Reaksi Enzim
description
Transcript of Reaksi Enzim
Kinetika Enzim
Departemen Biokimia
Reaksi Enzim
Reaksi Enzim
Reaksi Enzim
Leonor Michaelis & Maud Menten
Persamaan Michaelis-Menten:
V0 Laju/kecepatan awal enzimVmaks Laju/Kecepatan maksimum enzim
Km Konstanta Mechaelis-Menten (konsentrasi substrat pada saat
kecepatan setengah dari Vmaks)[S] Konsentrasi Substrat
Kinetika Enzim
Bila [S] Km , maka V berbanding lurus dengan (S)
Bila [S] = Km , maka V = 1/2 Vmax Bila [S] Km , maka V = Vmax
Kinetika Enzim
Plot double reciprocal atau plot Lineweaver-Burk
Penentuan Km dan Vmax
•Plot 1/[S] vs 1/Vo
•Persamaan L-B (garis lurus/linier)•X-intercept = -1/Km•Y-intercept = 1/Vmax
BB
B
BB B
B
0
0.05
0.1
0.15
0.2
0.25
0 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10
Vo
[S]
[S] Vo0.5 0.0750.75 0.092 0.1524 0.1966 0.218 0.21410 0.23
V max
KmKm ~ 1.3 mM
Vmax ~ 0.25
Penentuan Km dan Vmax
Penentuan Km dan Vmax
[S] Vo2.000 13.3331.333 11.1110.500 6.5790.250 5.1020.167 4.7620.125 4.6730.100 4.348
B
B
B
BBBB
B0
2
4
6
8
10
12
14
-1 -0.5 0 0.5 1 1.5 2
Vo
[S]
-1/Km = -0.8Km = 1.23 mM1/Vmax = 4.0Vmax = 0.25
Km ???1. Km = [S] pada ½ Vmax
2. Km affinitas enzim dengan substrat3. Km dapat digunakan untuk
mengevaluasi spesifisitas enzim untuk berikatan dengan substrat
4. Nilai Km kecil artinya affinitas enzim-substrat tinggi; sebaliknya Km tinggi affinitas enzim-substrat rendah
Glucose Km = 8 X 10-6
Allose Km = 8 X 10-3
Mannose Km = 5 X 10-6
Hexose KinaseGlucose + ATP <-> Glucose-6-P + ADP
Inhibisi Enzim
Inhibitor reveribel
E + S <-> ES -> E + PE + I <-> EI
Ki = [E][I]/[EI]• Competitive• Non-competitive
Inhibisi Enzim
• Inhibitor mempunyai struktur yang mirip dengan substrat
• Terjadi kompetisi antara substrat dengan inhibitor untuk bergabung dengan sisi aktif enzim
• Efek inhibitor dapat dihilangkan dengan penambahan substrat
Kompetitif:
Inhibisi Enzim
Non-Kompetitif • Peningkatan kadar substrat tdk dapat meniadakan efek inhibitor
• Menurunkan harga Vmax• Berikatan dengan enzim pada
tempat yang berbeda dengan tempat pengikatan substrat dan strukturnya tidak mirip substrat
• Dapat mengikat enzim bebas (E) maupun kompleks enzim-substrat
Kompetitif Non-Kompetitif
Plot Lineweaver-Burk
Aplikasi Inhibitor
-COOHH2N-
-SONH2H2N-
SulfanilamideSulfa drug (anti-inflammation)
Para-aminobenzoic acid (PABA)
Bakteri memerlukan PABA Untuk biosintesis asam folat, sehingga bakteri dapat tumbuh
Domagk (1939)
•Sulfanilamid mempunyai struktur yang sama dengan PABA,
sehingga bakteri tidak dapat tumbuh
• Sebagai inhibitor enzim• Inhibitor kompetitif
Quiz
1. Gambarkan hubungan antara kecepatan reaksi (aktivitas) terhadap substrat (S)
2. Bagaimana cara menentukan nilai Km dari gambar (pada no 1)3. Apa perbedaannya penentuan Km dengan kurva LWB4. Bandingkan, lebih akurat yang mana penentuan Km (pada soal
no 2) dengan (soal no 3)5. Berikan alasan singkat6. Berikan definisi nilai Km