pada tahap awal dan dilaporkan memiliki demam

kurang dari 10 hari. Sensitivitas PCR pada darah adalah 84,5%dibandingkan dengan 61,8% untuk kultur darah dan tertinggi

(95%) untuk sampel-sampel yang dikumpulkan selama lima

hari pertama sakit.



KESIMPULAN

• Kultur darah relatif tidak sensitif dan memakan waktu.

• Sensitivitas dan spesifisitas dengan uji Widal terlalu rendah

untuk digunakan dalam diagnosis demam tifoid.

• PCR nested bisa menjadi alternatif yang menarik dalam

mendiagnosis demam tifoid. Namun, PCR relatif rumit untuk dilakukan dan tidak cocok untuk digunakan dalam praktek

klinis rutin di laboratorium, dimana demam tifoid merupakan

endemic di negara tersebut. Di negara-negara di mana S.

paratyphi adalah penyebab umum dari demam enterik, metodeini tidak akan berguna. Studi ini menunjukkan bahwa

kebutuhan untuk alat diagnostik demam tifoid ditingkatkan

dan disesuaikan dengan kebutuhan di daerah endemic.



TELAAH KRITIS

1. Apakah terdapat ketersamaan dengan baku

emas? Ya, sama-sama digunakan untuk

mendeteksi kuman Salmonella typhii



2. Apakah sampel subjek penelitian meliputi spectrum

penyakit dari yang ringan sampai berat, penyakit yangterobati dan tidak terobati? Ya, dijelaskan pada bagian

materials and methods, paragraf pertama, baris 1 –

10



3. Apakah lokasi penelitian disebutkan dengan jelas? Ya, di 2 RS yang berbeda dan 1 pusat

kesehatan di dekat Makassar, Sulawesi Selatan

4. Apakah presisi uji diagnostic dan variasi

pengamatan dijelaskan? Sebagian benar, dalam

jurnal dijelaskan sensitivitas secara detail tetapitidak dijelaskan variabelnya



5. Apakah istilah normal dijelaskan? Tidak dijelaskandidalam jurnal

6. Apakah uji diagnosis yang diteliti merupakan bagian

dari suatu kelompok uji diagnosis, dan apakah

kontribusinya pada kelompok uji diagnosis tersebut

dijelaskan? Tidak, dalam jurnal tidak ada pembagian

subgrup



7. Apakah cara dan tehnik melakukan uji diagnosis yang

sedang diteliti dijelaskan sehinggadapat direplikasi? Ya,

dijelaskan pada bagian materials and methods, paragraf ke-3, 4, 5 dan 6

8. Apakah kegunaan uji diagnosis yang sedang diteliti

disebutkan? Ya, dijelaskan pada bagian discussion,

paragraph terakhir



•TERIMAKASIH

Tugas Evidance Based Medicine

Documents

Transcript of Tugas Evidance Based Medicine