Tugas Bakteri Uphie Karakteristik yang Digunakan Dalam Mengidentifikasi Bakteri Jenis Baru Dalam...

4
Karakteristik yang Digunakan Dalam Mengidentifikasi Bakteri Jenis Baru Dalam Jurnal “Akkermansia muciniphila Gen. nov., sp. nov., a Human Intestinal Mucin-degrading Bacterium (1) 1. Penjelajahan dalam situs NCBI (http://www.ncbi.nlm.nih.gov/Taxonomy/Browser/ wwwtax.cgi? mode=Undef&id=2&lvl=3&srchmode=1&keep=1&unlock) 1 Nama : Juprianto NIM : 1103135492 Tugas : Bakteriologi 13 Januari 2015

Transcript of Tugas Bakteri Uphie Karakteristik yang Digunakan Dalam Mengidentifikasi Bakteri Jenis Baru Dalam...

Karakteristik yang Digunakan Dalam Mengidentifikasi Bakteri Jenis Baru Dalam Jurnal Akkermansia muciniphila Gen. nov., sp. nov., a Human Intestinal Mucin-degrading Bacterium (1)Nama: JupriantoNIM: 1103135492Tugas: Bakteriologi13 Januari 2015

1. Penjelajahan dalam situs NCBI(http://www.ncbi.nlm.nih.gov/Taxonomy/Browser/wwwtax.cgi?mode=Undef&id=2&lvl=3&srchmode=1&keep=1&unlock)

Chlamydiae/Verrucomicrobia Verrucomicrobiae

Akkermansia

Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835

2. Karakteristik yang Diamati dalam menemukan Spesies BaruPada jurnal Derrien et al. (2004) bakeri yang akan diidentifikasi berasal dari kotoran manusia dewasa yang sehat. Kotoran manusia diencerkan dan dihitung dengan metode Most Probable Number (MPN) menggunakan medium yang diperkaya mucin sebagai sumber karbon dan energi tunggal. Bakteri tersebut kemudian dianalisis urutan nukleutida 16S rRNA menggunakan PCR-DGGE.Selain analisis urutan nukleutida 16S rRNA, juga di amati motilitas dan spora bakteri menggunakan mikroskop kontras fase (phase-contrast microscope), analisis gram menggunakan pewarnaan gram dan menguji keberadaan kapsul menggunakan suspensi tinta india. Selain itu digunakan juga mikroskop elektron seperti Scanning Electron Microscope (SEM) dan Transmission Electron Microscopy (TEM) untuk mengetahui gambar tiga dimensi sel bakteri dan bagian bagian sel bakteri lebih mendetail. Karakter-karakter dari bakteri jenis baru yang ditemukan yaitu bakteri dari genus Akkermansia devisi Verrucomicrobia adalah :

1