Mikrobiologi Medik

Marlia Singgih WibowoSchool of Pharmacy

Institut Teknologi Bandung

Aturan perkuliahan

• Kuliah dan tutorial (80% kehadiran)• Mahasiswa diharapkan datang tepat

waktu. 10 menit sesudah kuliah berjalan, mahasiswa yang terlambat tidak dapat masuk

• Berpakaian rapi dan memakai sepatu• Handphone di set pada posisi “silent”

Penilaian

• UTS (dilaksanakan pada minggu ke 7atau 8 sesuai jadwal ITB)

• UAS (dilakukan setelah kuliah selesai sesuai jadwal ITB )

• Tugas kelompok, Tugas individu, Partisipasi individu dalam kelas, Diskusi kelompok, Presentasi kelompok

• Kuesioner dan input

ISI KULIAH

• Pendahuluan : – Pengertian mikrobiologi– Sejarah mikrobiologi– Keragaman mikroba– Peranan mikroba dalam siklus kehidupan di

dunia• Struktur, fungsi dan komposisi kimia sel

prokariot: eubakteri, archaebakteri dan virus

Debbie & Catur

• Pertumbuhan mikroba dan virus• Patogen bakteri :

– Patogenesis bakteri – Patogen manusia

• Virus manusia• Pengendalian penyakit infeksi oleh bakteri dan

virus • Metode deteksi bakteri dan virus

Marlia & Sophi

• Struktur, fungsi dan komposisi kimia sel eukariot: ragi, kapang, protozoa

• Pertumbuhan ragi, kapang dan protozoa • Patogen fungi : Fungi patogen pada manusia,

Kontaminan pada makanan dan produk lain• Pengendalian penyakit infeksi oleh fungi dan

protozoa• Metode deteksi fungi dan protozoa

• Pengantar biosafety :– Pengelompokan mikroba berbasarkan tingkat

biosafety– Fasilitas dan persyaratan laboratorium

dengan biosafety level (BSL) 1, 2 dan 3– Biosafety cabinet tipe 1, 2 dan 3

Penilaian risiko, audit danLaboratory Safety

• Penilaian risiko• Audit mikrobiologik : Laboratory safety di bidang

mikrobiologi• Penilaian risiko : pertim-bangan farmasetik, pertim-

bangan mikrobiologik, kuantifikasi risiko, manajemen risiko

• Audit mikrobiologik : pengertian audit, auditor, pelatihan• Penggolongan mikroba berdasarkan risiko penularan,

penyebaran dan virulensinya menurut WHO• Cara penanganan dan ketentuan Biosafety• Pencegahan dan penanganan kecelakaan

Pengujian mikrobiologi untuk produk farmasi :

• Pengujian Mikrobiologi yang tercantum di Farmakope Indonesia edisi IV:– 51 Uji batas mikroba– 61 Uji efektivitas pengawet antimikroba– 71 Uji sterilitas– 131 Penetapan potensi antibiotik secara

mikrobiologi– 1321 Indikator biologik– 1371 Sterilisasi dan jaminan sterilitas bahan

kompendia

Praktikum Mikrobiologi medik(1) Persiapan dan Sterilisasi Alat dan Media(2) Inokulasi, Peremajaan Biakan (pada media padat dan

media cair)(3) Penetapan Angka Bakteri, Ragi dan Kapang dalam

bahan / sediaan(4) Uji Mikroba tertentu (isolasi, identifikasi, konfirmasi)(5) Uji Batas Mikroba (6) Uji Resistensi(7) PCR dan Elektroforesis

Tokoh / Peneliti di bidangMikrobiologi

Louis Pasteur

Alexander Fleming

H Adolf Krebs

Cyanobacteria

GrampositivesProteobacteria

Fungi

PlantsExtremeHalophilesMethanosarcina

Universal phylogenetic tree as determined from comparative sequencing of 16S or 18S rRNA (Wheelis et al. 1992).

Three Domains of Life

Bacteria Archaea

Eucarya (Eukaryote)

Prokaryotes

Microsporidia

AnimalsGreen non-sulfurbacteria

Flavobacteria

Thermotoga

Methanobacterium

MethanococcusPyrodictium

Thermoproteus

Slimemolds

Entamoebae

Ciliates

Flagellates

Trichomonads

Diplomonads

Thermococcus

Aquifex

Chloroplast

Mitochondrion

Thermoplasma

Methanopyrus

EuryarchaeotaCrenarchaeota

Korarchaeota

Mikroorganisme

• Patogen : menyebabkan kerusakan pada produk, menyebabkan penyakit pada manusia dan organisme lain

• Non-patogen : bermanfaat bagi kesejahteraan manusia, lingkungan

Peran negatif :Kontaminasi mikroba pada makanan

Mikroba penyebab karies gigi

Streptococcus sobrinus

Streptococcus mutans

Karies pada gigi

Peran positif :Pembuatan keju (cheese)

Di Belanda Di USA

Produk dari mikroba

Field Product Source UsagePharmacy Penicillin P.chrysogenum antibacteria

Griseofulvin P.griseofulvum antifungiCyclosporin Trich.polysporum immunosuppresant

Agriculture Zealarenone Gibberella zeae growth promoterGibberellins G.fujikuroi plants hormon

Industry Amylase Asp.oryzae, niger degradation of amilum

Lipase Mucor, Aspergillus degradation of lipid

Top 25 Biotechnol Company (2011)• Abbott Laboratories • Amgen, Inc. • AstraZeneca Pharmaceuticals • Bayer HealthCare

Pharmaceuticals • Biogen Idec Inc. • Boehringer Ingelheim

Pharmaceuticals, Inc.• Bristol-Myers Squibb Company • Chiron Corporation• Eli Lilly and Company • Forest Laboratories. • Genentech, Inc. • Genzyme Corporation

• Gilead Science, Inc. • GlaxoSmithKline LLC • Johnson & Johnson • Merck / Schering-Plough

Pharmaceuticals• MGI Pharma, Inc./ Eisai• Millennium Pharmaceuticals, Inc. • Mylan Pharmaceuticals Corporation • Novaris Pharmaceuticals

Corporation• Pfizer• Roche Diagnostics Corporation • Sanofi-Aventis • Takeda Pharmaceuticals North

America, Inc. • Teva Pharmaceutical Industries Ltd.

Industri vaksin di Indonesia

Kinerja PT.Biofarma (data 2002)

Job as microbiologist

Produk Farmasi

• Obat• Bahan Obat (bahan baku)• Bahan Pembantu (eksipien)• Kosmetik• Makanan dan minuman• Alat Kesehatan

Produk Farmasi

• Mengapa perlu persyaratan mikrobiologi? • Apa akibatnya bila tidak memenuhi syarat

mikrobiologi?• Bagaimana cara menguji nya?• Bagaimana menetapkan hasil uji nya?• …..??• …..??

Produk Farmasi

• SAFETY• QUALITY• BENEFIT

Kerusakan produk farmasioleh mikroba

• Kontaminasi mikroba terhadap produk farmasi dapat menyebabkan : kerusakan fisik, kimia dan biologis

• Faktor-faktor yang mempengaruhi pertumbuhan mikroba dalam produk : kandungan dalam produk, faktor lingkungan

• Cara perusakan produk farmasi oleh mikrobaterhadap zat aktif obat, kosmetika, makanan, zat-zat lainnya

• Bahaya infeksi dan keracunan

Beberapa contoh produk farmasi yang terkontaminasi mikroorganisme

Jenis produk Perubahan Mikroba penyebab

Antasida (MgOH) Bau amoniak coliform

Emulsi m/a Pemisahan fase Trichoderma viridae

Krim calamine Hypha jamur Penicillium spp.

Sirup obat batuk Populasi mikroba Osmotolerant moulds

Tablet prednisolon Perubahan warna Aspergillus spp.

Pengental sirup Viskositas berubah yeast

Mikrobiologi Analisis• Mikroba sebagai bahan

uji (mikroba uji) : untuk pengujian berdasarkan respons mikroba terhadap sampel

• Mikroba sebagai kontaminan (di dalam produk farmasi, makanan atau kosmetika)

Tahapan analisis mikrobiologiPenyiapan metode, alat dan bahan pereaksi

↓Identifikasi sampel

↓Sampling

↓Analisis kualitatif

↓Analisis kuantitatif

↓Kesimpulan

Analisis mikrobiologi