PPT RP

8
Ramachandran plot Oleh: Handariatul M. (121810301003) Tiara Farah H. (12181030)

description

ramachandran

Transcript of PPT RP

Page 1: PPT RP

Ramachandran plot

Oleh:Handariatul M. (121810301003)Tiara Farah H. (12181030)

Page 2: PPT RP

Plot Ramachandran

Struktur Protein Disebut juga dengan plot [ϕ,ѱ]

Gopalasamudram Ramachandran, pada

tahun 1963

Page 3: PPT RP

plot ramachandranCara untuk memvisualisasikan sudut dihedral ψ terhadap φ pada residu asam amino dalam struktur protein

Menunjukkan kombinasi perputaran sudut ψ dan φ yang dilarang dan yang diijinkan pada konformasi struktur skunder protein

Indikator penting dalam menaksirkan kualitas struktur 3 dimensi dari protein

Page 4: PPT RP

Sudut Torsi Rantai Polipeptida

Page 5: PPT RP

Contoh perputaran sudut ѱ

Page 6: PPT RP

Contoh perputaran sudut Φ

Page 7: PPT RP

Ramachandran plot, showing which atomic collisions (using a hard-sphere approximation) produce the restrictions of the main-chain angles and . The cross-hatched regions are allowed for all residues, and each boundary of a prohibited region is labeled with the atoms that collide in that conformation. Additional shaded regions are for glycine residues only. Each boundary of a prohibited region is labeled with the atoms that collide in that conformation.

Page 8: PPT RP

TERIMAKASIH